基本情報

所属
Harvard University
学位
理学博士(名古屋大学)

研究者番号
00202375
ORCID ID
 https://orcid.org/0000-0001-8193-2931
J-GLOBAL ID
201101075626746795
researchmap会員ID
B000002801

外部リンク

細胞表面分子に焦点を当てて、先端技術を利用、開発しつつ、網膜(ニワトリ、マウス)などの視覚系における神経回路の機能と形成の問題に、一貫して取り組んでいる。

研究領域

神経科学、神経発生

研究のキーワード

神経回路形成(網膜、網膜視蓋系)、細胞表面相互作用によるシナプス結合の決定因子と可視化ツール、細胞外マトリックスと細胞接着分子、シナプス接着分子、層特異的神経回路形成

                https://togotv.dbcls.jp/pics.html

主要論文 

Yamagata, M., Sanes, J. R. (2021)
CRISPR-mediated labeling of cells in chick embryos based on selectively expressed genes.
Bio-protocol, 11: e4105. doi: 10.21769/BioProtoc.4105

 

Yamagata, M., Yan, W., Sanes, J. R. (2021).
A cell atlas of the chick retina based on single-cell transcriptomics.
eLife. 10:e63907. doi: 10.7554/eLife.63907 (PMID: 33393903)
 解説記事(英語)


Yamagata, M., Sanes, J. R. (2019).
Expression and roles of the immunoglobulin superfamily recognition molecule sidekick1 in mouse retina.
Front. Mol. Neurosci. 11, 485.doi: 10.3389/fnmol.2018.00485 (PMID: 30687002)  Editors' Pick


Yamagata, M., Sanes, J.R. (2018).
Reporter-nanobody fusions (RANbodies) as versatile, small, sensitive immunohistochemical reagents.
Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 115, 2126-2131. doi: 10.1073/pnas.1722491115 (PMID: 29440485)  
解説記事(英語)

 

Yamagata, M., Duan, X., Sanes, J.R. (2018).
Cadherins interact with synaptic organizers to promote synaptic differentiation. 
Front. Mol. Neurosci. 11, 142. doi: 10.3389/fnmol.2018.00142 (PMID: 29760652) 
関連解説記事(英語)


*Goodman, K.M., *Yamagata, M., Jin, X., Mannepalli, S., Katsamba, P.S., Ahlsén, G., Sergeeva, A.P., Honig, B., Sanes, J.R., Shapiro, L. (2016).
Molecular basis of sidekick-mediated cell-cell adhesion and specificity. 
eLife 5, e19058 (*1st
Coauthor) doi: 10.7554/eLife.19058 (PMID: 27644106)  紹介記事(日本語)

 

Martell, J.D., Yamagata, M., Deerinck, T.J., Phan, S., Kwa, C.G., Ellisman, M.H., *Sanes, J.R., *Ting, A.Y. (2016).
A split horseradish peroxidase for the detection of intercellular protein-protein interactions and sensitive visualization of synapses. 
Nature Biotechnology 34, 774–780. doi: 10.1038/nbt.3563 (PMID: 27240195)  解説記事(日本語)

 

Joesch, M., Mankus, D., Yamagata, M., Shahbazi, A., Schalek, R., Suissa-Peleg, A., Meister, M., Lichtman, J.W., Scheirer, W.J., Sanes, J. R. (2016).
Reconstruction of genetically identified neurons imaged by serial-section electron microscopy. 
eLife 5, e15015 doi: 10.7554/eLife.15015 (PMID: 27383271)  解説記事(日本語)


*Krishnaswamy, A., *Yamagata, M., Duan, X., Hong, Y.K., Sanes, J.R. (2015).

