寺口俊介 (Shunsuke Teraguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 滋賀大学データサイエンス学部准教授

学位: 理学博士(2004年3月京都大学)

J-GLOBAL ID: 200901021158579834
researchmap会員ID: 5000057264

研究分野

経歴

2021年4月 - 現在

滋賀大学データサイエンス学部准教授
2018年4月 - 2021年3月

大阪大学免疫学フロンティア研究センター特任准教授
2016年11月 - 2018年3月

東北大学東北メディカル・メガバンク機構助教
2013年4月 - 2016年10月

大阪大学免疫学フロンティア研究センター特任助教
2010年4月 - 2013年3月

大阪大学免疫学フロンティア研究センター特任研究員
2007年10月 - 2010年3月

名古屋大学素粒子論研究室特任助教
2006年8月 - 2007年9月

台湾中央研究院物理研究所ポスドク研究員
2004年4月 - 2006年7月

国立台湾大学ポスドク研究員

学歴

2001年4月 - 2004年3月

京都大学大学院理学研究科物理学・宇宙物理学専攻博士後期課程
1999年4月 - 2001年3月

京都大学大学院理学研究科物理学・宇宙物理学専攻博士前期課程
1995年4月 - 1999年3月

京都大学理学部

論文

Improved Antibody-Specific Epitope Prediction Using AlphaFold and AbAdapt.

Zichang Xu, Ana Davila, Jan Wilamowski, Shunsuke Teraguchi, Daron M Standley

Chembiochem : a European journal of chemical biology 23(18) e202200303 2022年9月16日
AbAdapt: An adaptive approach to predicting antibody-antigen complex structures from sequence

Ana Davila, Zichang Xu, Songling Li, John Rozewicki, Jan Wilamowski, Sergei Kotelnikov, Dima Kozakov, Shunsuke Teraguchi, Daron M Standley, Michael Gromiha

Bioinformatics Advances 2022年3月7日査読有り
Unbiased integration of single cell transcriptome replicates

Martin Loza, Shunsuke Teraguchi, Daron M Standley, Diego Diez

NAR Genomics and Bioinformatics 4(1) lqac022 2022年1月13日査読有り
Flexible, Functional, and Familiar: Characteristics of SARS-CoV-2 Spike Protein Evolution

Dianita S. Saputri, Songling Li, Floris J. van Eerden, John Rozewicki, Zichang Xu, Hendra S. Ismanto, Ana Davila, Shunsuke Teraguchi, Kazutaka Katoh, Daron M. Standley

Frontiers in Microbiology 11 2112-2112 2020年9月査読有り
Genomic Heritabilities and Correlations of 17 Traits Related to Obesity and Associated Conditions in the Japanese Population

Olivier Gervais, Kazuko Ueno, Yosuke Kawai, Yuki Hitomi, Kazuharu Misawa, Shunsuke Teraguchi, Yen-Yen Wang, Katsushi Tokunaga, Masao Nagasaki

G3 Genes|Genomes|Genetics 10(7) 2221-2228 2020年7月1日査読有り
Methods for sequence and structural analysis of B and T cell receptor repertoires

Shunsuke Teraguchi, Dianita S. Saputri, Mara Anais Llamas-Covarrubias, Ana Davila, Diego Diez, Sedat Aybars Nazlica, John Rozewicki, Hendra S. Ismanto, Jan Wilamowski, Jiaqi Xie, Zichang Xu, Martin de Jesus Loza-Lopez, Floris J. van Eerden, Songling Li, Daron M. Standley

Computational and Structural Biotechnology Journal 18 2000-2011 2020年7月査読有り
Functional clustering of B cell receptors using sequence and structural features

Zichang Xu, Songling Li, John Rozewicki, Kazuo Yamashita, Shunsuke Teraguchi, Takeshi Inoue, Ryo Shinnakasu, Sarah Leach, Tomohiro Kurosaki, Daron M. Standley

MOLECULAR SYSTEMS DESIGN & ENGINEERING 4(4) 769-778 2019年8月査読有り
Theoretical modeling reveals that regulatory T cells increase T-cell interaction with antigen-presenting cells for stable immune tolerance

Tomoyuki Yamaguchi, Shunsuke Teraguchi, Chikara Furusawa, Hiroaki Machiyama, Tomonobu M, Watanabe, Hideaki Fujita, Shimon Sakaguchi, Toshio Yanagida

International Immunology 31(11) 743-753 2019年5月査読有り
Structural Modeling of Lymphocyte Receptors and Their Antigens.

Songling Li, Jan Wilamowski, Shunsuke Teraguchi, Floris J van Eerden, John Rozewicki, Ana Davila, Zichang Xu, Kazutaka Katoh, Daron M Standley

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2048 207-229 2019年
Identification of a two-SNP PLA2R1 Haplotype and HLA-DRB1 Alleles as Primary Risk Associations in Idiopathic Membranous Nephropathy

Khun Zaw Latt, Kenjiro Honda, Myo Thiri, Yuki Hitomi, Yosuke Omae, Hiromi Sawai, Yosuke Kawai, Shunsuke Teraguchi, Kazuko Ueno, Masao Nagasaki, Akihiko Mabuchi, Hajime Kaga, Atsushi Komatsuda, Katsushi Tokunaga, Eisei Noiri

Scientific Reports 8(1) 2018年10月査読有り
Estimation of diffusion constants from single molecular measurement without explicit tracking

Shunsuke Teraguchi, Yutaro Kumagai

BMC Systems Biology 12(S1) 2018年4月11日査読有り
Mapping circulating serum miRNAs to their immune-related target mRNAs.

