齋藤徹 (Toru Saito) - マイポータル

基本情報

所属: 広島市立大学情報科学研究科医用情報科学専攻准教授

学位: 博士(理学)(大阪大学)

研究者番号: 80747494
J-GLOBAL ID: 201801005138618374
researchmap会員ID: B000299723

研究キーワード

研究分野

経歴

2026年4月 - 現在

岩国YMCA保健看護専門学校, 非常勤講師
2023年4月 - 現在

広島市立大学, 大学院情報科学研究科医用情報科学専攻, 准教授
2019年4月 - 2023年3月

広島市立大学, 大学院情報科学研究科医用情報科学専攻, 講師
2016年4月 - 2019年3月

広島市立大学, 大学院情報科学研究科医用情報科学専攻, 助教
2014年5月 - 2016年3月

大阪大学, 大学院理学研究科化学専攻, 招へい研究員(兼任)
2014年2月 - 2016年3月

大阪大学, 未来戦略機構第三部門, 特任助教(常勤)
2012年4月 - 2014年1月

Max-Planck-Institut für Kohlenforschung, Theoretische Chemie, 日本学術振興会海外特別研究員
2009年4月 - 2012年3月

大阪大学, 大学院理学研究科化学専攻, 日本学術振興会特別研究員(DC1)

学歴

2009年4月 - 2012年3月

大阪大学, 理学研究科, 化学専攻博士後期課程
2007年4月 - 2009年3月

大阪大学, 理学研究科, 化学専攻博士前期課程
2003年4月 - 2007年3月

大阪大学, 理学部, 化学科

受賞

2026年3月

教員表彰（大学運営および地域・社会貢献）, 広島市立大学
2024年3月

指導学生の受賞：最優秀修士学位論文賞「量子化学計算と機械学習を併用した薬物代謝部位予測法の開発」

塩竹悠人
2024年3月

指導学生の受賞：最優秀卒業論文賞「量子化学計算と機械学習を併用した反応速度定数の予測」

金子未来
2023年3月

指導学生の受賞：最優秀卒業論文賞「自由エネルギー解析に基づくウレアーゼ阻害能の定量的評価」

末永隼也
2022年6月

日本蛋白質科学会若手奨励賞, 日本蛋白質科学会
2022年3月

教員表彰（研究および社会貢献）, 広島市立大学
2018年3月

指導学生の受賞：最優秀卒業論文賞「Ni(III)2(bis-mu-oxo)錯体の電子状態と反応活性に関する研究」

三上由美子
2011年

Travel Scholarship (ISTCP-VII)

論文

103

Molecular Docking, MM/GBSA, FEP/MD, and DFT/MM MD Studies on Predicting Binding Affinity of Carbonic Anhydrase II Inhibitors

Ryoma Shimizu, Yu Takano, Toru Saito

Physical Chemistry Chemical Physics 2026年3月査読有り最終著者責任著者
Site of metabolism prediction for aldehyde oxidase using molecular docking and molecular dynamics simulations

Ryoma Shimizu, Naoki Isemura, Yu Takano, Toru Saito

Chemistry Letters 54(11) 2025年10月28日査読有り最終著者責任著者
Nitrosation mechanisms, kinetics, and dynamics of the guanine and 9-methylguanine radical cations by nitric oxide—Radical–radical combination at different electron configurations

Jonathan Benny, Toru Saito, Jianbo Liu

The Journal of Chemical Physics 161(12) 2024年9月25日査読有り責任著者
C–H Bond Dissociation Enthalpy Prediction with Machine Learning Reinforced Semi-empirical Quantum Mechanical Calculations

Miki Kaneko, Yu Takano, Toru Saito

Chemistry Letters 53 upae016 2024年1月31日査読有り最終著者責任著者
Semi-empirical and machine learning-based prediction of site of metabolisms mediated by aldehyde oxidase

Yuto Shiotake, Yu Takano, Toru Saito

Chemical Physics Letters 833 140942-140942 2023年12月査読有り最終著者責任著者
Unraveling Binding Mechanism and Stability of Urease Inhibitors: A QM/MM MD Study

Shunya Suenaga, Yu Takano, Toru Saito

Molecules 28(6) 2697-2697 2023年3月16日査読有り最終著者責任著者
開殻電子状態を有する生体高分子の分子シミュレーション

齋藤徹

アンサンブル 25 13-18 2023年査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Singlet O₂Oxidation of the Radical Cation versus the Dehydrogenated Neutral Radical of 9-Methylguanine in a Watson–Crick Base Pair. Consequences of Structural Context

May Myat Moe, Toru Saito, Midas Tsai, Jianbo Liu

The Journal of Physical Chemistry B 126(29) 5458-5472 2022年7月18日査読有り
QM/MM Molecular Dynamics Simulations Revealed Catalytic Mechanism of Urease

