山本雄介 (Yusuke Yamamoto) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人国立がん研究センター病態情報学ユニットユニット長

学位: 理学(早稲田大学)

研究者番号: 60768117
J-GLOBAL ID: 201701008874109896
researchmap会員ID: B000279509

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https://scholar.google.co.jp/citations?user=yPshRB0AAAAJ&hl=ja

NCC HP

https://www.ncc.go.jp/jp/ri/division/integrative_oncology/index.html

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年10月 - 現在

慶応義塾大学, 薬学部, 客員准教授
2024年4月 - 現在

信州大学, 大学院総合医理工学研究科医学系専攻医学分野, 特任教授
2021年10月 - 現在

国立研究開発法人国立がん研究センター研究所, 病態情報学ユニット, ユニット長 (博士(理学))
2019年4月 - 2021年9月

国立研究開発法人国立がん研究センター研究所, 細胞情報学, 主任研究員 (博士(理学))
2015年7月 - 2019年3月

国立がん研究センター研究所, 分子細胞治療研究分野, 主任研究員
2012年12月 - 2015年6月

Jackson laboratory, Research Scientist
2010年4月 - 2012年12月

シンガポールゲノム研究所, リサーチアソシエイト
2008年10月 - 2010年3月

シンガポールゲノム研究所, 博士研究員
2008年4月 - 2008年9月

日本学術振興会特別研究員(PD)
2006年4月 - 2008年3月

日本学術振興会特別研究員(DC1)

学歴

2006年4月 - 2008年3月

早稲田大学大学院博士課程, 大学院理工学研究科, 生命理工
2004年4月 - 2006年3月

早稲田大学大学院修士課程, 大学院理工学研究科, 生命理工
2000年4月 - 2004年3月

早稲田大学, 教育学部, 理学科, 生物学専修
1997年4月 - 2000年3月

早稲田大学系属早稲田実業学校高等部

委員歴

2022年1月 - 現在

日本癌学会, 評議員

主要な論文

158

LIMCH1-enriched extracellular vesicles promote vascular permeability in early-onset preeclampsia.

Seiko Matsuo, Akira Yokoi, Takafumi Ushida, Kosuke Yoshida, Hironori Suzuki, Masami Kitagawa, Eri Asano-Inami, Hiroaki Yamada, Rika Miki, Sho Tano …

Science advances 12(5) eaeb8806 2026年1月30日査読有り
Integrated spatial and single-cell transcriptomics reveal PAK kinase as a therapeutic target in fibroblastic foci and dense fibrosis of IPF.

Naoaki Watanabe, Masahiro Yoshida, Yuta Hirano, Shota Fujimoto, Sachi Matsubayashi, Takashi Ishiguro, Nobumasa Takahashi, Yoshihiko Shimizu, Noboru Takayanagi, Yoshinori Kawabata …

The European respiratory journal 66(4) 2025年7月17日査読有り責任著者
Aberrant regulation of serine metabolism drives extracellular vesicle release and cancer progression.

Tomofumi Yamamoto, Jun Nakayama, Fumihiko Urabe, Kagenori Ito, Nao Nishida-Aoki, Masami Kitagawa, Akira Yokoi, Masahiko Kuroda, Yutaka Hattori, Yusuke Yamamoto …

Cell reports 43(8) 114517-114517 2024年7月17日査読有り責任著者
Spatial exosome analysis using cellulose nanofiber sheets reveals the location heterogeneity of extracellular vesicles.

Akira Yokoi, Kosuke Yoshida, Hirotaka Koga, Masami Kitagawa, Yukari Nagao, Mikiko Iida, Shota Kawaguchi, Min Zhang, Jun Nakayama, Yusuke Yamamoto …

Nature communications 14(1) 6915-6915 2023年11月8日査読有り
Cancer-prone Phenotypes and Gene Expression Heterogeneity at Single-cell Resolution in Cigarette-smoking Lungs.