Bakhtiyor Nosirov, Joël Billaud, Alexis Vandenbon, Diego Diez, Edward Wijaya, Ken J Ishii, Shunsuke Teraguchi, Daron M Standley

Advances and applications in bioinformatics and chemistry : AABC 10 1-9 2017年査読有り
Genome-wide map of RNA degradation kinetics patterns in dendritic cells after LPS stimulation facilitates identification of primary sequence and secondary structure motifs in mRNAs

Yutaro Kumagai, Alexis Vandenbon, Shunsuke Teraguchi, Shizuo Akira, Yutaka Suzuki

BMC GENOMICS 17(S13) 2016年12月査読有り
A rare subset of skin-tropic regulatory T cells expressing Il10/Gzmb inhibits the cutaneous immune response

Ryoyo Ikebuchi, Shunsuke Teraguchi, Alexis Vandenbon, Tetsuya Honda, Francis H. W. Shand, Yasutaka Nakanishi, Takeshi Watanabe, Michio Tomura

SCIENTIFIC REPORTS 6(1) 2016年10月査読有り
Immuno-Navigator, a batch-corrected coexpression database, reveals cell type-specific gene networks in the immune system

Alexis Vandenbon, Viet H. Dinh, Norihisa Mikami, Yohko Kitagawa, Shunsuke Teraguchi, Naganari Ohkura, Shimon Sakaguchi

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(17) E2393-E2402 2016年4月査読有り
Dynamics of enhancers in myeloid antigen presenting cells upon LPS stimulation

Alexis Vandenbon, Shunsuke Teraguchi, Osamu Takeuchi, Yutaka Suzuki, Daron M. Standley

BMC GENOMICS 15(Suppl 10) S4 2014年12月査読有り
Intrinsic Disorder Mediates Cooperative Signal Transduction in STIM1

Yukio Furukawa, Shunsuke Teraguchi, Takahisa Ikegami, Onur Dagliyan, Lin Jin, Damien Hall, Nikolay V. Dokholyan, Keiichi Namba, Shizuo Akira, Tomohiro Kurosaki, Yoshihiro Baba, Daron M. Standley

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 426(10) 2082-2097 2014年5月査読有り
Community-wide evaluation of methods for predicting the effect of mutations on protein-protein interactions

Rocco Moretti, Sarel J. Fleishman, Rudi Agius, Mieczyslaw Torchala, Paul A. Bates, Panagiotis L. Kastritis, João P. G. L. M. Rodrigues, Mikaël Trellet, Alexandre M. J. J. Bonvin, Meng Cui, Marianne Rooman, Dimitri Gillis, Yves Dehouck, Iain Moal, Miguel Romero-Durana, Laura Perez-Cano, Chiara Pallara, Brian Jimenez, Juan Fernandez-Recio, Samuel Flores, Michael Pacella, Krishna Praneeth Kilambi, Jeffrey J. Gray, Petr Popov, Sergei Grudinin, Juan Esquivel-Rodríguez, Daisuke Kihara, Nan Zhao, Dmitry Korkin, Xiaolei Zhu, Omar N. A. Demerdash, Julie C. Mitchell, Eiji Kanamori, Yuko Tsuchiya, Haruki Nakamura, Hasup Lee, Hahnbeom Park, Chaok Seok, Jamica Sarmiento, Shide Liang, Shusuke Teraguchi, Daron M. Standley, Hiromitsu Shimoyama, Genki Terashi, Mayuko Takeda-Shitaka, Mitsuo Iwadate, Hideaki Umeyama, Dmitri Beglov, David R. Hall, Dima Kozakov, Sandor Vajda, Brian G. Pierce, Howook Hwang, Thom Vreven, Zhiping Weng, Yangyu Huang, Haotian Li, Xiufeng Yang, Xiaofeng Ji, Shiyong Liu, Yi Xiao, Martin Zacharias, Sanbo Qin, Huan-Xiang Zhou, Sheng-You Huang, Xiaoqin Zou, Sameer Velankar, Joël Janin, Shoshana J. Wodak, David Baker

Proteins: Structure, Function and Bioinformatics 81(11) 1980-1987 2013年11月査読有り
A Parzen window-based approach for the detection of locally enriched transcription factor binding sites

Alexis Vandenbon, Yutaro Kumagai, Shunsuke Teraguchi, Karlou Mar Amada, Shizuo Akira, Daron M. Standley

BMC BIOINFORMATICS 14(1) 26 2013年1月査読有り
Systems biology approaches to toll-like receptor signaling

Alexis Vandenbon, Shunsuke Teraguchi, Shizuo Akira, Kiyoshi Takeda, Daron M. Standley

WILEY INTERDISCIPLINARY REVIEWS-SYSTEMS BIOLOGY AND MEDICINE 4(5) 497-507 2012年9月査読有り

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MISC

A rare subset of skin-tropic regulatory T cells expressing Il10/Gzmb inhibits the cutaneous immune response

Michio Tomura, Ryoyo Ikebuchi, Shunsuke Teraguchi, Alexis Vandenbon, Shand H. W. Francis, Tetsuya Honda

JOURNAL OF IMMUNOLOGY 198(1) 2017年5月

講演・口頭発表等

Structural modeling of T cell receptor and its application

寺口俊介

第4回理論免疫学ワークショップ 2020年1月11日招待有り
理論とデータで駆動する免疫学の融合研究

寺口俊介

第74回インシリコ・メガバンク研究会 2016年8月28日招待有り
A theoretical physicist in an immunology lab

寺口俊介

EQ研夏の学校2010 2010年9月2日

共同研究・競争的資金等の研究課題

T細胞受容体の抗原エピトープを予測する機械学習システムの開発、検証、及び、応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

寺口俊介, 榊原修平

寺口俊介

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研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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