志甫谷渉 (Shihoya Wataru) - マイポータル

基本情報

所属: 慶應義塾大学医学部坂口記念講座坂口記念講座(シグナル探求学) 准教授

学位: 創薬科学(名古屋大学)

研究者番号: 30809421
J-GLOBAL ID: 201801012097393881
researchmap会員ID: B000315363

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2025年4月 - 現在

慶應義塾大学ヒト生物学-微生物叢-量子計算研究センター(Bio2Q), Jr.PI
2025年4月 - 現在

慶應義塾大学医学部坂口光洋記念講座（シグナル探求学）, 准教授
2020年11月 - 2025年3月

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻濡木研究室, 助教
2020年4月 - 2020年11月

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻濡木研究室, 特任助教
2017年4月 - 2020年3月

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻濡木研究室, 日本学術振興会特別研究員PD
2014年4月 - 2017年3月

名古屋大学創薬科学研究科基盤創薬学専攻博士課程
2012年4月 - 2014年3月

名古屋大学創薬科学研究科基盤創薬学専攻修士課程
2008年4月 - 2012年3月

京都大学理学部

受賞

2022年12月

JAICI賞, 一般社団法人化学情報協会
2022年11月

Akira Arimura Award, The 15th International Symposium on VIP, PACAP and Related Peptides
2022年11月

令和4年度生化学会奨励賞, 日本生化学会
2022年5月

令和4年度花王研究奨励賞
2022年4月

令和4年度文部科学大臣若手科学者賞
2020年10月

第19回日本生物物理学会若手講演者賞
2019年10月

令和元年度日本結晶学会進歩賞
2019年8月

SPRUC 2019 Young Scientist Award
2018年

第34回井上研究奨励賞
2017年

第15回エンドセリン国際会議 Young investigator awardおよびBest presentation
2017年

第14回GPCR研究会松尾研究奨励賞
2017年

第7回日本学術振興会育志賞
2016年

名古屋大学学術奨励賞
2016年

第16回日本蛋白質学会若手奨励賞
2011年

京都大学総長賞

論文

Molecular basis of sarbecovirus evolution and receptor tropism in natural hosts, potential intermediate hosts, and humans.

Yusuke Kosugi, Kanata Matsumoto, Spyros Lytras, Arnon Plianchaisuk, Jarel Elgin Tolentino, Shigeru Fujita, Maximilian Stanley Yo, Chen Luo, Yoonjin Kim, Wataru Shihoya …

Cell reports 44(9) 116220-116220 2025年9月9日
Structural insights into ligand recognition and G protein preferences across histamine receptors.

Yuma Matsuzaki, Fumiya K Sano, Hidetaka S Oshima, Hiroaki Akasaka, Kazuhiro Kobayashi, Tatsuki Tanaka, Yuzuru Itoh, Wataru Shihoya, Yoshiaki Kise, Tsukasa Kusakizako …

Communications biology 8(1) 957-957 2025年6月27日
Insights into G-protein coupling preference from cryo-EM structures of Gq-bound PTH1R.

Fumiya K Sano, Kota Shimizume, Kazuhiro Kobayashi, Toshikuni Awazu, Kouki Kawakami, Hiroaki Akasaka, Takaaki A Kobayashi, Tatsuki Tanaka, Hiroyuki H Okamoto, Hisato Hirano …

Nature chemical biology 2025年6月26日
Cryo-EM structure of a blue-shifted channelrhodopsin from Klebsormidium nitens.

Yuzhu Z Wang, Koki Natsume, Tatsuki Tanaka, Shoko Hososhima, Rintaro Tashiro, Fumiya K Sano, Hiroaki Akasaka, Satoshi P Tsunoda, Wataru Shihoya, Hideki Kandori …

Nature communications 16(1) 5297-5297 2025年6月18日
Structural insights into light harvesting by antenna-containing rhodopsins in marine Asgard archaea.

