内藤龍彦 (Tatsuhiko Naito) - マイポータル

基本情報

researchmap会員ID: R000030437

研究キーワード

経歴

2026年1月 - 現在

国立研究開発法人国立成育医療研究センター, エコチル調査研究部遺伝子解析室, 室長
2024年7月 - 現在

東京大学大学院医学系研究科, 遺伝情報学, 客員研究員
2023年1月 - 2025年12月

New York Genome Center, Postdoctoral Fellow
2023年1月 - 2025年10月

Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Postdoctoral Fellow
2023年4月 - 2025年3月

日本学術振興会海外特別研究員
2022年4月 - 2022年12月

大阪大学大学院医学系研究科, 遺伝統計学, 助教
2020年4月 - 2022年3月

日本学術振興会特別研究員（DC2）
2021年11月 - 2022年1月

Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Visiting Scholar
2018年10月 - 2019年3月

東京大学医学部附属病院神経内科
2018年4月 - 2018年9月

東京逓信病院神経内科
2017年4月 - 2018年3月

虎の門病院神経内科
2016年10月 - 2017年3月

東京共済病院神経内科
2015年4月 - 2016年9月

東京大学医学部附属病院神経内科
2013年4月 - 2015年3月

国立国際医療研究センター病院

学歴

2018年4月 - 2022年3月

東京大学, 大学院医学系研究科, 脳神経医学専攻神経内科学
2009年4月 - 2013年3月

東京大学, 医学部, 医学科
2007年4月 - 2009年3月

東京大学, 教養学部, 理科三類

受賞

2024年10月

奨励賞, 日本人類遺伝学会
2024年7月

Alzheimer’s Disease Research Fellowship, BrightFocus Foundation
2023年12月

第40回井上研究奨励賞, 井上科学振興財団
2022年3月

東京大学総長賞, 東京大学
2021年8月

若手研究者海外挑戦プログラム, 日本学術振興会
2021年6月

日本メディカルAI学会奨励賞優秀一般演題賞, 日本メディカルAI学会
2021年6月

第6回日本骨免疫学会優秀演題賞, 日本骨免疫学会
2019年2月

Honorable Prize, Bioinformatics Contest 2019

論文

A meta-analysis of single-nucleus expression quantitative trait loci linking genetic risk to brain disorders

Beomjin Jang, Kailash BP, Alex Tokolyi, Winston H. Dredge, Ashvin Ravi, Sang-Hyuk Jung, Tatsuhiko Naito, Beomsu Kim, Min Seo Kim, Minyoung Cho …

Nature Genetics 2026年3月19日査読有り
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in CLAD

Yasufumi Goda†, Tatsuhiko Naito†, Mudassir M. Banday, Andrew S. Potter, Igor Odintsov, Kapil Patel, Nicole Davis, Stefi Lee, Amit Gaggar, Ivan Rosas …

The Journal of Heart and Lung Transplantation 2026年2月査読有り筆頭著者
Leveraging functional annotations to map rare variants associated with Alzheimer disease with gruyere

Anjali Das, Chirag Lakhani, Chloé Terwagne, Jui-Shan T. Lin, Tatsuhiko Naito, Towfique Raj, David A. Knowles

The American Journal of Human Genetics 2025年8月査読有り
Deciphering state-dependent immune features from multi-layer omics data at single-cell resolution

Ryuya Edahiro, Go Sato, Tatsuhiko Naito, Yuya Shirai, Ryunosuke Saiki, Kyuto Sonehara, Yoshihiko Tomofuji, Kenichi Yamamoto, Shinichi Namba, Noah Sasa …

Nature Genetics 2025年7月28日査読有り
Polygenic scores for precision psychiatry: a study on the effect heterogeneity of antidepressants.

