大田竜也 (Tatsuya Ota) - マイポータル

基本情報

所属: 総合研究大学院大学先導科学研究科生命共生体進化学専攻准教授

J-GLOBAL ID: 200901027513093504

専門：分子進化学。研究概要：免疫や生殖などの生物システムの分子進化。

研究キーワード

研究分野

経歴

2007年4月 - 現在

総合研究大学院大学生命共生体進化学専攻准教授
2015年7月 - 2019年6月

総合研究大学院大学学術情報基盤センター情報基盤整備推進部長
2013年4月 - 2015年6月

総合研究大学院大学情報基盤センターセンター長
2006年10月 - 2013年3月

総合研究大学院大学葉山情報ネットワークセンター長
2006年4月 - 2007年3月

総合研究大学院大学助教授
1999年4月 - 2006年3月

総合研究大学院大学助手

所属学協会

論文

Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameral symmetry in Echinoderms

Yongxin Li, Akihito Omori, Rachel L. Flores, Sheri Satterfield, Christine Nguyen, Tatsuya Ota, Toko Tsurugaya, Tetsuro Ikuta, Kazuho Ikeo, Mani Kikuchi, Jason C. K. Leong, Adrian Reich, Meng Hao, Wenting Wan, Yang Dong, Yaondong Ren, Si Zhang, Tao Zeng, Masahiro Uesaka, Yui Uchida, Xueyan Li, Tomoko F. Shibata, Takahiro Bino, Kota Ogawa, Shuji Shigenobu, Mariko Kondo, Fayou Wang, Luonan Chen, Gary Wessel, Hidetoshi Saiga, R. Andrew Cameron, Brian Livingston, Cynthia Bradham, Wen Wang, Naoki Irie

Communications Biology 3(1) 2020年12月査読有り
Spotted Gar and the Evolution of Innate Immune Receptors

Dustin J. Wcisel, Tatsuya Ota, Gary W. Litman, Jeffrey A. Yoder

JOURNAL OF EXPERIMENTAL ZOOLOGY PART B-MOLECULAR AND DEVELOPMENTAL EVOLUTION 328(7) 666 - 684 2017年11月査読有り
The spotted gar genome illuminates vertebrate evolution and facilitates human-teleost comparisons

Ingo Braasch, Andrew R. Gehrke, Jeramiah J. Smith, Kazuhiko Kawasaki, Tereza Manousaki, Jeremy Pasquier, Angel Amores, Thomas Desvignes, Peter Batzel, Julian Catchen, Aaron M. Berlin, Michael S. Campbell, Daniel Barrell, Kyle J. Martin, John F. Mulley, Vydianathan Ravi, Alison P. Lee, Tetsuya Nakamura, Domitille Chalopin, Shaohua Fan, Dustin Wcisel, Cristian Canestro, Jason Sydes, Felix E. G. Beaudry, Yi Sun, Jana Hertel, Michael J. Beam, Mario Fasold, Mikio Ishiyama, Jeremy Johnson, Steffi Kehr, Marcia Lara, John H. Letaw, Gary W. Litman, Ronda T. Litman, Masato Mikami, Tatsuya Ota, Nil Ratan Saha, Louise Williams, Peter F. Stadler, Han Wang, John S. Taylor, Quenton Fontenot, Allyse Ferrara, Stephen M. J. Searle, Bronwen Aken, Mark Yandell, Igor Schneider, Jeffrey A. Yoder, Jean-Nicolas Volff, Axel Meyer, Chris T. Amemiya, Byrappa Venkatesh, Peter W. H. Holland, Yann Guiguen, Julien Bobe, Neil H. Shubin, Federica Di Palma, Jessica Alfoeldi, Kerstin Lindblad-Toh, John H. Postlethwait

NATURE GENETICS 48(4) 427 - + 2016年4月査読有り
Natural Variation in the Flag Leaf Morphology of Rice Due to a Mutation of the NARROW LEAF 1 Gene in Oryza sativa L.