Sidekick 2 directs formation of a retinal circuit that detects differential motion. 
Nature 524, 466–470. (*1st Coauthor) doi: 10.1038/nature14682 (PMID: 26287463) 
紹介記事(日本語)


Yamagata, M., Sanes, J.R. (2012).
Expanding the Ig superfamily code for laminar specificity in retina: expression and role of contactins.
J. Neurosci. 32, 14402-14414. doi: 10.1523/JNEUROSCI.3193-12.2012 (PMID: 23055510)

 

Yamagata, M, Sanes, J.R. (2012).
Transgenic strategy for identifying synaptic connections in mice by fluorescence complementation (GRASP).
Front. Mol. Neurosci. 5, 18. doi: 10.3389/fnmol.2012.00018 (PMID: 22355283)


Yamagata M, Sanes JR. (2010). 
Synaptic localization and function of Sidekick recognition molecules require MAGI scaffolding proteins. 
J. Neurosci. 30, 3579-3588. doi: 10.1523/JNEUROSCI.6319-09.2010 (PMID: 20219992)


Kim, I.J., Zhang, Y., Yamagata, M., Meister, M., Sanes, J.R. (2008).
Molecular identification of a retinal cell type that responds to upward motion.
Nature 452, 478-482. doi: 10.1038/nature06739 (PMID: 18368118)


Yamagata, M., Sanes, J.R. (2008).
Dscam and Sidekick proteins direct lamina-specific synaptic connections in vertebrate retina.
Nature 451, 465-469. doi: 10.1038/nature06469 (PMID: 18216854) 解説記事(日本語)


Yamagata, M., Weiner, J.A., Dulac, C., Roth, K.A., Sanes, J.R. (2006).
Labeled lines in the retinotectal system: Markers for retinorecipient sublaminae and the retinal ganglion cell subsets that innervate them.
Mol Cell Neurosci. 33, 296-310.doi: 10.1016/j.mcn.2006.08.001 (PMID: 16978878)

 

Yamagata, M., Sanes, J.R. (2005).
Versican in the developing brain: Lamina-specific expression in interneuronal subsets and role in presynaptic maturation.
J. Neurosci. 25, 8457– 8467. doi: 10.1523/JNEUROSCI.1976-05.2005 (PMID: 16162928) 解説記事(英語)


Yamagata, M., Weiner, J.A., Sanes, J.R. (2002).
Sidekicks: synaptic adhesion molecules that promote lamina-specific connectivity in the retina.
Cell 110, 649-660. doi: 10.1016/s0092-8674(02)00910-8 (PMID: 12230981) 解説記事(日本語)


Yamagata, M., Sanes, J.R. (1995).
Target-independent diversification and target specific projections of chemically coded retinal ganglion cell.
Development. 121, 3763-3776. (PMID: 8582286) 解説総説(日本語)


Yamagata, M., Herman, J.-P., Sanes, J.R. (1995).
Lamina-specific expression of adhesion molecules in developing chick optic tectum. 
J. Neurosci. 15, 4556-4571. doi: 10.1523/JNEUROSCI.15-06-04556.1995 (PMID: 7790923)


Yamagata, M. and Sanes, J. R. (1995).
Lamina-specific outgrowth and arborization of retinal axons in chick optic tectum.
Development 121, 189-200. (PMID: 7867499)

 

総説

Yamagata, M. (2022).
Towards Tabula Gallus
Int. J. Mol. Sci. 23, 613.
doi: 10.3390/ijms23020613
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/2/613

 

Yamagata, M. (2020).
Structure and Functions of Sidekicks.
Front. Mol. Neurosci. 13, 139. doi: 10.3389/fnmol.2020.00139 (PMID: 32982686) 
 
Sanes, J. R., Yamagata, M. (2009).
Many paths to synaptic specificity.
Annu Rev Cell Dev Biol. 25:161-95. doi: 10.1146/annurev.cellbio.24.110707.175402 (PMID: 19575668)
 
Yamagata, M., Sanes, J. R., Weiner, J. A. (2003).
Synaptic adhesion molecules.
Curr Opin Cell Biol. 15:621-32. doi: 10.1016/s0955-0674(03)00107-8 (PMID: 14519398)
 
Sanes, J. R., Yamagata, M. (1999).
Formation of lamina-specific synaptic connections.
Curr Opin Neurobiol. 9:79-87. doi: 10.1016/s0959-4388(99)80010-5 (PMID: 10072367)
 
