林智彦 (Tomohiko Hayashi) - マイポータル

基本情報

所属: 新潟大学工学部工学科准教授
: 京都大学エネルギー理工学研究所協力研究員

学位: 博士（工学）(東京工業大学)

研究者番号: 90838070
J-GLOBAL ID: 202001017905477583
researchmap会員ID: R000008914

生き物の仕組みを、生体の分子・組織の「形状」・「動き」・「水の役割」に注目して解明し、医学・薬学・工学への応用を目指しています。

研究キーワード

研究分野

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 /

経歴

2023年4月 - 現在

新潟大学, 工学部工学科, 准教授
2019年10月 - 現在

京都大学, エネルギー理工学研究所, 協力研究員
2019年10月 - 2023年3月

新潟大学, 工学部工学科, 助教
2019年4月 - 2020年3月

立命館大学, 薬学部, 講師
2013年4月 - 2019年9月

京都大学, エネルギー理工学研究所, 研究員
2012年10月 - 2013年3月

東京工業大学, バイオ研究基盤支援総合センター, 研究員

学歴

- 2012年9月

東京工業大学, 生命理工学研究科, 生体分子機能工学専攻
- 2005年9月

東京工業大学, 生命理工学部, 生命工学科

受賞

2015年

第４回 Biophysics and Physicobiology 論文賞, Full-Quantum chemical calculation of the absorption maximum of bacteriorhodopsin: a comprehensive analysis of the amino acid residues contributing to the opsin shift, 日本生物物理学会

林智彦

論文

成長期における跳躍型疲労骨折の形態学的素因としての脛骨のねじれと弯曲の3次元評価

齋藤大寛, 林智彦, 渡邉聡, 林豊彦, 佐藤卓, 小林公一, 森清友亮, 大森豪, 坂本信

臨床バイオメカニクス 46 110-117 2025年10月査読有り責任著者
Enzyme Reactions Are Accelerated or Decelerated When the Enzymes Are Located Near the DNA Nanostructure

Peng Lin, Tomohiko Hayashi, Huyen Dinh, Eiji Nakata, Masahiro Kinoshita, Takashi Morii

ACS Applied Materials & Interfaces 17 15775-15792 2025年3月2日査読有り
A physical picture of liquid–liquid phase separation of proteins

Masahiro Kinoshita, Tomohiko Hayashi, Yuka Nakamura, Akira Yoshimori, Masato Katahira, Takashi Nagata

Journal of Molecular Liquids 424 127040-127040 2025年1月査読有り
Statistical-Mechanics Analyses on Thermodynamics of Protein Folding Constructed by Privalov and Co-Workers

Masao Inoue, Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Minoru Kato, Mitsunori Ikeguchi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita

The journal of physical chemistry. B 128(41) 10110-10125 2024年10月17日査読有り
成長期における跳躍型疲労骨折に関係する脛骨の弯曲と皮質骨厚の3次元評価

青木一磨, 林智彦, 渡邉聡, 林豊彦, 齋藤大寛, 齊藤将, 森清友亮, 古賀良生, 大森豪, 小林公一

臨床バイオメカニクス 45 60-66 2024年10月査読有り責任著者
An accurate and rapid method for calculating hydration free energies of solutes including small organic molecules, peptides, and proteins

Tomohiko Hayashi, Masato Kawamura, Shunsuke Miyamoto, Satoshi Yasuda, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita

Journal of Molecular Liquids 406 124989-124989 2024年7月査読有り筆頭著者
外側円板状半月板を有する若年小児の大腿骨外側顆部の軟骨表面の形態評価

青木一磨, 林智彦, 渡邉聡, 林豊彦

臨床バイオメカニクス 44 27-35 2023年10月査読有り責任著者
Nonadditivities of the Particle Sizes Hidden in Model Pair Potentials and Their Effects on Physical Adsorptions

Ken-ichi Amano, Satoshi Furukawa, Yuto Kubo, Yuka Nakamura, Rina Ishii, Ayane Tanase, Masahiro Maebayashi, Tomohiko Hayashi, Naoya Nishi, Tetsuo Sakka

Langmuir 39(37) 12999-13007 2023年9月2日査読有り
Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water

Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita

Frontiers in Molecular Biosciences 10 1159603 2023年6月9日査読有り
円板状半月板を有する若年小児の大腿骨外側顆部の3次元形状評価

青木一磨, 林智彦, 渡邉聡, 林豊彦, 古賀良生, 大森豪, 小林公一, 坂本信

臨床バイオメカニクス 43 97-105 2022年10月査読有り責任著者
A methodology for creating mutants of G‐protein coupled receptors stabilized in active state by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering

Taisei Yamamoto, Satoshi Yasuda, Rinshi S. Kasai, Ryosuke Nakano, Simon Hikiri, Kanna Sugaya, Tomohiko Hayashi, Satoshi Ogasawara, Mitsunori Shiroishi, Takahiro K. Fujiwara …

Protein Science 31(10) e4425 2022年10月査読有り
A methodology for creating thermostabilized mutants of G‐protein coupled receptors by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering

Kanna Sugaya, Satoshi Yasuda, Shingo Sato, Chen Sisi, Taisei Yamamoto, Daisuke Umeno, Tomoaki Matsuura, Tomohiko Hayashi, Satoshi Ogasawara, Masahiro Kinoshita …

Protein Science 31(9) e4404 2022年8月13日査読有り
Development of an Outward Proton Pumping Rhodopsin with a New Record in Thermostability by Means of Amino Acid Mutations