Ryunosuke Goto, Tatsuhiko Naito, Norbert Skokauskas, Kosuke Inoue

medRxiv : the preprint server for health sciences 2025年5月19日
Long-read RNA sequencing atlas of human microglia isoforms elucidates disease-associated genetic regulation of splicing

Jack Humphrey, Erica Brophy, Roman Kosoy, Biao Zeng, Elena Coccia, Daniele Mattei, Ashvin Ravi, Tatsuhiko Naito, Anastasia G. Efthymiou, Elisa Navarro …

Nature Genetics 57(3) 604-615 2025年3月3日査読有り
Germline variants and mosaic chromosomal alterations affect COVID-19 vaccine immunogenicity

Kyuto Sonehara, Yoshifumi Uwamino, Ryunosuke Saiki, Masaru Takeshita, Shinichi Namba, Shunsuke Uno, Tomoko Nakanishi, Tomoyasu Nishimura, Tatsuhiko Naito, Go Sato …

Cell Genomics 100783-100783 2025年3月査読有り
Contribution of germline and somatic mutations to risk of neuromyelitis optica spectrum disorder

Tomohiro Yata, Go Sato, Kotaro Ogawa, Tatsuhiko Naito, Kyuto Sonehara, Ryunosuke Saiki, Ryuya Edahiro, Shinichi Namba, Mitsuru Watanabe, Yuya Shirai …

Cell Genomics 100776-100776 2025年2月査読有り
Blood DNA virome associates with autoimmune diseases and COVID-19

Noah Sasa, Shohei Kojima, Rie Koide, Takanori Hasegawa, Ho Namkoong, Tomomitsu Hirota, Rei Watanabe, Yuumi Nakamura, Eri Oguro-Igashira, Kotaro Ogawa …

Nature Genetics 2025年1月3日査読有り
Machine learning reveals heterogeneous associations between environmental factors and cardiometabolic diseases across polygenic risk scores

Tatsuhiko Naito†, Kosuke Inoue†, Shinichi Namba, Kyuto Sonehara, Ken Suzuki, Koichi Matsuda, Naoki Kondo, Tatsushi Toda, Toshimasa Yamauchi, Takashi Kadowaki …

Communications Medicine 4(1) 2024年9月20日査読有り筆頭著者責任著者
Primary Aldosteronism and Risk of Cardiovascular Outcomes: Genome‐Wide Association and Mendelian Randomization Study

Kosuke Inoue†, Tatsuhiko Naito†, Ryosuke Fuji, Kyuto Sonehara, Kenichi Yamamoto, Ryuta Baba, Takaya Kodama, Yu Otagaki, Akira Okada, Kiyotaka Itcho …

Journal of the American Heart Association 13(15) 2024年8月5日査読有り筆頭著者
Common and rare genetic variants predisposing females to unexplained recurrent pregnancy loss

Kyuto Sonehara, Yoshitaka Yano, Tatsuhiko Naito, Shinobu Goto, Hiroyuki Yoshihara, Takahiro Otani, Fumiko Ozawa, Tamao Kitaori, Yuji Yamanashi, Yoichi Furukawa …

Nature Communications 15(1) 2024年7月17日査読有り
Quantification of escape from X chromosome inactivation with single-cell omics data reveals heterogeneity across cell types and tissues

Yoshihiko Tomofuji, Ryuya Edahiro, Kyuto Sonehara, Yuya Shirai, Kian Hong Kock, Qingbo S. Wang, Shinichi Namba, Jonathan Moody, Yoshinari Ando, Akari Suzuki …

Cell Genomics 100625-100625 2024年7月査読有り
CAGI, the Critical Assessment of Genome Interpretation, establishes progress and prospects for computational genetic variant interpretation methods

The Critical Assessment of Genome Interpretation Consortium

Genome Biology 25(1) 2024年2月22日査読有り
Multi-trait analysis characterizes the genetics of thyroid function and identifies causal associations with clinical implications

Rosalie B. T. M. Sterenborg†, Inga Steinbrenner†, Yong Li†, Melissa N. Bujnis†, Tatsuhiko Naito†, Eirini Marouli†, Tessel E. Galesloot, Oladapo Babajide, Laura Andreasen, Arne Astrup …

Nature Communications 15(1) 2024年1月30日査読有り筆頭著者
Genotype imputation methods for whole and complex genomic regions utilizing deep learning technology

