田中剛 (Tsuyoshi Tanaka) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基盤技術研究本部　研究推進室上級研究員

学位: 博士（理学）(総合研究大学院大学)

研究者番号: 70414919
J-GLOBAL ID: 201601002198905930
researchmap会員ID: B000259587

外部リンク: http://www.naro.affrc.go.jp/nics-neo/introduction/chart/0505/index.html

情報解析の分野から農学研究に足を踏み入れて、10年以上植物のゲノム情報解析を行ってまいりました。ゲノム配列そのものを決定する、ゲノム情報から機能情報を抽出する、ゲノム情報を利用可能な形に成型する、といった一連の流れを行っていく中で、様々な作物種におけるゲノム育種の推進に努めております。

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

受賞

2016年3月

日本育種学会奨励賞ムギ類のゲノム配列情報解析に関する研究 (一) 日本育種学会

田中剛
2015年7月

NIAS研究奨励賞ムギ類におけるゲノム情報解析及び情報リソース整備 (国) 農業生物資源研究所

田中剛

論文

Combination of long-read and short-read sequencing provides comprehensive transcriptome and new insight for Chrysanthemum morifolium ray-floret colorization

Mitsuko Kishi-Kaboshi, Tsuyoshi Tanaka, Katsutomo Sasaki, Naonobu Noda, Ryutaro Aida

Scientific Reports 12(1) 2022年10月25日
SUPPRESSOR OF GAMMA RESPONSE 1 plays rice-specific roles in DNA damage response and repair

Ayako Nishizawa-Yokoi, Ritsuko Motoyama, Tsuyoshi Tanaka, Akiko Mori, Keiko Iida, Seiichi Toki

Plant Physiology 2022年10月22日
Polymorphism of HvDRO1 and HvqSOR1 associated with root growth angle in barley accessions

Yuki Nakano, Junpei Konishi, Hirotake Ito, Tsuyoshi Tanaka, Masako Seki, Hideyuki Aoki, Takashi Nagamine

Plant Root 16 1-10 2022年3月16日査読有り
Two dominant genes in barley (Hordeum vulgare L.) complementarily encode perfect resistance to Japanese soil-borne wheat mosaic virus

Kaori Okada, Tsuyoshi Tanaka, Shuichi Fukuoka, Youko Oono, Kohei Mishina, Tetsuo Oikawa, Kazuhiro Sato, Tsuneo Kato, Takao Komatsuda, Kiyoshi Namai

Breeding Science 72(5) 372-382 2022年
Developing core marker sets for effective genomic-assisted selection in wheat and barley breeding programs

Goro Ishikawa, Hiroaki Sakai, Nobuyuki Mizuno, Elena Solovieva, Tsuyoshi Tanaka, Kazuki Matsubara

Breeding Science 72(3) 257-266 2022年
Reference Genome Sequencing and Advances in Genomic Resources in Common Wheat–Chromosome 6B Project in Japan

Fuminori KOBAYASHI, Tsuyoshi TANAKA, Hiroyuki KANAMORI, Jianzhong WU, Hirokazu HANDA

Japan Agricultural Research Quarterly: JARQ 55(4) 285-294 2021年10月1日査読有り
Multiple Wheat Genomes Reveal Novel Gli-2 Sublocus Location and Variation of Celiac Disease Epitopes in Duplicated α-Gliadin Genes

Gwyneth Halstead-Nussloch, Tsuyoshi Tanaka, Dario Copetti, Timothy Paape, Fuminori Kobayashi, Masaomi Hatakeyama, Hiroyuki Kanamori, Jianzhong Wu, Martin Mascher, Kanako Kawaura, Kentaro K. Shimizu, Hirokazu Handa

Frontiers in Plant Science 12 715985-715985 2021年9月3日査読有り
iPOTs: Internet of Things-based pot system controlling optional treatment of soil water condition for plant phenotyping under drought stress.