Satoshi Yasuda, Tomoki Akiyama, Keiichi Kojima, Tetsuya Ueta, Tomohiko Hayashi, Satoshi Ogasawara, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto, Naoki Kunishima, Yuki Sudo …

The Journal of Physical Chemistry B 126(5) 1004-1015 2022年2月10日査読有り
Controlling the Rigidity of Kinesin-Propelled Microtubules in an In Vitro Gliding Assay Using the Deep-Sea Osmolyte Trimethylamine N-Oxide

Arif Md. Rashedul Kabir, Tasrina Munmun, Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Atsushi P. Kimura, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata, Kazuki Sada, Akira Kakugo

ACS Omega 7(4) 3796-3803 2022年2月1日査読有り
Comparison based on statistical thermodynamics between globule-to-coil transition of poly(N-isopropylacrylamide) and cold denaturation of a protein

Masao Inoue, Tomohiko Hayashi, Simon Hikiri, Mitsunori Ikeguchi, Masahiro Kinoshita

Journal of Molecular Liquids 317 114129 2020年8月22日査読有り
Development and structural determination of an anti-prpc aptamer that blocks pathological conformational conversion of prion protein

Tsukasa Mashima, Joon-Hwa Lee, Yuji O. Kamatari, Tomohiko Hayashi, Takashi Nagata, Fumiko Nishikawa, Satoshi Nishikawa, Masahiro Kinoshita, Kazuo Kuwata, Masato Katahira

Scientific Reports 10 4934 2020年3月18日査読有り
Methodology for Further Thermostabilization of an Intrinsically Thermostable Membrane Protein Using Amino Acid Mutations with Its Original Function Being Retained

Satoshi Yasuda, Tomoki Akiyama, Sayaka Nemoto, Tomohiko Hayashi, Tetsuya Ueta, Keiichi Kojima, Takashi Tsukamoto, Satoru Nagatoishi, Kouhei Tsumoto, Yuki Sudo …

Journal of Chemical Information and Modeling 60(3) 1709-1716 2020年3月10日査読有り
Hydration properties of a protein at low and high pressures: Physics of pressure denaturation

Masao Inoue, Tomohiko Hayashi, Simon Hikiri, Mitsunori Ikeguchi, Masahiro Kinoshita

The Journal of Chemical Physics 152 065103 2020年2月11日査読有り
How Does a Microbial Rhodopsin RxR Realize Its Exceptionally High Thermostability with the Proton-Pumping Function Being Retained?

Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Kano Suzuki, Tomoki Akiyama, Kanae Kanehara, Keiichi Kojima, Mikio Tanabe, Ryuichi Kato, Toshiya Senda, Yuki Sudo …

The Journal of Physical Chemistry B 124(6) 990-1000 2020年1月20日査読有り筆頭著者
Mechanism of globule-to-coil transition of poly(N-isopropylacrylamide) in water: Relevance to cold denaturation of a protein

Masao Inoue, Tomohiko Hayashi, Simon Hikiri, Mitsunori Ikeguchi, Masahiro Kinoshita

Journal of Molecular Liquids 292 111374 2019年7月16日査読有り

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MISC

サーモフィリックロドプシンとキサントロドプシンの熱安定性の大きな違いに対する統計熱力学的解析

安田賢司, 安田賢司, 安田賢司, 林智彦, 林智彦, 村田武士, 村田武士, 木下正弘

アグリバイオ 5(2) 2021年
Accurate and rapid calculation of hydration free energy and its physical implication for biomolecular functions

Masahiro Kinoshita, Tomohiko Hayashi

Biophysical Reviews 12 469-480 2020年3月17日査読有り招待有り
Theoretical identification of thermostabilizing amino acid mutations for G-protein-coupled receptors

Takeshi Murata, Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Masahiro Kinoshita

Biophysical Reviews 12 323-332 2020年3月2日査読有り招待有り
サーモフィリックロドプシンの極めて高い熱安定性に関する統計熱力学的解析

安田賢司, 林智彦, 村田武士, 木下正弘

月刊「細胞」 52(2) 37-41 2020年招待有り

書籍等出版物

Statistical Thermodynamics on the Binding of Biomolecules, Part II: Basis of Protein-Ligand and Protein-Protein Interactions, Chapter 13, The Role of Water in ATP Hydrolysis Energy Transduction by Protein Machinery

Tomohiko Hayashi (担当:共著)

Springer 2018年

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

2024年5月 - 現在

バイオメカニズム学会
2023年9月 - 現在

日本物理学会
2021年10月 - 現在

日本臨床バイオメカニクス学会
2020年3月 - 現在

日本化学会
2013年9月 - 現在

米国生物物理学会（Biophysical Society, U.S.A.）
2012年10月 - 現在

日本生物物理学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

次世代バイオ医薬品の物理理論に基づく高速設計法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C)及び若手研究における独立基盤形成支援（試行） 2025年4月 - 2028年3月

林智彦
物理理論ベースのペプチド創薬設計エンジンによるHFpEF治療薬の開発

科学技術振興機構みちのくアカデミア発スタートアップ共創プラットフォームみちのくGAPファンド STEP1（医療系・創薬枠） 2026年4月 - 2027年3月

林智彦
次世代ペプチド薬の物理理論に基づく高速デザイン法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

林智彦
MDM2をターゲットとした新規抗癌剤候補ペプチドの設計・合成

文部科学省文部科学省卓越研究員事業 2019年10月 - 2024年3月
ペプチド抗癌剤の物理理論に基づく高速探索法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2019年4月 - 2022年3月

林智彦

産業財産権

特開2025-103885 自由エネルギーの計算方法

村田武士, 安田賢司, 木下正弘, 林智彦

林智彦

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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