丁天本 (Tianben Ding) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院理学系研究科助教

学位: 博士（工学）(2020年8月ワシントン大学セントルイス)

研究者番号: 90977224
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0003-0710-2344
J-GLOBAL ID: 202301010918101458
Researcher ID: AAZ-7846-2020
researchmap会員ID: R000054051

外部リンク: http://www.goda.chem.s.u-tokyo.ac.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年1月 - 現在

東京大学, 大学院理学系研究科, 助教
2022年4月 - 2023年1月

（株）日立製作所, 中央研究所, 研究員（チームリーダー）
2021年9月 - 2022年3月

（株）日立製作所, 中央研究所, 研究員
2020年8月 - 2021年8月

Washington University in St. Louis, Department of Electrical and Systems Engineering, School of Engineering, Postdoctoral Research Associate

学歴

2014年8月 - 2020年8月

Washington University in St. Louis,, School of Engineering,, Department of Electrical & Systems Engineering, Ph.D.
2012年4月 - 2014年3月

東京大学, 大学院工学系研究科, 電気系工学専攻修士課程
2008年4月 - 2012年3月

横浜国立大学, 工学部, 知能物理工学科

受賞

2016年

エレクトロニクスソサイエティ招待論文賞, 複素振幅を扱うニューラルネットワークとそのエレクトロニクスにおける利点, 電子情報通信学会

廣瀬明, 丁天本

論文

High-throughput optical imaging technology for large-scale single-cell analysis of live Euglena gracilis

Cheng Lei, Yuta Nakagawa, Yuzuki Nagasaka, Tianben Ding, Hiroshi Kanno, Chihana Toyokawa, Kuniyasu Niizuma, Kengo Suzuki, Ming Li, Anwar Sunna …

TrAC Trends in Analytical Chemistry 180 2024年11月査読有り招待有り責任著者
Enhanced CRISPR/Cas12a-based quantitative detection of nucleic acids using double emulsion droplets

Yang Zhang, Hangrui Liu, Yuta Nakagawa, Yuzuki Nagasaka, Tianben Ding, Shi-Yang Tang, Yaxiaer Yalikun, Keisuke Goda, Ming Li

Biosensors and Bioelectronics 257 116339-116339 2024年8月査読有り
Single-Molecule Orientation Imaging Reveals the Nano-Architecture of Amyloid Fibrils Undergoing Growth and Decay

Brian Sun, Tianben Ding, Weiyan Zhou, Tara S. Porter, Matthew D. Lew

Nano Letters 24(24) 7276-7283 2024年6月3日査読有り
High-Q silicon microring resonator with ultrathin sub-wavelength thicknesses for sensitive gas sensing

Rongxiang Guo, Qi He, Zunyue Zhang, Yingqi Xu, Shujiao Zhang, Qiyue Lang, Shuqi Xiao, Peize Han, Jiaqi Wang, Tianben Ding …

Applied Physics Reviews 2024年6月1日査読有り
Resolving the Nanoscale Structure of β-Sheet Peptide Self-Assemblies Using Single-Molecule Orientation–Localization Microscopy

Weiyan Zhou, Conor L. O’Neill, Tianben Ding, Oumeng Zhang, Jai S. Rudra, Matthew D. Lew

ACS Nano 18(12) 8798-8810 2024年3月13日査読有り
Is AI essential? Examining the need for deep learning in image-activated sorting of Saccharomyces cerevisiae

Mika Hayashi, Shinsuke Ohnuki, Yating Tsai, Naoko Kondo, Yuqi Zhou, Hongqian Zhang, Natsumi Tiffany Ishii, Tianben Ding, Maik Herbig, Akihiro Isozaki …

Lab on a Chip 2023年査読有り
In Situ Imaging of Catalytic Reactions on Tungsten Oxide Nanowires Connects Surface–Ligand Redox Chemistry with Photocatalytic Activity

Meikun Shen, Tianben Ding, Che Tan, William H. Rackers, Dongyan Zhang, Matthew D. Lew, Bryce Sadtler

Nano Letters 2022年6月22日査読有り
Single-Molecule Localization Microscopy of 3D Orientation and Anisotropic Wobble Using a Polarized Vortex Point Spread Function