Yuko Numajiri, Kanami Yoshino, Shota Teramoto, Atsushi Hayashi, Ryo Nishijima, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

The Plant journal : for cell and molecular biology 107(5) 1569-1580 2021年7月1日査読有り
Characterization of the genomic sequence data around common cutworm resistance genes in soybean (Glycine max) using short- and long-read sequencing methods

Eri Ogiso-Tanaka, Nobuhiko Oki, Tsuyoshi Tanaka, Takehiko Shimizu, Masao Ishimoto, Makita Hajika, Akito Kaga

Data in Brief 34 106577-106577 2021年2月査読有り
Multiple wheat genomes reveal global variation in modern breeding.

Sean Walkowiak, Liangliang Gao, Cecile Monat, Georg Haberer, Mulualem T Kassa, Jemima Brinton, Ricardo H Ramirez-Gonzalez, Markus C Kolodziej, Emily Delorean, Dinushika Thambugala, Valentyna Klymiuk, Brook Byrns, Heidrun Gundlach, Venkat Bandi, Jorge Nunez Siri, Kirby Nilsen, Catharine Aquino, Axel Himmelbach, Dario Copetti, Tomohiro Ban, Luca Venturini, Michael Bevan, Bernardo Clavijo, Dal-Hoe Koo, Jennifer Ens, Krystalee Wiebe, Amidou N'Diaye, Allen K Fritz, Carl Gutwin, Anne Fiebig, Christine Fosker, Bin Xiao Fu, Gonzalo Garcia Accinelli, Keith A Gardner, Nick Fradgley, Juan Gutierrez-Gonzalez, Gwyneth Halstead-Nussloch, Masaomi Hatakeyama, Chu Shin Koh, Jasline Deek, Alejandro C Costamagna, Pierre Fobert, Darren Heavens, Hiroyuki Kanamori, Kanako Kawaura, Fuminori Kobayashi, Ksenia Krasileva, Tony Kuo, Neil McKenzie, Kazuki Murata, Yusuke Nabeka, Timothy Paape, Sudharsan Padmarasu, Lawrence Percival-Alwyn, Sateesh Kagale, Uwe Scholz, Jun Sese, Philomin Juliana, Ravi Singh, Rie Shimizu-Inatsugi, David Swarbreck, James Cockram, Hikmet Budak, Toshiaki Tameshige, Tsuyoshi Tanaka, Hiroyuki Tsuji, Jonathan Wright, Jianzhong Wu, Burkhard Steuernagel, Ian Small, Sylvie Cloutier, Gabriel Keeble-Gagnère, Gary Muehlbauer, Josquin Tibbets, Shuhei Nasuda, Joanna Melonek, Pierre J Hucl, Andrew G Sharpe, Matthew Clark, Erik Legg, Arvind Bharti, Peter Langridge, Anthony Hall, Cristobal Uauy, Martin Mascher, Simon G Krattinger, Hirokazu Handa, Kentaro K Shimizu, Assaf Distelfeld, Ken Chalmers, Beat Keller, Klaus F X Mayer, Jesse Poland, Nils Stein, Curt A McCartney, Manuel Spannagl, Thomas Wicker, Curtis J Pozniak

Nature 588(7837) 277-283 2020年12月査読有り
Toward a breakthrough in Triticeae breeding: searching for ways to connect genotype and phenotype

Fuminori Kobayashi, Hideki Araki, Yushi Ishibashi, Keiichi Mochida, Hitoshi Matsunaka, Tsuyoshi Tanaka, Goro Ishikawa, Shuhei Nasuda

Breeding Research 22(1) 95-100 2020年6月1日
IonBreeders: bioinformatics plugins toward genomics-assisted breeding.

Eri Ogiso-Tanaka, Shiori Yabe, Tsuyoshi Tanaka

Breeding science 70(3) 396-401 2020年6月査読有り
Comparative Analysis of Root Transcriptome Reveals Candidate Genes and Expression Divergence of Homoeologous Genes in Response to Water Stress in Wheat.

Behnam Derakhshani, Habtamu Ayalew, Kohei Mishina, Tsuyoshi Tanaka, Yoshihiro Kawahara, Hossein Jafary, Youko Oono

Plants (Basel, Switzerland) 9(5) 596-596 2020年5月7日査読有り
Foreign DNA detection by high-throughput sequencing to regulate genome-edited agricultural products.

