内藤龍彦 (Tatsuhiko Naito) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学大学院医学系研究科遺伝統計学

researchmap会員ID: R000030437

研究キーワード

経歴

2023年4月 - 現在

日本学術振興会海外特別研究員
2023年1月 - 現在

New York Genome Center, Postdoctoral Fellow
2023年1月 - 現在

Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Postdoctoral Fellow
2022年4月 - 2022年12月

大阪大学大学院医学系研究科, 遺伝統計学, 助教
2020年4月 - 2022年3月

日本学術振興会特別研究員（DC2）
2021年11月 - 2022年1月

Icahn School of Medicine at Mount Sinai, Visiting Scholar
2018年10月 - 2019年3月

東京大学医学部附属病院神経内科
2018年4月 - 2018年9月

東京逓信病院神経内科
2017年4月 - 2018年3月

虎の門病院神経内科
2016年10月 - 2017年3月

東京共済病院神経内科
2015年4月 - 2016年9月

東京大学医学部附属病院神経内科
2013年4月 - 2015年3月

国立国際医療研究センター病院

学歴

2018年4月 - 2022年3月

東京大学大学院, 医学系研究科脳神経医学専攻神経内科学
2009年4月 - 2013年3月

東京大学, 医学部医学科
2007年4月 - 2009年3月

東京大学, 教養学部理科三類

受賞

2023年12月

第40回井上研究奨励賞, 井上科学振興財団
2022年3月

東京大学総長賞, 東京大学
2021年8月

若手研究者海外挑戦プログラム, 日本学術振興会
2021年6月

日本メディカルAI学会奨励賞優秀一般演題賞, 日本メディカルAI学会
2021年6月

第6回日本骨免疫学会優秀演題賞, 日本骨免疫学会
2019年2月

Honorable Prize, Bioinformatics Contest 2019

論文

CAGI, the Critical Assessment of Genome Interpretation, establishes progress and prospects for computational genetic variant interpretation methods

The Critical Assessment of Genome Interpretation Consortium

Genome Biology 25(1) 2024年2月22日査読有り
Multi-trait analysis characterizes the genetics of thyroid function and identifies causal associations with clinical implications

Rosalie B. T. M. Sterenborg†, Inga Steinbrenner†, Yong Li†, Melissa N. Bujnis†, Tatsuhiko Naito†, Eirini Marouli†, Tessel E. Galesloot, Oladapo Babajide, Laura Andreasen, Arne Astrup …

Nature Communications 15(1) 2024年1月30日査読有り筆頭著者
Genotype imputation methods for whole and complex genomic regions utilizing deep learning technology

Tatsuhiko Naito, Yukinori Okada

Journal of Human Genetics 2024年1月15日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Multifaceted analysis of cross-tissue transcriptomes reveals phenotype–endotype associations in atopic dermatitis

Aiko Sekita, Hiroshi Kawasaki, Ayano Fukushima-Nomura, Kiyoshi Yashiro, Keiji Tanese, Susumu Toshima, Koichi Ashizaki, Tomohiro Miyai, Junshi Yazaki, Atsuo Kobayashi …

Nature Communications 14(1) 2023年10月2日査読有り
Multiancestry analysis of the HLA locus in Alzheimer’s and Parkinson’s diseases uncovers a shared adaptive immune response mediated by HLA-DRB1*04 subtypes

Yann Le Guen, Guo Luo, Aditya Ambati, Vincent Damotte, Iris Jansen, Eric Yu, Aude Nicolas, Itziar de Rojas, Thiago Peixoto Leal, Akinori Miyashita …

Proceedings of the National Academy of Sciences 120(36) 2023年8月29日査読有り
Genome-wide association study identifies risk loci within the major histocompatibility complex region for Hunner-type interstitial cystitis

Yoshiyuki Akiyama, Kyuto Sonehara, Daichi Maeda, Hiroto Katoh, Tatsuhiko Naito, Kenichi Yamamoto, Biobank Japan Project, Takayuki Morisaki, Shumpei Ishikawa, Tetsuo Ushiku …

Cell Reports Medicine 4(7) 101114-101114 2023年7月査読有り
Genetic Risk of Primary Aldosteronism and Its Contribution to Hypertension: A Cross-Ancestry Meta-Analysis of Genome-Wide Association Studies

Tatsuhiko Naito, Kosuke Inoue, Kyuto Sonehara, Ryuta Baba, Takaya Kodama, Yu Otagaki, Akira Okada, Kiyotaka Itcho, Kazuhiro Kobuke, Shinji Kishimoto …

