仙石徹 (Toru Sengoku) - マイポータル

基本情報

所属: 横浜市立大学医学部医学科生化学准教授

学位: 理学博士(東京大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-9461-8714
J-GLOBAL ID: 201301059908260266
researchmap会員ID: B000228407

外部リンク: http://kaken.nii.ac.jp/d/r/60576312.ja.html

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2011年

独立行政法人理化学研究所研究員

主要な論文

Structural basis of transcription regulation by CNC family transcription factor, Nrf2

Toru Sengoku, Masaaki Shiina, Kae Suzuki, Keisuke Hamada, Ko Sato, Akiko Uchiyama, Shunsuke Kobayashi, Asako Oguni, Hayato Itaya, Kota Kasahara, Hirotomo Moriwaki, Chiduru Watanabe, Teruki Honma, Chikako Okada, Shiho Baba, Tsutomu Ohta, Hozumi Motohashi, Masayuki Yamamoto, Kazuhiro Ogata

Nucleic Acids Research 50(21) 12543-12557 2022年12月1日査読有り筆頭著者責任著者
De Novo Discovery of Thiopeptide Pseudo-natural Products Acting as Potent and Selective TNIK Kinase Inhibitors

Alexander A. Vinogradov, Yue Zhang, Keisuke Hamada, Jun Shi Chang, Chikako Okada, Hirotaka Nishimura, Naohiro Terasaka, Yuki Goto, Kazuhiro Ogata, Toru Sengoku, Hiroyasu Onaka, Hiroaki Suga

Journal of the American Chemical Society 144(44) 20332-20341 2022年10月25日査読有り
LimF is a versatile prenyltransferase for histidine-C-geranylation on diverse non-natural substrates

Yuchen Zhang, Keisuke Hamada, Dinh Thanh Nguyen, Sumika Inoue, Masayuki Satake, Shunsuke Kobayashi, Chikako Okada, Kazuhiro Ogata, Masahiro Okada, Toru Sengoku, Yuki Goto, Hiroaki Suga

Nature Catalysis 5(8) 682-693 2022年8月15日査読有り責任著者
Structural basis of the regulation of the normal and oncogenic methylation of nucleosomal histone H3 Lys36 by NSD2

Ko Sato, Amarjeet Kumar, Keisuke Hamada, Chikako Okada, Asako Oguni, Ayumi Machiyama, Shun Sakuraba, Tomohiro Nishizawa, Osamu Nureki, Hidetoshi Kono, Kazuhiro Ogata, Toru Sengoku

Nature Communications 12(1) 6605-6605 2021年12月査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Ribosomal synthesis and de novo discovery of bioactive foldamer peptides containing cyclic β-amino acids

Takayuki Katoh, Toru Sengoku, Kunio Hirata, Kazuhiro Ogata, Hiroaki Suga

Nature Chemistry 2020年8月24日査読有り
Structural basis of protein arginine rhamnosylation by glycosyltransferase EarP article

Toru Sengoku, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Chiduru Watanabe, Teruki Honma, Yasushi Hikida, Yoshiki Yamaguchi, Hideyuki Takahashi, Shigeyuki Yokoyama, Tatsuo Yanagisawa

Nature Chemical Biology 14(4) 368-374 2018年4月1日査読有り筆頭著者
Structural basis for histone H3 Lys 27 demethylation by UTX/KDM6A

Toru Sengoku, Shigeyuki Yokoyama

GENES & DEVELOPMENT 25(21) 2266-2277 2011年11月査読有り筆頭著者
Crystal structure of the bifunctional tRNA modification enzyme MnmC from Escherichia coli

Aya Kitamura, Toru Sengoku, Madoka Nishimoto, Shigeyuki Yokoyama, Yoshitaka Bessho

PROTEIN SCIENCE 20(7) 1105-1113 2011年7月査読有り筆頭著者
Crystal structure of histone demethylase LSD1 and tranylcypromine at 2.25 angstrom