Tatsuhiko Naito, Yukinori Okada

Journal of Human Genetics 69(10) 481-486 2024年1月15日査読有り招待有り筆頭著者
A Novel De Novo Variant in KCNH5 in a Patient with Refractory Epileptic Encephalopathy

Akihiko Mitsutake, Takashi Matsukawa, Tatsuhiko Naito, Hiroyuki Ishiura, Jun Mitsui, Hiroaki Harada, Keishi Fujio, Jun Fujishiro, Harushi Mori, Shinichi Morishita …

Internal Medicine 2024年査読有り
Multifaceted analysis of cross-tissue transcriptomes reveals phenotype–endotype associations in atopic dermatitis

Aiko Sekita, Hiroshi Kawasaki, Ayano Fukushima-Nomura, Kiyoshi Yashiro, Keiji Tanese, Susumu Toshima, Koichi Ashizaki, Tomohiro Miyai, Junshi Yazaki, Atsuo Kobayashi …

Nature Communications 14(1) 2023年10月2日査読有り
Multiancestry analysis of the HLA locus in Alzheimer’s and Parkinson’s diseases uncovers a shared adaptive immune response mediated by HLA-DRB1*04 subtypes

Yann Le Guen, Guo Luo, Aditya Ambati, Vincent Damotte, Iris Jansen, Eric Yu, Aude Nicolas, Itziar de Rojas, Thiago Peixoto Leal, Akinori Miyashita …

Proceedings of the National Academy of Sciences 120(36) 2023年8月29日査読有り
Genome-wide association study identifies risk loci within the major histocompatibility complex region for Hunner-type interstitial cystitis

Yoshiyuki Akiyama, Kyuto Sonehara, Daichi Maeda, Hiroto Katoh, Tatsuhiko Naito, Kenichi Yamamoto, Biobank Japan Project, Takayuki Morisaki, Shumpei Ishikawa, Tetsuo Ushiku …

Cell Reports Medicine 4(7) 101114-101114 2023年7月査読有り

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MISC

Germline and somatic mutations are associated with the risk of neuromyelitis optica spectrum disorder

Tomohiro Yata, Kotaro Ogawa, Go Sato, Tatsuhiko Naito, Kyuto Sonehara, Ryuya Edahiro, Shinichi Namba, Mitsuru Watanabe, Makoto Kinoshita, Takuya Matsushita …

MULTIPLE SCLEROSIS JOURNAL 31(3) 116-116 2025年9月
ゲノム情報とシングルセル解析の統合による神経免疫疾患に関連する体細胞変異の評価

矢田知大, 矢田知大, 矢田知大, 小河浩太郎, 佐藤豪, 佐藤豪, 佐藤豪, 内藤龍彦, 内藤龍彦, 曽根原究人 …

日本神経学会学術大会プログラム・抄録集 66th 2025年
孤発性・多因子性神経変性疾患の遺伝学的研究

内藤龍彦

BIO Clinica 39(12) 2024年11月筆頭著者
ゲノムワイド関連解析の活用法

内藤龍彦, 岡田随象

Medical Science Digest 50(11) 2024年10月筆頭著者
ヒト脳のオミクスデータベース

内藤龍彦, 岡田随象

実験医学増刊 42(7) 2024年4月筆頭著者
原発性アルドステロン症の遺伝的背景と高血圧への寄与

内藤龍彦

医学のあゆみ 288(13) 2024年3月筆頭著者
遺伝情報解析に対する深層学習の応用―HLA imputation法を例に

内藤龍彦

実験医学増刊 41(7) 2023年4月筆頭著者
1型糖尿病とHLA—MHC領域のファンマッピングによる疾患感受性アレルの解明

内藤龍彦, 岡田随象

臨床免疫・アレルギー科 76(5) 2021年11月筆頭著者
Trans-ethnic fine-mapping of the MHC region on Parkinson's disease identified shared genetic features associated with the risk

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Kotaro Ogawa, Ken Suzuki, Jun Hirata, Jia Foo, Ek Tan, Yukinori Okada, Tatsushi Toda

