山下翔大 (Shota Yamashita) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所遺伝形質研究系博士研究員

研究者番号: 60910940
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-7478-5953
J-GLOBAL ID: 202101011295655157
researchmap会員ID: R000020024

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 進化生物学 /

経歴

2021年4月 - 現在

国立遺伝学研究所, 遺伝形質研究系, 特任研究員

学歴

2017年4月 - 2021年3月

東京大学, 大学院理学系研究科, 生物科学専攻
2015年4月 - 2017年3月

東京大学, 大学院理学系研究科, 生物科学専攻
2013年4月 - 2015年3月

東京大学, 理学部, 生物学科
2011年4月 - 2013年3月

東京大学, 教養学部, 理科Ⅱ類

受賞

2022年9月

日本植物形態学会奨励賞, ボルボックス系列緑藻アストレフォメネの発生学的解析とゲノム解読を用いた多細胞形質の平行進化に関する研究, 日本植物形態学会

山下翔大
2018年9月

ポスター賞, 平面状群体の胚発生の解析から探るボルボックス系列緑藻における球状群体への進化, 日本植物形態学会第30回大会

山下翔大, 野崎久義
2018年8月

最優秀ポスター発表賞, ボルボックス系列における球状群体の平行進化の発生学的解明に向けて, 日本進化学会第20回大会

山下翔大, 野崎久義

論文

IPTG- and estradiol-inducible gene expression systems in the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae

Takayuki Fujiwara, Shunsuke Hirooka, Shota Yamashita, Shin-ya Miyagishima

Plant Physiology 2025年11月10日査読有り
Sexual life cycle establishes the unicellular red algae Cyanidiophyceae as a genetically tractable model lineage for eukaryotic evolution

Shunsuke Hirooka, Takayuki Fujiwara, Mark Seger, Soichi Inagaki, Shota Yamashita, Dai Tsujino, Ryo Onuma, Yu Kanesaki, Satoru Watanabe, Yuu Hirose …

2025年10月16日
Costs of photosynthesis and cellular remodeling in trophic transitions of the unicellular red alga Galdieria partita

Shota Yamashita, Shunsuke Hirooka, Takayuki Fujiwara, Baifeng Zhou, Fumi Yagisawa, Kei Tamashiro, Hiroki Murakami, Koichiro Awai, Shin-ya Miyagishima

Communications Biology 8 891 2025年6月7日査読有り筆頭著者責任著者
Heterotrophic unicellular eukaryotes feeding on the unicellular red alga Cyanidiococcus sp. in moderately hot geothermal sulfuric springs

Yuki Sunada, Dai Tsujino, Shota Yamashita, Wei-Hsun Hsieh, Kei Tamashiro, Jin Izumi, Fumi Yagisawa, Baifeng Zhou, Shunsuke Hirooka, Takayuki Fujiwara …

FEMS Microbiology Ecology 101(5) 2025年4月14日査読有り
A fusion protein of polyphosphate kinase 1 (PPK1) and a Nudix hydrolase is involved in inorganic polyphosphate accumulation in the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae.

Fumi Yagisawa, Takayuki Fujiwara, Shota Yamashita, Shunsuke Hirooka, Kei Tamashiro, Jin Izumi, Yu Kanesaki, Ryo Onuma, Osami Misumi, Soichi Nakamura …

Plant Molecular Biology 115 9 2024年12月19日査読有り
Development of a rapamycin-inducible protein-knockdown system in the unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae

Takayuki Fujiwara, Shunsuke Hirooka, Shota Yamashita, Fumi Yagisawa, Shin-ya Miyagishima

Plant Physiology 196(1) 77-94 2024年6月4日査読有り
Cryopreservation of two species of the multicellular volvocine green algal genus Astrephomene

Hisayoshi Nozaki, Fumi Mori, Yoko Tanaka, Ryo Matsuzaki, Shota Yamashita, Haruyo Yamaguchi, Masanobu Kawachi

BMC Microbiology 23(1) 2023年1月18日査読有り
Life cycle and functional genomics of the unicellular red alga Galdieria for elucidating algal and plant evolution and industrial use

Shunsuke Hirooka, Takeshi Itabashi, Takako M. Ichinose, Ryo Onuma, Takayuki Fujiwara, Shota Yamashita, Lin Wei Jong, Reiko Tomita, Atsuko H. Iwane, Shin-ya Miyagishima

Proceedings of the National Academy of Sciences 119(41) 2022年10月11日査読有り
Genome sequencing of the multicellular alga Astrephomene provides insights into convergent evolution of germ-soma differentiation.