Jun Nakayama, Yusuke Yamamoto

Cancer research communications 2023年11月1日査読有り最終著者責任著者
Identifying high-grade serous ovarian carcinoma-specific extracellular vesicles by polyketone-coated nanowires.

Akira Yokoi, Mayu Ukai, Takao Yasui, Yasuhide Inokuma, Kim Hyeon-Deuk, Juntaro Matsuzaki, Kosuke Yoshida, Masami Kitagawa, Kunanon Chattrairat, Mikiko Iida …

Science advances 9(27) eade6958 2023年7月7日査読有り
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Intratumoral Heterogeneity and Molecular Features of Ductal Carcinoma In Situ

Momoko Tokura, Jun Nakayama, Marta Prieto-Vila, Sho Shiino, Masayuki Yoshida, Tomofumi Yamamoto, Naoaki Watanabe, Shin Takayama, Yutaka Suzuki, Koji Okamoto …

Cancer Research 82(18) 3236-3248 2022年7月19日最終著者責任著者
Aberrant activation of cell cycle-related kinases and the potential therapeutic impact of PLK1 or CHEK1 inhibition in uterine leiomyosarcoma.

Kosuke Yoshida, Akira Yokoi, Tomofumi Yamamoto, Yusuke Hayashi, Jun Nakayama, Tsuyoshi Yokoi, Hiroshi Yoshida, Tomoyasu Kato, Hiroaki Kajiyama, Yusuke Yamamoto

Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research 28(10) 2147-2159 2022年3月18日最終著者責任著者
Selective targeting of KRAS-driven lung tumorigenesis via unresolved ER stress.

Iwao Shimomura, Naoaki Watanabe, Tomofumi Yamamoto, Minami Kumazaki, Yuji Tada, Koichiro Tatsumi, Takahiro Ochiya, Yusuke Yamamoto

JCI insight 6(7) 2021年4月8日最終著者責任著者
miR-26a regulates extracellular vesicle secretion from prostate cancer cells via targeting SHC4, PFDN4, and CHORDC1.

Fumihiko Urabe, Nobuyoshi Kosaka, Yurika Sawa, Yusuke Yamamoto, Kagenori Ito, Tomofumi Yamamoto, Takahiro Kimura, Shin Egawa, Takahiro Ochiya

Science advances 6(18) eaay3051 2020年5月査読有り
Cloning of ground-state intestinal stem cells from endoscopic biopsy samples.

Marcin Duleba, Yusuke Yamamoto, Rahul Neupane, Wei Rao, Jingzhong Xie, Yutao Qi, Audrey-Ann Liew, Suchan Niroula, Yanting Zhang, Rajasekaran Mahalingam …

Nature protocols 2020年4月1日査読有り筆頭著者
Single-Cell Analysis Reveals a Preexisting Drug-Resistant Subpopulation in the Luminal Breast Cancer Subtype.

Marta Prieto-Vila, Wataru Usuba, Ryou-U Takahashi, Iwao Shimomura, Hideo Sasaki, Takahiro Ochiya, Yusuke Yamamoto

Cancer research 79(17) 4412-4425 2019年9月1日査読有り最終著者責任著者
Integrated extracellular microRNA profiling for ovarian cancer screening.

Akira Yokoi, Juntaro Matsuzaki, Yusuke Yamamoto, Yutaka Yoneoka, Kenta Takahashi, Hanako Shimizu, Takashi Uehara, Mitsuya Ishikawa, Shun-Ichi Ikeda, Takumi Sonoda …

Nature communications 9(1) 4319-4319 2018年10月17日査読有り
Malignant extracellular vesicles carrying MMP1 mRNA facilitate peritoneal dissemination in ovarian cancer

Akira Yokoi, Yusuke Yoshioka, Yusuke Yamamoto, Mitsuya Ishikawa, Shun-ichi Ikeda, Tomoyasu Kato, Tohru Kiyono, Fumitaka Takeshita, Hiroaki Kajiyama, Fumitaka Kikkawa …