Gali Tzlil, María Del Carmen Marín, Yuma Matsuzaki, Probal Nag, Shota Itakura, Yosuke Mizuno, Shunya Murakoshi, Tatsuki Tanaka, Shirley Larom, Masae Konno …

Nature microbiology 10(6) 1484-1500 2025年6月
Structure of a lasso peptide bound ETB receptor provides insights into the mechanism of GPCR inverse agonism.

Wataru Shihoya, Hiroaki Akasaka, Peter A Jordan, Anna Lechner, Bethany K Okada, Gabriella Costa Machado da Cruz, Fumiya K Sano, Tatsuki Tanaka, Ryo Kawahara, Rajan Chaudhari …

Nature communications 16(1) 3446-3446 2025年4月22日
Structural visualization of small molecule recognition by CXCR3 uncovers dual-agonism in the CXCR3-CXCR7 system.

Shirsha Saha, Fumiya K Sano, Saloni Sharma, Manisankar Ganguly, Annu Dalal, Sudha Mishra, Divyanshu Tiwari, Hiroaki Akasaka, Takaaki A Kobayashi, Nabarun Roy …

Nature communications 16(1) 3047-3047 2025年3月28日
Molecular basis of promiscuous chemokine binding and structural mimicry at the C-X-C chemokine receptor, CXCR2.

Shirsha Saha, Fumiya K Sano, Saloni Sharma, Manisankar Ganguly, Sudha Mishra, Annu Dalal, Hiroaki Akasaka, Takaaki A Kobayashi, Nashrah Zaidi, Divyanshu Tiwari …

Molecular cell 85(5) 976-988 2025年3月6日
Structural insights into the agonist selectivity of the adenosine A3 receptor.

Hidetaka S Oshima, Akiko Ogawa, Fumiya K Sano, Hiroaki Akasaka, Tomoyoshi Kawakami, Aika Iwama, Hiroyuki H Okamoto, Chisae Nagiri, Fan-Yan Wei, Wataru Shihoya …

Nature communications 15(1) 9294-9294 2024年11月7日
Structural mechanisms of potent lysophosphatidic acid receptor 1 activation by nonlipid basic agonists.

Hiroaki Akasaka, Fumiya K Sano, Wataru Shihoya, Osamu Nureki

Communications biology 7(1) 1444-1444 2024年11月6日
Molecular mechanism of the endothelin receptor type B interactions with Gs, Gi, and Gq.

Donghee Ham, Wataru Shihoya, Osamu Nureki, Asuka Inoue, Ka Young Chung

Structure (London, England : 1993) 32(10) 1632-1639 2024年10月3日査読有り筆頭著者
The high-light-sensitivity mechanism and optogenetic properties of the bacteriorhodopsin-like channelrhodopsin GtCCR4.

Tatsuki Tanaka, Shoko Hososhima, Yo Yamashita, Teppei Sugimoto, Toshiki Nakamura, Shunta Shigemura, Wataru Iida, Fumiya K Sano, Kazumasa Oda, Takayuki Uchihashi …

Molecular cell 84(18) 3530-3544 2024年9月19日査読有り責任著者
Cryo-EM structure of I domain-containing integrin αEβ7.

Hiroaki Akasaka, Dan Sato, Wataru Shihoya, Osamu Nureki, Yoshiaki Kise

Biochemical and biophysical research communications 721 150121-150121 2024年8月20日査読有り
Cryo-EM advances in GPCR structure determination.

Wataru Shihoya, Aika Iwama, Fumiya K Sano, Osamu Nureki

Journal of biochemistry 176(1) 1-10 2024年7月1日査読有り筆頭著者責任著者
Structure and dynamics of the pyroglutamylated RF-amide peptide QRFP receptor GPR103.

Aika Iwama, Ryoji Kise, Hiroaki Akasaka, Fumiya K Sano, Hidetaka S Oshima, Asuka Inoue, Wataru Shihoya, Osamu Nureki

Nature communications 15(1) 4769-4769 2024年6月19日査読有り責任著者
Structural basis for lysophosphatidylserine recognition by GPR34.

