山形 方人
基本情報
- 学位
-
理学博士(名古屋大学)
- 研究者番号
- 00202375
- ORCID ID
- https://orcid.org/0000-0001-8193-2931
- J-GLOBAL ID
- 201101075626746795
- researchmap会員ID
- B000002801
- 外部リンク
細胞表面分子に焦点を当てて、先端技術を利用、開発しつつ、網膜(ニワトリ、マウス)などの視覚系における神経回路の機能と形成の問題に、一貫して取り組んでいる。
研究領域
神経科学、神経発生
研究のキーワード
神経回路形成(網膜、網膜視蓋系)、細胞表面相互作用によるシナプス結合の決定因子と可視化ツール、
細胞外マトリックスと細胞接着分子、シナプス接着分子、層特異的神経回路形成
https://togotv.dbcls.jp/pics.html
Editorial Board
Associate Editor: Frontiers in Neural Circuits
(Chief editors: Takao K Hensch, Edward S Ruthazer)
https://www.frontiersin.org/journals/neural-circuits#editorial-board
Fronteirs Research Topic Editor (Frontiers in Cellular Neuroscience, Frontiers in Neural Circuits, Frontiers in Molecular Neuroscience, Frontiers in Aging Neuroscience)
"Understanding Neural Circuits Using Single-Cell Technologies"
https://www.frontiersin.org/research-topics/29256/
Frontiers Research Topic Editor (Frontiers in Cellular Neuroscience, Frontiers in Neural Circuits, Frontiers in Synaptic Neuroscience, Frontiers in Molecular Neuroscience, Frontiers in Neural Circuits)
"Neuroscience and Neurotechnology of Neuronal Cell Surface Molecules in Neural Circuits"
https://www.frontiersin.org/research-topics/11563/
IJMS (International Journal of Molecular Sciences) Molecular Neurobiology section
https://www.mdpi.com/journal/ijms/sectioneditors/Molecular_Neurobiology
Special Issue "Advances in the Research of Neural Circuits"
SynBio
https://www.mdpi.com/journal/synbio/editors
Special Issue " Programmable proteins in synthetic biology"
Synthetic Biology and Engineering
https://www.sciepublish.com/journals/sbe
JoVE (Guest Editor, Methods Collection "Current methods in chick embryology")
https://www.jove.com/methods-collections/924
脳科学辞典(日本神経科学学会)編集委員(発生)
https://bsd.neuroinf.jp/
日本神経科学学会公認ニューロナビゲータ
https://www.jnss.org/neuro_navigator
日本科学振興協会(JAAS)理事 https://jaas.science/aboutus/
主要論文
Yamagata, M., Sanes, J. R. (2021)
CRISPR-mediated labeling of cells in chick embryos based on selectively expressed genes.
Bio-protocol, 11: e4105. doi: 10.21769/BioProtoc.4105
Yamagata, M., Yan, W., Sanes, J. R. (2021).
A cell atlas of the chick retina based on single-cell transcriptomics.
eLife. 10:e63907. doi: 10.7554/eLife.63907 (PMID: 33393903) 解説記事(英語)
Yamagata, M., Sanes, J. R. (2019).
Expression and roles of the immunoglobulin superfamily recognition molecule sidekick1 in mouse retina.
Front. Mol. Neurosci. 11, 485.doi: 10.3389/fnmol.2018.00485 (PMID: 30687002) Editors' Pick
Yamagata, M., Sanes, J.R. (2018).
Reporter-nanobody fusions (RANbodies) as versatile, small, sensitive immunohistochemical reagents.
Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 115, 2126-2131. doi: 10.1073/pnas.1722491115 (PMID: 29440485) 解説記事(英語)
Yamagata, M., Duan, X., Sanes, J.R. (2018).
Cadherins interact with synaptic organizers to promote synaptic differentiation.