Tianben Ding, Matthew D. Lew

The Journal of Physical Chemistry B 2021年11月25日査読有り筆頭著者
Single-Molecule Colocalization of Redox Reactions on Semiconductor Photocatalysts Connects Surface Heterogeneity and Charge-Carrier Separation in Bismuth Oxybromide

Meikun Shen, Tianben Ding, William H. Rackers, Che Tan, Khalid Mahmood, Matthew D. Lew, Bryce Sadtler

Journal of the American Chemical Society 2021年8月4日査読有り
Quantifying accuracy and heterogeneity in single-molecule super-resolution microscopy

Hesam Mazidi, Tianben Ding, Arye Nehorai, Matthew D. Lew

Nature Communications 11(1) 2020年12月11日査読有り
Single‐Molecule 3D Orientation Imaging Reveals Nanoscale Compositional Heterogeneity in Lipid Membranes

Jin Lu, Hesam Mazidi, Tianben Ding, Oumeng Zhang, Matthew D. Lew

Angewandte Chemie International Edition 59(40) 17572-17579 2020年9月28日査読有り
Competing Activation and Deactivation Mechanisms in Photodoped Bismuth Oxybromide Nanoplates Probed by Single-Molecule Fluorescence Imaging

Meikun Shen, Tianben Ding, Jiang Luo, Che Tan, Khalid Mahmood, Zheyu Wang, Dongyan Zhang, Rohan Mishra, Matthew D. Lew, Bryce Sadtler

The Journal of Physical Chemistry Letters 11(13) 5219-5227 2020年7月2日査読有り
Single-molecule orientation localization microscopy for resolving structural heterogeneities between amyloid fibrils

Tianben Ding, Tingting Wu, Hesam Mazidi, Oumeng Zhang, Matthew D. Lew

Optica 7(6) 602-602 2020年6月4日査読有り筆頭著者
Nanoscale colocalization of fluorogenic probes reveals the role of oxygen vacancies in the photocatalytic activity of tungsten oxide nanowires

Shen, M., Ding, T., Hartman, S.T., Wang, F., Krucylak, C., Wang, Z., Tan, C., Yin, B., Mishra, R., Lew, M.D. …

ACS Catalysis 10(3) 2088-2099 2020年2月7日査読有り筆頭著者
Online Regularization of Complex-Valued Neural Networks for Structure Optimization in Wireless-Communication Channel Prediction

Tianben Ding, Akira Hirose

IEEE Access 8 143706-143722 2020年査読有り筆頭著者
Super-resolution Imaging of Amyloid Structures over Extended Times by Using Transient Binding of Single Thioflavin T Molecules

Spehar, K., Ding, T., Sun, Y., Kedia, N., Lu, J., Nahass, G.R., Lew, M.D., Bieschke, J.

ChemBioChem 19(18) 1944-1948 2018年9月17日査読有り筆頭著者
Imaging the three-dimensional orientation and rotational mobility of fluorescent emitters using the Tri-spot point spread function

Zhang, O., Lu, J., Ding, T., Lew, M.D.

Applied Physics Letters 113(3) 2018年査読有り
Fading Channel Prediction Based on Combination of Complex-Valued Neural Networks and Chirp Z-Transform

Tianben Ding, Akira Hirose

IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems 25(9) 1686-1695 2014年9月査読有り筆頭著者責任著者

MISC

Cover art: Resolving the Nanoscale Structure of β-Sheet Peptide Self-Assemblies Using Single-Molecule Orientation-Localization Microscopy (ACS Nano 12/2024)

Weiyan Zhou, Conor L. O’Neill, Tianben Ding, Oumeng Zhang, Jai S. Rudra, Matthew D. Lew

ACS Nano 18(12) 8798-8810 2024年3月査読有り
Back cover: Is AI essential? Examining the need for deep learning in image-activated sorting of Saccharomyces cerevisiae (Lab Chip, 19/2023)

Mika Hayashi, Shinsuke Ohnuki, Yating Tsai, Naoko Kondo, Yuqi Zhou, Hongqian Zhang, Natsumi Tiffany Ishii, Tianben Ding, Maik Herbig, Akihiro Isozaki …

Lab on a Chip 23(19) 4368-4368 2023年査読有り
Cover art: Single-Molecule Localization Microscopy of 3D Orientation and Anisotropic Wobble Using a Polarized Vortex Point Spread Function (J. Phys. Chem. B 46/2021)

