浦上直人 (Naohito Urakami) - マイポータル

基本情報

所属: 山口大学大学院創成科学研究科教授

学位: 博士(理学)(金沢大学)
修士(理学)(金沢大学)

研究者番号: 50314795
J-GLOBAL ID: 200901098814389764
researchmap会員ID: 1000244074

外部リンク: http://ds0n.cc.yamaguchi-u.ac.jp/~urakami/

研究キーワード

ソフトマターの物理

研究分野

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 /

経歴

2022年4月 - 現在

山口大学, 大学院創成科学研究科(理学系), 教授
2016年4月 - 2022年3月

山口大学, 大学院創成科学研究科(理学系), 准教授
2011年10月 - 2016年3月

山口大学, 大学院理工学研究科(理学), 准教授
2006年10月 - 2011年9月

山口大学, 大学院理工学研究科（理学）, 講師
2003年10月 - 2006年9月

山口大学, 理学部, 講師
1999年4月 - 2003年9月

山口大学, 理学部, 助手

学歴

1996年4月 - 1999年3月

金沢大学, 自然科学研究科, 物質科学専攻
1994年4月 - 1996年3月

金沢大学, 理学研究科, 物理学専攻
1990年4月 - 1994年3月

金沢大学, 理学部, 物理学

委員歴

2017年 - 現在

高分子計算機科学研究会, 運営委員
2012年 - 2023年12月

高分子学会中国四国地区高分子若手研究会, 運営委員

論文

Temperature dependence of membrane viscosity of ternary lipid GUV with Lo domains

Julia Tanaka, Kenya Haga, Naohito Urakami, Masayuki Imai, Yuka Sakuma

Biophysical Journal 124(5) 818-828 2025年3月査読有り
Formation of the various types of daisy chains constructed by modified cyclodextrin depending on the bond angle of the modified part linked to alpha-cyclodextrin

Naohito Urakami, Haruna Shimomasu, Junya Matsumura

MOLECULAR SIMULATION 47(17) 1455-1464 2021年11月査読有り筆頭著者責任著者
Vesicle deformation and division induced by flip-flop of lipid molecules

Naohito Urakami, Yuka Sakuma, Toshikaze Chiba, Masayuki Imai

Soft Matter 17(37) 8434-8445 2021年査読有り筆頭著者責任著者
Molecular mechanism of vesicle division induced by coupling between lipid geometry and membrane curvatures

Naohito Urakami, Takehiro Jimbo, Yuka Sakuma, Masayuki Imai

Soft Matter 14(16) 3018-3027 2018年査読有り
Role of Inverse-Cone-Shape Lipids in Temperature-Controlled Self-Reproduction of Binary Vesicles

Takehiro Jimbo, Yuka Sakuma, Naohito Urakami, Primoz Ziherl, Masayuki Imai

BIOPHYSICAL JOURNAL 110(7) 1551-1562 2016年4月査読有り
Molecular dynamics simulation for shape change of water-in-oil droplets

Naohito Urakami, Akio Takaki, Masayuki Imai, Takashi Yamamoto

MOLECULAR SIMULATION 41(10-12) 986-992 2015年8月査読有り
Dissipative Particle Dynamics Simulation for Vesicle Shape Change

Yoshiyuki Oofuji, Naohito Urakami, Masayuki Imai, Takashi Yamamoto

PROCEEDINGS OF INTERNATIONAL CONFERENCE ON ARTIFICIAL LIFE AND ROBOTICS (ICAROB 2014) 308-311 2014年査読有り
Three-dimensional analysis of lipid vesicle transformations

Ai Sakashita, Naohito Urakami, Primoz Ziherl, Masayuki Imai

SOFT MATTER 8(33) 8569-8581 2012年査読有り
Asymmetric distribution of cone-shaped lipids in a highly curved bilayer revealed by a small angle neutron scattering technique

Y. Sakuma, N. Urakami, T. Taniguchi, M. Imai

JOURNAL OF PHYSICS-CONDENSED MATTER 23(28) 1-6 2011年7月査読有り
Simulation of chain length recognition observed in formation of inclusion complex.

