夏目やよい (Yayoi Natsume-Kitatani) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所バイオインフォマティクスプロジェクト
: 徳島大学先端酵素学研究所
: 大阪大学蛋白質研究所

J-GLOBAL ID: 201801008558528345
researchmap会員ID: B000310295

研究分野

情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /

受賞

2024年8月

Fellow, Asia-Pacific Artificial Intelligence Association

Yayoi Natsume

論文

Subset binding enables detection of multimodal patient subgroup patterns and drug target discovery in idiopathic pulmonary fibrosis

Yayoi Natsume-Kitatani, Mari N Itoh, Yoshito Takeda, Masataka Kuroda, Haruhiko Hirata, Kotaro Miyake, Takayuki Shiroyama, Yuya Shirai, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi …

Briefings in Bioinformatics 27(2) 2026年3月1日
PPFE-like findings identify an IPF subgroup with shortened telomeres and poor prognosis

Ryota Otoshi, Hideya Kitamura, Takashi Niwa, Kota Murohashi, Tsuneyuki Oda, Tomohisa Baba, Eri Hagiwara, Tae Iwasawa, Tamiko Takemura, Koji Okudela …

ERJ Open Research 01619-2025 2026年2月20日
Familial fibrotic hypersensitivity pneumonitis: A distinct clinical phenotype with shorter leukocyte telomere length.

Masashi Nishimura, Hideya Kitamura, Yoichi Tagami, Kazushi Fujimoto, Takashi Fukushima, Ryota Otoshi, Takashi Niwa, Jun Aoki, Taiki Fukuda, Tomoe Sawazumi …

Respiratory investigation 63(6) 1338-1346 2025年11月5日
Serum vesicle biomarkers reflect the disease activity of idiopathic pulmonary fibrosis.

Yuya Shirai, Takatoshi Enomoto, Yoshito Takeda, Ryuya Edahiro, Miho Takahashi-Itoh, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi, Mana Nakayama, Takahiro Kawasaki, Taro Koba …

Journal of translational medicine 23(1) 1102-1102 2025年10月15日
Spatial transcriptomics identifies SPARC as a prognostic marker in interstitial lung diseases.

Takayuki Niitsu, Toshiaki Kataoka, Kiyoharu Fukushima, Daisuke Motooka, Shigeyuki Shichino, Yayoi Natsume-Kitatani, Hideya Kitamura, Takashi Niwa, Tomohisa Baba, Daisuke Okuzaki …

The Journal of pathology 267(1) 79-91 2025年9月
An adjuvant database for preclinical evaluation of vaccines and immunotherapeutics.

Yayoi Natsume-Kitatani, Kouji Kobiyama, Yoshinobu Igarashi, Taiki Aoshi, Noriyuki Nakatsu, Lokesh P Tripathi, Junichi Ito, Johan Nyström-Persson, Yuji Kosugi, Rodolfo S Allendes Osorio …

Cell chemical biology 32(8) 1075-1088 2025年8月21日
Homology-feature-assisted quantification of fibrotic lesions in computed tomography images: a proof of concept for CT image feature-based prediction for gene-expression-distribution.

Kentaro Doi, Hodaka Numasaki, Yusuke Anetai, Yayoi Natsume-Kitatani

International journal of computer assisted radiology and surgery 20(8) 1703-1711 2025年8月
間質性肺疾患基礎研究2 空間的遺伝子発現解析により同定されたSPARC 分類不能型特発性間質性肺炎の新規予後バイオマーカー

船内敦司, 橋本和樹, 新津敬之, 片岡俊郎, 福島清春, 元岡大祐, 七野成之, 夏目やよい, 北村英也, 奥崎大介 …

日本呼吸器学会誌 14(増刊) 188-188 2025年3月
A modern multi-omics data exploration experience with Panomicon

Rodolfo S Allendes Osorio, Yuji Kosugi, Johan T Nyström-Persson, Kenji Mizuguchi, Yayoi Natsume-Kitatani

Bioinformatics Advances 4(1) vbae147 2024年10月3日査読有り
Correlation of CT-based radiomics analysis with pathological cellular infiltration in fibrosing interstitial lung diseases.