邦文総説
Nanobody (2020 年) 山形方人  月刊「臨床免疫・アレルギー科」73巻3号, pp329-335
神経回路構築に関わるシナプス接着分子 (2005年) 山形方人「生化学」pp. 431-435 (77巻)

層特異的シナプス結合を促進するシナプス接着分子Sidekick (2003年) 山形方人「実験医学」pp. 61-63 (21巻)

網膜神経節細胞が示す層特異的シナプス結合の発生機構 (2002年) 山形方人 「実験医学」(実験医学2002年3月増刊号「脳・神経研究のフロンティア」) pp. 731-737 (20巻)

目から脳への特異的神経投射:網膜視蓋系を組み立てる機構 (1996年) 山形方人、野田昌晴「細胞工学」pp. 143-152(15巻)

キメラコラーゲン: コラーゲン繊維に新しい機能を付加するコラーゲン (1992年) 山形方人、木全弘治「生化学」pp. 26-32 (64巻)
 
リバースト遺伝学によるプロテオグリカン機能の解明 (1992年)
山形方人「糖鎖工学」pp. 342-347 分担(小川智也、木幡陽、渋谷直人、鈴木旺、永井克孝編、産業調 査会バイオテクノロジー情報センター:ISBN-10: 4882825155) 
 
辞書項目
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/コネクトーム
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/ナノボディ
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/シナプス形成
https://bsd.neuroinf.jp/wiki/シングルセルRNAシーケンシング
Yamagata M. (2017) Lamina-specific neuronal connections
In: Reference module in Neuroscience and Biobehavioral Psychology (Elsevier).
In: Encyclopedia of Neuroscience (Squire LR (ed.)) Oxford, England, Academic Press. Volume. 5, pp. 299-305. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-809324-5.02636-5
Yamagata M. (2009) Synaptic adhesion molecule.
In: Encyclopedia of Neuroscience (Binder MD, Hirokawa N, Windhorst U (eds.)) Springer-Verlag, Berlin, Germany. pp. 3945-3948. https://doi.org/10.1007/978-3-540-29678-2_5807
 
論文総目録(英語・日本語 PDF版ダウンロード)
 
Editorial Board
Associate Editor: Frontiers in Neural Circuits 
(Chief editors: Takao K Hensch, Edward S Ruthazer) 
https://www.frontiersin.org/journals/neural-circuits#editorial-board
 
Fronteirs Research Topic Editor (Frontiers in Cellular Neuroscience, Frontiers in Neural Circuits, Frontiers in Molecular Neuroscience, Frontiers in Aging Neuroscience) 
"Understanding Neural Circuits Using Single-Cell Technologies"
https://www.frontiersin.org/research-topics/29256/
 
Frontiers Research Topic Editor (Frontiers in Cellular Neuroscience, Frontiers in Neural Circuits, Frontiers in Synaptic Neuroscience, Frontiers in Molecular Neuroscience, Frontiers in Neural Circuits)
"Neuroscience and Neurotechnology of Neuronal Cell Surface Molecules in Neural Circuits"
https://www.frontiersin.org/research-topics/11563/
Editorial

 
IJMS (International Journal of Molecular Sciences) Molecular Neurobiology section
https://www.mdpi.com/journal/ijms/sectioneditors/Molecular_Neurobiology
Special Issue "Advances in the Research of Neural Circuits"
 
SynBio
https://www.mdpi.com/journal/synbio/editors
Special Issue " Programmable proteins in synthetic biology"
 
JoVE (Guest Editor, Methods Collection "Current methods in chick embryology")
https://www.jove.com/methods-collections/924

 
脳科学辞典(日本神経科学学会)編集委員(発生)
https://bsd.neuroinf.jp/
 
Wheel in chick retina
(Harvard University Brain Initiative, Beauty of the Brain写真コンテスト受賞作
Wheel in Chick Retina 
 
詳しくはこちら参考(外部の独自サイトにリンクしてあります)
http://masahitoyamagata.hatenablog.com/profile

論文

  70

MISC

  33

書籍等出版物

  2

講演・口頭発表等

  4