菊地泰生 (Taisei Kikuchi) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院新領域創成科学研究科　先端生命科学専攻教授

研究者番号: 20353659
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-2759-9167
J-GLOBAL ID: 200901066320427184
researchmap会員ID: 5000101224

研究分野

経歴

2022年7月 - 現在

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科
- 2022年6月

宮崎大学医学部寄生虫学分野, 准教授

論文

141

A chromosome-level genome of the lethal tapeworm Sparganum proliferum, with candidate genomic safe harbours for functional genetics

Atsushi Hikima, Simo Sun, Tetsuya Okino, Kensei Kinoshita, Akemi Yoshida, Yasunobu Maeda, Kenji Ishiwata, Hirotaka Kanuka, Taisei Kikuchi

Journal of Heredity 2026年7月2日
Uncovering cryptic coral species in Japan’s precious coral fishery: Conservation and sustainable management implications

Kenji Takata, Takeshi Hayashibara, Masanori Nonaka, Bertalan Lendvay, Tzu-Hsuan Tu, Federica Costantini, Holly Bolick, Hiroshi Namikawa, Naoko Ishikawa, Yoshihisa Suyama …

Global Ecology and Conservation 67 e04125-e04125 2026年6月
Active and unusually expanded PIF/Harbinger transposable elements in the Caenorhabditis inopinata genome

Kazuki Sato, Xiaodan Jin, Shun Oomura, Kazuma Kawahara, Simo Sun, Akemi Yoshida, Nami Haruta, Asako Sugimoto, Taisei Kikuchi

2026年5月29日
Illuminating Deep Reef Refugia: Horizontal and Vertical Genomic Connectivity of Seriatopora hystrix in the Ryukyu Islands, Japan

Kenji Takata, Yuji Narita, Nanami Noguchi, Satoshi Nagai, Taisei Kikuchi, Yoshihisa Suyama, Frederic Sinniger, Saki Harii, Nina Yasuda

Molecular Ecology 35(10) 2026年5月21日
Morphological and Phylogenomic Insights Into Hidden Diversity in Coralliidae With Description of a New Species Paraminabea xishaensis sp. nov. From the South China Sea

Biying Luan, Fei Xia, Kenji Takata, Taisei Kikuchi, Nina Yasuda, Yonghong Liu, Xinming Liu

Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 2026年1月
Expanded <scp>28S rRNA</scp> Dataset for Environmental <scp>DNA</scp> Detection of Mesophotic and Deep‐Sea Octocorals in the Western Pacific

Kenji Takata, Masanori Nonaka, Holly Bolick, Hiroshi Namikawa, Fei Xia, Taisei Kikuchi, Nina Yasuda

Ecological Research 41(1) 2025年12月22日
Proteomic Dataset of Sparganum proliferum and Spirometra mansoni to Understand Asexual Proliferation in Hosts

Akito Fujihira, Kensei Kinoshita, Atsushi Hikima, Asuka Kounosu, Yasunobu Maeda, Kuniyo Sakamoto, Yoko Kondo, Taisei Kikuchi

Scientific Data 2025年12月10日
Programmed DNA elimination was present in the last common ancestor of Caenorhabditis nematodes

Lewis Stevens, Simo Sun, Nami Haruta, Leyun Xiao, Naoki Uwatoko, Manuela Kieninger, Kazuki Sato, Akemi Yoshida, Dominic Absolon, Joanna Collins …

2025年10月24日
Microparticle Bombardment as a Method for Transgenesis in Auanema and Tokorhabditis.

Tatsuya Yamashita, Andre Pires-daSilva, Shun Oomura, Taichi Kusano, Nami Haruta, Mayu Hasumi, Taisei Kikuchi, Sally Adams, Asako Sugimoto, Ryoji Shinya

microPublication biology 2025 2025年
The complete mitochondrial genome of Pleurocorallium inutile (Octocorallia: Scleralcyonacea: Coralliidae)

Takata, K., Nonaka, M., Xia, F., Kikuchi, T., Gibu, K., Yasuda, N.

Molecular Biology Reports 52(1) 2025年
Small non-coding RNAs have predicted roles in reproductive biology and transposable element regulation in the parasitic worm Strongyloides venezuelensis

Lastik, D., Kounosu, A., Dayi, M., Yoshida, A., Fujihira, A., Reynolds, K., Hunt, V.L., Kikuchi, T.

