許仕傑 (Shijie Xu) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: 北海道大学

学位: 博士（環境科学）(2025年3月北海道大学)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-6974-353X
J-GLOBAL ID: 202501004755368804
researchmap会員ID: R000082878

外部リンク: https://xu-shi-jie.github.io/

研究キーワード

7

研究分野

1

ライフサイエンス / 構造生物化学 / タンパク質・構造予測・AI for science

受賞

4

2024年4月

Program for Supporting Challenging and Interdisciplinary Research Field, 北海道大学
2023年4月

Program for Supporting Challenging and Interdisciplinary Research Field, 北海道大学
2022年4月

Program for Supporting Challenging and Interdisciplinary Research Field, 北海道大学
2022年4月

DX 博士人材フェローシップ, 北海道大学

論文

5

Probe-based identification of metal-binding sites using deep learning representations

Shijie Xu, Akira Onoda

Nature Communications 2026年6月30日筆頭著者
Accurate prediction of enzymatic degradation of plastics by language models

Shijie Xu, Ke Xu, Akira Onoda

Chemistry Letters 55(2) 2026年2月3日筆頭著者
Accurate and Rapid Prediction of Protein pKa: Protein Language Models Reveal the Sequence–pKa Relationship

Shijie Xu, Akira Onoda

Journal of Chemical Theory and Computation 2025年4月8日筆頭著者
PsiPartition: Improved Site Partitioning for Genomic Data by Parameterized Sorting Indices and Bayesian Optimization

Shijie Xu, Akira Onoda

Journal of Molecular Evolution 92(6) 874-890 2024年12月5日筆頭著者
Accurate and Fast Prediction of Intrinsically Disordered Protein by Multiple Protein Language Models and Ensemble Learning

Shijie Xu, Akira Onoda

Journal of Chemical Information and Modeling 64(7) 2901-2911 2023年10月26日筆頭著者

講演・口頭発表等

8

Accurate and Fast Prediction of Metal-binding Sites in Proteins Using Deep Learning Methods

Shijie Xu, Akira Onoda

52nd Biomolecule Science Symposium 2026年5月14日
Accurate and Fast Prediction of Protein pKa by A Protein Language Model

Shijie Xu, Akira Onoda

the 19th Symposium on Biorelevant Chemistry 2025年9月2日
Accurate and Fast Prediction of Protein pKa by Protein Language Model

Shijie Xu, Akira Onoda

51st Biomolecule Science Symposium 2025年6月26日
Accurate and Fast Prediction of Protein pKa by Protein Language Model

Shijie Xu, Akira Onoda

8th ICReDD International Symposium 2024年10月22日
Accurate Prediction of Intrinsically Disordered Protein by Protein Language Models

Shijie Xu, Akira Onoda

the 24th Annual Meeting of the Protein Science Society of Japan 2024年7月11日
Accurate Prediction of Protein pKa by Geometric Deep Learning

Shijie Xu, Akira Onoda

the 104th CSJ annual meeting 2024年3月18日
Accurate Prediction of Intrinsically Disordered Protein by Protein Language Models

Shijie Xu, Akira Onoda

the 17th Biorelevant Chemistry Symposium 2023年9月8日
Fast and Accurate Prediction of Intrinsically Disordered Protein by Protein Language Model

Shijie Xu, Akira Onoda

the 103rd CSJ annual meeting 2023年3月22日

所属学協会

1

2023年3月 - 現在

日本化学会