松田知己 (Tomoki Matsuda) - マイポータル

基本情報

所属: 北里大学理学部生物科学科教授

学位: 工学修士(大阪大学)
博士（理学）(大阪大学)

J-GLOBAL ID: 201801018084520963
researchmap会員ID: B000331153

研究キーワード

蛋白質科学、バイオイメージング、蛍光蛋白質、光遺伝学、構造生物学、細胞間相互作用

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

北里大学, 理学部生物科学科, 教授
2013年9月 - 2024年3月

大阪大学, 産業科学研究所, 准教授
2012年4月 - 2013年8月

大阪大学, 産業科学研究所, 助教
2008年4月 - 2012年3月

北海道大学, 電子科学研究所, 助教
2007年7月 - 2008年3月

財団法人医療機器センター, 派遣先：北海道大学電子科学研究所, 非常勤職員
2005年7月 - 2007年6月

北海道大学, 電子科学研究所, 非常勤研究員
2004年3月 - 2005年6月

理化学研究所, ゲノム科学総合研究センター, リサーチアソシエイト
2004年1月 - 2004年2月

科学技術振興機構, 派遣先：大阪大学蛋白質研究所, 研究支援員

学歴

2000年4月 - 2003年12月

大阪大学大学院, 理学研究科, 化学専攻博士後期課程
1999年4月 - 2000年3月

大阪大学大学院, 工学研究科, 物質・生命工学専攻博士後期課程
1997年4月 - 1999年3月

大阪大学大学院, 工学研究科, 物質・生命工学専攻博士前期課程
1993年4月 - 1997年3月

大阪大学, 工学部, 応用生物工学科

委員歴

2022年1月 - 現在

日本生物物理学会, 分野別専門委員
2024年6月 - 2025年5月

日本蛋白質科学会, 蛋白質科学会アーカイブ編集委員
2017年6月 - 2024年5月

日本蛋白質科学会, 蛋白質科学会アーカイブ編集委員長
2019年1月 - 2019年12月

日本生物物理学会, 分野別専門委員

論文

Reversibly photoswitchable fluorescent proteins: integrating photophysics, photochemistry, bioimaging, and protein engineering

Ryohei Ozaki-Noma, Tetsuichi Wazawa, Kai Lu, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai

Nanoscale 18(5) 2448-2474 2026年査読有り
Genetically-encoded temperature indicators for thermal biology

Tetsuichi Wazawa, Ryohei Ozaki-Noma, Lu Kai, Shun-ichi Fukushima, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai

Biophysics and Physicobiology 2025年査読有り
High-affinity tuning of single fluorescent protein-type indicators by flexible linker length optimization in topology mutant

Yusuke Hara, Aya Ichiraku, Tomoki Matsuda, Ayuko Sakane, Takuya Sasaki, Takeharu Nagai, Kazuki Horikawa

Communications Biology 7(1) 2024年6月8日査読有り
Near-infrared PAINT localization microscopy via chromophore replenishment of phytochrome-derived fluorescent tag

Kai Lu, Tetsuichi Wazawa, Tomoki Matsuda, Daria M. Shcherbakova, Vladislav V. Verkhusha, Takeharu Nagai

Communications Biology 7(1) 2024年4月18日査読有り
Improvement of the Green–Red Förster Resonance Energy Transfer-Based Ca2+ Indicator by Using the Green Fluorescent Protein, Gamillus, with a Trans Chromophore as the Donor

Tomoki Matsuda, Shinya Sakai, Kei-ichi Okazaki, Takeharu Nagai

ACS Sensors 2024年3月査読有り筆頭著者責任著者
Protocol to visualize trans-interaction of clustered protocadherin using cIPAD, a fluorescent indicator, in cultured human cells and mouse neurons

Takashi Kanadome, Natsumi Hoshino, Takeharu Nagai, Takeshi Yagi, Tomoki Matsuda

STAR Protocols 5(1) 102844-102844 2024年3月査読有り
Visualization of trans-interactions of a protocadherin-α between processes originating from single neurons