Tianben Ding, Matthew D. Lew

The Journal of Physical Chemistry B 125(46) 12637-12908 2021年11月査読有り筆頭著者
Rücktitelbild: Single‐Molecule 3D Orientation Imaging Reveals Nanoscale Compositional Heterogeneity in Lipid Membranes (Angew. Chem. 40/2020)

Jin Lu, Hesam Mazidi, Tianben Ding, Oumeng Zhang, Matthew D. Lew

Angewandte Chemie 132(40) 17912-17912 2020年9月28日査読有り
Back Cover: Single‐Molecule 3D Orientation Imaging Reveals Nanoscale Compositional Heterogeneity in Lipid Membranes (Angew. Chem. Int. Ed. 40/2020)

Jin Lu, Hesam Mazidi, Tianben Ding, Oumeng Zhang, Matthew D. Lew

Angewandte Chemie International Edition 59(40) 17760-17760 2020年9月28日査読有り
Structural Organization and Chemical Activity Revealed by New Developments in Single-Molecule Fluorescence and Orientation Imaging

Tianben Ding

2020年8月15日筆頭著者最終著者責任著者
Superresolution 3D Orientation Imaging Reveals Nanoscale Compositional Heterogeneity in Lipid Membranes

Jin Lu, Hesam Mazidi, Tianben Ding, Oumeng Zhang, Matthew D. Lew

Biophysical Journal 118(3) 2020年2月
Enhanced Transient Amyloid Binding Microscopy using Single-Molecule Orientation Measurements

Tianben Ding, Tingting Wu, Hesam Mazidi, Oumeng Zhang, Matthew D. Lew

Biophysical Journal 118(3) 2020年2月
Erratum: “Imaging the three-dimensional orientation and rotational mobility of fluorescent emitters using the Tri-spot point spread function” [Appl. Phys. Lett. 113, 031103 (2018)]

Oumeng Zhang, Jin Lu, Tianben Ding, Matthew D. Lew

Applied Physics Letters 115(6) 069901-069901 2019年8月5日査読有り
Superresolution Imaging of Amyloid Structures over Extended Times using Transient Binding of Single Thioflavin T Molecules

Kevin Spehar, Tianben Ding, Yuanzi Sun, Niraja Kedia, Jin Lu, George R. Nahass, Matthew D. Lew, Jan Bieschke

Biophysical Journal 116(3) 458a-458a 2019年2月
Proposal of Online Regularization for Dynamical Structure Optimization in Complex-Valued Neural Networks

Ding, T., Hirose, A.

Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) 11954 LNCS 2019年査読有り筆頭著者
Cover Feature: Super‐resolution Imaging of Amyloid Structures over Extended Times by Using Transient Binding of Single Thioflavin T Molecules (ChemBioChem 18/2018)

Kevin Spehar, Tianben Ding, Yuanzi Sun, Niraja Kedia, Jin Lu, George R. Nahass, Matthew D. Lew, Jan Bieschke

ChemBioChem 19(18) 1897-1897 2018年9月17日査読有り筆頭著者
Long-Term Super-Resolution Imaging of Amyloid Structures using Transient Binding of Standard Amyloid Probes

Kevin Spehar, Tianben Ding, Yuanzi Sun, Jin Lu, George R. Nahass, Matthew D. Lew, Jan Bieschke

Biophysical Journal 114(3) 346a-347a 2018年2月
Proposal of Polarization State Prediction Using Quaternion Neural Networks for Fading Channel Prediction in Mobile Communications

Maoki Hikosaka, Tianben Ding, Akira Hirose

2016 INTERNATIONAL JOINT CONFERENCE ON NEURAL NETWORKS (IJCNN) 4105-4111 2016年査読有り
Proposal of channel prediction by complex-valued neural networks that deals with polarization as a transverse wave entity

Murata, T., Ding, T., Hirose, A.

Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) 9491 2015年査読有り
Fading channel prediction based on self-optimizing neural networks

Ding, T., Hirose, A.

Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) 8834 2014年査読有り筆頭著者
Fading Channel Prediction Based on Complex-Valued Neural Networks in Frequency Domain

Tianben Ding, Akira Hirose

PROCEEDINGS OF 2013 URSI INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ELECTROMAGNETIC THEORY (EMTS) 640-643 2013年

講演・口頭発表等

出芽酵母の画像活性分取におけるAI画像解析法の有効性評価

Mika Hayashi, 大貫慎輔, Yating Tsai, 丁天本, 磯崎瑛宏, 大矢禎一, 合田圭介

日本化学会第104春季年会(2024) 2024年3月20日
Elucidating nanoscale biological architecture using multi-dimensional single-molecule localization microscopy

Tianben Ding

10th International Workshop of Quantum Simulation and Quantum Walks (QSQW2023) 2023年11月11日招待有り
多次元超解像蛍光イメージング技術とその応用

丁天本

第10回光科学異分野横断萌芽研究会 2023年9月2日招待有り
Elucidating the nanoscale architecture of amyloid aggregates using a polarized donut point spread function

Tianben Ding, Matthew Lew

Microscopy and Microanalysis (M&M) 2021 Meeting
Orientations of transient binding Nile red molecules reveal the organization of amyloid aggregates

Tianben Ding

Single-Molecule Sensors and nanoSystems International Conference (S3IC)
Enhanced transient amyloid binding microscopy using single-molecule orientation measurements

Tianben Ding

64th Annual Meeting of the Biophysical Society
Long-term, super-resolution imaging of amyloid structures using transient amyloid binding microscopy

Tianben Ding

SPIE Photonics West BiOS (Biomedical Optics)
Sparsity of complex-valued neural networks in fading channel prediction

Tianben Ding

Technical Committee on Neurocomputing 2014年3月
Fading channel prediction based on path separation in Doppler spectrum and complex-valued neural network processing

Tianben Ding

42th Electromagnetic Theory Symposium 2013年11月
Fading channel prediction based on complex-valued neural networks in frequency domain

Tianben Ding, Akira Hirose

International Symposium on Electromagnetic Theory (EMTS) 2013 (URSI commission B) 2013年5月

所属学協会

2024年8月 - 現在

日本光学会
2024年1月 - 現在

日本化学会
2019年1月 - 現在

SPIE, the International Society for Optics and Photonics

共同研究・競争的資金等の研究課題

超解像画像活性細胞選抜法

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2024年4月 - 2026年3月

丁天本
弾性慣性フォーカシングを活用した大きな細胞のための画像活性分取法の開発

公益財団法人マツダ財団第39回（2023年度）マツダ研究助成募集―科学技術振興関係― 2024年4月 - 2026年3月

丁天本

産業財産権

特開2024-009723 データ管理装置、データ管理システム及びデータ管理方法

丁天本, 高田実佳, 樫山俊彦, 増田博亮
US20230073324A1 Systems and methods for performing optical imaging using duo-spot point spread functions

Matthew Lew, Tingting Wu, Tianben Ding

学術貢献活動

The 86th Fujihara Seminar Serendipity Symposium 2024

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

Keisuke Goda 2024年3月10日 - 2024年3月14日
High-Speed Biomedical Imaging and Spectroscopy IX, SPIE Photonics West 2024

パネル司会・セッションチェア等

2024年1月27日 - 2024年2月1日
42th Electromagnetic Theory Symposium

その他

2013年 - 2013年
Asia-Pacific Conference on Synthetic Aperture Radar (APSAR)

パネル司会・セッションチェア等

Akira Hirose 2013年 - 2013年

社会貢献活動

Portal to the Public, Saint Louis Science Center

講師, 情報提供, 企画, 運営参加・支援, 実演

Saint Louis Science Center, USA 2020年

メディア報道

Gassing up potential for silicon microring resonators

AIP - News & Analysis https://ww2.aip.org/scilights/gassing-up-potential-for-silicon-microring-resonators 2024年5月インターネットメディア
Imaging technique shows new details of peptide structures

EurekAlert! - AAAS https://www.eurekalert.org/news-releases/1042735 2024年4月インターネットメディア
Imaging technique shows new details of peptide structures

The Source - Washington University https://source.wustl.edu/2024/04/imaging-technique-shows-new-details-of-peptide-structures/ 2024年4月インターネットメディア
Vortex microscope sees more than ever before - In a first for imaging, new microscope captures details, 3D motion of molecules in liquid