Circulation 2023年2月21日査読有り筆頭著者
A genomewide association study for allergen component sensitizations identifies allergen component-specific and allergen protein group-specific associations

Wataru Morii, Koki Kasai, Takako Nakamura, Daisuke Hayashi, Monami Hara, Tatsuhiko Naito, Kyuto Sonehara, Tatsuki Fukuie, Mayako Saito-Abe, Limin Yang …

Journal of Allergy and Clinical Immunology: Global 100086-100086 2023年2月査読有り
Exome-wide association study to identify rare variants influencing COVID-19 outcomes: Results from the Host Genetics Initiative

Guillaume Butler-Laporte, Gundula Povysil, Jack A. Kosmicki, Elizabeth T. Cirulli, Theodore Drivas, Simone Furini, Chadi Saad, Axel Schmidt, Pawel Olszewski, Urszula Korotko …

PLOS Genetics 18(11) e1010367-e1010367 2022年11月3日査読有り
The whole blood transcriptional regulation landscape in 465 COVID-19 infected samples from Japan COVID-19 Task Force

Qingbo S. Wang, Ryuya Edahiro, Ho Namkoong, Takanori Hasegawa, Yuya Shirai, Kyuto Sonehara, Hiromu Tanaka, Ho Lee, Ryunosuke Saiki, Takayoshi Hyugaji …

Nature Communications 13(1) 4830-4830 2022年8月22日査読有り
DOCK2 is involved in the host genetics and biology of severe COVID-19

Ho Namkoong, Ryuya Edahiro, Tomomi Takano, Hiroshi Nishihara, Yuya Shirai, Kyuto Sonehara, Hiromu Tanaka, Shuhei Azekawa, Yohei Mikami, Ho Lee …

Nature 609(7928) 754-760 2022年8月8日査読有り
A common deletion at BAK1 reduces enhancer activity and confers risk of intracranial germ cell tumors

Kyuto Sonehara, Yui Kimura, Yoshiko Nakano, Tatsuya Ozawa, Meiko Takahashi, Ken Suzuki, Takashi Fujii, Yuko Matsushita, Arata Tomiyama, Toshihiro Kishikawa …

Nature Communications 13(1) 4478-4478 2022年8月査読有り
Comparative whole transcriptome analysis of Parkinson’s disease focusing on the efficacy of zonisamide

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Pei-Chieng Cha, Kazuhiro Kobayashi, Miho Murata, Tatsushi Toda

Journal of Neurology, Neurosurgery & Psychiatry 93(5) 509-512 2022年3月9日査読有り筆頭著者
Decoding the diversity of killer immunoglobulin-like receptors by deep sequencing and a high-resolution imputation method

Saori Sakaue, Kazuyoshi Hosomichi, Jun Hirata, Hirofumi Nakaoka, Keiko Yamazaki, Makoto Yawata, Nobuyo Yawata, Tatsuhiko Naito, Junji Umeno, Takaaki Kawaguchi …

Cell Genomics 2(3) 100101-100101 2022年3月査読有り
HLA imputation and its application to genetic and molecular fine-mapping of the MHC region in autoimmune diseases

Tatsuhiko Naito, Yukinori Okada

Seminars in Immunopathology 44(1) 15-28 2021年11月16日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Trans‐Ethnic Fine‐Mapping of the Major Histocompatibility Complex Region Linked to Parkinson's Disease

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Kotaro Ogawa, Ken Suzuki, Jun Hirata, Jia Nee Foo, Eng‐King Tan, Tatsushi Toda, Yukinori Okada

Movement Disorders 36(8) 1805-1814 2021年8月査読有り筆頭著者
A deep learning method for HLA imputation and trans-ethnic MHC fine-mapping of type 1 diabetes

Tatsuhiko Naito, Ken Suzuki, Jun Hirata, Yoichiro Kamatani, Koichi Matsuda, Tatsushi Toda, Yukinori Okada

Nature Communications 12(1) 2021年3月査読有り筆頭著者
Disseminated necrotizing leukoencephalopathy after allogeneic peripheral blood stem cell transplantation and methotrexate administration

Mizuho Kawai, Tatsuo Mano, Tatsuhiko Naito, Akira Honda, Yudai Nakai, Kazuhiro Toyama, Yosei Fujioka, Norihiro Makise, Hirotaka Hasegawa, Kaori Sakuishi …