NATURE COMMUNICATIONS 8 14470 2017年3月査読有り
Conversion of Terminally Committed Hepatocytes to Culturable Bipotent Progenitor Cells with Regenerative Capacity

Takeshi Katsuda, Masaki Kawamata, Keitaro Hagiwara, Ryou-u Takahashi, Yusuke Yamamoto, Fernando D. Camargo, Takahiro Ochiya

CELL STEM CELL 20(1) 41-55 2017年1月査読有り
In vitro and in vivo correlates of physiological and neoplastic human Fallopian tube stem cells

Yusuke Yamamoto, Gang Ning, Brooke E. Howitt, Karishma Mehra, Lingyan Wu, Xia Wang, Yue Hong, Florian Kern, Tay Seok Wei, Ting Zhang …

JOURNAL OF PATHOLOGY 238(4) 519-530 2016年3月査読有り筆頭著者
Mutational spectrum of Barrett's stem cells suggests paths to initiation of a precancerous lesion

Yusuke Yamamoto, Xia Wang, Denis Bertrand, Florian Kern, Ting Zhang, Marcin Duleba, Supriya Srivastava, Chiea Chuen Khor, Yuanyu Hu, Lane H. Wilson …

NATURE COMMUNICATIONS 7 10380 2016年1月査読有り筆頭著者
Loss of microRNA-27b contributes to breast cancer stem cell generation by activating ENPP1

Ryou-u Takahashi, Hiroaki Miyazaki, Fumitaka Takeshita, Yusuke Yamamoto, Kaho Minoura, Makiko Ono, Makoto Kodaira, Kenji Tamura, Masaki Mori, Takahiro Ochiya

NATURE COMMUNICATIONS 6 7318 2015年6月査読有り
Cloning and variation of ground state intestinal stem cells

Xia Wang, Yusuke Yamamoto, Lane H. Wilson, Ting Zhang, Brooke E. Howitt, Melissa A. Farrow, Florian Kern, Gang Ning, Yue Hong, Chiea Chuen Khor …

NATURE 522(7555) 173-+ 2015年6月査読有り筆頭著者
p63(+)Krt5(+) distal airway stem cells are essential for lung regeneration

Wei Zuo, Ting Zhang, Daniel Zheng'An Wu, Shou Ping Guan, Audrey-Ann Liew, Yusuke Yamamoto, Xia Wang, Siew Joo Lim, Matthew Vincent, Mark Lessard …

NATURE 517(7536) 616-U194 2015年1月査読有り
A discrete population of squamocolumnar junction cells implicated in the pathogenesis of cervical cancer

Michael Herfs, Yusuke Yamamoto, Anna Laury, Xia Wang, Marisa R. Nucci, Margaret E. McLaughlin-Drubin, Karl Muenger, Sarah Feldman, Frank D. McKeon, Wa Xian …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 109(26) 10516-10521 2012年6月査読有り
An integrative genomic analysis revealed the relevance of microRNA and gene expression for drug-resistance in human breast cancer cells

Yusuke Yamamoto, Yusuke Yoshioka, Kaho Minoura, Ryou-u Takahashi, Fumitaka Takeshita, Toshiki Taya, Reiko Horii, Yayoi Fukuoka, Takashi Kato, Nobuyoshi Kosaka …

MOLECULAR CANCER 10 135 2011年11月査読有り筆頭著者
Distal Airway Stem Cells Yield Alveoli In Vitro and during Lung Regeneration following H1N1 Influenza Infection

Pooja A. Kumar, Yuanyu Hu, Yusuke Yamamoto, Neo Boon Hoe, Tay Seok Wei, Dakai Mu, Yan Sun, Lim Siew Joo, Rania Dagher, Elisabeth M. Zielonka …

CELL 147(3) 525-538 2011年10月査読有り
Residual Embryonic Cells as Precursors of a Barrett's-like Metaplasia