Tamaki Izume, Ryo Kawahara, Akiharu Uwamizu, Luying Chen, Shun Yaginuma, Jumpei Omi, Hiroki Kawana, Fengjue Hou, Fumiya K Sano, Tatsuki Tanaka …

Nature communications 15(1) 902-902 2024年2月7日査読有り責任著者
Optimizing cryo-EM structural analysis of Gi-coupling receptors via engineered Gt and Nb35 application.

Hidetaka S Oshima, Fumiya K Sano, Hiroaki Akasaka, Aika Iwama, Wataru Shihoya, Osamu Nureki

Biochemical and biophysical research communications 693 149361-149361 2024年1月22日査読有り責任著者
Molecular insights into atypical modes of β-arrestin interaction with seven transmembrane receptors.

Jagannath Maharana, Fumiya K Sano, Parishmita Sarma, Manish K Yadav, Longhan Duan, Tomasz M Stepniewski, Madhu Chaturvedi, Ashutosh Ranjan, Vinay Singh, Sayantan Saha …

Science (New York, N.Y.) 383(6678) 101-108 2024年1月5日査読有り
Structural insights into endothelin receptor signalling.

Wataru Shihoya, Fumiya K Sano, Osamu Nureki

Journal of biochemistry 174(4) 317-325 2023年9月29日査読有り筆頭著者責任著者
Cryo-EM structure of the endothelin-1-ETB-Gi complex.

Fumiya K Sano, Hiroaki Akasaka, Wataru Shihoya, Osamu Nureki

eLife 12 2023年4月25日査読有り責任著者

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MISC

高感度な光開閉型カチオンチャネルの分光解析

山下陽, 杉本哲平, 片山耕大, 片山耕大, 角田聡, 角田聡, 田中達基, 志甫谷渉, 濡木理, 神取秀樹 …

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 17th 2023年
PTH1受容体における内在性リガンドの認識機構と構造ダイナミクス

小林和弘, 川上耕季, 草木迫司, 郷野弘剛, 富田敦弘, 小林幹, 志甫谷渉, 山下恵太郎, 西澤知宏, 加藤英明 …

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 95回 2T12a-07 2022年11月
代謝安定型作動薬とLysoPS受容体LPS1の構造解析(Cryo-EM structure of LysoPS Receptor LPS1 in complex with Metabolically Stable Agonist)

Kawahara Ryo, Sano Fumiya, Uwamizu Akiharu, Chen Luying, Ohwada Tomohiko, Aoki Junken, Shihoya Wataru, Nureki Osamu

生物物理 62(Suppl.1-2) S268-S268 2022年8月
ナノポア計測によるCALHM2チャネルダイナミクスの解明(Investigation of CALHM2 Channel Dynamics using Nanopore measurement)

Nakamura Sotaro, Yamazaki Hirohito, Shihoya Wataru, Nureki Osamu, Uemura Sotaro

生物物理 62(Suppl.1-2) S334-S334 2022年8月
クライオ電子顕微鏡によるヒトLPA1受容体の構造解析(Cryo-EM structure of Human Lysophosphatidic Acid Receptor 1)

Akasaka Hiroaki, Tanaka Tatsuki, Sano Fumiya, Shihoya Wataru, Nureki Osamu

生物物理 62(Suppl.1-2) S346-S346 2022年8月
クライオ電子顕微鏡によるヒト由来メラトニン受容体シグナル伝達複合体の立体構造解析(Cryo-EM structure of the human MT1-Gi signaling complex)

Okamoto Hiroyuki, Miyauchi Hirotake, Inoue Asuka, Raimondi Francesco, Tsujimoto Hirokazu, Kusakizako Tsukasa, Shihoya Wataru, Yamashita Keitaro, Suno Ryoji, Nomura Norimichi …

生物物理 62(Suppl.1-2) S347-S347 2022年8月
PTH1受容体における内在性リガンドの認識機構と構造ダイナミクス

小林和弘, 川上耕季, 草木迫司, 郷野弘剛, 富田敦弘, 小林幹, 志甫谷渉, 山下恵太郎, 山下恵太郎, 西澤知宏 …

日本生化学会大会(Web) 95th 2022年
ヒトメラトニン受容体シグナル伝達複合体のクライオ電子顕微鏡による単粒子解析

岡本紘幸, 宮内弘剛, 井上飛鳥, Francesco Raimondi, 辻本浩一, 草木迫司, 志甫谷渉, 山下恵太郎, 寿野良二, 小林拓也 …

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 94回 [1T15m-186)] 2021年11月
選択的薬剤が結合したbeta3アドレナリン受容体の構造