Fumio Taguchi-Shiobara, Tatsuya Ota, Kaworu Ebana, Taiichiro Ookawa, Masanori Yamasaki, Takanari Tanabata, Utako Yamanouchi, Jianzhong Wu, Nozomi Ono, Yasunori Nonoue, Kazufumi Nagata, Shuichi Fukuoka, Hideyuki Hirabayashi, Toshio Yamamoto, Masahiro Yano

GENETICS 201(2) 795 - + 2015年10月査読有り
A tetrapod-like repertoire of innate immune receptors and effectors for coelacanths

Pierre Boudinot, Jun Zou, Tatsuya Ota, Francesco Buonocore, Giuseppe Scapigliati, Adriana Canapa, John Cannon, Gary Litman, John D. Hansen

JOURNAL OF EXPERIMENTAL ZOOLOGY PART B-MOLECULAR AND DEVELOPMENTAL EVOLUTION 322(6) 415 - 437 2014年9月査読有り
Genome complexity in the coelacanth is reflected in its adaptive immune system

Nil Ratan Saha, Tatsuya Ota, Gary W. Litman, John Hansen, Zuly Parra, Ellen Hsu, Francesco Buonocore, Adriana Canapa, Jan-Fang Cheng, Chris T. Amemiya

JOURNAL OF EXPERIMENTAL ZOOLOGY PART B-MOLECULAR AND DEVELOPMENTAL EVOLUTION 322(6) 438 - 463 2014年9月査読有り
The African coelacanth genome provides insights into tetrapod evolution.

Chris T Amemiya, Jessica Alföldi, Alison P Lee, Shaohua Fan, Hervé Philippe, Iain Maccallum, Ingo Braasch, Tereza Manousaki, Igor Schneider, Nicolas Rohner, Chris Organ, Domitille Chalopin, Jeramiah J Smith, Mark Robinson, Rosemary A Dorrington, Marco Gerdol, Bronwen Aken, Maria Assunta Biscotti, Marco Barucca, Denis Baurain, Aaron M Berlin, Gregory L Blatch, Francesco Buonocore, Thorsten Burmester, Michael S Campbell, Adriana Canapa, John P Cannon, Alan Christoffels, Gianluca De Moro, Adrienne L Edkins, Lin Fan, Anna Maria Fausto, Nathalie Feiner, Mariko Forconi, Junaid Gamieldien, Sante Gnerre, Andreas Gnirke, Jared V Goldstone, Wilfried Haerty, Mark E Hahn, Uljana Hesse, Steve Hoffmann, Jeremy Johnson, Sibel I Karchner, Shigehiro Kuraku, Marcia Lara, Joshua Z Levin, Gary W Litman, Evan Mauceli, Tsutomu Miyake, M Gail Mueller, David R Nelson, Anne Nitsche, Ettore Olmo, Tatsuya Ota, Alberto Pallavicini, Sumir Panji, Barbara Picone, Chris P Ponting, Sonja J Prohaska, Dariusz Przybylski, Nil Ratan Saha, Vydianathan Ravi, Filipe J Ribeiro, Tatjana Sauka-Spengler, Giuseppe Scapigliati, Stephen M J Searle, Ted Sharpe, Oleg Simakov, Peter F Stadler, John J Stegeman, Kenta Sumiyama, Diana Tabbaa, Hakim Tafer, Jason Turner-Maier, Peter van Heusden, Simon White, Louise Williams, Mark Yandell, Henner Brinkmann, Jean-Nicolas Volff, Clifford J Tabin, Neil Shubin, Manfred Schartl, David B Jaffe, John H Postlethwait, Byrappa Venkatesh, Federica Di Palma, Eric S Lander, Axel Meyer, Kerstin Lindblad-Toh

Nature 496(7445) 311 - 6 2013年4月18日査読有り
S-LOCUS EARLY FLOWERING 3 Is Exclusively Present in the Genomes of Short-Styled Buckwheat Plants that Exhibit Heteromorphic Self-Incompatibility

Yasuo Yasui, Masashi Mori, Jotaro Aii, Tomoko Abe, Daiki Matsumoto, Shingo Sato, Yoriko Hayashi, Ohmi Ohnishi, Tatsuya Ota