Takeshi Itoh, Ritsuko Onuki, Mai Tsuda, Masao Oshima, Masaki Endo, Hiroaki Sakai, Tsuyoshi Tanaka, Ryo Ohsawa, Yutaka Tabei

Scientific reports 10(1) 4914-4914 2020年3月18日査読有り
De Novo Genome Assembly of the indica Rice Variety IR64 Using Linked-Read Sequencing and Nanopore Sequencing.

Tsuyoshi Tanaka, Ryo Nishijima, Shota Teramoto, Yuka Kitomi, Takeshi Hayashi, Yusaku Uga, Taiji Kawakatsu

G3 (Bethesda, Md.) 10(5) 1495-1501 2020年3月17日査読有り
Multifamily QTL analysis and comprehensive design of genotypes for high-quality soft wheat

Goro Ishikawa, Aimin Zhang, Takeshi Hayashi, Kazuhiro Nakamura, Tsuyoshi Tanaka, Fuminori Kobayashi, Mika Saito, Hiroyuki Ito, Sachiko Ikenaga, Yoshinori Taniguchi, Toshiki Nakamura

PLOS ONE 15(3) 2020年3月11日査読有り
Combined QTL mapping and RNA-Seq profiling reveals candidate genes associated with cadmium tolerance in barley.

Behnam Derakhshani, Hossein Jafary, Bahram Maleki Zanjani, Karim Hasanpur, Kohei Mishina, Tsuyoshi Tanaka, Yoshihiro Kawahara, Youko Oono

PloS one 15(4) e0230820-e0230820 2020年査読有り
Towards a deeper integrated multi-omics approach in the root system to develop climate-resilient rice

Kanami Yoshino, Yuko Numajiri, Shota Teramoto, Naoki Kawachi, Takanari Tanabata, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Yusaku Uga

Molecular Breeding 39(165) 2019年11月査読有り
TASUKE+: a web-based platform for exploring GWAS results and large-scale resequencing data.

Kumagai M, Nishikawa D, Kawahara Y, Wakimoto H, Itoh R, Tabei N, Tanaka T, Itoh T

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 2019年9月査読有り
Genome-Edited Triple-Recessive Mutation Alters Seed Dormancy in Wheat.

Fumitaka Abe, Emdadul Haque, Hiroshi Hisano, Tsuyoshi Tanaka, Yoko Kamiya, Masafumi Mikami, Kanako Kawaura, Masaki Endo, Kazumitsu Onishi, Takeshi Hayashi, Kazuhiro Sato

Cell reports 28(5) 1362-1369 2019年7月30日査読有り

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MISC

小麦農林61号を含む世界の実用コムギ品種の高精度ゲノム配列情報

小林史典, 田中剛, 金森裕之, 呉健忠, 半田裕一

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2020 2020年
国際コムギ10+ゲノムプロジェクト品種におけるalpha-グリアジン遺伝子座Gli-2の構造解析

半田裕一, 半田裕一, 清水健太郎, 清水健太郎, GWYNETH Halstead-Nussloch, 田中剛, TIMOTHY Paape, DARIO Copetti, 小林史典, 畠山剛臣, 畠山剛臣, 金森裕之, WU J., 川浦香奈子, POZNIAK Curtis J.

育種学研究 22 2020年
コムギ縞萎縮病抵抗性遺伝子領域の高効率選抜マーカー

小林史典, 中村俊樹, 小島久代, 田中剛, 齋藤美香, 乙部千雅子

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2019 2019年
ゲノム編集技術による穂発芽耐性の改良されたコムギ育種素材

安倍史高, ハクエムダドウル, 久野裕, 田中剛, 神谷容子, 三上雅史, 川浦香奈子, 遠藤真咲, 大西一光, 林武司, 佐藤和広

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2019 2019年
パンコムギにおけるCRISPR/Cas9を用いたTaQsd1全同祖遺伝子のゲノム編集 1:編集ホモ系統の効率的な作出