Takashi Kanadome, Natsumi Hoshino, Takeharu Nagai, Takeshi Yagi, Tomoki Matsuda

iScience 26(7) 107238-107238 2023年7月査読有り最終著者責任著者
Selective plane activation structured illumination microscopy

Kenta Temma, Ryosuke Oketani, Toshiki Kubo, Kazuki Bando, Shunsuke Maeda, Kazunori Sugiura, Tomoki Matsuda, Rainer Heintzmann, Tatsuya Kaminishi, Koki Fukuda …

2023年6月19日
Visualization of trans homophilic interaction of clustered protocadherin in neurons

Natsumi Hoshino*, Takashi Kanadome*(*co-first), Mizuho Itoh, Ryosuke Kaneko, Yukiko U. Inoue, Takayoshi Inoue, Takahiro Hirabayashi, Masahiko Watanabe, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai …

bioRxiv 2023年4月
Development of intensiometric indicators for visualizing N-cadherin interaction across cells

Takashi Kanadome, Kanehiro Hayashi, Yusuke Seto, Mototsugu Eiraku, Kazunori Nakajima, Takeharu Nagai, Tomoki Matsuda

Communications Biology 5(1) 1065-1065 2022年10月7日査読有り最終著者責任著者
Structure‐based analysis and evolution of a monomerized red‐colored chromoprotein from the Olindias formosa jellyfish

Le Zhai, Ryosuke Nakashima, Hajime Shinoda, Yoshimasa Ike, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai

Protein Science 31(5) 2022年5月査読有り
Nonlinear confocal microscopy using visible-wavelength two-photon activation of fluorescent proteins

Toshiki Kubo, Kenta Temma, Kazunori Sugiura, Hajime Shinoda, Kai Lu, Nicholas I. Smith, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai, Katsumasa Fujita

Multiphoton Microscopy in the Biomedical Sciences XXII 2022年3月7日
Fluorescence Imaging of Extracellular Potassium Ion Using Potassium Sensing Oligonucleotide.

Shinobu Sato, Shinsuke Ohzawa, Kojiro Sota, Naoto Sakamoto, Ayano Udo, Shinji Sueda, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai, Shigeori Takenaka

Frontiers in chemistry 10 922094-922094 2022年査読有り
Development of FRET-based indicators for visualizing homophilic trans interaction of a clustered protocadherin

Takashi Kanadome, Natsumi Hoshino, Takeharu Nagai, Tomoki Matsuda, Takeshi Yagi

Scientific Reports 11(1) 22237-22237 2021年12月査読有り責任著者
Stepwise synaptic plasticity events drive the early phase of memory consolidation

Akihiro Goto, Ayaka Bota, Ken Miya, Jingbo Wang, Suzune Tsukamoto, Xinzhi Jiang, Daichi Hirai, Masanori Murayama, Tomoki Matsuda, Thomas J. McHugh …

Science 374(6569) 857-863 2021年11月12日査読有り
Ratiometric Bioluminescent Indicator for a Simple and Rapid Measurement of Thrombin Activity Using a Smartphone.

Mitsuru Hattori, Nae Sugiura, Tetsuichi Wazawa, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai

Analytical chemistry 2021年9月27日査読有り
Visible-Wavelength Multiphoton Activation Confocal Microscopy

Toshiki Kubo, Kenta Temma, Kazunori Sugiura, Hajime Shinoda, Kai Lu, Nicholas Isaac Smith, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai, Katsumasa Fujita

ACS Photonics 8(9) 2666-2673 2021年9月15日査読有り
Multicolor Bioluminescence Imaging of Subcellular Structures and Multicolor Calcium Imaging in Single Living Cells.

Kazushi Suzuki, Md Nadim Hossain, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2350 229-237 2021年査読有り
Method for Detecting Emission Spectral Change of Bioluminescent Ratiometric Indicators by a Smartphone.

Mitsuru Hattori, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2274 295-304 2021年査読有り
Hyperspectral two-photon excitation microscopy using visible wavelength.