Toru Saito, Yu Takano

The Journal of Physical Chemistry B 126(10) 2087-2097 2022年3月17日査読有り筆頭著者責任著者
Singlet O₂ Reactions with Radical Cations of 8-Bromoguanine and 8-Bromoguanosine: Guided-Ion Beam Mass Spectrometric Measurements and Theoretical Treatments

Jonathan Benny, Toru Saito, May Myat Moe, Jianbo Liu

The Journal of Physical Chemistry A 126(1) 68-79 2022年1月13日査読有り責任著者
Spin-projected QM/MM Free Energy Simulations for Oxidation Reaction of Guanine in B-DNA by Singlet Oxygen

T. Saito, Y. Takano

ChemPhysChem 22 561-568 2021年査読有り筆頭著者責任著者
Quantitative Assessment of Reparameterized PM6 (rPM6) for Hydrogen Abstraction Reactions

T. Saito, H. Kambara, Y. Takano

Molecular Physics 114 e1700313 2020年査読有り筆頭著者責任著者
UNO DMRG CAS CI calculations of binuclear manganese complex Mn(IV)2O2(NHCHCO2)4: Scope and applicability of Heisenberg model

T. Kawakami, K. Miyagawa, S. Sharma, T. Saito, M. Shoji, S. Yamada, S. Yamanaka, M. Okumura, T. Nakajima, K. Yamaguchi

Journal of Computational Chemistry 40 333-341 2019年査読有り
Singlet-Triplet Energy Gaps in Binuclear Copper Complexes and Organic Diradicals by Approximate Spin Projected Spin-unrestricted Coupled Cluster Method

T. Saito, Y. Takano

Chemistry Letters 48 1441-1444 2019年査読有り筆頭著者責任著者
A Bis(μ-oxido)dinickel(III) Complex with a Triplet Ground State

Yuma Morimoto, Yusaku Takagi, Toru Saito, Takehiro Ohta, Takashi Ogura, Norimitsu Tohnai, Motohiro Nakano, Shinobu Itoh

Angewandte Chemie 130(26) 7766-7769 2018年6月25日招待有り
A Bis(μ-oxido)dinickel(III) Complex with a Triplet Ground State

Y. Morimoto, Y. Takagi, T. Saito, T. Ohta, T. Ogura, N. Tohnai, M. Nakano, S. Itoh

Angewandte Chemie International Edition 57(26) 7640-7643 2018年6月25日査読有り
rPM6 parameters for phosphorous and sulphur-containing open-shell molecules

Toru Saito, Yu Takano

Molecular Physics 116(5-6) 602-610 2018年3月19日査読有り筆頭著者責任著者
Transition State Search Using rPM6: Iron- and Manganese-catalyzed Oxidation Reactions as a Test Case

T. Saito, Y. Takano

Bulletin of the Chemical Society of Japan 91 1377-1389 2018年査読有り筆頭著者責任著者
近似スピン射影法の開発と多核遷移金属錯体の電子状態・分子構造・物性解明への展開

北河康隆, 齋藤徹, 山口兆

Bulletin of Japan Society of Coordination Chemistry (Accounts) 71 57-68 2018年査読有り
Quantitative Assessment of rPM6 for Fluorine- and Chlorine-Containing Metal Complexes: Comparison with Experimental, First-Principles, and Other Semiempirical Results

T. Saito, M. Fujiwara, Y. Takano

Molecules 23 3332-1-3332-17 2018年査読有り筆頭著者責任著者

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MISC

基底状態の分子物性の計算

齋藤徹

理論化学会誌フロンティア 26(7) 92-111 2025年4月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Instability in chemical bonds from broken-symmetry single-reference to symmetry-adapted multireference approaches to strongly correlated electron systems

K. Yamaguchi, S. Yamanaka, H. Isobe, K. Kawakami, Y. Kitagawa, R. Takeda, T. Saito, M. Nishihara, M. Okumura

AIP Conference Proceedings 1108 20-29 2009年5月15日
七核銅錯体における電子状態と磁性についての理論的解明

庄司光男, 齋藤徹, 伊藤正秀, 小泉健一, 北河康隆, 山中秀介, 奥村光隆, 山口兆, 藤岡準治, 井頭麻子 …

日本化学会講演予稿集 87th(1) 2007年

書籍等出版物

Approximate spin projection for broken-symmetry method and its application" in Symmetry (Group Theory) and Mathematical Treatment in Chemistry

Y. Kitagawa, T. Saito, K. Yamaguchi (担当:共著)

IntechOpen 2018年
“Approximate Spin Projection for Geometry Optimization of Biradical Systems: Case Studies of Through-Space and Through-Bond Systems” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics

N. Yasuda, Y. Kitagawa, H. Hatake, T. Saito, Y. Kataoka, T. Matsui, T. Kawakami, S. Yamanaka, M. Okumura, K. Yamaguchi (担当:共著)

Springer Verlag 2012年
Calculation of Magnetic Properties and Spectroscopic Parameters of Manganese Clusters with Density Functional Theory” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics

K. Kanda, S. Yamanaka, T. Saito, Y. Kitagawa, T. Kawakami, M. Okumura, K. Yamaguchi (担当:共著)

Springer Verlag 2012年
Density Functional Study of Manganese Complexes: Protonation Effects on Geometry and Magnetism” In Progess in Theoretical Chemistry and Physics

S. Yamanaka, K. Kanda, T. Saito, Y. Kitagawa, T. Kawakami, M. Ehara, M. Okumura, H. Nakamura, K. Yamaguchi (担当:共著)

Springer Verlag 2012年
Electronic and Spin Structures of the CaMn4O5(H2O)4 Cluster in OEC of PSII Refined to 1.9 Å X-ray Resolution" Advances in Quantum Chemistry

S. Yamanaka, K. Kanda, T. Saito, Y. Umena, K. Kawakami, J.-R. Shen, N. Kamiya, M. Okumura, H. Nakamura, K. Yamaguchi (担当:共著)

Elsevier 2012年
エネルギー科学における多階層連結コンピューティング (第4章、分担執筆)

財団法人国際高等研究所 2011年3月25日 (ISBN: 9784906671854)

講演・口頭発表等

157

金属酵素-リガンド相互作用の定量的評価を目指して

九重分子科学セミナー2026 2026年9月4日招待有り
塩素化反応触媒能をもつ人工金属酵素を理論設計する

予知生合成科学第八回公開シンポジウム 2026年7月11日
分子シミュレーションと深層学習による金属酵素阻害剤の評価

清水良真, 齋藤徹

第28回理論化学討論会 2026年5月20日
Integration of Molecular Simulation and Chemoinformatics for Inhibition and Engineering of Metalloenzymes

Ryoma Shimizu, Toru Saito

Pacifichem 2025 2025年12月17日
深層学習モデル構築に向けた金属酵素リガンドの結合自由エネルギーの評価

清水良真, 齋藤

第48回ケモインフォマティクス討論会 2025年11月26日
Structure-based法によるアルデヒドオキシダーゼの代謝部位予測

伊勢村尚希, 清水良真, 齋藤徹

日本化学会中国四国支部大会香川大会 2025年11月23日
結合⾃由エネルギーによる⾦属酵素阻害活性モデルの構築

日本化学会中国四国支部大会香川大会 2025年11月23日
生体高分子の量子化学計算：金属酵素機能の「解明」から「設計」へ

齋藤徹

第9回生命分子科学研究会ポストミーティング 2025年9月18日招待有り
結合⾃由エネルギーによる⾦属酵素阻害活性の評価

清水良真, 齋藤徹

第19回分子科学討論会 2025年9月11日
塩素化反応触媒能をもつ人工金属酵素を理論設計する

予知生合成科学第六回公開シンポジウム 2025年7月18日
Prediction of Inhibitory Activity of Carbonic Anhydrases Using Free Energy Perturbation Simulations

Ryoma Shimizu, Toru Saito

APATCC-11 2025年4月25日
Molecular Simulation and Chemoinformatics Studies on Inhibition Mechanism of Metalloenzymes

Toru Saito

APATCC-11 2025年4月23日招待有り
⾃由エネルギー摂動法による⾦属酵素阻害剤の結合⾃由エネルギーの評価

日本化学会中国四国支部大会岡山大会 2024年11月16日
配座解析と量⼦化学計算/機械学習による薬物代謝部位予測

日本化学会中国四国支部大会岡山大会 2024年11月16日
ケモインフォマティクスによるIDO1の阻害剤設計に向けた機械学習モデルの開発

第57回酸化反応討論会 2024年11月16日
Δ-Machine learningによる酸化反応の予測

第57回酸化反応討論会 2024年11月16日
QM計算とQM/MM-MD計算によるDNA塩基対の二重プロトン移動の機構解析

日本化学会第104春季年会 2024年3月18日
SQM-MLによる芳香族化合物のNMR化学シフトの自動予測

日本化学会第104春季年会 2024年3月18日
ケモインフォマティクスによるIDO1阻害剤の結合自由エネルギーの評価

日本化学会第104春季年会 2024年3月18日
SQM-MLモデルによる結合解離自由エネルギーの予測

日本化学会第104春季年会 2024年3月18日

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

塩素化反応触媒能をもつ人工金属酵素を理論設計する

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2025年4月 - 2027年3月

齋藤徹
酸化還元酵素の阻害活性予測モデルの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

齋藤徹
金属酵素の酵素反応機構およびリガンド相互作用の定量的解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