Neurology and Clinical Neuroscience 9(1) 155-156 2020年11月5日査読有り
Communicating hydrocephalus associated with neurosarcoidosis diagnosed by endoscopic biopsy

Sayako Maruno, Tatsuhiko Naito, Fumiko Kusunoki Nakamoto, Aya Kamisawa, Tatsuya Sato, Tomonari Seki, Risa Maekawa, Takuto Hideyama, Tetsuo Ushiku, Masahiro Shin …

Neurology and Clinical Neuroscience 8(2) 79-81 2020年3月査読有り責任著者
Assessing predictions of the impact of variants on splicing in CAGI5

Stephen M. Mount, Žiga Avsec, Liran Carmel, Rita Casadio, Muhammed Hasan Çelik, Ken Chen, Jun Cheng, Noa E. Cohen, William G. Fairbrother, Tzila Fenesh …

Human Mutation 40(9) 1215-1224 2019年9月査読有り

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MISC

ヒト脳のオミクスデータベース

内藤龍彦, 岡田随象

実験医学増刊 42(7) 2024年4月筆頭著者
原発性アルドステロン症の遺伝的背景と高血圧への寄与

内藤龍彦

医学のあゆみ 288(13) 2024年3月筆頭著者
遺伝情報解析に対する深層学習の応用―HLA imputation法を例に

内藤龍彦

実験医学増刊 41(7) 2023年4月筆頭著者
1型糖尿病とHLA—MHC領域のファンマッピングによる疾患感受性アレルの解明

内藤龍彦, 岡田随象

臨床免疫・アレルギー科 76(5) 2021年11月筆頭著者
Trans-ethnic fine-mapping of the MHC region on Parkinson's disease identified shared genetic features associated with the risk

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Kotaro Ogawa, Ken Suzuki, Jun Hirata, Jia Foo, Ek Tan, Yukinori Okada, Tatsushi Toda

Journal of the Neurological Sciences 429 117854-117854 2021年10月
大規模データからのGWAS、その他の解析の最新事情

内藤龍彦, 岡田随象

実験医学増刊 39(7) 2021年5月筆頭著者
菌状息肉症に対し造血幹細胞移植後メソトレキセートを投与し出現した播種性壊死性脳症

河合三津保, 内藤龍彦, 間野達雄, 藤岡洋成, 本田晃, 遠山和博, 作石かおり, 清水潤, 黒川峰夫, 戸田達史

神経治療学 36(6) S233-S233 2019年10月
偽性核間性眼筋麻痺を呈したMiller Fisher症候群の1例

江頭柊平, 内藤龍彦, 関大成, 佐藤達哉, 勝又淳子, 坂内太郎, 中元ふみ子, 海田賢一, 椎尾康

日本内科学会関東地方会 652回 27-27 2019年7月査読有り
M232R変異による遺伝性クロイツフェルト・ヤコブ病が疑われた83歳男性例

鈴木祥代, 前川理沙, 中元ふみ子, 内藤龍彦, 佐藤達哉, 勝又淳子, 坂内太郎, 関大成, 日出山拓人, 椎尾康

臨床神経学 59(5) 303-303 2019年5月
肺炎球菌性髄膜炎に対して抗生剤加療中に広範な脳梗塞を合併した55歳男性剖検例

内藤龍彦, 平賢一郎, 林俊宏, 清水潤, 日向宗利, 田中真理子, 池村雅子, 村山繁雄

NEUROINFECTION 22(2) 235-235 2017年9月
水頭症を来した神経サルコイドーシスの1例

瀬戸瑛子, 羽尾曉人, 清水崇紘, 内藤龍彦, 間野かおり, 平賢一郎, 作石かおり, 林俊宏, 辛正廣, 辻省次

日本内科学会関東地方会 626回 45-45 2016年9月
細菌性髄膜炎の経過中に脳梗塞を合併した一例

貝梅正文, 福田直到, 園生智弘, 石井健, 土井研人, 平賢一郎, 寺尾安生, 内藤龍彦, 辻省次, 中島勧 …

日本救急医学会雑誌 26(8) 490-490 2015年8月

書籍等出版物

HLA Typing 2nd Edition: Methods and Protocols

Sebastian Boegel (担当:分担執筆, 範囲:Deep learning-based HLA allele imputation applicable to GWAS)