Toshiki Kubo, Kenta Temma, Nicholas I Smith, Kai Lu, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai, Katsumasa Fujita

Optics letters 46(1) 37-40 2021年1月1日査読有り

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MISC

蛍光タンパク質プローブによる細胞間相互作用の可視化

京卓志, 永井健治, 松田知己

医学のあゆみ 286(5) 329-335 2023年9月最終著者責任著者
蛍光・生物発光タンパク質を利用した機能分子の開発

松田知己, 服部満, 永井健治

材料の科学と工業 28(3) 243-246 2022年3月筆頭著者
多色の光増感蛍光タンパク質を用いた複数機能の個別破壊

松田知己, 永井健治

多色の光増感蛍光タンパク質を用いた複数機能の個別破壊 4(4) 61-65 2020年4月筆頭著者責任著者
バイオセンサ

服部満, 松田知己, 永井健治

炎症と免疫 28(3) 243-246 2020年3月査読有り
光増感蛍光タンパク質を用いた多色機能破壊

松田知己, 永井健治

細胞 52(2) 47-50 2020年1月査読有り筆頭著者責任著者
高輝度発光タンパク質による高感度バイオイメージング

松田知己, 永井健治

光学 49(1) 26-30 2020年1月査読有り筆頭著者
Fluorescent protein-based indicators for functional super-resolution imaging of biomolecular activities in living cells

Kai Lu, Cong Quang Vu, Tomoki Matsuda, Takeharu Nagai

International Journal of Molecular Sciences 20(22) 2019年11月2日
蛍光マグネシウムイオンプローブの開発とそれを利用した新たな染色体凝縮メカニズムの解明

前島一博, 松田知己, 永井健治

Journal of Japanese society for Magnesium Research 37 13-18 2019年招待有り
Analysis of the Dynamics of a Multi-Drug Exporter AcrB in the Absence and Presence of Substrates

Tomoki Matsuda, Seiji Yamasaki, Kunihiko Nishino, Takeharu Nagai, Akihito Yamaguchi

BIOPHYSICAL JOURNAL 112(3) 509A-509A 2017年2月
遺伝子工学的に開発した蛍光プローブによる細胞生理機能超解像イメージング

和沢鉄一, 新井由之, 河原吉伸, 中野雅裕, 松田知己, 鷲尾隆, 永井健治

人工知能学会全国大会論文集 2017 2I4OS10b4-2I4OS10b4 2017年
1D33 マイクロ弾性パターニングゲル上での硬領域指向性細胞運動における接着班パキシリンの動態イメージング

KUBOKI Thasaneeya, MATSUDA Tomoki, ARAI Yoshiyuki, NAGAI Takeharu, KIDOAKI Satoru

バイオエンジニアリング講演会講演論文集 2016(28) "1D33-1"-"1D33-4" 2016年1月9日
蛍光スイッチングイメージング : 光スイッチング蛍光タンパク質を利用したバイオイメージング技術 (特集無限 : 複数の波長の可能性)

松田知己, 永井健治

光アライアンス 26(11) 1-5 2015年11月
光スイッチング機能プローブで挑む細胞の個性 (特集細胞の少数性と多様性に挑む : シングルセルアナリシス) -- (シングルセルアナリシスへ向けた技術開発)

松田知己, 永井健治

生体の科学 65(2) 101-106 2014年3月
Structure Analysis of Ultramarine Fluorescent Protein Sirius

Tomoki Matsuda, Nobuo Noda, Fuyuhiko Inagaki, Takeharu Nagai

BIOPHYSICAL JOURNAL 104(2) 72A-72A 2013年1月
生体組織内の1細胞レベルでの機能イメージングを可能にする光活性化型生理機能プローブ

松田知己, 堀川一樹, 永井健治

バイオイメージング 20(2) 185-186 2011年8月10日
光遺伝学的ツールとの併用に相応しい自動発光性Ca^<2+>指示薬による神経細胞のビデオレートイメージング