PLOS ONE 7(2) e31264 2012年2月査読有り
Comparative genomic analysis of the proteasome β5t subunit gene: implications for the origin and evolution of thymoproteasomes

Yoichi Sutoh, Mizuho Kondo, Yuko Ohta, Tatsuya Ota, Utano Tomaru, Martin F. Flajnik, Masanori Kasahara

Immunogenetics 64(1) 49 - 58 2012年1月査読有り
The basis for haplotype complexity in VCBPs, an immune-type receptor in amphioxus

Larry J. Dishaw, Tatsuya Ota, M. Gail Mueller, John P. Cannon, Robert N. Haire, Natasha R. Gwatney, Ronda T. Litman, Gary W. Litman

IMMUNOGENETICS 62(9) 623 - 631 2010年9月査読有り
Genomic complexity of the variable region-containing chitin-binding proteins in amphioxus

Larry J. Dishaw, M. Gail Mueller, Natasha Gwatney, John P. Cannon, Robert N. Haire, Ronda T. Litman, Chris T. Amemiya, Tatsuya Ota, Lee Rowen, Gustavo Glusman, Gary W. Litman

BMC GENETICS 9 78 2008年12月査読有り
Construction of a BAC library for buckwheat genome research - An application to positional cloning of agriculturally valuable traits

Yasuo Yasui, Masashi Mori, Daiki Matsumoto, Ohmi Ohnishi, Clayton G. Campbell, Tatsuya Ota

GENES & GENETIC SYSTEMS 83(5) 393 - 401 2008年10月査読有り
Zebrafish mutants with disrupted early T-cell and thymus development identified in early pressure screen

Nikolaus S. Trede, Tatsuya Ota, Hirohide Kawasaki, Barry H. Paw, Tammisty Katz, Bradley Demarest, Sarah Hutchinson, Yi Zhou, Candace Hersey, Agustin Zapata, Chris T. Amemiya, Leonard I. Zon

DEVELOPMENTAL DYNAMICS 237(9) 2575 - 2584 2008年9月査読有り
Ancient divergence of a complex family of immune-type receptor genes

John P. Cannon, Robert N. Haire, M. Gail Mueller, Ronda T. Litman, Donna D. Eason, Deborah Tinnemore, Chris T. Amemiya, Tatsuya Ota, Gary W. Litman

IMMUNOGENETICS 58(5-6) 362 - 373 2006年6月査読有り
Resolution of the novel immune-type receptor gene cluster in zebrafish

JA Yoder, RT Litman, MG Mueller, S Desai, KP Dobrinski, JS Montgomery, MP Buzzeo, T Ota, CT Amemiya, NS Trede, S Wei, JY Djeu, S Humphray, K Jekosch, JAH Prada, DA Ostrov, GW Litman

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 101(44) 15706 - 15711 2004年11月査読有り
Construction of a bacterial artificial chromosome library from the inshore hagfish, Eptatretus burgeri: A resource for the analysis of the agnathan genome

T Suzuki, T Ota, A Fujiyama, M Kasahara

GENES & GENETIC SYSTEMS 79(4) 251 - 253 2004年8月査読有り
T cells and the thymus in developing zebrafish

N Danilova, VS Hohman, F Sacher, T Ota, CE Willett, LA Steiner

DEVELOPMENTAL AND COMPARATIVE IMMUNOLOGY 28(7-8) 755 - 767 2004年6月査読有り
Lineage-restricted retention of a primitive immunoglobulin heavy chain isotype within the Dipnoi reveals an evolutionary paradox

T Ota, JP Rast, GW Litman, CT Amemiya

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 100(5) 2501 - 2506 2003年3月査読有り
Positive Darwinian selection operating on the immunoglobulin heavy chain of antarctic fishes

T Ota, TA Nguyen, E Huang, HW Detrich, CT Amemiya

JOURNAL OF EXPERIMENTAL ZOOLOGY PART B-MOLECULAR AND DEVELOPMENTAL EVOLUTION 295B(1) 45 - 58 2003年2月査読有り
Cloning novel immune-type inhibitory receptors from the rainbow trout, Oncorhynchus mykiss