安倍史高, 久野裕, 三上雅史, 三上雅史, 神谷容子, 大西一光, HAQUE E, 田中剛, 遠藤真咲, 川浦香奈子, 佐藤和広

育種学研究 20 88 2018年9月22日
パンコムギにおけるCRISPR/Cas9を用いたTaQsd1全同祖遺伝子のゲノム編集 2:導入遺伝子の分離除去

神谷容子, 川浦香奈子, 安倍史高, 田中剛, HAQUE E, 三上雅史, 三上雅史, 遠藤真咲, 久野裕, 佐藤和広

育種学研究 20 89 2018年9月22日
パンコムギにおけるCRISPR/Cas9を用いたTaQsd1全同祖遺伝子のゲノム編集:3.編集ホモ系統の形質評価

HAQUE E, 安倍史高, 林武司, 久野裕, 田中剛, 神谷容子, 川浦香奈子, 佐藤和広

育種学研究 20 162 2018年9月22日
キャベツ4元交雑集団を利用したゲノムワイドSNP開発と抽だい性・結球性のQTL解析

畠山勝徳, 白澤健太, 小貫律子, 田中剛, 山本英司, 山本英司, 片寄裕一, 福岡浩之, 松元哲, 柿崎智博, 林武司

育種学研究別冊 20(2) 148 2018年9月
Nanopore sequencingとLinked-read sequencingによるインディカ水稲品種「IR64」ゲノムのde novoアセンブリ

田中剛, 西嶋遼, 寺本翔太, 木富悠花, 林武司, 宇賀優作, 川勝泰二

育種学研究 20 2018年
コムギ全染色体の参照ゲノム配列情報

小林史典, 半田裕一, 金森裕之, 片桐敏, 田中剛, 呉健忠, 那須田周平

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2018 2018年
画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備第2章高次解析システムの整備 1 超高速シーケンサーに対応したゲノム断片の整列化機能(3)プログラム運用

伊藤剛, 沼寿隆, 田中剛

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (570) 16‐19 2017年3月31日
画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備第2章高次解析システムの整備 2 ゲノム情報を活用した新規遺伝子予測機能(1)予測基礎プログラム構築

伊藤剛, 沼寿隆, 田中剛

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (570) 19‐21 2017年3月31日
画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備第2章高次解析システムの整備 2 ゲノム情報を活用した新規遺伝子予測機能(2)プログラム結合動作

伊藤剛, 沼寿隆, 田中剛

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (570) 21‐23 2017年3月31日
画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備第2章高次解析システムの整備 1 超高速シーケンサーに対応したゲノム断片の整列化機能(2)プログラム結合動作

伊藤剛, 沼寿隆, 田中剛

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (570) 14‐15 2017年3月31日
画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備第2章高次解析システムの整備 2 ゲノム情報を活用した新規遺伝子予測機能(3)プログラム運用

伊藤剛, 沼寿隆, 田中剛

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (570) 23‐24 2017年3月31日
画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備第2章高次解析システムの整備 1 超高速シーケンサーに対応したゲノム断片の整列化機能(1)既存プログラム動作単体試験

伊藤剛, 沼寿隆, 田中剛

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (570) 12‐13 2017年3月31日
国内のコムギ育種材料間で多型頻度の高いゲノムワイドマーカーの整備

石川吾郎, 田中剛, 田中剛, 齋藤美香, 片寄裕一, 金森裕之, 森聡美, 佐々木晴美, 栗田加奈子, 小林史典, 半田裕一, 中村俊樹

育種学研究 19 67 2017年3月29日
コムギ6B染色体上の赤さび病抵抗性遺伝子LrRW12領域のゲノム構造解析

小林史典, 水野信之, 田中剛, 金森裕之, 片寄裕一, WU J, 佐藤和広, 那須田周平, 半田裕一

育種学研究 18 220 2016年9月24日
コムギ系統「RW‐12」が保有する野生二粒系コムギ由来の赤さび病抵抗性遺伝子の解析

小林史典, 田中剛, 金森裕之, 片寄裕一, WU J, 松本隆, 半田裕一

育種学研究 18 20 2016年3月21日
コムギ6B染色体における配列情報の精度向上について

金森裕之, 片桐敏, 小林史典, 栗田加奈子, 佐々木晴美, 森聡美, 藤沢弘子, 田中剛, 下村道彦, 並木信和, 伊川浩司, 松本隆, 片寄裕一, 呉健忠, 半田裕一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th ROMBUNNO.2P‐0024 (WEB ONLY) 2016年

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