張郁芬, 齊藤健太, 堀川一樹, 松田知己, 新井由之, 永井健治

バイオイメージング 20(2) 175-176 2011年8月10日
単量体型光増感蛍光蛋白質mKillerRedの結晶構造解析

坂井直樹, 北郷悠, 竹本研, 松田知己, 綾部時芳, 永井健治

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 73 2010年5月15日
光スイッチング蛍光タンパク質を用いた生細胞内でのタンパク質動態定量法(C.蛋白質,核酸,カルシウムのイメージング)

永井健治, 松田知己

組織細胞化学 2009 99-105 2009年7月10日
蛍光蛋白質KillerRedのS‐SAD法による結晶構造解析

坂井直樹, 北郷悠, 竹本研, 松田知己, 永井健治

日本結晶学会年会講演要旨集 2009 40 2009年
vanX酵素活性が大腸菌の細胞壁合成に与える影響

惣谷志保里, 石原謙一郎, 泉川直重, 松田知己, 池上貴久, 中村春木, 黒田裕

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 8th 116 2008年5月23日

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書籍等出版物

先端の分析法

沢田, 嗣郎, 小澤, 岳昌, 北森, 武彦, 中村, 洋, 藤浪, 眞紀, 宮村, 一夫 (担当:共著, 範囲:原理編第3章プローブ 2、316-323 , 永井健治; 松田知己; 鈴木和志; 篠田肇)

エヌ・ティー・エス 2022年1月 (ISBN: 9784860437374)
Optogenetics: Light-Sensing Proteins and Their Applications in Neuroscience and Beyond (Advances in Experimental Medicine and Biology, 1293)

八尾, 寛, 神取, 秀樹, 小泉, 周, 影山, 龍一郎 (担当:共著, 範囲:PartIII Optogenetics in Biological Systems, 265-279 Genetically Encoded Photosensitizer for Destruction of Protein or Cell Function, Riani Y.D., Matsuda T., Nagai T.)

Springer 2021年1月6日 (ISBN: 9811587620)
Live cell imaging : methods and protocols

Hattori M, Matsuda T, Nagai T (担当:共著, 範囲:Vol. 2274, Live Cell Imaging, 295-304, 2. Method for Detecting Emission Spectral Change of Bioluminescent Ratiometric Indicators by a Smartphone, Hattori M; Matsuda T; Nagai T)

2021年 (ISBN: 9781071612576)
発光イメージング実験ガイド : 機能イメージングから細胞・組織・個体まで蛍光で観えないものを観る!

永井, 健治, 小澤, 岳昌 (担当:分担執筆, 範囲:蛍光／発光バイモーダルプローブ, 松田知己, Israt Farhana, 永井健治, 発展編 5, 198-202)

羊土社 2019年10月 (ISBN: 9784758122405)
生きてるものは全部観る!イメージングの選び方・使い方100+

原田, 慶恵, 永井, 健治 (担当:分担執筆, 範囲:蛍光タンパク質 ⅱ．カルシウム指示薬 / 蛍光タンパク質 ⅴ．マグネシウム指示薬, 松田知己, 永井健治, 第9章59、153-15 / 62、160-161)

羊土社 2018年12月 (ISBN: 9784758103756)
ビジュアルバイオテクノロジー

Dehlinger, Carolyn, 福井, 希一, 内山, 進, 松田, 史生 (担当:分担執筆, 範囲:バイオインフォマティクス：ゲノミクス，プロテオミクス，フェノミクス, 松田知己, 第3章, 48-72)

化学同人 2017年4月 (ISBN: 9784759819205)
初めてでもできる!超解像イメージング : STED、PALM、STORM、SIM、顕微鏡システムの選定から撮影のコツと撮像例まで

岡田, 康志 (担当:分担執筆, 範囲:超解像イメージングに利用する光スイッチング蛍光タンパク質の種類と特性, 松田知己, 永井健治, 第3章 1, 138-145)