Akira Haga, Tae Iwasawa, Toshihiro Misumi, Koji Okudela, Tsuneyuki Oda, Hideya Kitamura, Tomoki Saka, Shoichiro Matsushita, Tomohisa Baba, Yayoi Natsume-Kitatani …

Japanese journal of radiology 42(10) 1157-1167 2024年6月18日査読有り
SFTPB in serum extracellular vesicles as a biomarker of progressive pulmonary fibrosis.

Takatoshi Enomoto, Yuya Shirai, Yoshito Takeda, Ryuya Edahiro, Shigeyuki Shichino, Mana Nakayama, Miho Takahashi-Itoh, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi, Takahiro Kawasaki …

JCI insight 9(11) 2024年6月10日査読有り
びまん性肺疾患病因・病態エクソソームのプロテオミクスによる線維性過敏性肺炎の新規バイオマーカー開発

原伶奈, 武田吉人, 足立淳, 夏目やよい, 伊藤眞里, 長谷拓明, 辻川和丈, 井上義一, 広瀬雅樹, 熊ノ郷淳

日本呼吸器学会誌 13(増刊) 199-199 2024年3月
IPF患者血清EVプロテオミクスと血清・尿メタボロミクスの統合ネットワーク解析によるIPF特有のパスウェイの探索

伊藤眞里, 武田吉人, 白井雄也, 榎本貴俊, 村岡賢, 足立淳, 夏目やよい, 水口賢司, 熊ノ郷淳

日本呼吸器学会誌 13(増刊) 341-341 2024年3月
Idiopathic pulmonary fibrosis-specific Bayesian network integrating extracellular vesicle proteome and clinical information

Mei Tomoto, Yohei Mineharu, Noriaki Sato, Yoshinori Tamada, Mari Nogami-Itoh, Masataka Kuroda, Jun Adachi, Yoshito Takeda, Kenji Mizuguchi, Atsushi Kumanogoh …

Scientific Reports 14(1) 1315-1315 2024年1月15日査読有り
Latent inter-organ mechanism of idiopathic pulmonary fibrosis unveiled by a generative computational approach.

Satoshi Kozawa, Kengo Tejima, Shunki Takagi, Masataka Kuroda, Mari Nogami-Itoh, Hideya Kitamura, Takashi Niwa, Takashi Ogura, Yayoi Natsume-Kitatani, Thomas N Sato

Scientific reports 13(1) 21981-21981 2023年12月11日
Data-driven processing of electronic medical record (EMR) and serum exosome proteomics data of idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) patients identified pathological networks and its regulatory molecules

Mari Nogami-Itoh, Masataka Kuroda, Yoshito Takeda, Yuya Shirai, Takatoshi Enomoto, Jun Adachi, Sadao Kurohashi, Eiji Aramaki, Toshihiro Takeda, Yasushi Matsumura …

Idiopathic interstitial pneumonias 2023年9月9日
DruMAP: A Novel Drug Metabolism and Pharmacokinetics Analysis Platform

Hitoshi Kawashima, Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Masataka Kuroda, Chioko Nagao, Yayoi Natsume-Kitatani, Rikiya Ohashi, Hiroshi Komura, Kenji Mizuguchi

Journal of Medicinal Chemistry 66(14) 9697-9709 2023年7月14日査読有り
びまん性肺疾患過敏性肺炎エクソソームのプロテオミクスによる線維性過敏性肺炎の新規バイオマーカー開発