齋藤徹
生体分子シミュレーションを用いたウレアーゼ阻害剤の設計

益財団法人サタケ技術振興財団 2022年度大学研究助成金 2022年4月 - 2023年3月

齋藤徹
生体分子中の窒素の特性を，中性子回折と計算化学により解明する

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2019年2月 - 2023年3月

尾瀬農之, 齋藤徹, 塚本卓
タンパク質構造形成の高次構造依存性の解明と高次構造依存型分子力場の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

鷹野優, 中村春木, 齋藤徹, 近藤寛子
新規医薬品設計に向けた薬物代謝反応の計算化学的研究

公益財団法人サタケ技術振興財団平成30年度大学研究助成金 2018年4月 - 2019年3月

齋藤徹
金属酵素の反応活性と動的構造変化の理論的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

齋藤徹
分子シミュレーションによる生体活性サイトの構造・機能相関の解明とデザイン

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

鷹野優, 石北央, 兼松佑典, 米澤康滋, 齋藤徹, 重田育照, 神谷克政, 庄司光男, 近藤寛子
ビラジカル遷移状態計算法の深化と実在分子における反応機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年7月 - 2018年3月

北河康隆, 齋藤徹, 浅岡瑞稀, 宮城公磁, 寺本玲奈, 名取圭紀, 青木笙悟, 江良伊織, 多田隼人, 中野雅由
局在スピンを持つ金属酵素活性中心とその模倣錯体の反応機構に関する理論的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2009年4月 - 2012年3月

齋藤徹

社会貢献活動

いちだい情報インターンシップ

講師, 助言・指導

2026年8月31日 - 2026年9月4日
情報I 入試対策講座〜夏期パワーアップ編〜

講師, 助言・指導, 運営参加・支援

2026年7月31日
情報I 入試対策講座島根県立松江東高等学校

講師, 助言・指導, 運営参加・支援

2026年7月27日 - 2026年7月28日
令和7年度広島県科学セミナー第3回科学セミナー審査委員

助言・指導

2026年2月1日 - 2026年2月1日
令和7年度広島県立広島国泰寺高等学校課題研究成果発表会

助言・指導

2026年1月30日 - 2026年1月30日
「情報I」ステップアップ講座

講師, 運営参加・支援

2025年12月24日 - 2025年12月24日
第15回量子化学スクール講師「分子物性の計算」

講師

2025年12月10日 - 2025年12月10日
令和7年度広島県科学セミナー第2回科学セミナー講師、指導、助言

講師, 助言・指導

2025年10月25日 - 2025年10月25日
「情報I」パワーアップ講座

講師, 運営参加・支援

2025年7月26日 - 2025年9月6日
模擬授業「コンピュータを使った医薬品設計」広島市立沼田高等学校

講師

2025年6月24日 - 2025年6月24日
令和6年度広島県科学セミナー第3回科学セミナー審査委員

助言・指導

2025年2月2日 - 2025年2月2日
令和6年度広島県立広島国泰寺高等学校課題研究成果発表会

助言・指導

2025年1月31日 - 2025年1月31日
広島市立大学情報科学部冬期「情報I」特訓セミナー

講師

2024年12月25日 - 2024年12月26日
第14回量子化学スクール講師「分子物性の計算」

講師

2024年12月11日 - 2024年12月11日
模擬授業「シミュレーションとAIを使って化学と生物学に挑む」広島市立広島中等教育学校

講師

2024年7月12日 - 2024年7月12日
令和5年度広島県立広島国泰寺高等学校課題研究成果発表会

助言・指導

2024年3月19日
令和5年度広島県科学セミナー第3回科学セミナー審査委員

運営参加・支援

2024年2月10日 - 2024年2月10日
令和5年度広島県科学セミナー第2回科学セミナー助言・指導

助言・指導

2023年12月16日 - 2023年12月16日
第13回量子化学スクール講師「分子物性の計算」

講師

2023年12月 - 2023年12月
ひろしま医工学スクールハンズオンチュートリアル「コンピュータを使った医薬品設計」

講師

2023年8月 - 2023年8月

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その他

化学と工業 vol....

2021年8月 - 2021年8月

化学と工業 vol. 74 特集理論・計算化学による生体分子の機能解明
査読歴

International Journal of Quantum Chemistry Journal of Physical Chemistry A Journal of Physical Chemistry B Journal of American Chemical Society Bulletin of the Chemical Society of Japan Chemistry – An Asian Journal Asian Journal of Organic Chemistry Chemistry Letters Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry Journal of Computational Chemistry Nature Communications Biomedicines Nature Synthesis Inorganic Chemistry The FEBS Journal PLOS One Journal of Chemistry Molecular Physics Chemistry Select

齋藤徹

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受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

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共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

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