Shinya Mimasu, Toru Sengoku, Seketsu Fukuzawa, Takashi Umehara, Shigeyuki Yokoyama

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 366(1) 15-22 2008年2月査読有り筆頭著者
Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila vasa

T Sengoku, O Nureki, A Nakamura, KI Satoru, S Yokoyama

CELL 125(2) 287-300 2006年4月査読有り筆頭著者
Crystallization and preliminary X-ray analysis of the helicase domains of Vasa complexed with RNA and an ATP analogue

T Sengoku, O Nureki, N Dohmae, A Nakamura, S Yokoyama

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 60 320-322 2004年2月査読有り筆頭著者

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MISC

Nrf2-小Mafヘテロ二量体による標的DNA認識機構のFMO法(フラグメント分子軌道法)による解析

仙石徹, 森脇寛智, 渡邉千鶴, 本間光貴, 緒方一博

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
反転型糖転移酵素によるタンパク質アルギニン・ラムノシル化の構造基盤

仙石徹, 鈴木健裕, 堂前直, 渡邉千鶴, 本間光貴, 疋田泰士, 山口芳樹, 高橋英之, 柳沢達男, 横山茂之

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.2AW27‐6 (WEB ONLY) 2017年
髄膜炎菌由来の翻訳因子EF‐Pのラムノース修飾による活性化の構造的基盤

仙石徹, 鈴木健裕, 堂前直, 渡邉千鶴, 本間光貴, 疋田泰士, 山口芳樹, 高橋英之, 横山茂之, 柳沢達男

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.4LT25‐09(3P‐0099) (WEB ONLY) 2017年
髄膜炎菌由来の翻訳因子EF‐Pのラムノース修飾による活性化の構造的基盤

仙石徹, 柳沢達男, 鈴木健裕, 堂前直, 渡邉千鶴, 本間光貴, 疋田泰士, 高橋英之, 横山茂之

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th ROMBUNNO.3P‐0247 (WEB ONLY) 2016年
アセチル化ヒストンH4K16を特異的に認識する抗体の結晶構造解析

仙石徹, 森田鋭, 佐藤優子, KUMAREVEL Thirumananseri, 沖山佳生, 渡邉千鶴, 梅原崇史, 本間光貴, 横山茂之, 木村宏

日本生化学会大会(Web) 88th 3P0620 (WEB ONLY) 2015年
Catalytic fragment of UTX/KDM6A bound with histone H3K27me3 peptide, N-oxyalylglycine, and Ni(II)

T. Sengoku, S. Yokoyama

2011年10月19日筆頭著者
Tryptophanyl-tRNA synthetase for the Mycoplasma deviant genetic code

KITAMURA Aya, SASAKI Hiroshi, HIGASHIJIMA Kyoko, NISHIMOTO Madoka, SENGOKU Toru, YOKOBORI Shin‐ichi, YOKOYAMA Shigeyuki, BESSHO Yoshitaka

日本RNA学会年会要旨集 13th 372 2011年
Crystal structure of human LSD1 at 2.3 A resolution

T. Sengoku, S. Yokoyama

2007年9月4日筆頭著者
Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa

T. Sengoku, O. Nureki, A. Nakamura, S. Kobayashi, S. Yokoyama

2006年5月2日筆頭著者
Crystal structure of tRNA adenosine deaminase TadA from Aquifex aeolicus

M. Kuratani, R. Ishii, Y. Bessho, R. Fukunaga, T. Sengoku, S. Sekine, S. Yokoyama

2005年2月1日
A short peptide insertion crucial for angiostatic activity of human tryptophanyl-tRNA synthetase

Yoshiaki Kise, Sang Won Lee, Sang Gyu Park, Shuya Fukai, Toru Sengoku, Ryohei Ishii, Shigeyuki Yokoyama, Sunghoon Kim, Osamu Nureki

Nature Structural and Molecular Biology 11(2) 149-156 2004年2月

主要なWorks(作品等)

Nrf2-MafG heterodimer bound with CsMBE1

Sengoku, T., Shiina, M., Suzuki, K., Hamada, K., Sato, K., Uchiyama, A., Okada, C., Baba, S., Ohta, T., Motohashi, H., Yamamoto, M., Ogata, K.