Front. Mol. Neurosci. 11, 142. doi: 10.3389/fnmol.2018.00142 (PMID: 29760652) 関連解説記事(英語)
*Goodman, K.M., *Yamagata, M., Jin, X., Mannepalli, S., Katsamba, P.S., Ahlsén, G., Sergeeva, A.P., Honig, B., Sanes, J.R., Shapiro, L. (2016).
Molecular basis of sidekick-mediated cell-cell adhesion and specificity.
eLife 5, e19058 (*1st Coauthor) doi: 10.7554/eLife.19058 (PMID: 27644106) 紹介記事(日本語)
Martell, J.D., Yamagata, M., Deerinck, T.J., Phan, S., Kwa, C.G., Ellisman, M.H., *Sanes, J.R., *Ting, A.Y. (2016).
A split horseradish peroxidase for the detection of intercellular protein-protein interactions and sensitive visualization of synapses.
Nature Biotechnology 34, 774–780. doi: 10.1038/nbt.3563 (PMID: 27240195) 解説記事(日本語)
Joesch, M., Mankus, D., Yamagata, M., Shahbazi, A., Schalek, R., Suissa-Peleg, A., Meister, M., Lichtman, J.W., Scheirer, W.J., Sanes, J. R. (2016).
Reconstruction of genetically identified neurons imaged by serial-section electron microscopy.
eLife 5, e15015 doi: 10.7554/eLife.15015 (PMID: 27383271) 解説記事(日本語)
*Krishnaswamy, A., *Yamagata, M., Duan, X., Hong, Y.K., Sanes, J.R. (2015).
Sidekick 2 directs formation of a retinal circuit that detects differential motion.
Nature 524, 466–470. (*1st Coauthor) doi: 10.1038/nature14682 (PMID: 26287463) 紹介記事(日本語)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (2012).
Expanding the Ig superfamily code for laminar specificity in retina: expression and role of contactins.
J. Neurosci. 32, 14402-14414. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3193-12.2012 (PMID: 23055510)
Yamagata, M, Sanes, J.R. (2012).
Transgenic strategy for identifying synaptic connections in mice by fluorescence complementation (GRASP).
Front. Mol. Neurosci. 5, 18. doi: 10.3389/fnmol.2012.00018 (PMID: 22355283)
Kim, I.J., Zhang, Y., Yamagata, M., Meister, M., Sanes, J.R. (2008).
Molecular identification of a retinal cell type that responds to upward motion.
Nature 452, 478-482. doi: 10.1038/nature06739 (PMID: 18368118)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (2008).
Dscam and Sidekick proteins direct lamina-specific synaptic connections in vertebrate retina.
Nature 451, 465-469. doi: 10.1038/nature06469 (PMID: 18216854) 解説記事(日本語)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (2005).
Versican in the developing brain: Lamina-specific expression in interneuronal subsets and role in presynaptic maturation.
J. Neurosci. 25, 8457– 8467. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1976-05.2005 (PMID: 16162928) 解説記事(英語)
Yamagata, M., Weiner, J.A., Sanes, J.R. (2002).
Sidekicks: synaptic adhesion molecules that promote lamina-specific connectivity in the retina.
Cell 110, 649-660. doi: 10.1016/s0092-8674(02)00910-8 (PMID: 12230981) 解説記事(日本語)
Yamagata, M., Sanes, J.R. (1995).
Target-independent diversification and target specific projections of chemically coded retinal ganglion cell.
Development. 121, 3763-3776. (PMID: 8582286) 解説総説(日本語)
Yamagata, M., Herman, J.-P., Sanes, J.R. (1995).
Lamina-specific expression of adhesion molecules in developing chick optic tectum.
J. Neurosci. 15, 4556-4571. doi: 10.1523/JNEUROSCI.15-06-04556.1995 (PMID: 7790923)
Yamagata, M. and Sanes, J. R. (1995).
Lamina-specific outgrowth and arborization of retinal axons in chick optic tectum.