志甫谷渉, 名切千彩恵, 井上飛鳥, 濡木理

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 94回 [P-994] 2021年11月
【Gタンパク質共役型受容体(GPCR)の新展開】Cryo-EMを用いたクラスB GPCRの構造研究

小林和弘, 志甫谷渉

細胞 53(5) 272-275 2021年5月
RNA修飾代謝物のN6-methyladenosine(m6A)は受容体応答を引き起こす新規液性因子である

小川亜希子, 小川亜希子, 名切千彩恵, 志甫谷渉, 井上飛鳥, 川上耕季, 平塚寿々音, 青木淳賢, 青木淳賢, 伊藤康裕 …

日本生化学会大会(Web) 94th [P-546] 2021年
アスガルドアーキア由来の新奇光駆動型内向きプロトンポンプ:シゾロドプシンの機能・分光・構造研究

井上圭一, 志甫谷渉, 今野雅恵, 今野雅恵, 樋口晶光, 但馬聖也, 古谷祐詞, 古谷祐詞, 川崎佑真, 永田崇 …

生体分子科学討論会講演要旨集 47th 2021年
シゾロドプシンの結晶構造から明らかになった内向きH⁺輸送機構

志甫谷渉, 樋口昌光, 今野雅恵, 井上圭一, 濡木理

日本結晶学会年会講演要旨集 2021 2021年
GRK3選択的活性化機構の生化学的解析

カリニョカーロマリオンコドッグ, 生田達也, 志甫谷渉, 川上耕季, 平塚寿々音, 濡木理, 井上飛鳥

日本生化学会大会(Web) 94th [P-566] 2021年
Gタンパク質共役型受容体の構造機能相関:創薬の新戦略に向けてクライオ電子顕微鏡解析で見えてきたGPCRの分子機構

濡木理, 岡本紘幸, 小林和弘, 名切千彩恵, 志甫谷渉, 西澤知宏

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 93回 [2S03e-02] 2020年9月
ヘリオロドプシンおよびシゾロドプシンの構造から明らかになった微生物型ロドプシンの多様性(Structures of heliorhodopsin and schizorhodopsin elucidate the structural diversity of microbial rhodopsins)

Shihoya Wataru, Inoue Keiichi, Manish Singh, Higuchi Akimitsu, Konno Masae, Yoshizumi Rei, Uchihashi Takayuki, Kandori Hideki, Nureki Osamu

生物物理 60(Suppl.1-2) S154-S154 2020年8月
クライオ電子顕微鏡を用いたメラトニン受容体シグナル伝達複合体の立体構造解析

岡本紘幸, 宮内弘剛, 井上飛鳥, 志甫谷渉, 山下恵太郎, 草木迫司, 西澤知宏, 濡木理

日本薬学会年会要旨集 140年会 27H-pm10S 2020年3月
光駆動型内向きプロトンポンプ,シゾロドプシンのプロトン輸送メカニズム

井上圭一, 志甫谷渉, 今野雅恵, 今野雅恵, 樋口晶光, 但馬聖也, 古谷祐詞, 古谷祐詞, 川崎佑真, 八尾寛 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
光駆動型内向きH⁺ポンプ型シゾロドプシンのH⁺輸送メカニズムの分光及び構造研究

井上圭一, 志甫谷渉, 今野雅恵, 今野雅恵, 樋口晶光, 但馬聖也, 古谷祐詞, 川崎佑真, 永田崇, 永田崇 …

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 46th 2020年
ヘリオロドプシンの構造生物学的および物理化学的研究

SHIHOYA Wataru, INOUE Keiichi, INOUE Keiichi, INOUE Keiichi, SINGH Manish, KONNO Masae, HOSOSHIMA Shoko, YAMASHITA Keitaro, YAMASHITA Keitaro, IKEDA Kento …

