薬剤耐性菌は、人医療からだけではなく農業、とくに集約的な畜産業からも発生している。近年、先進国では薬剤耐性菌の発生が低下傾向にある。しかし、途上国は発生拡大傾向にあり、とくにアフリカでは実態把握も困難な状況である。本研究では、経済発展に伴い工業的な畜産業が拡大するウガンダを調査地として、畜産から発生する薬剤耐性菌の現状把握と無薬畜産を提案するためのプロバイオ候補菌探索を行った。家畜および畜産物からテトラサイクリン耐性が多く検出されたが、都市周辺の野鳥からESBL多剤耐性菌が検出され、公衆衛生上のリスクを明らかにした。また粗放な飼育形態の家禽および野鳥から抗菌性を示す乳酸菌を複数株選抜できた。