Shota Yamashita, Kayoko Yamamoto, Ryo Matsuzaki, Shigekatsu Suzuki, Haruyo Yamaguchi, Shunsuke Hirooka, Yohei Minakuchi, Shin-Ya Miyagishima, Masanobu Kawachi, Atsushi Toyoda …

Scientific reports 11(1) 22231-22231 2021年11月22日査読有り筆頭著者
Embryogenesis of flattened colonies implies the innovation required for the evolution of spheroidal colonies in volvocine green algae

Shota Yamashita, Hisayoshi Nozaki

BMC Evolutionary Biology 19(1) 120-120 2019年12月査読有り筆頭著者
Morphology, taxonomy and mating-type loci in natural populations of Volvox carteri in Taiwan

Hisayoshi Nozaki, Noriko Ueki, Mari Takusagawa, Shota Yamashita, Osami Misumi, Ryo Matsuzaki, Masanobu Kawachi, Yin-Ru Chiang, Jiunn-Tzong Wu

Botanical Studies 59(1) 2018年12月査読有り
Alternative evolution of a spheroidal colony in volvocine algae: developmental analysis of embryogenesis in Astrephomene (Volvocales, Chlorophyta)

Shota Yamashita, Yoko Arakaki, Hiroko Kawai-Toyooka, Akira Noga, Masafumi Hirono, Hisayoshi Nozaki

BMC Evolutionary Biology 16(1) 2016年12月査読有り筆頭著者
Morphology and reproduction of Volvox capensis (Volvocales, Chlorophyceae) from Montana, USA

Hisayoshi Nozaki, Noriko Ueki, Osami Misumi, Kayoko Yamamoto, Shota Yamashita, Matthew D. Herron, Frank Rosenzweig

Phycologia 54(3) 316-320 2015年5月査読有り

MISC

単細胞紅藻シゾンで明らかになった有性生殖過程

廣岡俊亮, 藤原崇之, 山下翔大, 周柏峰, 辻野代, 冨田麗子, 八木沢芙美, 宮城島進也

Plant Morphology 37(1) 2025年
単細胞紅藻ガルデリアの従属栄養成長との比較で見る光合成独立栄養成長のコスト

山下翔大, 廣岡俊亮, 藤原崇之, 周柏峰, 八木沢芙美, 村上博紀, 粟井光一郎, 宮城島進也

Plant Morphology 37(1) 2025年
モデル単細胞紅藻イデユコゴメ類における遺伝子発現誘導系の開発

藤原崇之, 廣岡俊亮, 山下翔大, 八木沢芙美, 宮城島進也

Plant Morphology 37(1) 2025年
モデル単細胞紅藻イデユコゴメ類における遺伝子発現誘導系の開発

藤原崇之, 廣岡俊亮, 山下翔大, 八木沢芙美, 宮城島進也

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 88th 2024年
単細胞紅藻イデユコゴメ類における生活環の理解に向けて

廣岡俊亮, 藤原崇之, 山下翔大, 周柏峰, 辻野代, 冨田麗子, 八木沢芙美, 宮城島進也

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 88th 2024年
単細胞紅藻ガルデリアの独立栄養・従属栄養の比較から見た光合成のための′′コスト′′

山下翔大, 廣岡俊亮, 藤原崇之, 八木沢芙美, 村上博紀, 粟井光一郎, 宮城島進也

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 88th 2024年
ボルボックス系列緑藻アストレフォメネに着目した多細胞形質の平行進化の研究

山下翔大

35(1) 69-75 2023年4月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
単細胞紅藻類における細胞質分裂機構の解析

八木沢芙美, 廣岡俊亮, 藤原崇之, 山下翔大, 黒岩晴子, 黒岩常祥

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
単細胞紅藻イデユコゴメ類における有性生殖過程の発見

廣岡俊亮, 冨田麗子, 山下翔大, 周柏峰, 辻野代, 八木沢芙美, 藤原崇之, 宮城島進也

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
単細胞紅藻イデユコゴメ類におけるタンパク質ノックダウン法の開発