Naohito Urakami, Junko Imada, Takashi Yamamoto

Comput. Phys. Commun. 182(1) 240-242 2011年査読有り
Molecular dynamics simulation for morphological change of water-in-oil microemulsion droplets induced by addition of polymer chains

Takahisa Kurokawa, Naohito Urakami, Kaori Nakaya Yaegashi, Ai Sakashita, Masayuki Imai, Takashi Yamamoto

SOFT MATTER 7(16) 7504-7510 2011年査読有り
余剰面積の違いによるベシクルの形態変化シミュレーション

野口威照, 浦上直人, 今井正幸, 山本隆

高分子論文集 67(10) 605-610 2010年10月査読有り
Simulation of pseudopolyrotaxane formation and orientational order between pseudopolyrotaxanes

Naohito Urakami, Junko Imada, Takashi Yamamoto

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 132(5) 1-7 2010年2月査読有り
n-アルカン薄膜の構造形成における基板構造の効果

三根雅生, 浦上直人, 野崎浩二, 山本隆

高分子論文集 67(3) 198-202 2010年査読有り
Diffusion of domains on nanometer sized vesicle

Y. Sakuma, N. Urakami, Y. Ogata, M. Nagao, S. Komura, T. Kawakatsu, M. Imai

INTERNATIONAL CONFERENCE ON NEUTRON SCATTERING 2009 251(012036) 1-4 2010年査読有り
Diffusion of Nano-Meter-Sized Domains on A Vesicle

Yuka Sakuma, Masayuki Imai, Naohito Urakami, Michihiro Nagao, Shigeyuki Komura, Toshihiro Kawakatsu

BIOPHYSICAL JOURNAL 98(3) 220A-220A 2010年1月査読有り
Nano-meter-sized domain formation in lipid membranes observed by small angle neutron scattering

T. Masui, N. Urakami, M. Imai

EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL E 27(4) 379-389 2008年12月査読有り
Lamellar to micelle transition of nonionic surfactant assemblies induced by addition of colloidal particles

Yukiko Suganuma, Naohito Urakami, Rina Mawatari, Shigeyuki Komura, Kaori Nakaya-Yaegashi, Masayuki Imai

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 129(13) 1-10 2008年10月査読有り
Dynamics of nano-meter-sized domains on a vesicle

Y. Sakuma, N. Urakami, Y. Ogata, M. Nagao, S. Komura, M. Imai

COMPLEX SYSTEMS-BOOK 1 982 717-+ 2008年査読有り
Structures of Multilayered Thin Films of Long-Chain Molecules: X-ray Scattering Study

Ken Tanaka, Kiyoshi Ishikawa, Koji Nozaki, Naohito Urakami, Takashi Yamamoto

POLYMER JOURNAL 40(10) 1017-1024 2008年査読有り

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MISC

膜グラフト高分子のコンフォメーション転移による拡散係数への影響

高田翔太郎, 村島隆浩, 浦上直人, 川勝年洋, 今井正幸, 佐久間由香

分子シミュレーション討論会講演要旨集 38th 2024年
高分子科学と生物物理の計算科学的融合

浦上直人, 山本隆

高分子 60(11) 807-809 2011年11月1日
25aGT-11 三次元画像解析による生体膜変形機構の解明(25aGT コロイド・タンパク質・膜,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

坂下あい, 浦上直人, Ziherl Primoz, 今井正幸

日本物理学会講演概要集 66(1) 371-371 2011年3月3日
26aPS-5 三次元画像解析による生体膜変形機構の解明(26aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

坂下あい, 浦上直人, Ziherl Primoz, 今井正幸

日本物理学会講演概要集 65(2) 340-340 2010年8月18日
シクロデキストリンの包接化合物形成と分子認識－粗視化モデルを用いたシミュレーション－

浦上直人

アンサンブル 12(3) 198-202 2010年7月
25aQF-9 ベシクル膜面上でのナノドメインダイナミクス(複雑液体,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

佐久間由香, 浦上直人, 緒方祐介, 長尾道弘, 好村滋行, 川勝年洋, 今井正幸

日本物理学会講演概要集 64(2) 248-248 2009年8月18日
30aPS-110 ジャイアントベシクルの3次元画像構築法(30aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

堀井香奈子, 今井正幸, 浦上直人

日本物理学会講演概要集 64(1) 389-389 2009年3月3日
25pPSB-36 擬ポリロタキサン形成における鎖長認識シミュレーション(ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

今田絢子, 浦上直人, 山本隆

日本物理学会講演概要集 63(1) 380-380 2008年2月29日
25pPSB-37 ジャイアントベシクルの3次元トモグラフィー(ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

堀井香奈子, 今井正幸, 浦上直人

日本物理学会講演概要集 63(1) 380-380 2008年2月29日
25pPSB-48 ナノサイズベシクルにおける脂質ドメインのダイナミクス(ポスターセッション,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