Development 121, 189-200. (PMID: 7867499)
総説
Yamagata, M. (2022).
Programmable Proteins: Target Specificity, Programmability and Future Directions.
SynBio 1, 65-76. doi: 10.3390/synbio1010005 日本語翻訳
Yamagata, M. (2022).
Chicken Cell Atlas: Science and DeSci (プレプリント、2022)
https://jxiv.jst.go.jp/index.php/jxiv/preprint/view/182
Yamagata, M. (2022).
Towards Tabula Gallus
Int. J. Mol. Sci. 23, 613. doi: 10.3390/ijms23020613 日本語翻訳
Yamagata, M. (2020).
Structure and Functions of Sidekicks.
Front. Mol. Neurosci. 13, 139. doi: 10.3389/fnmol.2020.00139 (PMID: 32982686)
Sanes, J. R., Yamagata, M. (2009).
Many paths to synaptic specificity.
Annu Rev Cell Dev Biol. 25:161-95. doi: 10.1146/annurev.cellbio.24.110707.175402 (PMID: 19575668)
Yamagata, M., Sanes, J. R., Weiner, J. A. (2003).
Synaptic adhesion molecules.
Curr Opin Cell Biol. 15:621-32. doi: 10.1016/s0955-0674(03)00107-8 (PMID: 14519398)
Sanes, J. R., Yamagata, M. (1999).
Formation of lamina-specific synaptic connections.
Curr Opin Neurobiol. 9:79-87. doi: 10.1016/s0959-4388(99)80010-5 (PMID: 10072367)
邦文総説
Nanobody (2020 年) 山形方人 月刊「臨床免疫・アレルギー科」73巻3号, pp329-335
神経回路構築に関わるシナプス接着分子 (2005年) 山形方人「生化学」pp. 431-435 (77巻)
層特異的シナプス結合を促進するシナプス接着分子Sidekick (2003年) 山形方人「実験医学」pp. 61-63 (21巻)
網膜神経節細胞が示す層特異的シナプス結合の発生機構 (2002年) 山形方人 「実験医学」(実験医学2002年3月増刊号「脳・神経研究のフロンティア」) pp. 731-737 (20巻)
目から脳への特異的神経投射:網膜視蓋系を組み立てる機構 (1996年) 山形方人、野田昌晴「細胞工学」pp. 143-152(15巻)
キメラコラーゲン: コラーゲン繊維に新しい機能を付加するコラーゲン (1992年) 山形方人、木全弘治「生化学」pp. 26-32 (64巻)
リバースト遺伝学によるプロテオグリカン機能の解明 (1992年)
山形方人「糖鎖工学」pp. 342-347 分担(小川智也、木幡陽、渋谷直人、鈴木旺、永井克孝編、産業調 査会バイオテクノロジー情報センター:ISBN-10: 4882825155)
辞書項目
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/コネクトーム
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/ナノボディ
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/シナプス形成
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/シングルセルRNAシーケンシング
Yamagata M. (2017) Lamina-specific neuronal connections.
In: Reference module in Neuroscience and Biobehavioral Psychology (Elsevier).
In: Encyclopedia of Neuroscience (Squire LR (ed.)) Oxford, England, Academic Press. Volume. 5, pp. 299-305. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-809324-5.02636-5
Yamagata M. (2009) Synaptic adhesion molecule.