原伶奈, 武田吉人, 足立淳, 夏目やよい, 伊藤眞里, 井上義一, 広瀬雅樹, 熊ノ郷淳

日本呼吸器学会誌 12(増刊) 160-160 2023年3月
びまん性肺疾患病因・病態1 「PRISM」データから見えてきた新たな線維化バイオマーカー

白井雄也, 武田吉人, 榎本貴俊, 足立雄一, 野田成美, 平田陽彦, 足立淳, 夏目やよい, 伊藤眞里, 熊ノ郷淳

日本呼吸器学会誌 12(増刊) 166-166 2023年3月
エクソソームの次世代プロテオミクスによる気管支喘息T2炎症の新規BM開発

吉村華子, 武田吉人, 榎本貴俊, 原伶奈, 山本真, 内藤祐二朗, 二見真史, 白山敬之, 平田陽彦, 小山正平 …

日本呼吸器学会誌 12(増刊) 312-312 2023年3月

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MISC

110

SPATIAL TRANSCRIPTOMICS IDENTIFIES SPARC AS A PROGNOSTIC BIOMARKER IN UNCLASSIFIABLE INTERSTITIAL LUNG DISEASES

Takayuki Niitsu, Toshiaki Kataoka, Kiyoharu Fukushima, Daisuke Motooka, Shigeyuki Shichino, Yayoi Natsume-Kitatani, Hideya Kitamura, Takashi Niwa, Tomohisa Baba, Daisuke Okuzaki …