藤原崇之, 廣岡俊亮, 山下翔大, 辻野代, 八木沢芙美, 宮城島進也

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年

講演・口頭発表等

Analysis of a prototype-like system of plant cell differentiation in a unicellular red alga Galdieria partita

Shota Yamashita

NSF BII for Mechanisms of Cellular Evolution’s Annual Symposium 2025年11月8日
単細胞紅藻ガルデリアの独立栄養・従属栄養切り替えの分子機構の解明を目指して

山下翔大, 廣岡俊亮, 藤原崇之, 周柏峰, 宮城島進也

日本植物学会第89回大会 2025年9月19日
単細胞紅藻ガルデリアの独立栄養・従属栄養の比較から見た光合成のための”コスト”

山下翔大, 廣岡俊亮, 藤原崇之, 八木沢芙美, 村上博紀, 粟井光一郎, 宮城島進也

日本植物学会第88回大会 2024年9月14日
紅藻Galdieria partitaの独立栄養成長・従属栄養成長と遷移過程の解析

山下翔大, 廣岡俊亮, 藤原崇之, 宮城島進也

日本藻類学会第48回大会 2024年3月24日
単細胞紅藻Galdieria partitaの独立栄養・従属栄養切り替え機構の解析

山下翔大, 廣岡俊亮, 藤原崇之, 宮城島進也

日本植物学会第87回大会 2023年9月9日
単細胞生物から多細胞生物への進化を“群体性”緑藻で解き明かしたい！

山下翔大

日本藻類学会第47回大会 2023年3月21日
ボルボックス系列緑藻アストレフォメネの発生学的解析とゲノム解読を用いた多細胞形質の平行進化に関する研究

山下翔大

日本植物形態学会第34回総会・大会 2022年9月16日
アストレフォメネの新規ゲノム解読とボルボックス系列緑藻における非生殖細胞分化の平行進化の解析

山下翔大, 山本荷葉子, 松﨑令, 鈴木重勝, 山口晴代, 廣岡俊亮, 水口洋平, 宮城島進也, 河地正伸, 豊田敦, 野崎久義

日本植物学会第85回大会 2021年9月18日
Unveiling the molecular bases involved in another evolution of multicellular complexity in Astrephomene gubernaculifera

Shota Yamashita, Atsuki Suguchi, Kayoko Yamamoto, Ryo Matsuzaki, Masanobu Kawachi, Hideki Noguchi, Yohei Minakuchi, Atsushi Toyoda, Masafumi Hirono, Hiroyuki Sekimoto, Hisayoshi Nozaki

The 5th International Volvox Conference 2019年7月28日
ボルボックス系列緑藻の基部に位置する平面状群体の胚発生の解析

山下翔大, 野崎久義

日本植物学会第82回大会 2018年9月14日
Cell biological analysis of the embryogenesis in Gonium

Shota Yamashita, Akira Noga, Masafumi Hirono, Hisayoshi Nozaki

The 4th International Volvox Conference 2017年8月17日
反転しない群体性ボルボックス目アストレフォメネにおけるInvAオーソログの同定と発現・局在解析

山下翔大, 新垣陽子, 豊岡博子, 西井一郎, 野崎久義

日本藻類学会第41回大会 2017年3月25日
Developmental analysis of the spheroidal colony formation in Astrephomene (Volvocales, Chlorophyta)

Shota Yamashita, Yoko Arakaki, Hiroko Kawai-Toyooka, Masafumi Hirono, Hisayoshi Nozaki

17th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas 2016年6月30日
球状群体形成へのもうひとつの進化：アストレフォメネ（緑藻綱,ボルボックス目）の発生学的解析

山下翔大, 新垣陽子, 豊岡博子, 野崎久義

日本植物学会第79回大会 2015年9月8日
Another evolution for spheroidal colony formation: developmental analysis of Astrephomene (Volvocales, Chlorophyta)

Shota Yamashita, Yoko Arakaki, Hiroko Kawai-Toyooka, Hisayoshi Nozaki

The 3rd International Volvox Conference 2015年8月20日

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

真核光合成生物における栄養性制御機構と細胞分化の進化関連性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2024年4月 - 2027年3月

山下翔大
真核生物の多分裂細胞周期の進化を担う分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2022年4月 - 2025年3月

山下翔大
多細胞化に伴う発展的形質の平行進化の比較生物学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2017年4月 - 2020年3月

山下翔大

山下翔大

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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