Springer Nature 2024年
ヒトの分子遺伝学

Strachan, T., Read, A. P. (Andrew), 戸田, 達史, 井上, 聡, 松本, 直通 (担当:共訳, 範囲:第11章ヒトの遺伝的多様性の概要)

メディカル・サイエンス・インターナショナル 2021年10月 (ISBN: 9784815730321)

講演・口頭発表等

Decoding disease and HLA-specific regulation of the T cell receptor repertoire in Parkinson's disease

Tatsuhiko Naito, Ricardo Vialle, Kazuyoshi Ishigaki, Yukinori Okada, David A. Knowles, Towfique Raj

American Society of Human Genetics 2023年11月3日
多因子性・孤発性神経疾患のゲノム医学・医療

内藤龍彦

第53回日本神経精神薬理学会年会 2023年9月招待有り
機械学習とAIの遺伝学研究への応用

内藤龍彦

第63回日本神経学会学術大会 2022年5月招待有り
Trans-ethnic fine-mapping in the major histocompatibility complex region on Parkinson's disease risk

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Kotaro Ogawa, Ken Suzuki, Jun Hirata, Jia Nee Foo, Eng-King Tan, Tatsushi Toda, Yukinori Okada

American Society of Human Genetics 2021年10月
MHC領域のtrans-ethnic fine-mappingによるParkinson病の遺伝的リスクの解明

内藤龍彦, 佐竹渉, 小河浩太郎, 鈴木顕, 平田潤, 戸田達史, 岡田随象

第66回人類遺伝学会 2021年10月
Trans-ethnic fine-mapping of the MHC region on Parkinson's disease identified shared genetic features associated with the risk

Tatsuhiko Naito, Wataru Satake, Kotaro Ogawa, Ken Suzuki, Jun Hirata, Jia Nee Foo, Eng-King Tan, Yukinori Okada, Tatsushi Toda

World Congress of Neurology 2021 2021年10月
DEEP*HLA: 深層学習を用いたHLA imputation法の開発と1型糖尿病の原因遺伝子変異解明への応用

内藤龍彦, 岡田随象

第3回日本メディカルAI学会学術集会 2021年6月
DEEP*HLA: 深層学習を用いたHLA imputation法の開発と1型糖尿病のtrans-ethnic MHC fine-mappingへの応用

内藤龍彦, 岡田随象

第6回日本骨免疫学会 2021年6月
Trans-ethnic fine-mapping of the major histocompatibility complex region in Parkinson’s disease

内藤龍彦, 佐竹渉, 小河浩太郎, 鈴木顕, 平田潤, 岡田随象, 戸田達史

第62回日本神経学会学術大会 2021年5月
DEEP*HLA: A multi-task convolutional deep learning method for HLA allelic imputation and its application to trans-ethnic MHC fine-mapping of type 1 diabetes.

Tatsuhiko Naito, Ken Suzuki, Jun Hirata, Yoichiro Kamatani, Koichi Matsuda, Tatsushi Toda, Yukinori Okada

American Society of Human Genetics 2020年10月
Does human leukocyte antigen peptide-biding score explain the global disparity in the mortality rates of COVID-19?

Tatsuhiko Naito, Yukinori Okada

COVID/SARS CoV2 Rapid Research Reports #3 2020年8月
RNA-seq解析によるパーキンソン病に対するゾニサミドの治療効果を規定する因子の検討

内藤龍彦, 佐竹渉, Cha Pei Chieng, 村田美穂, 戸田達史

第61回日本神経学会学術大会 2020年5月
Ensemble Method for Predicting the Effects of Mutation in MaPSy.

Tatsuhiko Naito

The Fifth International Experiment of the Critical Assessment of Genome Interpretation 2018年7月招待有り
免疫チェックポイント阻害薬投与後に発症した神経関連有害事象の臨床的検討

内藤龍彦, 大崎雅央, 宇羽野恵, 神崎真実, 上坂義和

第59 回日本神経学会学術大会 2018年5月

共同研究・競争的資金等の研究課題

大規模ゲノム情報を用いたパーキンソン病の遺伝学的背景の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2020年4月 - 2022年3月

内藤龍彦

メディア報道

原発性アルドステロン症の発症に関わる遺伝子を同定

日経バイオテク 2023年2月インターネットメディア
東大と阪大、深層学習を用いて高精度にHLA遺伝子配列の予測が可能に

日本経済新聞 2021年3月インターネットメディア

内藤龍彦

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書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

メディア報道

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