島村徹平 (Teppei Shimamura) - マイポータル

基本情報

所属: 名古屋大学医学系研究科教授

学位: 博士（情報科学）(北海道大学)

J-GLOBAL ID: 201801006737971186

2007年4月より、東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター DNA 情報解析分野宮野悟教授の下で、特任研究員を経て助教に着任。スーパーコンピュータの利用を前提とした大規模オミクスデータ解析のための統計科学的・システム生物学的方法論の開発に従事した。2014年4月より、名古屋大学大学院医学系研究科神経疾患・腫瘍分子医学研究センター・システム生物学分野に特任准教授として着任。リーディング大学院プログラム「実世界データ循環学」メンター教員としてプログラム履修生に医学データの情報解析の教育・指導を行うとともに、日々蓄積される多様かつ膨大なオミクスデータから医学・生物学的に有用な情報を抽出する数理モデリングに関する研究に従事した。2019年6月より、名古屋大学大学院医学系研究科神経疾患・腫瘍分子医学研究センター・システム生物学分野に教授（分野長）として着任。がんや精神疾患の病態の包括的理解を目的として、データサイエンスに基づく最適医療の実現に向けた研究を推進している。

研究キーワード

研究分野

経歴

2019年6月 - 現在

名古屋大学大学院医学系研究科システム生物学分野教授
2014年4月 - 2019年5月

名古屋大学大学院医学系研究科システム生物学分野特任准教授
2011年8月 - 2014年3月

東京大学医科学研究所 DNA情報解析分野助教
2010年4月 - 2011年8月

東京大学医科学研究所 DNA情報解析分野特任助教
2007年4月 - 2010年3月

東京大学医科学研究所 DNA情報解析分野特任研究員

もっとみる

学歴

2004年4月 - 2007年3月

北海道大学大学院情報科学研究科複合情報学専攻博士後期課程
2002年4月 - 2004年3月

北海道大学大学院工学研究科情報工学専攻修士課程
1998年4月 - 2002年3月

北海道大学工学部

委員歴

2020年7月 - 現在

日本メディカルAI学会評議員

受賞

2016年3月

文部科学省委託事業スキルと実践を重視したビッグデータ・イノベーション人材育成ビッグデータチャレンジ賞

島村徹平
2016年3月

日本計算機統計学会平成28年度データ解析コンペティションID-POS部門最優秀賞

島村徹平
2011年12月

日本バイオインフォマティクス学会 Japanese Society for Bioinformatics Prize Winners

島村徹平

論文

Meta-Analysis of Gut Dysbiosis in Parkinson's Disease.

Hiroshi Nishiwaki, Mikako Ito, Tomohiro Ishida, Tomonari Hamaguchi, Tetsuya Maeda, Kenichi Kashihara, Yoshio Tsuboi, Jun Ueyama, Teppei Shimamura, Hiroshi Mori, Ken Kurokawa, Masahisa Katsuno, Masaaki Hirayama, Kinji Ohno

Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society 2020年6月18日査読有り
EXOSC9 depletion attenuates P-body formation, stress resistance, and tumorigenicity of cancer cells.

Seiko Yoshino, Yusuke Matsui, Yuya Fukui, Masahide Seki, Kiyoshi Yamaguchi, Akane Kanamori, Yurika Saitoh, Teppei Shimamura, Yutaka Suzuki, Yoichi Furukawa, Shuichi Kaneko, Motoharu Seiki, Yoshinori Murakami, Jun-Ichiro Inoue, Takeharu Sakamoto

Scientific reports 10(1) 9275 - 9275 2020年6月9日査読有り
Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells.

Yoshiki Higashijima, Yusuke Matsui, Teppei Shimamura, Ryo Nakaki, Nao Nagai, Shuichi Tsutsumi, Yohei Abe, Verena M Link, Mizuko Osaka, Masayuki Yoshida, Ryo Watanabe, Toshihiro Tanaka, Akashi Taguchi, Mai Miura, Xiaoan Ruan, Guoliang Li, Tsuyoshi Inoue, Masaomi Nangaku, Hiroshi Kimura, Tetsushi Furukawa, Hiroyuki Aburatani, Youichiro Wada, Yijun Ruan, Christopher K Glass, Yasuharu Kanki

The EMBO journal 39(7) e103949 2020年4月1日査読有り
Model-based clustering for flow and mass cytometry data with clinical information

Abe K, Minoura K, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T

BMC Systems Biology. in press 2020年2月査読有り
Model-based cell clustering and population tracking for time-series flow cytometry data

Minoura K, Abe K, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T

BMC Bioinformatics. in press 20(Suppl 23) 633 2019年12月査読有り

もっとみる

MISC

腫瘍微小環境における細胞膜リン脂質代謝の役割

大澤毅, 島村徹平, 近藤彩乃, 宮野悟, 油谷浩幸, 曽我朋義, 児玉龍彦

がんと代謝研究会プログラム&抄録集 5th 36 2017年7月
低pH腫瘍微小環境における転写・代謝機構の解明

近藤彩乃, 島村徹平, 児玉龍彦, 油谷浩幸, 大澤毅

がんと代謝研究会プログラム&抄録集 5th 30 2017年7月
High-resolution copy number variation analysis of schizophrenia in Japan

I. Kushima, B. Aleksic, M. Nakatochi, T. Shimamura, T. Shiino, A. Yoshimi, H. Kimura, Y. Takasaki, C. Wang, J. Xing, K. Ishizuka, T. Oya-Ito, Y. Nakamura, Y. Arioka, T. Maeda, M. Yamamoto, M. Yoshida, H. Noma, S. Hamada, M. Morikawa, Y. Uno, T. Okada, T. Iidaka, S. Iritani, T. Yamamoto, M. Miyashita, A. Kobori, M. Arai, M. Itokawa, M-C Cheng, Y-A Chuang, C-H Chen, M. Suzuki, T. Takahashi, R. Hashimoto, H. Yamamori, Y. Yasuda, Y. Watanabe, A. Nunokawa, T. Someya, M. Ikeda, T. Toyota, T. Yoshikawa, S. Numata, T. Ohmori, S. Kunimoto, D. Mori, N. Iwata, N. Ozaki

MOLECULAR PSYCHIATRY 22(3) 430 - 440 2017年3月
ニュートリオミクスから迫るがんの病態解明と治療戦略

大澤毅, 島村徹平, 近藤彩乃, 油谷浩幸, 宮野悟, 曽我朋義, 児玉龍彦

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.1PW08‐7 (WEB ONLY) 2017年
低悪性度神経膠腫の予後に関与する遺伝子異常の解析

青木恒介, 鈴木啓道, 松尾恵太郎, 片岡圭亮, 島村徹平, 永田安伸, 吉里哲一, 真田昌, 宮野悟, 若林俊彦, 小川誠司, 夏目敦至

日本癌学会総会記事 75回 E - 1013 2016年10月