Scientific Reports 15(1) 2025年
Rapid chromosome evolution and acquisition of thermosensitive stochastic sex determination in nematode androdioecious hermaphrodites

Kohta Yoshida, Hanh Witte, Ryo Hatashima, Simo Sun, Taisei Kikuchi, Waltraud Röseler, Ralf J. Sommer

Nature Communications 15(1) 2024年11月7日
Effect of the frequency of multi-specific synchronous spawning on genetic introgression among three Acropora species

Naoko Isomura, Keisuke Inoha, Akifumi Shimura, Nina Yasuda, Taisei Kikuchi, Kenji Iwao, Seiya Kitanobo, Shun Ohki, Masaya Morita, Hironobu Fukami

Coral Reefs 43(5) 1497-1509 2024年10月
Evolutionary changes of noncoding elements associated with transition of sexual mode in Caenorhabditis nematodes

Katsunori Tamagawa, Mehmet Dayi, Simo Sun, Rikako Hata, Taisei Kikuchi, Nami Haruta, Asako Sugimoto, Takashi Makino

Science Advances 10(37) 2024年9月13日
Aberrant sparganosis in cat caused by Spirometra mansoni (Cestoda: Diphyllobothriidae): a case report.

Toshihiro Tokiwa, Momo Fushimi, Shyun Chou, Akemi Yoshida, Kensei Kinoshita, Atsushi Hikima, Taisei Kikuchi, Kiyokazu Ozaki

BMC veterinary research 20(1) 148-148 2024年4月20日
Strongyloides questions-a research agenda for the future.

Reem Al-Jawabreh, Roy Anderson, Louise E Atkinson, Jack Bickford-Smith, Richard S Bradbury, Minka Breloer, Astra S Bryant, Dora Buonfrate, Luke C Cadd, Bethany Crooks …

Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences 379(1894) 20230004-20230004 2024年1月15日
Syntenic relationship of chromosomes in Strongyloides species and Rhabditophanes diutinus based on the chromosome-level genome assemblies

Asuka Kounosu, Simo Sun, Yasunobu Maeda, Mehmet Dayi, Akemi Yoshida, Haruhiko Maruyama, Vicky Hunt, Asako Sugimoto, Taisei Kikuchi

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 379(1894) 20220446-20220446 2024年1月15日
INCX3 PLASMID CARRYING BLASHV-12 AND QNRS1 IN A JAPANESE RACEHORSE-ORIGIN ESCHERICHIA COLI ISOLATE,PRISUSTVO PLAZMIDA INCX3 SA GENIMA REZISTENCIJE BLASHV-12 I QNRS1 U IZOLATU ESCHERICHIA COLI POREKLOM OD TRKAČKOG KONJA U JAPANU

Sukmawinata, E., Uemura, R., Nishiki, I., Yoshida, T., Sueyoshi, M., Kikuchi, T.

Veterinarski Glasnik 78(1) 2024年
Gastrointestinal Nematode Infections of Deer and Sheep in An Agritourism Farm in Bogor, Indonesia

Arif, R., Sukmawinata, E., Nurhidayah, N., Satrija, F., Nuradji, H., Wienanto, R., Kikuchi, T.

Philippine Journal of Veterinary Medicine 61(1) 2024年
Microbiome of Zoophytophagous Biological Control Agent Nesidiocoris tenuis

Yuta Owashi, Toma Minami, Taisei Kikuchi, Akemi Yoshida, Ryohei Nakano, Daisuke Kageyama, Tetsuya Adachi-Hagimori

Microbial Ecology 2023年9月2日

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MISC

Eight years of weekly eDNA monitoring in the North-Western Pacific

Sirje Sildever, Noriko Nishi, Satoshi Tazawa, Hiromi Kasai, Junya Hirai, Akihiro Shiomoto, Taisei Kikuchi, Seiji Katakura, Satoshi Nagai

Environmental DNA 5(6) 1202-1215 2023年11月
ミドリイシ属サンゴ集団における同調産卵と遺伝的構造の関係

磯村尚子, 伊野波佳介, 菊地泰生, 安田仁奈, 深見裕伸

日本生態学会大会講演要旨(Web) 68th 2021年
単為生殖型を持つStrongyloides線虫の性染色体の解析

鴻巣明日香, SIMO Sun, 吉田朱美, 村瀬一典, HUNT Vicky, 丸山治彦, 杉本亜砂子, 菊地泰生

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
小笠原と琉球列島・日本本土のオニヒトデ集団の遺伝構造の解明

袰岩美月, 飴田洋祐, 佐々木哲朗, 中村隆志, 菊地泰生, 湯淺英知, 谷中絢貴, 安田仁奈

DNA多型 28(1) 2020年
放精放卵型のオニヒトデの個体間に受精相性は存在するのか?