Xia Wang, Hong Ouyang, Yusuke Yamamoto, Pooja Ashok Kumar, Tay Seok Wei, Rania Dagher, Matthew Vincent, Xin Lu, Andrew M. Bellizzi, Khek Yu Ho …

CELL 145(7) 1023-1035 2011年6月査読有り筆頭著者
RPN2 gene confers docetaxel resistance in breast cancer

Kimi Honma, Kyoko Iwao-Koizumi, Fumitaka Takeshita, Yusuke Yamamoto, Teruhiko Yoshida, Kazuto Nishio, Shunji Nagahara, Kikuya Kato, Takahiro Ochiya

NATURE MEDICINE 14(9) 939-948 2008年9月査読有り
Recapitulation of in vivo gene expression during hepatic differentiation from murine embryonic stem cells

Y Yamamoto, T Teratani, H Yamamoto, G Quinn, S Murata, R Ikeda, K Kinoshita, K Matsubara, T Kato, T Ochiya

HEPATOLOGY 42(3) 558-567 2005年9月査読有り筆頭著者

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MISC

232

間質性肺炎の新時代!大きく変わる国際分類、診断と研究の最前線を紹介する空間トランスクリプトーム解析によるIPFの線維化進展病態の解明(A New Era in Interstitial Lung Disease: Revisions in International Classification and Advances in Diagnosis and Research Integrated spatial and single-cell transcriptomic analysis of idiopathic pulmonary fibrosis)

吉田昌弘, 渡邊直昭, 平野悠太, 荒屋潤, 山本雄介, 藤田雄

日本病理学会会誌 115(1) 261-261 2026年3月
空間・シングルセルトランスクリプトーム統合解析による特発性肺線維症の新規治療標的PAK2の同定

平野悠太, 吉田昌弘, 渡邉直昭, 藤本祥太, 松林沙知, 高柳昇, 河端美則, 岡本康司, 皆川俊介, 桑野和善 …

東京慈恵会医科大学雑誌 140(6) 151-151 2025年11月
Klebsiella pneumoniae由来tsRNAの肝がん発がんに与える影響(Impact of tsRNA derived from Klebsiella pneumoniae on hepatocarcinogenesis)

大嶋一輝, 松崎潤太郎, 中山淳, 山本雄介, 津川仁, 加藤健, 落谷孝広, 齋藤義正

日本癌学会総会記事 84回 199-199 2025年9月
シングルセル解析による原発腫瘍細胞の稀少サブクローンにおける転移関連遺伝子発現シグネチャ(Single-cell analysis reveals a metastatic gene expression signature in a rare subpopulation of primary tumor cells)

プリエトビラマルタ, 中山淳, 薄場渉, 小島康幸, 椎野翔, 吉田正行, 松崎潤太郎, 落谷孝広, 山本雄介

日本癌学会総会記事 84回 344-344 2025年9月
1細胞メタ解析による多発性骨髄腫の薬剤耐性機構の解明(Elucidation of drug resistance mechanisms in multiple myeloma by single-cell meta-analysis)

片岡寛樹, 中道和也, 山本雄介

日本癌学会総会記事 84回 511-511 2025年9月
乳がんにおけるHER2発現の動的変化とその意義の解明(Analysis of Expressional Alterations of HER2 and Associated Phenotypes in Breast Cancer Cell Lines)

片山翔太, 仙波憲太郎, 山本雄介, 中山淳

日本癌学会総会記事 84回 606-606 2025年9月
高悪性度漿液性卵巣癌における細胞間クロストークを介した薬剤耐性を解明するための空間的トランスクリプトーム解析(Spatial transcriptomic profiling to elucidate drug resistance via intercellular crosstalk in HGSOC)

鈴木公基, 吉田康将, 横井暁, 鈴木一弘, 平野悠太, 梶山広明, 山本雄介

日本癌学会総会記事 84回 971-971 2025年9月
副腎癌のRNA-seqとexome-seqによる病因解明(Elucidating the pathology of adrenocortical carcinoma using RNA-sequencing and exome sequencing.)

