坪坂歩 (Ayumu Tsubosaka) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院医学系研究科大学院生

研究者番号: 71020450
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-3699-9659
J-GLOBAL ID: 202401016193539385
researchmap会員ID: R000066785

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研究分野

経歴

2025年4月

東京大学, 大学院医学系研究科, 助教
2022年4月 - 2025年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員 (DC1)
2019年4月 - 2025年3月

東京大学医学系研究科, 社会医学専攻衛生学分野, 博士課程大学院生
2019年4月 - 2021年3月

東京大学医学部附属病院, 初期研修医

学歴

2019年4月 - 2025年3月

東京大学, 大学院医学系研究科, 社会医学専攻衛生学分野
2013年4月 - 2019年3月

千葉大学, 医学部, 医学科

主要な論文

Stomach encyclopedia: Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal cell diversity and homeostatic regulation of human stomach.

Tsubosaka A, Komura D, Kakiuchi M, Katoh H, Onoyama T, Yamamoto A, Abe H, Seto Y, Ushiku T, Ishikawa S

Cell reports 2023年10月17日筆頭著者
Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal the Cell Diversity and Developmental Features of Human Gastric and Metaplastic Mucosa

Ayumu Tsubosaka, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Miwako Kakiuchi, Takumi Onoyama, Asami Yamamoto, Hiroyuki Abe, Yasuyuki Seto, Tetsuo Ushiku, Shumpei Ishikawa

2022年5月23日筆頭著者
Whole-lung pathology of pleuroparenchymal fibroelastosis (PPFE) in an explanted lung: Significance of elastic fiber-rich, non-specific interstitial pneumonia-like change in chemotherapy-related PPFE.

Ayumu Tsubosaka, Jun Matsushima, Masayuki Ota, Masaki Suzuki, Yoko Yonemori, Satoshi Ota, Ichiro Yoshino, Kenji Tsushima, Koichiro Tatsumi, Yukio Nakatani

Pathology international 69(9) 547-555 2019年9月筆頭著者

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MISC

Stromal Cell Diversity in Angioimmunoblastic T-cell Lymphoma through Spatial Transcriptomics at Single Cell Resolution

Yuki Shimizu, Yoshiaki Abe, Kenichi Makishima, Sakurako Suma, Yasuhito Suehara, Keiichiro Hattori, Tatsuhiro Sakamoto, Kyohei Sano, Ayumu Tsubosaka, Miwako Kakiuchi …

CANCER SCIENCE 117 993-993 2026年1月
Single-cell transcriptomics reveal distinct TME remodeling in liver metastasis of pancreatic cancer upon K RAS inhibition

Yuuya Shiraishi, Keisuke Yamamoto, Miwako Kakiuchi, Ayumu Tsubosaka, Kyohei Sano, Hirotaka Inoue, Keiko Nakamura, Dosuke Iwadate, Daisuke Komura, Shumpei Ishikawa …

CANCER SCIENCE 117 59-59 2026年1月
Dissecting Chemotherapy Resistance in Gastric Cancer at Single-cell Resolution Using Orthotopic Syngeneic Mouse Model

Tsuyoshi Hirosue, Miwako Kakiuchi, Kuniyo Sueyoshi, Ayumu Tsubosaka, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Sachiyo Nomura, Yoshifumi Baba, Shumpei Ishikawa

CANCER SCIENCE 117 688-688 2026年1月
Exploring Mechanisms Driving Glioblastoma Invasion

Hirotaka Inoue, Miwako Kakiuchi, Masashi Nomura, Kazuhito Tanaka, Mieko Ochi, Ayumu Tsubosaka, Kyohei Sano, Hiroyuki Sueyoshi, Kenji Fujimoto, Takahiro Yamamoto …

CANCER SCIENCE 117 1672-1672 2026年1月
Spatial transcriptomics reveals epithelial heterogeneity and microenvironmental divergence in gastric cancer subtypes

Ayumu Tsubosaka, Kyohei Sano, Miwako Kakiuchi, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Tetsuo Ushiku, Shumpei Ishikawa

CANCER SCIENCE 117 66-66 2026年1月
Spatial Transcriptomic Characterization of the Tumor Microenvironment in Clinically Sequenced Breast Cancer Cases

Mariko Kikuchi, Miwako Kakiuchi, Hirotaka Inoue, Ayumu Tsubosaka, Kyohei Sano, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Arisa Morizono, Katsutoshi Oda, Tanabe Masahiko …

CANCER SCIENCE 117 1950-1950 2026年1月
Single-Cell and Spatial Profiling of Tumor-Infiltrating B Cells Reveals Distinct Tumor-Specific Clones in Gastric Cancer

Yichen Jiang, Ayumu Tsubosaka, Kyohei Sano, Daisuke Komura, Miwako Kakiuchi, Hiroto Katoh, Shumpei Ishikawa

