2014年4月に熊本県で発生した高病原性鳥インフルエンザ(HPAI)は，H5N8亜型のA型インフルエンザウイルスによるものであった。起因ウイルスの赤血球凝集素タンパク質(HA)遺伝子は2003年以降世界的な流行を見せているH5N1亜型HPAI virus(HPAIV)と遺伝的由来が同じであり，クレード2.3.4.6に属することが明らかになった。同じクレードに属するH5N8亜型HPAIVが国内での発生に先駆けて韓国でHPAI発生を起こしていた。クレード2.3.4.6に属するHAを持つH5N2，H5N5，H5N6，H5N8亜型のHPAIVが2014年以前にも分離されており，これらの異なる亜型のNA遺伝子が野鳥に存在するAIVに由来していることから，中国大陸では以前から野鳥のAIVと家禽由来のHPAIVの遺伝子再集合が頻繁に起こっていた可能性が考えられた。