緒方裕介, 浦上直人, 山本隆, 今井正幸

日本物理学会講演概要集 63(1) 382-382 2008年2月29日
23pRK-14 包接化合物の安定性による鎖長認識メカニズムの解析(ゲル・構造化高分子,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

浦上直人, 今田絢子, 山本隆

日本物理学会講演概要集 62(2) 381-381 2007年8月21日
Dynamical Structure of Nano-Meter-Sized Domains on a Vesicle(Poster session 1, New Frontiers in Colloidal Physics : A Bridge between Micro- and Macroscopic Concepts in Soft Matter) :

Sakuma Yuka, Masui Tomomi, Imai Masayuki, Urakami Naohito, Nagao Michihiro, Komura Shigeyuki

物性研究 89(1) 45-45 2007年
The Molecular Dynamics Simulation of Inclusion Complex Formation(Poster session 1, New Frontiers in Colloidal Physics : A Bridge between Micro- and Macroscopic Concepts in Soft Matter) :

Urakami Naohito, Imada Junko, Yamamoto Takashi

物性研究 89(1) 76-77 2007年
25pWG-6 モデル化したシクロデキストリンによる包接現象シミュレーション(25pWG ソフトマターとシミュレーション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

浦上直人, 山本隆

日本物理学会講演概要集 61(2) 279-279 2006年8月18日
1C07 高分子の拘束が誘起する球状マイクロエマルションのネマチック転移(トピカルセッション-ソフトマターと液晶-, 2005年日本液晶学会討論会)

中谷香織, 今井正幸, 好村滋行, 川勝年洋, 浦上直人

日本液晶学会討論会講演予稿集 (2005) 59-60 2005年9月5日
26aP-11 多糖類によるタバコモザイクウイルスの秩序転移

浦上直人, 今井正幸, 佐野洋, 高須昌子

日本物理学会講演概要集 54(2) 315-315 1999年9月3日
27a-S-7 多糖類の濃度変化に対するタバコモザイクウィルスの構造変化II

浦上直人, 今井正幸, 佐野洋, 高須昌子

日本物理学会講演概要集 53(2) 829-829 1998年9月5日
31a-YY-7 多糖類の濃度変化に対するタバコモザイクウイルスの構造変化

浦上直人, 今井正幸, 佐野洋, 高須昌子

日本物理学会講演概要集 53(1) 705-705 1998年3月10日
29a-A-6 sticker を持つポリマー鎖のMC

浦上直人, 高須昌子

日本物理学会講演概要集. 年会 50(3) 682-682 1995年3月16日

講演・口頭発表等

126

グラフト⾼分⼦の膜内拡散への影響

髙田翔太郎, 村島隆浩, 浦上直人, 川勝年洋, 今井正幸, 佐久間由香

第12回ソフトマター研究会 2024年12月16日
膜グラフト高分子のコンフォメーション転移による拡散係数への影響

髙田翔太郎, 村島隆浩, 浦上直人, 川勝年洋, 今井正幸, 佐久間由香

第38回分子シミュレーション討論会 2024年12月3日
三角メッシュによる基板に吸着したベシクルの形状計算

柳井璃花乃, 浦上直人

第39回中国四国地区高分子若手研究会 2024年11月12日
高分子鎖の秩序形成とベシクルの形状変化

森田匠, 浦上直人

第39回中国四国地区高分子若手研究会 2024年11月12日
分子動力学法による逆ミセルに閉じ込められた水分子の構造解析

原田翔, 堀川裕加, 浦上直人

第39回中国四国地区高分子若手研究会 2024年11月12日
アイソタクチックポリプロピレン (iPP) の異なる配列秩序をもつα相結晶の結晶化挙動

沖村俊之介, 山田浩司, 髙部巧, 浦上直人, 野崎浩二

第73回高分子討論会 2024年9月27日
Helical Arrangements within the α-Form Crystal of Isotactic Polypropylene

山田浩司, 野崎浩二, 戸田昭彦, 浦上直人

2024年9月18日
Monte-Carlo simulation of crystal structures of isotactic polypropylene

高部巧, 浦上直人, 山田浩司, 野崎浩二

2024年9月18日
ベシクル成長・分裂メカニズム

浦上直人, 佐久間由香, 今井正幸

第37回分子シミュレーション討論会 2023年12月4日
脂質供給による球状ベシクルからの形状変化・分裂シミュレーション

浦上直人, 佐久間由香, 今井正幸

第72回高分子討論会 2023年9月28日
Vesicle growth and division induced by the addition of lipids

