遠藤俊徳 (Toshinori Endo) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学情報科学研究院教授

学位: 博士（理学）(総合研究大学院大学)
Master.of Science(The University of Tokyo)

研究者番号: 00323692
J-GLOBAL ID: 200901084345719960
researchmap会員ID: 1000317007

外部リンク: http://ibio.jp

研究キーワード

研究分野

経歴

2016年12月 - 現在

北海道大学, 数理・データサイエンス教育研究センター
2004年4月 - 現在

北海道大学, 大学院情報科学研究科, 教授
2020年4月 - 2021年3月

北海道大学, 大学院情報科学院, 生体情報工学コース長
2020年4月 - 2021年3月

北海道大学, 大学院情報科学研究院情報科学専攻, 生命人間情報科学部門長
2015年4月 - 2017年3月

北海道大学, 情報学企画委員会, 委員長
2014年4月 - 2015年3月

北海道大学, 大学院情報科学研究科, 生命人間情報科学専攻長
2014年4月 - 2015年3月

北海道大学, 工学部情報エレクトロニクス, 学科長
2008年4月 - 2009年3月

北海道大学, 大学院情報科学研究科, 生命人間情報科学専攻長
2000年4月 - 2004年3月

東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 講師
1999年5月 - 2000年3月

理化学研究所, ゲノム科学総合研究センター, 研究員
1997年4月 - 1999年4月

独立行政法人日本学術振興会 (特別研究員)
1996年4月 - 1997年3月

国立研究開発法人新エネルギー・産業技術総合開発機構, 研究員

学歴

1993年4月 - 1996年3月

総合研究大学院大学, 生命科学研究科, 遺伝学専攻
1990年4月 - 1993年3月

東京大学, 大学院理学系研究科, 生物化学専攻
1986年4月 - 1990年3月

東京大学, 理学部, 生物化学科

委員歴

2019年4月 - 現在

日本バイオインフォマティクス学会, 北海道地域部会長
2016年12月 - 現在

数理・データサイエンス教育強化拠点コンソーシアム, 委員
2011年4月 - 現在

日本情報処理学会, バイオ情報学研究会論文誌編集委員会
2011年4月 - 現在

日本情報処理学会, バイオ情報学研究会運営委員会
2009年 - 現在

日本遺伝学会, 幹事
2020年9月 - 2022年10月

日本遺伝学会, 第94回大会長
2018年4月 - 2022年3月

札幌市IoTイノベーション推進コンソーシアム, BI研究部会委員
2003年 - 2021年6月

生き物文化誌学会, 常任理事
2016年9月 - 2019年3月

日本バイオインフォマティクス学会, 評議員
2016年10月 - 2017年12月

第6回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP) / 日本バイオインフォマティクス学会年会, 大会長
2011年

Society for Molecular Biology and Evolution, 年会準備委員
2011年

Society for Molecular Biology and Evolution, Annual meeting committee member
2008年 - 2010年

日本遺伝学会, 第82回大会実行委員
2005年 - 2007年

日本バイオインフォマティクス学会, 幹事
2005年 - 2007年

日本バイオインフォマティクス学会, 北海道地域部会長

論文

Current trends in RNA virus detection through metatranscriptome sequencing data.

So Nakagawa, Shoichi Sakaguchi, Atsushi Ogura, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo, Yoshiyuki Suzuki, Takashi Gojobori

FEBS open bio 13(6) 992-1000 2023年5月10日
Multi-Omics and Artificial Intelligence-Guided Drug Repositioning: Prospects, Challenges, and Lessons Learned from COVID-19

Yi Cong, Toshinori Endo

OMICS: A Journal of Integrative Biology 26(7) 361-371 2022年7月1日査読有り招待有り最終著者責任著者
A New Approach to Drug Repurposing with Two-Stage Prediction, Machine Learning, and Unsupervised Clustering of Gene Expression

Yi Cong, Misaki Shintani, Fuga Imanari, Naoki Osada, Toshinori Endo

OMICS: A Journal of Integrative Biology 26(6) 339-347 2022年6月1日査読有り最終著者責任著者
Whole-Genome Sequencing of Vero E6 (VERO C1008) and Comparative Analysis of Four Vero Cell Sublines

Kazuhiro Konishi, Toshiyuki Yamaji, Chisato Sakuma, Fumio Kasai, Toshinori Endo, Arihiro Kohara, Kentaro Hanada, Naoki Osada