CANCER SCIENCE 117 50-50 2026年1月
Uncovering Gastric Cancer Heterogeneity with Histopathology and Spatial Transcriptomics

Kyohei Sano, Takumi Onoyama, Ayumu Tsubosaka, Miwako Kakiuchi, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Tetsuo Ushiku, Shumpei Ishikawa

CANCER SCIENCE 117 2049-2049 2026年1月
Spatial transcriptomics uncovers the tumor microenvironment in a mouse model of diffuse gastric cancer

Shin Suzuki, Ayumu Tsubosaka, Kyohei Sano, Miwako Kakiuchi, Daisuke Komura, Hiroto Katoh, Shumpei Ishikawa

CANCER SCIENCE 117 2048-2048 2026年1月
Spatial Transcriptomic Profiling Reveals Niche-Specific Interactions in Early Gastric Cancer Microenvironment

Keiko Nakamura, Miwako Kakiuchi, Ayumu Tsubosaka, Kyohei Sano, Daisuke Komura, Keisuke Yamamoto, Chihiro Takeuchi, Yosuke Tsuji, Hiroto Katoh, Shumpei Ishikawa …

CANCER SCIENCE 117 536-536 2026年1月
全身全細胞解析に挑むシングルセル×空間オミクス×透明化で見る生命像空間オミクス解析によるがん研究の現状と展望

坪坂歩, 石川俊平, 石川俊平

実験医学 44(1) 2026年
Distinct blood endothelial cells shape spatial niches in angioimmunoblastic T-cell lymphoma

Yuki Shimizu, Manabu Fujisawa, Yoshiaki Abe, Kenichi Makishima, Sakurako Suma, Yasuhito Suehara, Keiichiro Hattori, Tatsuhiro Sakamoto, Kyohei Sano, Ayumu Tsubosaka …

BLOOD 146 462-463 2025年11月3日
造影境界領域の性状の違いは膠芽腫の浸潤性の違いと関連するのか

井上博貴, 垣内美和子, 越智三枝子, 田中一仁, 坪坂歩, 佐野恭平, 末吉博之, 藤本健二, 黒田順一郎, 吉井大貴 …

日本脳神経CI学会総会プログラム・抄録集 48th 2025年
空間プロファイリングによる胃癌の多様性の理解【JST機械翻訳】|||

垣内美和子, 坪坂歩, 佐野恭平, 廣末剛士, 廣末剛士, 竹内千尋, 河村大輔, 山本恵介, 辻陽介, 加藤洋人 …

日本解剖学会総会・全国学術集会抄録集(CD-ROM) 130th 2025年
シングルセル・空間トランスクリプトームによる胃間質ニッチェの統合的解析

垣内美和子, 坪坂歩, 佐野恭平, 河村大輔, 加藤洋人, 加藤洋人, 石川俊平, 石川俊平

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 48th 2025年
病理組織画像・ゲノム・空間トランスクリプトームの統合による胃癌不均一性の解釈

佐野恭平, 斧山巧, 斧山巧, 垣内美和子, 坪坂歩, 河村大輔, 加藤洋人, 加藤洋人, 牛久哲男, 石川俊平 …

日本衛生学雑誌(Web) 80(Supplement) 2025年
空間トランスクリプトーム解析が紐解く早期胃がんの細胞間相互作用

垣内美和子, 坪坂歩, 佐野恭平, 河村大輔, 辻陽介, 山本恵介, 加藤洋人, 藤城光弘, 石川俊平, 石川俊平

日本癌学会学術総会抄録集(Web) 83rd 2024年
scRNA-seqと空間トランスクリプトームの統合解析が明らかにする慢性炎症と胃がんの複雑性

坪坂歩, 佐野恭平, 垣内美和子, 河村大輔, 加藤洋人, 牛久哲男, 石川俊平, 石川俊平

日本癌学会学術総会抄録集(Web) 83rd 2024年
病理組織画像・空間トランスクリプトームの統合による胃癌不均一性の解釈

佐野恭平, 斧山巧, 斧山巧, 河村大輔, 坪坂歩, 垣内美和子, 加藤洋人, 牛久哲男, 石川俊平

日本癌学会学術総会抄録集(Web) 83rd 2024年
Orthotopicマウスモデルを用いた胃がん化学療法耐性のシングルセル解析

廣末剛士, 廣末剛士, 垣内美和子, 末吉国誉, 坪坂歩, 河村大輔, 加藤洋人, 八木浩一, 野村幸世, 瀬戸泰之 …

日本消化器癌発生学会総会プログラム・抄録集 35th 2024年

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

びまん型胃癌における腫瘍-微小環境ネットワークの空間的分子機構の解明と応用展開

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2025年7月 - 2027年3月

坪坂歩
びまん性胃がん及び周辺組織におけるシングルセルオミクス解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2023年3月 - 2025年3月

坪坂歩