Journal of the Neurological Sciences 429 117854-117854 2021年10月
大規模データからのGWAS、その他の解析の最新事情

内藤龍彦, 岡田随象

実験医学増刊 39(7) 2021年5月筆頭著者
菌状息肉症に対し造血幹細胞移植後メソトレキセートを投与し出現した播種性壊死性脳症

河合三津保, 内藤龍彦, 間野達雄, 藤岡洋成, 本田晃, 遠山和博, 作石かおり, 清水潤, 黒川峰夫, 戸田達史

神経治療学 36(6) S233-S233 2019年10月
偽性核間性眼筋麻痺を呈したMiller Fisher症候群の1例

江頭柊平, 内藤龍彦, 関大成, 佐藤達哉, 勝又淳子, 坂内太郎, 中元ふみ子, 海田賢一, 椎尾康

日本内科学会関東地方会 652回 27-27 2019年7月査読有り
M232R変異による遺伝性クロイツフェルト・ヤコブ病が疑われた83歳男性例

鈴木祥代, 前川理沙, 中元ふみ子, 内藤龍彦, 佐藤達哉, 勝又淳子, 坂内太郎, 関大成, 日出山拓人, 椎尾康

臨床神経学 59(5) 303-303 2019年5月
肺炎球菌性髄膜炎に対して抗生剤加療中に広範な脳梗塞を合併した55歳男性剖検例

内藤龍彦, 平賢一郎, 林俊宏, 清水潤, 日向宗利, 田中真理子, 池村雅子, 村山繁雄

NEUROINFECTION 22(2) 235-235 2017年9月
水頭症を来した神経サルコイドーシスの1例

瀬戸瑛子, 羽尾曉人, 清水崇紘, 内藤龍彦, 間野かおり, 平賢一郎, 作石かおり, 林俊宏, 辛正廣, 辻省次

日本内科学会関東地方会 626回 45-45 2016年9月
細菌性髄膜炎の経過中に脳梗塞を合併した一例

貝梅正文, 福田直到, 園生智弘, 石井健, 土井研人, 平賢一郎, 寺尾安生, 内藤龍彦, 辻省次, 中島勧 …

日本救急医学会雑誌 26(8) 490-490 2015年8月

書籍等出版物

HLA Typing 2nd Edition: Methods and Protocols

Sebastian Boegel (担当:分担執筆, 範囲:Deep learning-based HLA allele imputation applicable to GWAS)

Springer Nature 2024年
ヒトの分子遺伝学

Strachan, T., Read, A. P. (Andrew), 戸田, 達史, 井上, 聡, 松本, 直通 (担当:共訳, 範囲:第11章ヒトの遺伝的多様性の概要)

メディカル・サイエンス・インターナショナル 2021年10月 (ISBN: 9784815730321)

講演・口頭発表等

Decoding Splicing in Alzheimer’s Disease via Long-Read RNA-Seq and Deep Learning

Tatsuhiko Naito

Gordon Research Conference on Alzheimer’s Disease 2025年6月25日
遺伝統計学による原発性アルドステロン症の病態解明

内藤龍彦, 岡田随像

第98回日本内分泌学会学術総会 2025年6月6日招待有り
神経変性疾患発症におけるRNAスプライシングの役割ーロングリードから深層学習までー

内藤龍彦

第65回日本神経学会学術大会 2025年5月24日招待有り
Understanding the role of APOE genotype in the genetic regulation of gene expression and splicing in human microglia

Tatsuhiko Naito, Jack Humphrey, Connie Ha, Karthik Raju, Kathryn M. Monroe, Thomas Sandmann, Michael E. Belloy, David A. Knowles, Shan V. Andrews, Towfique Raj

American Society of Human Genetics 2024年11月
Decoding disease and HLA-specific regulation of the T cell receptor repertoire in Parkinson's disease

Tatsuhiko Naito, Ricardo Vialle, Kazuyoshi Ishigaki, Yukinori Okada, David A. Knowles, Towfique Raj