JA Yoder, MG Mueller, KM Nichols, SS Ristow, GH Thorgaard, T Ota, GW Litman

IMMUNOGENETICS 54(9) 662 - 670 2002年12月査読有り

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書籍等出版物

進化学事典 (日本進化学会編)

大田竜也(担当:分担執筆, 範囲:19.6 分子進化学、 19.7 塩基配列とアミノ酸配列データの解析)

共立出版 2012年4月 (ISBN: 9784320057777)
比較ゲノム学から読み解く生命システム基本概念から最新ゲノム情報まで（藤山秋佐夫監修）

大田竜也(担当:分担執筆, 範囲:第１６章進化系統樹－正しい読み方・書き方ガイダンス)

秀潤社 2007年9月 (ISBN: 9784879623607)
分子進化と分子系統学 (根井正利、Sudhir Kumar 共著、根井正利監訳・改訂)

大田竜也, 竹崎直子(担当:共訳)

培風館 2006年7月
新移植免疫学（藤原大美編）

大田竜也, 笠原正典(担当:分担執筆, 範囲:第１章自己・非自己識別システムの進化)

中外医学社 2000年10月 (ISBN: 4498006569)
Weir's handbook of experimental immunology (Leonore A. Herzenberg, Donald M. Weir, Leonard A. Herzenberg, Caroline Blackwell (eds))

Tatsuya Ota(担当:分担執筆, 範囲:Chapter 8. Molecular evolution of immunoglobulin VH segments.)

Blackwell Science 1997年 (ISBN: 0865425728)
Nonmammalian genomic analysis: a practical guide (Bruce Birren, Eric Lai (eds))

Chris T. Amemiya, Tatsuya Ota, Gary W. Litman(担当:分担執筆, 範囲:Chapter 8. Construction of P1 artificial chromosome (PAC) libraries from lower vertebrates.)

Academic Press 1996年 (ISBN: 0121012859)
Current Topics on molecular evolution (Masatoshi Nei, Naoyuki Takahata (eds))

Chris T. Amemiya, Tatsuya Ota, Jonatha, P. Rast, Leonard I. Zon, Gary W. Litman(担当:分担執筆, 範囲:Chapter 17. Organization and evolution of immunoglobulin genes, and identification of genes involved in regulation and ontogeny of the immune system.)

Institute of molecular evolutionary genetics, The Pennsylvania State University, USA. Graduate School for Advanced Studies, Hayama, Japan 1995年
Current Topics on molecular evolution (Masatoshi Nei, Naoyuki Takahata(eds))

Tatsuya Ota, Martin Margittai, Jonathan, P. Rast, Ronda T. Litman, Gary W. Litman, Chris T. Amemiya(担当:分担執筆, 範囲:Chapter 16. Studies on the early evolution of immunoglobulin genes.)

Institute of molecular evolutionary genetics, The Pennsylvania State University, USA. Graduate School for Advanced Studies, Hayama, Japan 1995年
Genetics of cellular, individual, family and population variability (C.F. Sing and C.L. Hanis (eds))

Masatoshi Nei, Gregory Livshits, Tatsuya Ota(担当:分担執筆, 範囲:Chapter 16. Genetic variation and evolution of human populations.)

Oxford University Press 1993年 (ISBN: 0195066251)
Evolution of life. Fossils, molecules, amd culture (Shozo Osawa, Tasuku Honjo (eds))

Masatoshi Nei, Tatsuya Ota(担当:分担執筆, 範囲:Chapter 4.4. Evolutionary relationships of human populations at the molecular level.)