EurekAlert! - AAAS https://www.eurekalert.org/news-releases/943830 2022年2月17日インターネットメディア
Vortex microscope sees more than ever before - In a first for imaging, new microscope captures details, 3D motion of molecules in liquid

The Source - Washington University https://source.wustl.edu/2022/02/vortex-microscope-sees-more-than-ever-before/ 2022年2月17日インターネットメディア
New computational method validates images without 'ground truth' - WIF helps ensure 'seeing is believing' when it comes to the very small

EurekAlert! - AAAS https://www.eurekalert.org/news-releases/862127 2020年12月11日インターネットメディア
New computational method validates images without ‘ground truth’ - WIF helps ensure ‘seeing is believing’ when it comes to the very small

The Source - Washington University https://source.wustl.edu/2020/12/new-computational-method-validates-images-without-ground-truth/ 2020年12月11日インターネットメディア
Close to the Edge - New single-molecule microscopy technique lets researchers see lipid membranes in unique detail

The Analytical Scientist https://theanalyticalscientist.com/techniques-tools/close-to-the-edge 2020年10月12日インターネットメディア
Methodology Aids Microscopic Study of Fibrils in Molecules

Photonics Media https://www.photonics.com/Articles/Mechanism_Aids_Microscopic_Study_of_Fibrils/a65939 2020年9月インターネットメディア
Using light's properties to indirectly see inside a cell membrane - New imaging technique helps resolve nanodomains, chemical composition in cell membranes

EurekAlert! - AAAS https://www.eurekalert.org/news-releases/662745 2020年8月25日インターネットメディア
Using light’s properties to indirectly see inside a cell membrane - New imaging technique helps resolve nanodomains, chemical composition in cell membranes

The Source - Washington University https://source.wustl.edu/2020/08/using-lights-properties-to-indirectly-see-inside-a-cell-membrane/ 2020年8月24日インターネットメディア
New microscopy method provides unprecedented look at amyloid protein structure - Measuring the location and orientation of single molecules could provide new insights into Alzheimer's and Parkinson's diseases

EurekAlert! - AAAS https://www.eurekalert.org/news-releases/728210 2020年6月4日インターネットメディア
New microscopy method provides unprecedented look at amyloid protein structure - Measuring location, orientation of single molecules could give new insights into Alzheimer’s, Parkinson’s

The Source - Washington University https://source.wustl.edu/2020/06/new-microscopy-method-provides-unprecedented-look-at-amyloid-protein-structure/ 2020年6月4日インターネットメディア
New Microscopy Method Provides Unprecedented Look at Amyloid Protein Structure - Measuring the location and orientation of single molecules could provide new insights into Alzheimer’s and Parkinson’s diseases

OPTICA News Releases https://www.optica.org/about/newsroom/news_releases/2020/new_microscopy_method_provides_unprecedented_look_at_amyloid_protein_structure/ 2020年6月4日インターネットメディア
Technique Uses Well-Known Dye to Watch Amyloid Plaques in the Brain - Researchers have demonstrated a way to use Thioflavin T, a dye used to study amyloid for nearly a century, as a sensor that can image Alzheimer’s-related plaques with ultra-high resolution and monitor drug effects.

OPTICA News Releases https://www.optica.org/about/newsroom/news_releases/2019/technique_uses_well-known_dye_to_watch_amyloid_plaques_in_the_brain/ 2019年3月26日インターネットメディア
DYE GETS AMYLOIDS TO ‘BLINK’ TO MAKE THEM EASIER TO SPOT

Futurity https://www.futurity.org/amyloids-alzheimers-disease-1860842/ 2018年9月10日インターネットメディア
'Blink' and you won't miss amyloids - Engineering team just found new way to see proteins that cause Alzheimer's, other diseases

EurekAlert! - AAAS https://www.eurekalert.org/news-releases/771006 2018年8月30日インターネットメディア
‘Blink’ and you won’t miss amyloids - Engineering team just found new way to see proteins that cause Alzheimer’s, other diseases

The Source - Washington University https://source.wustl.edu/2018/08/blink-and-you-wont-miss-amyloids/ 2018年8月30日インターネットメディア

丁天本

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

学術貢献活動

社会貢献活動

メディア報道

メニュー

共著者の一覧