その他
Nrf2-MafG heterodimer bound with CsMBE2

Sengoku, T., Shiina, M., Suzuki, K., Hamada, K., Sato, K., Uchiyama, A., Okada, C., Baba, S., Ohta, T., Motohashi, H., Yamamoto, M., Ogata, K.

その他
Nrf2 (A510Y)-MafG heterodimer bound with CsMBE2

Sengoku, T., Shiina, M., Suzuki, K., Hamada, K., Sato, K., Uchiyama, A., Okada, C., Baba, S., Ohta, T., Motohashi, H., Yamamoto, M., Ogata, K.

その他
Crystal structure of TNIK-thiopeptide TP1 complex

Hamada, K., Vinogradov, A.A., Zhang, Y., Chang, J.S., Nishimura, H., Goto, Y., Onaka, H., Suga, H., Ogata, K., Sengoku, T.

その他
Crystal structure of TNIK-AMPPNP-thiopeptide TP15 complex

Hamada, K., Vinogradov, A.A., Zhang, Y., Chang, J.S., Nishimura, H., Goto, Y., Onaka, H., Suga, H., Ogata, K., Sengoku, T.

その他
Crystal structure of LimF prenyltransferase bound with a peptide substrate and GSPP

Hamada, K., Kobayashi, S., Okada, C., Zhang, Y., Inoue, S., Goto, Y., Suga, H., Ogata, K., Sengoku, T.

その他
Crystal structure of LimF prenyltransferase bound with GSPP

Hamada, K., Kobayashi, S., Okada, C., Zhang, Y., Inoue, S., Goto, Y., Suga, H., Ogata, K., Sengoku, T.

その他
NSD2 E1099K mutant bound to nucleosome

Sengoku, T., Sato, K., Nishizawa, T., Nureki, O., Ogata, K.

その他
Human Coagulation Factor XIIa (FXIIa) bound with the macrocyclic peptide F3 containing two (1S,2S)-2-ACHC residues

Sengoku, T., Katoh, T., Hirata, K., Suga, H., Ogata, K.

その他
EarP bound with dTDP-rhamnose (soaked)

Sengoku, T., Yokoyama, S., Yanagisawa, T.

その他
Apo EarP

Sengoku, T., Yokoyama, S., Yanagisawa, T.

その他
EarP bound with domain I of EF-P

Sengoku, T., Yokoyama, S., Yanagisawa, T.

その他
EarP bound with dTDP-rhamnose (co-crystal)

Sengoku, T., Yokoyama, S., Yanagisawa, T.

その他
Catalytic fragment of UTX/KDM6A bound with histone H3K27me3 peptide, N-oxyalylglycine, and Ni(II)

Sengoku, T., Yokoyama, S.

その他
Catalytic fragment of UTX/KDM6A bound with N-oxyalylglycine, and Ni(II)

Sengoku, T., Yokoyama, S.

その他
Bifunctional tRNA modification enzyme MnmC from Escherichia coli

Kitamura, A., Sengoku, T., Nishimoto, M., Yokoyama, S., Bessho, Y.

その他
Crystal structure of Lysine-specific histone demethylase 1

Mimasu, S., Sengoku, T., Yokoyama, S., RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI)

その他
LSD1-tranylcypromine complex

Sengoku, T., Mimasu, S., Umehara, T., Yokoyama, S., RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI)

その他
Crystal structure of Lysine-specific demethylase1

Mimasu, S., Sengoku, T., Umehara, T., Yokoyama, S., RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI)

その他
Crystal structure of human LSD1 at 2.3 A resolution

Sengoku, T., Yokoyama, S., RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI)

その他
Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa

Sengoku, T., Nureki, O., Nakamura, A., Kobayashi, S., Yokoyama, S., RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI)

その他

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