In: Encyclopedia of Neuroscience (Binder MD, Hirokawa N, Windhorst U (eds.)) Springer-Verlag, Berlin, Germany. pp. 3945-3948. https://doi.org/10.1007/978-3-540-29678-2_5807
論文総目録(英語・日本語 PDF版ダウンロード)
Wheel in chick retina
(Harvard University Brain Initiative, Beauty of the Brain写真コンテスト受賞作)
より詳しくはこちら参考(外部の独自サイトにリンクしてあります)
http://masahitoyamagata.hatenablog.com/profile
研究キーワード
30研究分野
15論文
74-
SynBio 2023年10月
-
Cytogenetic and Genome Research 2023年1月30日
-
SynBio 1(1) 65-76 2022年10月28日
-
International Journal of Molecular Sciences 23(2) 613-613 2022年1月6日 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
-
BIO-PROTOCOL 11(15) 2021年8月5日 査読有り筆頭著者
-
Frontiers in Neural Circuits 15 2021年6月23日
-
eLife 10 2021年1月4日 査読有り筆頭著者
-
脳科学辞典 2020年12月 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
-
bioRxiv 2020年10月10日
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脳科学辞典 2020年10月 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
-
Frontiers in Molecular Neuroscience 13 2020年8月25日 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
-
BioProcess International 2019年9月26日 査読有り
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The Journal of Neuroscience 39(25) 4889-4908 2019年6月19日 査読有り
-
Neuron 99(6) 1145-1154 2018年9月19日 査読有り
-
脳科学辞典 2018年8月 査読有り筆頭著者最終著者責任著者
-
Nature methods 15(6) 469-469 2018年6月 査読有り
-
Nature Methods 15(6) 429-432 2018年6月 査読有り
-
Neuron 98(3) 658-668 2018年5月2日 査読有り
-
Proceedings of the National Academy of Sciences 115(9) 2126-2131 2018年2月27日 査読有り
書籍等出版物
2-
産業調査会 バイオテクノロジー情報センター 1992年1月 (ISBN: 4882825155)
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丸善 1989年5月 (ISBN: 4621033700)
経歴
6-
2004年 - 現在
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1998年 - 2004年
-
1994年9月 - 1998年8月
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1990年 - 1991年
-
1988年 - 1990年
受賞
5-
1996年
-
1996年
-
1996年
-
1995年
-
1991年
MISC
33-
academist 2016年12月 招待有り
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脳科学辞典(日本神経科学学会) 2016年6月 査読有り招待有り
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日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 81回・31回 2S25-2 2008年11月
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生化学 77(5) 431-435 2005年5月25日
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生化学 77(5) 431-435 2005年5月
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脳・神経研究のフロンティア 脳のパターン形成,神経ネットワーク,そして注目の神経再生から臨床応用まで 第2章 細胞移動および層形成のメカニズム 4. 網膜神経節細胞が示す層特異的シナプス結合の発生機構実験医学 20(5) 731-737 2002年3月25日
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実験医学 20(5) 731-737 2002年3月
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日本神経科学大会プログラム・抄録集 23rd 107 2000年9月4日
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日本獣医学会学術集会講演要旨集 129th 29 2000年3月1日
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DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION 41(5) 575-587 1999年10月
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神経化学 37(3) 549-549 1998年9月
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神経化学 37(3) 550-550 1998年9月
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上原記念生命科学財団研究報告集 11 175-177 1997年11月30日
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TRENDS IN GLYCOSCIENCE AND GLYCOTECHNOLOGY 9 S25-S28 1997年5月
-
神経回路の機能発達2 平成9年 51-52 1997年
-
MOLECULAR BASIS OF AXON GROWTH AND NERVE PATTERN FORMATION (20) 197-214 1997年
-
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 661-661 1996年8月1日
-
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19th 661-661 1996年7月
-
細胞工学 15(2) 143-152 1996年2月
講演・口頭発表等
4-
1996年3月14日 招待有り
-
1995年12月11日 招待有り
-
1995年12月9日 招待有り
-
1994年12月12日 招待有り
共同研究・競争的資金等の研究課題
6-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 奨励研究(A) 1997年 - 1998年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 奨励研究(A) 1996年 - 1996年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 重点領域研究 1996年 - 1996年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 重点領域研究 1996年 - 1996年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 奨励研究(A) 1995年 - 1995年
-
日本学術振興会 科学研究費助成事業 奨励研究(A) 1988年 - 1989年