Frontiers in Genetics 13 1-9 2022年3月22日査読有り
Predicting PRDM9 Binding Sites by a Convolutional Neural Network and Verification Using Genetic Recombination Map

Takahiro Nakamura, Toshinori Endo, Naoki Osada

IPSJ Transactions on Bioinformatics 15 9-16 2022年
Identification of Characteristic Genomic Markers in Human Hepatoma HuH-7 and Huh7.5.1-8 Cell Lines

Masaki Kawamoto, Toshiyuki Yamaji, Kyoko Saito, Yoshitaka Shirasago, Kazuhiro Satomura, Toshinori Endo, Masayoshi Fukasawa, Kentaro Hanada, Naoki Osada

Frontiers in Genetics 11 546106-546106 2020年10月9日査読有り
Exhaustive identification of conserved upstream open reading frames with potential translational regulatory functions from animal genomes.

Hiro Takahashi, Shido Miyaki, Hitoshi Onouchi, Taichiro Motomura, Nobuo Idesako, Anna Takahashi, Masataka Murase, Shuichi Fukuyoshi, Toshinori Endo, Kenji Satou, Satoshi Naito, Motoyuki Itoh

Scientific reports 10(1) 16289-16289 2020年10月1日査読有り
Comprehensive genome-wide identification of angiosperm upstream ORFs with peptide sequences conserved in various taxonomic ranges using a novel pipeline, ESUCA.

Hiro Takahashi, Noriya Hayashi, Yuta Hiragori, Shun Sasaki, Taichiro Motomura, Yui Yamashita, Satoshi Naito, Anna Takahashi, Kazuyuki Fuse, Kenji Satou, Toshinori Endo, Shoko Kojima, Hitoshi Onouchi

BMC genomics 21(1) 260-260 2020年3月30日査読有り
Computational Drug-repositioning Approach Identifying Sirolimus as a Potential Therapeutic Option for Inflammatory Dilated Cardiomyopathy.

Kyoko Shibata, Toshinori Endo, Yoshikazu Kuribayashi

Drug research 69(10) 565-571 2019年10月査読有り
Achiasmy and sex chromosome evolution

Kazuhiro Satomura, Naoki Osada, Toshinori Endo

Ecological Genetics and Genomics 13 100045 2019年9月査読有り最終著者
Comprehensive phylogenomic analysis reveals a novel cluster of simian endogenous retroviral sequences in Colobinae monkeys

Masaki Ikeda, Kazuhiro Satomura, Tsuyoshi Sekizuka, Kentaro Hanada, Toshinori Endo, Naoki Osada

American Journal of Primatology e22882 2018年6月査読有り
A Generalized Linear Model for Decomposing Cis-regulatory, Parent-of-Origin, and Maternal Effects on Allele-Specific Gene Expression

Yasuaki Takada, Ryutaro Miyagi, Aya Takahashi, Toshinori Endo, Naoki Osada

G3-GENES GENOMES GENETICS 7(7) 2227-2234 2017年7月査読有り
旧世界ザルにおけるサルレトロウイルスの内在化に関する進化系統解析

池田昌輝, 遠藤俊徳, 長田直樹

霊長類研究 Supplement 32 59-59 2016年
Guidelines for the Nomenclature of Genetic Elements in Tunicate Genomes

Stolfi, Alberto, Sasakura, Yasunori, Chalopin, Domitille, Satou, Yutaka, Christiaen, Lionel, Dantec, Christelle, Endo, Toshinori, Naville, Magali, Nishida, Hiroki, Swalla, Billie J, Volff, Jean-Nicolas, Voskoboynik, Ayelet, Dauga, Delphine, Lemaire, Patrick

GENESIS 53(1:::SI) 1-14 2015年1月査読有り
Sustained Heterozygosity Across a Self-Incompatibility Locus in an Inbred Ascidian

Satou, Yutaka, Hirayama, Kazuko, Mita, Kaoru, Fujie, Manabu, Chiba, Shota, Yoshida, Reiko, Endo, Toshinori, Sasakura, Yasunori, Inaba, Kazuo, Satoh, Nori

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 32(1) 81-90 2015年1月査読有り
Exploring functionally related enzymes using radially distributed properties of active sites around the reacting points of bound ligands

Keisuke Ueno, Katsuhiko Mineta, Kimihito Ito, Toshinori Endo

BMC STRUCTURAL BIOLOGY 12 5 2012年4月査読有り最終著者責任著者
Proteomic Profiling Reveals Compartment-Specific, Novel Functions of Ascidian Sperm Proteins