吉原健太郎, 占部文彦, 伊藤景紀, 鈴木公基, 小島勇貴, 高橋陵宇, 木村高弘, 山本雄介

日本癌学会総会記事 84回 1473-1473 2025年9月
空間トランスクリプトーム解析による古典型浸潤性小葉がんと多形型浸潤性小葉がんの分子生物学的特徴の比較(Comparing Molecular Profile of Classical and Pleomorphic Invasive Lobular Carcinoma Using Spatial Transcriptome Analysis)

都倉桃子, 中山淳, 鈴木公基, 高山伸, 吉田正行, 山本雄介

日本癌学会総会記事 84回 1941-1941 2025年9月
E-cadherinの点変異や核局在がもたらすentosisへの影響(Effects of point mutations and nuclear localization of E-cadherin on entosis.)

武井祐樹, 林祐介, 東和志, 仙波憲太郎, 山本雄介

日本癌学会総会記事 84回 2051-2051 2025年9月
ALK陽性肺がん細胞株SNU-2563を用いた骨転移機構の解明

井上航輔, 土井雄太, 山本雄介, 仙波憲太郎

日本骨代謝学会学術集会プログラム抄録集 43回 168-168 2025年7月
高異型度漿液性卵巣癌における薬剤耐性機構を解明するための空間トランスクリプトーム解析

鈴木公基, 横井暁, 吉田康将, 鈴木一弘, 北川雅美, 稲見恵理, 梶山広明, 山本雄介

日本婦人科腫瘍学会学術講演会プログラム・抄録集 67回 224-224 2025年7月
PSAT1を介したEV分泌が促進するがん転移機構と転移リスク診断としての有用性の検討

山元智史, 山本雄介, 石井明子, 落谷孝広

日本分子腫瘍マーカー研究会誌 40 4-4 2025年
肝臓がん患者における血中循環"細菌由来RNA"プロファイルの特徴

大嶋一輝, 松崎潤太郎, 中山淳, 津川仁, 山本雄介, 加藤健, 落谷孝広, 齋藤義正

日本分子腫瘍マーカー研究会誌 40 10-10 2025年
En bloc TUR検体を用いた空間トランスクリプトーム解析による膀胱癌の浸潤機構の解明

吉原健太郎, 吉原健太郎, 占部文彦, 占部文彦, 伊藤景紀, 伊藤景紀, 鈴木公基, 木村高弘, 山本雄介

日本ヒト細胞学会学術集会 43rd 2025年
乳がん休眠を制御する遺伝子ネットワークの解析

安岡(明果瑠)いるま, 西田亮一, 山本雄介, 東山繁樹, 中山淳, 中山淳

日本がん転移学会学術集会・総会プログラム抄録集 34th 1849-1849 2025年
シングルセルメタ解析によって明らかとなった肺腺癌と肺扁平上皮癌における繊維芽細胞の特性(Integrated Single-Cell Lung Cancer Atlas Revealed Distinct Fibroblast Phenotypes between LUAD and LUSC)

平野悠太, 鈴木公基, 中山淳, 山元智史, 荒屋潤, 藤田雄, 山本雄介, 山本雄介

日本癌学会総会記事 83回 E-1018 2024年9月
浸潤性小葉がんにおける空間遺伝子発現と細胞特性の解明(Spatial transcriptomics reveals expressional diversity in invasive lobular carcinoma)

中山淳, 都倉桃子, 山本雄介, 山本雄介

日本癌学会総会記事 83回 P-1105 2024年9月
転移性前立腺癌に教育された破骨細胞由来細胞外小胞は骨転移巣で腫瘍進展・骨破壊を促進する(EVs from prostate cancer - educated osteoclasts drive tumor progression and bone destruction in bone metastatic site)