CHEST 168(4) 3703A-3704A 2025年10月
γ-ヘルペスウイルス亜科のチミジンキナーゼ活性に関するインシリコ構造解析

山口達生, RE Suyong, 渡部匡史, 藤室雅弘, 夏目やよい

日本薬学会年会要旨集(Web) 145th 2025年
アジュバント;過去,現在,未来アジュバントのデータベース

夏目やよい, 夏目やよい, 夏目やよい

臨床とウイルス 53(1) 2025年
空間的遺伝子発現解析により同定されたSPARC:分類不能型特発性間質性肺炎の新規予後バイオマーカー

船内敦司, 橋本和樹, 新津敬之, 片岡俊郎, 福島清春, 福島清春, 元岡大祐, 七野成之, 夏目やよい, 北村英也 …

日本呼吸器学会誌(Web) 14 2025年
家族性間質性肺炎における予後予測因子としてのテロメア長の有用性

田上陽一, 北村英也, 宮澤一雄, 藤本一志, 大迫亮介, 大利亮太, 馬場智尚, 夏目やよい, 伊藤薫, 小倉高志

日本呼吸器学会誌(Web) 14 2025年
特発性肺線維症における正常肺領域と三尖弁逆流速度による予後評価と血中エクソソーム解析

藤本一志, 北村英也, 大迫亮介, 田上陽一, 宮澤一雄, 馬場智尚, 伊藤薫, 岩澤多恵, 夏目やよい, 小倉高志

日本呼吸器学会誌(Web) 14 2025年
特発性肺線維症と線維性過敏性肺臓炎の病因病態と適応免疫応答

北村英也, 大迫亮介, 藤本一志, 田上陽一, 宮澤一雄, 岩澤多恵, 夏目やよい, 伊藤薫, 小倉高志

日本呼吸器学会誌(Web) 14 2025年
ナレッジグラフにおける機械学習によるがん治療薬レジメン予測

舘功陽, 矢野雄一, 赤木健一朗, 夏目やよい, 夏目やよい, 黒田正孝, 黒田正孝, 伊藤眞里, 樋口千洋, 上野賢也 …

人工知能学会全国大会論文集(Web) 38th 2024年
家族性間質性肺炎における予後予測因子としてのテロメア長の有用性

田上陽一, 田上陽一, 北村英也, 室橋光太, 藤本一志, 福島高志, 大利亮太, 馬場智尚, 岩澤多恵, 金子猛 …

日本呼吸器学会誌(Web) 13 2024年
特発性肺線維症と線維性過敏性肺炎を鑑別するための機械学習に基づく画像定量ソフトPyradiomicsの有用性

北村英也, 小野寺葉子, 丹羽崇, 奥寺康司, 岩澤多恵, 夏目やよい, 小倉高志

日本呼吸器学会誌(Web) 13 2024年
IPF患者血清EVプロテオミクスと血清・尿メタボロミクスの統合ネットワーク解析によるIPF特有のパスウェイの探索

伊藤眞里, 武田吉人, 白井雄也, 榎本貴俊, 村岡賢, 足立淳, 夏目やよい, 水口賢司, 水口賢司, 熊ノ郷淳

日本呼吸器学会誌(Web) 13 2024年
家族性慢性過敏性肺炎におけるテロメア短縮とAIを用いた画像評価

西村匡司, 北村英也, 田上陽一, 田上陽一, 藤本一志, 福島高志, 大利亮太, 岩澤多恵, 金子猛, 夏目やよい …

日本呼吸器学会誌(Web) 13 2024年
クライオ生検組織を用いた特発性肺線維症の病態解明へのアプローチ

北村英也, 伊藤眞里, 丹羽崇, 馬場智尚, 夏目やよい, 小倉高志

日本呼吸器学会誌(Web) 13 2024年
エクソソームのプロテオミクスによる線維性過敏性肺炎の新規バイオマーカー開発

原伶奈, 武田吉人, 足立淳, 夏目やよい, 伊藤眞里, 長谷拓明, 辻川和丈, 井上義一, 広瀬雅樹, 熊ノ郷淳

日本呼吸器学会誌(Web) 13 2024年
クライオ生検組織を用いた特発性肺線維症と線維性過敏性肺臓炎の病態解明へのアプローチ

北村英也, 大迫亮介, 田上陽一, 福島高志, 藤本一志, 夏目やよい, 伊藤薫, 小倉高志

日本呼吸器学会誌(Web) 13 2024年
データ駆動的患者層別化と情報に基づく疾患理解

夏目やよい, 夏目やよい, 夏目やよい

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
トキシコゲノミクスとシステムバイオロジーとの融合による新型化学物質有害性評価系の実装研究 Percellomeデータベースを利用した解析パイプライン

夏目やよい

トキシコゲノミクスとシステムバイオロジーとの融合による新型化学物質有害性評価系の実装研究令和5年度総括・分担研究報告書(Web) 2024年
AIとの協業としての生命医学・毒性学

夏目やよい, 夏目やよい

Journal of Toxicological Sciences 49(Supplement (CD-ROM)) 2024年
ゲノムとAI:データ駆動的アプローチが描く次世代創薬

夏目やよい

バイオサイエンスとインダストリー 82(1) 2024年
トキシコゲノミクスとシステムバイオロジーとの融合による新型化学物質有害性評価系の実装研究 Percellomeデータベースを利用した解析パイプライン

夏目やよい

トキシコゲノミクスとシステムバイオロジーとの融合による新型化学物質有害性評価系の実装研究令和4年度総括・分担研究報告書(Web) 2023年

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書籍等出版物

医薬品モダリティにおける創薬技術開発と展望

(担当:分担執筆)

情報機構 2024年6月 (ISBN: 9784865022711)
ワクチン設計のサイエンス

(担当:分担執筆)

医歯薬出版 2022年10月
革新的AI創薬 : 医療ビッグデータ、人工知能がもたらす創薬研究の未来像

(担当:分担執筆)

エヌ・ティー・エス 2022年7月 (ISBN: 9784860437886)

共同研究・競争的資金等の研究課題

発生を制御するヒストン修飾動態のin silico解析

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進/戦略的創造研究推進事業/さきがけ 2010年 - 2014年

夏目やよい

産業財産権

特願2021-13264 複数の項目を関係付けるための方法、システム、及びプログラム

夏目やよい, 上田修功

夏目やよい

基本情報

研究分野

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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