Naohito Urakami, Yuka Sakuma, Masayuki Imai

The 7th International Soft Matter Conference (ISMC) 2023年9月4日
脂質供給によるベシクル変形と分裂

浦上直人, 佐久間由香, 今井正幸

第36回分子シミュレーション討論会 2022年12月5日
ベシクル成長と分裂シミュレーション

浦上直人, 佐久間由香, 今井正幸

第71回高分子討論会 2022年9月7日招待有り
フリップフロップによるベシクル変形と分裂シミュレーション

浦上直人, 佐久間由香, 千葉紀風, 今井正幸

第35回分子シミュレーション討論会 2021年11月29日
L体、D体フェニルアラニンとシクロデキストリンの包接化合物形成の相違

大久保玄斗, 堀川裕加, 浦上直人

第36回中国四国地区高分子若手研究会 2021年11月6日
フリップフロップによるベシクル変形と分裂

浦上直人, 佐久間由香, 千葉紀風, 今井正幸

第70回高分子討論会 2021年9月6日招待有り
ポリオキサミドコポリマー結晶における分子構造と分子配置のモデリングおよびMDシミュレーション

矢野航季, 中川知之, 浦上直人, 野崎浩二

第35回中国四国地区高分子若手研究会 2020年11月6日
シクロデキストリンとフェニルアラニンの包接現象シミュレーション

大久保玄人, 堀川裕加, 浦上直人

第35回中国四国地区高分子若手研究会 2020年11月6日
シクロデキストリンとミセルの包接化合物形成シミュレーション

上野泰, 浦上直人

第35回中国四国地区高分子若手研究会 2020年11月6日
ノナメチレンオキサミド/2-メチル-1,8オクタメチレンオキサミドコポリマーPX9(n/i)の結晶構造の組成依存性

矢野航季, 浦上直人, 野崎浩二, 中川知之

第69回高分子討論会 2020年9月17日

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担当経験のある科目(授業)

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

進化する自己生産ミニマルセル：人工生命システムに向けて

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2023年4月 - 2026年3月

今井正幸, 栗栖実, 川勝年洋, 佐久間由香, 浦上直人
ミニマルセルの創成を通してみる生命誕生のための非平衡熱力学条件

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2020年4月 - 2023年3月

今井正幸, 川勝年洋, 佐久間由香, 浦上直人
細胞運動の動力学ダイナミクスの分子・遺伝子発現シミュレーションによる理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2020年3月

松野浩嗣, 西井淳, 堀学, 岩楯好昭, 浦上直人
ソフトマターの機能発現によるベシクルの形状変化：単細胞生物の運動理解へ

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2015年4月 - 2020年3月

浦上直人
ベシクルからプロトセルへの道：代謝・情報・熱力学

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2016年4月 - 2019年3月

今井正幸, 川勝年洋, 佐久間由香, 浦上直人
分子集合体からプロトセルへの物理

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2013年4月 - 2016年3月

今井正幸, 佐久間由香, 浦上直人, 鈴木健太郎
高分子の結晶化と分子認識：普遍性と個性に基づいた第一原理材料設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2012年4月 - 2016年3月

山本隆, 浦上直人
生体系の機能発現による秩序構造の形成と変化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2012年4月 - 2015年3月

浦上直人
ベシクル変形と化学場の結合：生命誕生へのソフトマターからのアプローチ

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2010年5月 - 2014年3月

今井正幸, 浦上直人
らせん高分子の構造形成における分子認識-新たな計算スキームを目指して-

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2008年 - 2010年

山本隆, 浦上直人
多成分ベシクルの形態形成ダイナミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2007年 - 2009年

今井正幸, 浦上直人, 中谷香織
シクロデキストリンによる包接現象及び分子認識に関する分子シミュレーション

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2007年 - 2009年

浦上直人
らせん高分子の自己組織化における分子認識機構の計算科学

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2006年 - 2007年

山本隆, 浦上直人
高分子の構造発現における分子認識過程の計算科学

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2004年 - 2005年

山本隆, 浦上直人
生体系モデルとしてのソフトマター複合系の秩序形成

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2003年 - 2005年

今井正幸, 中谷香織, 浦上直人
ソフトマテリアル系の秩序構造形成:炭化水素鎖の構造形成とその役割

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2002年 - 2004年

野崎浩二, 山本隆, 朝日孝尚, 浦上直人
高分子鎖のモレキュラーダイナミクス-高次構造の第一原理設計を目指して-

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2000年 - 2002年

山本隆, 藤原進, 浦上直人, 野崎浩二
タンパク質物性のマルチカノニカルMC法による研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 1998年 - 1998年

浦上直人

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