田村貴明, 山元智史, 木暮暁子, 吉岡祐亮, 山本雄介, 坂本信一, 市川智彦, 落谷孝広, 落谷孝広

日本癌学会総会記事 83回 P-2163 2024年9月
卵巣癌プラチナ抵抗性の克服に向けた細胞外小胞関連JAK/STAT経路解析(Targeting JAK/STAT pathway via extracellular vesicles overcomes platinum resistance in ovarian cancer)

鈴木一弘, 横井暁, 吉田康将, 北川雅美, 長尾有佳里, 北井美穂, 須藤保, 山本雄介, 梶山広明, 横井暁

日本癌学会総会記事 83回 J-3003 2024年9月

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担当経験のある科目(授業)

2022年9月 - 2024年3月

生物学特殊講義III (早稲田大学教育学部理学科生物学専修)
2016年4月 - 2022年11月

生物学 (工学院大学先進工学部)

所属学協会

2022年6月 - 現在

日本細胞外小胞学会
2018年4月 - 現在

International Society for Extracellular Vesicles (ISEV)
2006年9月 - 現在

日本癌学会
2003年8月 - 現在

日本分子生物学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

がん細胞の低栄養ストレス適応の分子基盤解明とその応用研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

山本雄介, 中山淳, 宮本崇史, 西田奈央
細胞外小胞トランスレーショナル解析による新規卵巣がん治療戦略開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

横井暁, 梶山広明, 山本雄介
間質性膀胱炎の包括理解を目指した単一細胞マルチオミックス解析とバイオマーカー探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

占部文彦, 中山淳, 山本雄介, 古田昭
ブタとシングルセル解析で挑むMWCNT肺疾患の病態解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

梅田ゆみ, 新井佐知子, 山本雄介, 山野荘太郎, 風間啓, 高須正規
超高解像度画像解析によるエクソソームの標的細胞内の情報リプログラミング機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2023年6月 - 2027年3月

山本雄介, 宮本崇史, 増田正人
１細胞解像度で紐解くじん肺アトラスの創出

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

山野荘太郎, 高須正規, 新井佐知子, 杉原英志, 山本雄介, 七野成之, 風間啓
ミトコンドリアの形態が紡ぐ多彩な情報様式に対する統合解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

宮本崇史, 高橋伸一郎, 山本雄介
難治性卵巣がんにおける細胞外小胞機能解析と臨床応用基盤創生

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

横井暁, 梶山広明, 山本雄介, 吉田康将
腫瘍内の機能的不均一性の解明を目指した患者由来がん細胞培養技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

山本雄介, 横井暁
がん遺伝的素因を有する小児・AYA世代へのフォローアップ体制確立を目指したLi-Fraumeni症候群におけるがんサーベイランスプログラムの実行可能性と新規バイオマーカー探索に関する研究

国立研究開発法人日本医療研究開発機構日本医療研究開発機構研究費令和２年度革新的がん医療実用化研究事業二次公募領域６-２がんの遺伝的素因を有する小児・AYA 世代に対する先制医療開発に関する研究 2020年4月 - 2023年3月

服部浩佳, 熊本忠史, 下村昭彦, 倉橋浩樹, 田村智英子, 宮坂実木子, 田代志門, 齋藤明子, 井上永介, 山本雄介, 高阪真路, 岩田広治, 小杉眞司, 西川亮, 櫻井晃洋, 尾崎敏文, 加藤元博
前がん病変由来オルガノイドの形態変化に着目した悪性化ポテンシャル規定因子の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2020年3月

宮本真吾, 山本雄介
肝発がん経路を解明するためのゲノム編集によるがん抑制因子のスクリーニング系の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2017年6月 - 2020年3月

山本雄介, 松崎潤太郎
活性化型Ras遺伝子の発がん過程での組織特異性および指向性の理解

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2017年4月 - 2020年3月

山本雄介
間葉系幹細胞由来ヒト肝細胞の機能解析とその応用的利用法の検討

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2006年 - 2008年

山本雄介

山本雄介

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MISC

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