Mia Nakachi, Ayako Nakajima, Mamoru Nomura, Kouki Yonezawa, Keisuke Ueno, Toshinori Endo, Kazuo Inaba

MOLECULAR REPRODUCTION AND DEVELOPMENT 78(7) 529-549 2011年7月査読有り
Predicted expansion of the claudin multigene family

Katsuhiko Mineta, Yasuko Yamamoto, Yuji Yamazaki, Hiroo Tanaka, Yukiyo Tada, Kuniaki Saito, Atsushi Tamura, Michihiro Igarashi, Toshinori Endo, Kosei Takeuchi, Sachiko Tsukita

FEBS LETTERS 585(4) 606-612 2011年2月査読有り
CIPRO 2.5: Ciona intestinalis Protein integrated database with large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with ability for user rating and comments

Lixy Yamada, Mamoru Nomura, Michio Ogasawara, Junko Yaguchi, Hiroki Takahashi, Alu Konno, Ayako Nakajima, Sasakura Yasunori, Akiyasu Yoshizawa, Toshinori Endo, Hisaaki Taniguchi, Keisuke Ueno, Chisato Yamasaki, Kouki Yonezawa, Miho Sera, Katsuhiko Mineta, Tadashi Imanishi, Kazuo Inaba, Kohji Hotta, Mia Nakachi, Yutaka Satou

Nature Precedings 2011年1月6日
CIPRO 2.5: Ciona intestinalis protein database, a unique integrated repository of large-scale omics data, bioinformatic analyses and curated annotation, with user rating and reviewing functionality

Toshinori Endo, Keisuke Ueno, Kouki Yonezawa, Katsuhiko Mineta, Kohji Hotta, Yutaka Satou, Lixy Yamada, Michio Ogasawara, Hiroki Takahashi, Ayako Nakajima, Mia Nakachi, Mamoru Nomura, Junko Yaguchi, Yasunori Sasakura, Chisato Yamasaki, Miho Sera, Akiyasu C. Yoshizawa, Tadashi Imanishi, Hisaaki Taniguchi, Kazuo Inaba

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 39(suppl) D807-D814 2011年1月筆頭著者責任著者

もっとみる

MISC

Revisiting the Relationship between Evolutionary Conservation and Disease Causality: A Case Study of Beta Globin Gene

Sangeetha Udani Ratnayake, Toshinori Endo, Naoki Osada

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 345-345 2016年12月
The cause of gene expression changes in reciprocal crosses of Drosophila melanogaster by measuring allele-specific gene expression

Yasuaki Takada, Aya Takahashi, Ryutaro Miyagi, Toshinori Endo, Naoki Osada

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 372-372 2016年12月
グラフを用いたタンパク質のモーション表現法の提案

安富祖仁, 峯田克彦, 遠藤俊徳

研究報告バイオ情報学（BIO） 2013(7) 1-7 2013年12月4日
グラフを用いたタンパク質のモーション表現法の提案

安富祖仁, 峯田克彦, 遠藤俊徳

研究報告数理モデル化と問題解決（MPS） 2013(7) 1-7 2013年12月4日
Development of an efficient multiple sequence alignment method using GPGPU

Liu Zheng, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 88(6) 380-380 2013年12月
Selective Constraint on Flanking Regions of Fish Genes

Du Peng, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 87(6) 435-435 2012年12月
Developing a fast multiple sequence alignment on GPU toward high efficiency analysis of biological information

Hitoshi Orito, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 429-429 2010年12月
Molecular evolutionary study of the nonsyndromic deafness genes in mammals

Koya Kato, Toshinori Endo, Katsuhiko Mineta

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 401-401 2010年12月
A Method for Construction of Protein-protein Interaction Network between Hepatitis B Virus and Human

Zhang Wenjuan, Liu Zhi-ping, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 429-429 2010年12月
Function Prediction for the Orphan GPCR based on Machine Learning

Takashi Tamura, Fuyuto Abe, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 428-428 2010年12月
Evolutionary divergence of the auditory system in mammals

Koya Kato, Toshinori Endo, Katsuhiko Mineta

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 455-455 2010年12月
A new approach to estimate protein functions by Hidden Markov Model for enzyme classifications

Fuyuto Abe, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 416-416 2010年12月
Genetic polymorphisms of T1R family and the diversity of umami/sweet perception in human populations