羊土社 2016年7月 (ISBN: 9784758101950)
新・生細胞蛍光イメージング

原口, 徳子, 木村, 宏(生物学), 平岡, 泰 (担当:分担執筆, 範囲:蛍光タンパク質の利用, 永井健治, 松田知己, 第13章, 114-126; 7. スペクトルイメージングによるFRETの検出, 原口徳子, 永井健治, 松田知己, 実習7-1, 299-302)

共立出版 2015年11月 (ISBN: 9784320057791)
発光の事典 : 基礎からイメージングまで

木下, 修一, 太田, 信廣, 永井, 健治, 南, 不二雄 (担当:分担執筆, 範囲:光退色/光活性化を利用したイメージング（FRAP, FDAP）, 松田知己, 永井健治, 7.3.6, 661-668)

朝倉書店 2015年9月 (ISBN: 9784254102628)
1分子ナノバイオ計測 : 分子から生命システムを探る革新的技術

野地, 博行 (担当:分担執筆, 範囲:蛍光タンパク質が拓く超解像技術, 永井健治, 松田知己, 15章, 190-199)

化学同人 2014年6月 (ISBN: 9784759807530)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

領域研究「細胞外情報を統御するマルチモーダルECM」の統括と運営

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

藤原裕展, 木戸屋浩康, 島村徹平, 高橋淑子, 鳴瀧彩絵, 秋元文, 長山雅晴, 出口真次, 永樂元次, 関口清俊, 松田知己, 高田慎治, 岸田晶夫, 大槻純男, 三輪佳宏, 三井優輔, 山城義人, 秋吉一成, 板倉英祐
ECMダイナミクスの可視化・光操作技術開発とin vivo解析の基盤整備

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

松田知己, 三輪佳宏
記憶を司るシナプス微小構造の時空間ダイナミクス

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2020年 - 2025年

林康紀
心筋再生療法のメカニズム究明のための心筋ミトコンドリア機能のイメージング

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

森大輔, 澤芳樹, 永井健治, 寒川延子, 松田知己, 宮川繁
脳構築における発生時計と場の連携

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2021年4月 - 2022年3月

影山龍一郎, 仲嶋一範, 後藤由季子, 見学美根子, 永樂元次, 花嶋かりな, 安達泰治, 松田知己
脳構築における発生時計と場の連携

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年6月 - 2021年3月

影山龍一郎, 見学美根子, 安達泰治, 永樂元次, 松田知己, 後藤由季子, 花嶋かりな, 仲嶋一範
脳組織構築過程で移動する神経細胞と取り巻く場の可視化と光操作

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年6月 - 2021年3月

松田知己
新規インバースタイプのカルシウムプローブを用いた抑制性神経活動測定法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

久下小百合, 石原健, 寺本孝行, 永井健治, 松田知己
少数性生物学ー個と多数の狭間が織りなす生命現象の探求ー

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2016年3月

永井健治, 上田泰己, 石島秋彦, 今田勝巳, 前島一博, 野地博行, 冨樫祐一, 新井由之, 松田知己, 吉村成弘, 堀川一樹, 渡邉朋信, 藤田克昌, 金原数, 山東信介, 竹内昌治, 小松崎民樹, 岡田康志, 原田慶恵
分子プローブと光摂動ツールの開発－少数生体分子の可視化・操作技術－

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2016年3月

永井健治, 金原数, 堀川一樹, 山東信介, 浦野泰照, 小澤岳昌, 松田知己, 新井由之
立体構造情報を利用した高輝度蛍光タンパク質の合理的なデザイン法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2009年4月 - 2013年3月

松田知己
個体・組織での１細胞機能イメージングを可能にする光活性化機能センサータンパク質

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

松田知己
立体構造情報を利用した蛍光イメージング用バイオセンサーの設計法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2006年 - 2008年

松田知己, 永井健治
Study on interaction mechanism of the protein-ligand complex
蛋白質基質複合体における相互作用メカニズムの研究

松田知己

基本情報

研究キーワード

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論文

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書籍等出版物

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