Springer-Verlag 1991年 (ISBN: 0387700641)

MISC

The spotted gar genome illuminates vertebrate evolution and facilitates human-teleost comparisons (vol 48, pg 427, 2016)

Ingo Braasch, Andrew R. Gehrke, Jeramiah J. Smith, Kazuhiko Kawasaki, Tereza Manousaki, Jeremy Pasquier, Angel Amores, Thomas Desvignes, Peter Batzel, Julian Catchen, Aaron M. Berlin, Michael S. Campbell, Daniel Barrell, Kyle J. Martin, John F. Mulley, Vydianathan Ravi, Alison P. Lee, Tetsuya Nakamura, Domitille Chalopin, Shaohua Fan, Dustin Wcisel, Cristian Canestro, Jason Sydes, Felix E. G. Beaudry, Yi Sun, Jana Hertel, Michael J. Beam, Mario Fasold, Mikio Ishiyama, Jeremy Johnson, Steffi Kehr, Marcia Lara, John H. Letaw, Gary W. Litman, Ronda T. Litman, Masato Mikami, Tatsuya Ota, Nil Ratan Saha, Louise Williams, Peter F. Stadler, Han Wang, John S. Taylor, Quenton Fontenot, Allyse Ferrara, Stephen M. J. Searle, Bronwen Aken, Mark Yandell, Igor Schneider, Jeffrey A. Yoder, Jean-Nicolas Volff, Axel Meyer, Chris T. Amemiya, Byrappa Venkatesh, Peter W. H. Holland, Yann Guiguen, Julien Bobe, Neil H. Shubin, Federica Di Palma, Jessica Alfoldi, Kerstin Lindblad-Toh, John H. Postlethwait

NATURE GENETICS 48(6) 700 - 700 2016年6月
Searching for the genes responsible for heterostylous self-incompatibility in buckwheat - the detection of S-ELF3 gene

Yasuo Yasui, Masashi Mori, Jotaro Aii, Tomoko Abe, Daiki Matsumoto, Shingo Sato, Yoriko Hayashi, Ohmi Ohnishi, Tatsuya Ota

GENES & GENETIC SYSTEMS 87(6) 399 - 399 2012年12月
Positional cloning of the genes determining heterostylous self-incompatibility in buckwheat

Tatsuya Ota, Masashi Mori, Mari Mori, Daiki Matsumoto, Ohmi Ohnishi, Clayton Campbell, Yasuo Yasui

GENES & GENETIC SYSTEMS 81(6) 444 - 444 2006年12月

講演・口頭発表等

ソバ属植物におけるゲノムの進化

Jeffrey Fawcett, 上野まりこ, 大澤良, 大田竜也, 齊藤大樹, 白澤健太, 竹島亮馬, 中崎鉄也, 西村和紗, 原尚資, 平川英樹, 松井勝弘, 水野信之, 安井康夫

日本遺伝学会 2019年9月13日
ソバにおける異型花型自家不和合性遺伝子座のゲノム解析

大田竜也, 相井城太郎, 上野まりこ, 大澤良, 齊藤大樹, 白澤健太, 竹島亮馬, 中崎鉄也, 西村和紗, 原尚資, 平川英樹, Jeffrey Fawcett, 松井勝弘, 水野信之, 安井康夫

日本育種学会第１３６講演会 2019年9月
Identification of genes at the S-locus controlling heteromorphic self-incompatibility in buckwheat through genetic and genomic analyses

安井康夫, 水野信之, 相井城太郎, 大田竜也

The annual meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution 2018 2018年7月招待有り
フツウソバにおける異形花型自家不和合性遺伝子座の解析

秋山彩香, 相井城太郎, 佐藤真吾, 田巻茜, 中野絢菜, 安井康夫, 森正之, 大田竜也, 田中宥司

第133回日本育種学会 2018年3月
異型花型自家不和合性を示すソバの雄蕊におけるトランスクリプトーム解析

相井城太郎, 大田竜也, 安井康夫, 森正之, 佐藤真吾, 田巻茜, 中野絢菜, キャンベルクレイトン, 長野美緒, 田中宥司

第130回日本育種学会 2016年9月
フツウソバにおける異型花型自家不和合性 -ゲノム・トランスクリプトーム解析を踏まえて-

大田竜也

分子進化学の現状と今後の展望 2016年8月招待有り
異型花型自家不和合性を示すソバにおけるトランスクリプトーム解析

相井城太郎, 安井康夫, 佐藤真吾, 田巻茜, 中野絢菜, 森正之, 田中宥司, 大田竜也

第18回日本進化学会 2016年8月
イネNARROW LEAF 1遺伝子の１アミノ酸置換が止め葉形態の自然変異に寄与する

田口文緒, 大田竜也, 江花薫子, 大川泰一郎, 山崎将紀, 七夕高也, 山内歌子, 呉健忠, 小野望, 野々上慈徳, 永田和史, 福岡修一, 平林秀介, 山本敏央, 矢野昌裕

