Yamada Toshimichi (Toshimichi Yamada) - マイポータル

基本情報

所属: University of California, San Francisco Department of Cellular and Molecular Pharmacology Postdoctoral fellow

学位: 博士（理学）(東京大学)

研究者番号: 50809811
J-GLOBAL ID: 201701016665278942
researchmap会員ID: B000282603

研究分野

学歴

東京大学, 理学系研究科, 化学専攻

論文

Repression of PUM1-mediated mRNA decay activates translesion synthesis after DNA damage

Toshimichi Yamada, Xiaoning Sun, Nobuyoshi Akimitsu

Molecular and Cellular Oncology 7(6) 2020年11月1日
Metabolic labeling of RNA using multiple ribonucleoside analogs enables the simultaneous evaluation of RNA synthesis and degradation rates

Kentaro Kawata, Hiroyasu Wakida, Toshimichi Yamada, Kenzui Taniue, Han Han, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu

Genome Research 30(10) 1481-1491 2020年10月
Systematic Analysis of Targets of Pumilio-Mediated mRNA Decay Reveals that PUM1 Repression by DNA Damage Activates Translesion Synthesis.

Toshimichi Yamada, Naoto Imamachi, Katsutoshi Imamura, Kenzui Taniue, Takeshi Kawamura, Yutaka Suzuki, Masami Nagahama, Nobuyoshi Akimitsu

Cell reports 31(5) 107542-107542 2020年5月5日査読有り
Contributions of regulated transcription and mRNA decay to the dynamics of gene expression.

Toshimichi Yamada, Nobuyoshi Akimitsu

Wiley interdisciplinary reviews. RNA 10(1) e1508 2019年1月査読有り
Identification of Functional Targets Reveals that the Suppression of Pumilio mediated mRNA Decay Increases Cell Resistance to DNA Damage in Human Cells

Toshimichi Yamada, Naoto Imamachi, Katsutoshi Imamura, Takeshi Kawamura, Masami Nagahama, nobuyoshi akimitsu

2018年8月査読有り
Diminished nuclear RNA decay upon Salmonella infection upregulates antibacterial noncoding RNAs.

Katsutoshi Imamura, Akiko Takaya, Yo-Ichi Ishida, Yayoi Fukuoka, Toshiki Taya, Ryo Nakaki, Miho Kakeda, Naoto Imamachi, Aiko Sato, Toshimichi Yamada …

The EMBO journal 37(13) 2018年7月2日査読有り
5'-Bromouridine IP Chase (BRIC)-Seq to Determine RNA Half-Lives.

Toshimichi Yamada, Naoto Imamachi, Rena Onoguchi-Mizutani, Katsutoshi Imamura, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1720 1-13 2018年査読有り
Spatiotemporal analysis with a genetically encoded fluorescent RNA probe reveals TERRA function around telomeres

Toshimichi Yamada, Hideaki Yoshimura, Rintaro Shimada, Mitsuru Hattori, Masatoshi Eguchi, Takahiro K. Fujiwara, Akihiro Kusumi, Takeaki Ozawa

SCIENTIFIC REPORTS 6 38910 2016年12月査読有り
Development of red-shifted mutants derived from luciferase of Brazilian click beetle Pyrearinus termitilluminans

Tomoki Nishiguchi, Toshimichi Yamada, Yusuke Nasu, Mashiho Ito, Hideaki Yoshimura, Takeaki Ozawa

JOURNAL OF BIOMEDICAL OPTICS 20(10) 101205 2015年10月査読有り
Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli

Katsutoshi Imamura, Naoto Imamachi, Gen Akizuki, Michiko Kumakura, Atsushi Kawaguchi, Kyosuke Nagata, Akihisa Kato, Yasushi Kawaguchi, Hiroki Sato, Misako Yoneda …

MOLECULAR CELL 53(3) 393-406 2014年2月査読有り
3P295 生細胞内における長鎖非翻訳RNAの一分子イメージング法の開発(27. バイオイメージング,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Yamada Toshimichi, Yoshimura Hideaki, Hattori Mituru, Segawa Hiroki, Ozawa Takeaki

生物物理 54(1) S298 2014年
1P295 生きた細胞内における内在性テロメアRNAの一分子動態解析(27. バイオイメージング,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Yamada Toshimichi, Yoshimura Hideaki, Hattori Mitsuru, Ozawa Takeaki

生物物理 53(1) S154 2013年
Fluorescent probes for imaging endogenous β-actin mRNA in living cells using fluorescent protein-tagged pumilio.

Yoshimura H, Inaguma A, Yamada T, Ozawa T

ACS chemical biology 7(6) 999-1005 2012年6月査読有り
Visualization of Nonengineered Single mRNAs in Living Cells Using Genetically Encoded Fluorescent Probes

Toshimichi Yamada, Hideaki Yoshimura, Asumi Inaguma, Takeaki Ozawa

ANALYTICAL CHEMISTRY 83(14) 5708-5714 2011年7月査読有り
Ratiometric Bioluminescence Indicators for Monitoring Cyclic Adenosine 3 ',5 '-Monophosphate in Live Cells Based on Luciferase-Fragment Complementation

Masaki Takeuchi, Yasutaka Nagaoka, Toshimichi Yamada, Hideo Takakura, Takeaki Ozawa

ANALYTICAL CHEMISTRY 82(22) 9306-9313 2010年11月査読有り

MISC

Long Noncoding RNA NEAT1-Dependent SFPQ Relocation from Promoter Region to Paraspeckle Mediates IL8 Expression upon Immune Stimuli (vol 53, pg 393, 2014)

Katsutoshi Imamura, Naoto Imamachi, Gen Akizuki, Michiko Kumakura, Atsushi Kawaguchi, Kyosuke Nagata, Akihisa Kato, Yasushi Kawaguchi, Hiroki Sato, Misako Yoneda …

MOLECULAR CELL 54(6) 1055-1055 2014年6月

共同研究・競争的資金等の研究課題

ＲＮＡ結合ドメインを用いたｉｎｖｉｖｏＲＮＡ解析手法の創製と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2017年4月 - 2020年3月

山田俊理

Yamada Toshimichi

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論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

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