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 100th 2020年

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講演・口頭発表等

リゾフォスファチジルセリン受容体GPR34の構造と機能

志甫谷渉

第96回日本生化学会 2023年11月2日招待有り
クライオ電子顕微鏡法とAlphaFoldによってひかれた構造生物学

志甫谷渉

第87回植物学会シンポジウム 2023年9月招待有り
非古典的ロドプシンの構造と機能

志甫谷渉

高速分子動画「若手オンラインセミナー」 2023年6月7日招待有り
クライオ電子顕微鏡法とAlphafoldによってひらかれた構造生物学

志甫谷渉

第52回日本心脈管作動物質学会 2023年2月招待有り
非古典的ロドプシンの構造機能解析

志甫谷渉

令和4年度高速分子動画シンポジウム 2022年11月20日招待有り
G蛋白質共役受容体の構造と機能

志甫谷渉

第95回日本生化学会奨励賞シンポジウム 2022年11月14日招待有り
非古典的ロドプシンの構造と機能

志甫谷渉

第5回「高速分子動画」オンラインセミナー 2022年2月16日招待有り
Cryo-EM structure of the human PAC1 receptor coupled to an engineered heterotrimeric G protein

Wataru Shihoya

The 15th International Symposium on VIP, PACAP and Related Peptides 2022年招待有り
Structural biology of peptide-activated G-protein coupled receptors From X-ray crystallography to Cryo-EM

Wataru Shihoya

The 15th International Symposium on VIP, PACAP and Related Peptides 2022年招待有り
酵素型ロドプシンの活性化機構

志甫谷渉

令和2年度日本分子生物学会 2020年招待有り
酵素型ロドプシンの構造基盤

志甫谷渉

令和2年度日本生物物理学会 2020年招待有り
ヘリオロドプシンおよびシゾロドプシンの構造から明らかになった微生物型ロドプシンの多様性

志甫谷渉

令和2年度日本生物物理学会 2020年招待有り
エンドセリンB型受容体の結晶構造と活性化機構の解明

志甫谷渉

令和元年度日本結晶学会 2019年11月19日招待有り
エンドセリン受容体B型の構造機能活性相関の解明

志甫谷渉

SPring-8シンポジウム 2019年8月30日招待有り
Cryo-EMを用いたGPCRの構造研究

志甫谷渉

第92回日本生化学会 2018年9月20日招待有り
エンドセリン受容体のリガンド認識機構の解明

志甫谷渉

Re-PCR研究会 2018年招待有り
エンドセリン受容体の活性化および不活性化の構造基盤

志甫谷渉

蛋白研セミナー / SPring-8 先端利用技術ワークショップ 2018年招待有り
エンドセリン受容体B型のリガンド認識機構の構造基盤

志甫谷渉

第22回日本心血管内分泌代謝学会学術総会 2018年招待有り
Structural Basis for Ligand Recognition by Endothelin ETB Receptor

第15回国際エンドセリン学会 2017年招待有り
複数の結晶構造から明らかになった, エンドセリン受容体B型のリガンド認識機構

志甫谷渉

平成28 年度日本蛋白質学会年会若手奨励賞シンポジウム 2016年6月8日招待有り

共同研究・競争的資金等の研究課題

クライオ電子顕微鏡法を用いたGPCR創薬研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

志甫谷渉
クライオ電子顕微鏡法を用いたGPCR創薬研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

志甫谷渉
リゾリン脂質受容体を標的としたGPCR創薬2.0

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2025年3月

志甫谷渉
光動作タンパク質の時分割構造解析と合理的改変

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年6月 - 2024年3月

岩田想, 野村紀通, 近藤美欧, 志甫谷渉, 草木迫司, 山下恵太郎
非古典的ロドプシンの構造機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2020年4月 - 2023年3月

志甫谷渉
XFELを用いた非古典的ロドプシンのダイナミクスの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

志甫谷渉
エンドセリン受容体のシグナル伝達複合体の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2020年3月

志甫谷渉

志甫谷渉

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講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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