American Society of Human Genetics 2023年11月3日
多因子性・孤発性神経疾患のゲノム医学・医療

内藤龍彦

第53回日本神経精神薬理学会年会 2023年9月招待有り
機械学習とAIの遺伝学研究への応用

内藤龍彦

第63回日本神経学会学術大会 2022年5月招待有り
Trans-ethnic fine-mapping in the major histocompatibility complex region on Parkinson's disease risk

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Kotaro Ogawa, Ken Suzuki, Jun Hirata, Jia Nee Foo, Eng-King Tan, Tatsushi Toda, Yukinori Okada

American Society of Human Genetics 2021年10月
MHC領域のtrans-ethnic fine-mappingによるParkinson病の遺伝的リスクの解明

内藤龍彦, 佐竹渉, 小河浩太郎, 鈴木顕, 平田潤, 戸田達史, 岡田随象

第66回人類遺伝学会 2021年10月
Trans-ethnic fine-mapping of the MHC region on Parkinson's disease identified shared genetic features associated with the risk

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Kotaro Ogawa, Ken Suzuki, Jun Hirata, Jia Nee Foo, Eng-King Tan, Yukinori Okada, Tatsushi Toda

World Congress of Neurology 2021 2021年10月
DEEP*HLA: 深層学習を用いたHLA imputation法の開発と1型糖尿病の原因遺伝子変異解明への応用

内藤龍彦, 岡田随象

第3回日本メディカルAI学会学術集会 2021年6月
DEEP*HLA: 深層学習を用いたHLA imputation法の開発と1型糖尿病のtrans-ethnic MHC fine-mappingへの応用

内藤龍彦, 岡田随象

第6回日本骨免疫学会 2021年6月
Trans-ethnic fine-mapping of the major histocompatibility complex region in Parkinson’s disease

内藤龍彦, 佐竹渉, 小河浩太郎, 鈴木顕, 平田潤, 岡田随象, 戸田達史

第62回日本神経学会学術大会 2021年5月
DEEP*HLA: A multi-task convolutional deep learning method for HLA allelic imputation and its application to trans-ethnic MHC fine-mapping of type 1 diabetes.

Tatsuhiko Naito, Ken Suzuki, Jun Hirata, Yoichiro Kamatani, Koichi Matsuda, Tatsushi Toda, Yukinori Okada

American Society of Human Genetics 2020年10月
Does human leukocyte antigen peptide-biding score explain the global disparity in the mortality rates of COVID-19?

Tatsuhiko Naito, Yukinori Okada

COVID/SARS CoV2 Rapid Research Reports #3 2020年8月
RNA-seq解析によるパーキンソン病に対するゾニサミドの治療効果を規定する因子の検討

内藤龍彦, 佐竹渉, Cha Pei Chieng, 村田美穂, 戸田達史

第61回日本神経学会学術大会 2020年5月
Ensemble Method for Predicting the Effects of Mutation in MaPSy.

Tatsuhiko Naito

The Fifth International Experiment of the Critical Assessment of Genome Interpretation 2018年7月招待有り
免疫チェックポイント阻害薬投与後に発症した神経関連有害事象の臨床的検討

内藤龍彦, 大崎雅央, 宇羽野恵, 神崎真実, 上坂義和

第59 回日本神経学会学術大会 2018年5月

共同研究・競争的資金等の研究課題

ゲノム・シングルセル解析による甲状腺リンパ腫発症機構の解明

日本内分泌学会若手研究助成金 2026年4月 - 2027年3月

内藤龍彦
食生活関連疾患の遺伝学的背景の解明と予防医療への応用

公益財団法人三島海雲記念財団学術研究奨励金（自然科学部門研究助成） 2025年7月 - 2026年6月

内藤龍彦
大規模ゲノム情報を用いたパーキンソン病の遺伝学的背景の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2020年4月 - 2022年3月

内藤龍彦

メディア報道

原発性アルドステロン症の発症に関わる遺伝子を同定

日経バイオテク 2023年2月インターネットメディア
東大と阪大、深層学習を用いて高精度にHLA遺伝子配列の予測が可能に

日本経済新聞 2021年3月インターネットメディア

内藤龍彦

基本情報

研究キーワード

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

メディア報道

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