東村幸浩, 志村晶史, 袰岩美月, 菊地泰生, 湯淺英知, 野口七海, 谷中絢貴, 長井敏, 安田仁奈

日本生態学会大会講演要旨(Web) 66th 2019年
アオサンゴの隠蔽系統分布と異時的種分化の可能性

谷中絢貴, RICHARDS Zoe T., TANG Sen-Lin, 和田直久, 陶山佳久, 菊地泰生, 井口亮, 本郷悠貴, 安田仁奈

DNA多型 27(1) 2019年
多種同調産卵する地域におけるミドリイシ属サンゴ集団の遺伝的関係

磯村尚子, 原口弦大, 菊地泰生, 志村晶史, 袰岩美月, 安田仁奈, 深見裕伸

日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会講演要旨集 2019 2019年
カミキリによって誘導された耐久型線虫の遺伝子発現変化

田中克, 田中龍聖, 竹内祐子, 神崎菜摘, 菊地泰生, 福田健二

第127回日本森林学会大会学術講演集 127 160-365 2016年3月
Phenotype/genotype association for pathogenesis of the pine wood nematode, Bursaphelenchus xylophilus

Tetsuro Kato, Akira Kaneko, Mie N. Honjo, Atsushi J. Nagano, Hiroshi Kudoh, Kazuki Mori, Taisei Kikuchi, Satoru Kuhara, Kazuyoshi Futai, Yuko Takeuchi

Japan-Korea Joint Symposium on Nematology 2014 2014年9月
マツ材線虫病診断キットの開発

菊地泰生, 相川拓也, 神崎菜摘

林業と薬剤 (191) 12-18 2010年3月
マツノザイセンチュウのDNAを利用した簡易なマツ材線虫病診断ツール"マツ材線虫病診断キット"について

相川拓也, 神崎菜摘, 菊地泰生

森林防疫 59(2) 60-67 2010年

共同研究・競争的資金等の研究課題

機動性DNAエレメントと宿主がおりなす生物多様性創出：宿主対応と継世代伝播

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2025年4月 - 2030年3月

石黒啓一郎, 菊地泰生, 岩崎由香, 塩見美喜子, 有田恭平, 林剛介, 古関明彦
生物多様性を駆動する染色体再編成に関する基盤的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2024年4月 - 2027年3月

杉本亜砂子, 菊地泰生
極限環境に棲む線虫で切り拓く動物胎生化の適応的意義と進化プロセス研究

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2023年6月 - 2027年3月

新屋良治, 神崎菜摘, 菊地泰生
プログラムされた染色体削減の分子機構と生理的意義の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2023年6月 - 2026年3月

杉本亜砂子, 菊地泰生
C.elegans姉妹種を用いたトランスポゾンによるゲノム進化の理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

菊地泰生, 平形樹生, 杉本亜砂子
ウシ消化管内で共生するヒト病原細菌の空間・生態的特徴の解明と新たな防除法の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

井口純, 菊地泰生, 小椋義俊
線虫の生活様式多様化と種分化に関する統合的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

神崎菜摘, 菊地泰生, 新屋良治
線虫の生活様式多様化と種分化に関する統合的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

神崎菜摘, 菊地泰生, 新屋良治
寄生虫の分子同定と系統解析のための統一標準法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

丸山治彦, 菊地泰生, 長安英治
ゲノムワイド関連解析を用いたマツノザイセンチュウの病原性因子の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

秋庭満輝, 菊地泰生, 新屋良治
A群レンサ球菌が産生する細胞外小胞の病原性発揮機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

村瀬一典, 菊地泰生, 相川知宏
C.elegans姉妹種を用いた小分子RNAによるトランスポゾン制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2023年3月

菊地泰生, 平形樹生, 佐藤薫, 塩見美喜子
線虫近縁種間のゲノム比較およびゲノム改変による遺伝子回路リワイヤリング過程の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年7月 - 2020年3月

杉本亜砂子, 菊地泰生
バクテリア叢による寄生虫病制御に向けた相互作用解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2020年3月

菊地泰生, 丸山治彦
C. elegans最近縁種のゲノム、形態発生、生態解析に基づく比較進化研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

菊地泰生, 神崎菜摘, 杉本亜砂子
侵入地と原産地のマツノザイセンチュウの比較ゲノムと生態的特性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

秋庭満輝, 菊地泰生, 神崎菜摘
マツ材線虫病被害拡大の主因、線虫の二型性に遺伝学と化学で迫る

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

竹内祐子, 菊地泰生, 神崎菜摘, 福田健二, 土原和子, 田中克
芽殖孤虫のゲノム解読による条虫類幼虫における無性増殖機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

丸山治彦, 倉持利明, 菊地泰生
Caenorhabditis 属線虫を用いた新たなサテライトモデル系の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

神崎菜摘, 菊地泰生, 長谷川浩一, 田中龍聖
絶対寄生性線虫の全ゲノム増幅による次世代シーケンシング解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2012年4月 - 2016年3月

菊地泰生

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