第128回日本育種学会 2015年9月
南極海に生息するノトセニア亜目魚類におけるＡＴＰ合成酵素の分子進化

永田健, 大田竜也

第87回日本遺伝学会 2015年9月
Buckwheat and people in the Japanese archipelago

大田竜也, 児玉智則

総研大融合研究プロジェクト「日本列島人の起源」第２回研究会 2015年1月
RNA-seq解析によるソバ異形花型自家不和合性の雄性因子の探索

相井城太郎, 佐藤真吾, 田巻茜, 長野美緒, Clayton Campbell, 安井康夫, 森正之, 大田竜也, 田中宥司

第126回日本育種学会 2014年9月
Heteromorphic self-incompatibility in Buckwheat - Evolutionary perspectives-

大田竜也

Molecular Evolution at All Fields of Biology 2013年11月8日田村浩一郎、斎藤成也招待有り
ノトセニア亜目魚類におけるATP合成酵素の分子進化

永田健, 大田竜也

第８５回日本遺伝学会 2013年9月
Intact S-ELF 3 is exclusive to heteromorphic SI specices in Fagopyrum

Yasuo Yasui, Masashi Mori, Jotaro Aii, Shingo Sato, Ohmi Ohnishi, Tomoko Abe, Yoriko Hayashi, Daiki Matsumoto, Tatsuya Ota

12th international symposium on buckwheat 2013年8月21日招待有り
ソバの生物学～進化遺伝学の視点から～

大田竜也

第15回先導科学研究科・学術講演会 2012年11月3日
ソバにおける異型花型自家不和合性を司る遺伝子の探求 ― S-ELF3 遺伝子の発見―

安井康夫, 森正之, 相井城太郎, 阿部知子, 松本大生, 佐藤真吾, 林依子, 大西近江, 大田竜也

第84回日本遺伝学会 2012年9月
ソバ属の自殖性植物における S-LOCUS EARLY FLOWERING 3 遺伝子の崩壊

安井康夫, 森正之, 相井城太郎, 阿部知子, 佐藤信吾, 田中宥司, 松本大生, 林依子, 大西近江, 大田竜也

第122回育種学会 2012年9月
ソバの二花柱性関連遺伝子 S-LOCUS EARLY FLOWERING 3 の同定

相井城太郎, 安井康夫, 森正之, 阿部知子, 佐藤真吾, 田中宥司, 松本大生, 林依子, 大西近江, 大田竜也

第122回日本育種学会 2012年9月
スズキ目ノトセニア亜目魚類における細胞呼吸関連遺伝子の分子進化

永田健, 大田竜也

第１３回日本進化学会 2011年7月
Analysis of Hox genes of a crinoid, Oxycomanthus japonicus

Mariko Kondo, Toko Tsurugaya, Noriko Sumiyoshi, Akihito Omori, Tetsuro Ikuta, Tatsuya Ota, Kazuho Ikeo, Hidetoshi Saiga, Koji Akasaka

Developmental Biology of the Sea Urchin XX 2011年4月

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担当経験のある科目(授業)

Works(作品等)

RESTDATA

大田竜也

1994年コンピュータソフト
DISPAN

大田竜也

1993年コンピュータソフト

委員歴

2020年9月 - 現在

一般社団法人日本進化学会監事
2018年8月 - 現在

Plant Gene Associate Editor
2017年11月 - 2020年8月

一般社団法人日本進化学会専務理事
2016年8月 - 2019年12月

Agri Gene Associate Editor
2016年 - 2018年

日本進化学会事務幹事長
2008年 - 2009年

日本進化学会庶務
2005年 - 2006年

日本遺伝学会会計監査

大田竜也

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研究キーワード

研究分野

経歴

所属学協会

論文

書籍等出版物

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

Works(作品等)

委員歴

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