Rie Watanabe, Toshinori Endo, Katsuhiko Mineta

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 439-439 2010年12月
Development for a prediction method of drug therapy efficacy with support vector machine based on the personal gene expression patterns

Hiroki Yoshida, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 429-429 2010年12月
酵素の階層機能分類に基づくタンパク質機能予測

阿部布由人, 峯田克彦, 遠藤俊徳

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 82nd 103 2010年9月7日
機械学習を用いたオーファンGPCRの機能予測

田村崇, 阿部布由人, 峯田克彦, 遠藤俊徳

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 82nd 118 2010年9月7日
聴覚の多様性—聴覚に注目した哺乳動物の適応戦略—

加藤耕也, 遠藤俊徳, 峯田克彦

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 82nd 74 2010年9月7日
うま昧・甘昧受容体T1Rファミリー分子群の集団間多型と味覚多様性

渡邉理恵, 遠藤俊徳, 峯田克彦

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 82nd 123 2010年9月7日
遺伝子発現情報の機械学習に基づく投薬効果予測法の開発

吉田寛輝, 峯田克彦, 遠藤俊徳

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 82nd 119 2010年9月7日
GPGPU応用によるマルチプルシーケンスアラインメントの高速化

折戸仁志, 峯田克彦, 遠藤俊徳

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 82nd 118 2010年9月7日

もっとみる

書籍等出版物

生物の科学遺伝 Vol.76 No.4 特集:メンデル生誕200年記念

遠藤俊徳 (担当:分担執筆, 範囲:日本における遺伝学の発展)

エヌ・ティー・エス 2022年7月1日 (ISBN: 486043756X)
遺伝学の百科事典 : 継承と多様性の源

日本遺伝学会 (担当:共編者(共編著者))

丸善出版 2022年1月 (ISBN: 9784621306604)
改訂遺伝単 ―遺伝学用語集対訳付き (『生物の科学遺伝』別冊No.25)

日本遺伝学会・遺伝学教育用語検討委員会, 日本遺伝学会 (担当:共編者(共編著者))

エヌ・ティー・エス 2021年3月15日 (ISBN: 4860437128)
遺伝単―遺伝学用語集対訳付き (生物の科学遺伝別冊No.22)

日本遺伝学会 (担当:共編者(共編著者))

エヌ・ティー・エス 2017年9月21日 (ISBN: 4860434994)
分子生物学のためのバイオインフォマティクス入門 : 生物情報解析の理論とアルゴリズム

Setubal, João Carlos, Meidanis, João, 遠藤, 俊徳, 五條堀, 孝

共立出版 2001年12月 (ISBN: 4320055802)
すぐに使えるPerl/CGIモジュールサンプル集

遠藤, 俊徳

秀和システム 2001年7月 (ISBN: 4798001600)
GNU C compiler : manual & reference

遠藤, 俊徳

秀和システム 1999年4月 (ISBN: 4879668710)
GNU C compiler : Manual&reference

遠藤, 俊徳

秀和システム 1998年5月 (ISBN: 487966782X)
はじめてのWindows95

遠藤, 俊徳

秀和システム 1995年12月 (ISBN: 4879664952)
はじめてのロータス1-2-3 R5J : Windows版

遠藤, 俊徳

秀和システム 1995年4月 (ISBN: 4879664308)
Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures.

Takashi Gojobori, Toshinori Endo, Kazuho Ikeo (担当:共著, 範囲:Mitiko Go and Paul Schimmel eds. pp. 249-260)

Elsevier Science B. V., Amsterdam. 1995年
はじめての98

遠藤, 俊徳

秀和システムトレーディング 1994年11月 (ISBN: 4879663891)
はじめてのWindows3.1

遠藤, 俊徳

秀和システムトレーディング 1994年1月 (ISBN: 4879663468)
はじめての9801

遠藤, 俊徳

秀和システムトレーディング 1993年8月 (ISBN: 487966295X)
はじめてのWindows3

遠藤, 俊徳

秀和システムトレーディング 1992年2月 (ISBN: 4879662623)
はじめてのパソコン通信

遠藤, 俊徳, 霜田, 靖

秀和システムトレーディング 1991年5月 (ISBN: 4879662259)
はじめてのパソコン通信

遠藤, 俊徳, 霜田, 靖

秀和システムトレーディング 1991年1月 (ISBN: 4879662259)
PC-9801のアソコが知りたい : PC-98常識アンサー

遠藤, 俊徳

秀和システムトレーディング 1988年12月 (ISBN: 4879661589)