山本英司 (Yamamoto Eiji) - マイポータル

基本情報

所属: 農研機構作物研究部門主任研究員

学位: 農学博士(2010年3月名古屋大学)

J-GLOBAL ID: 201601008364553336
researchmap会員ID: B000261997

研究分野

環境・農学 / 遺伝育種科学 /

経歴

2023年4月 - 現在

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 作物研究部門, 主任研究員
2020年4月 - 2023年3月

明治大学, 大学院農学研究科, 特任講師
2018年4月 - 2020年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, 植物ゲノム・遺伝学研究室, 研究員
2016年10月 - 2020年3月

JST, さきがけ研究員
2014年4月 - 2017年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構野菜花き研究部門野菜育種・ゲノム研究領域ゲノム解析ユニット, 研究員

論文

Whole-genome resequencing of Japanese large-sized tomato cultivars provides insights into the history of modern breeding

Eiji Yamamoto, Hiroshi Matsunaga, Akio Ohyama, Tsukasa Nunome, Hirotaka Yamaguchi, Koji Miyatake, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe

Breeding Science 74(4) 344-353 2024年
Cytonuclear interactions modulate the plasticity of photosynthetic rhythmicity and growth in wild barley.

Lalit Dev Tiwari, Eyal Bdolach, Manas Ranjan Prusty, Schewach Bodenheimer, Avital Be'ery, Adi Faigenboim-Doron, Eiji Yamamoto, Klára Panzarová, Khalil Kashkush, Noam Shental …

Physiologia plantarum 176(1) e14192 2024年
Integrated genome-wide differentiation and association analyses identify causal genes underlying breeding-selected grain quality traits in japonica rice

Hideki Yoshida, Satoshi Okada, Fanmiao Wang, Shohei Shiota, Masaki Mori, Mayuko Kawamura, Xue Zhao, Yiqiao Wang, Naho Nishigaki, Asako Kobayashi …

Molecular Plant 16(9) 1460-1477 2023年9月査読有り
MORE PANICLES 3 , a natural allele of OsTB1/FC1 , impacts rice yield in paddy fields at elevated <scp> CO ₂ </scp> levels

Toshiyuki Takai, Yojiro Taniguchi, Megumu Takahashi, Hideki Nagasaki, Eiji Yamamoto, Sakiko Hirose, Naho Hara, Hiroko Akashi, Jun Ito, Yumiko Arai‐Sanoh …

The Plant Journal 2023年3月27日
Independent control of organ number and distribution pattern in rice panicle

Eiji Yamamoto, Shiori Yabe, Mayuko Inari-Ikeda, Hideki Yoshida, Yoichi Morinaka, Makoto Matsuoka, Hidemi Kitano

Frontiers in Plant Science 14 2023年2月7日
Effective use of legacy data in a genome-wide association studies improves the credibility of quantitative trait loci detection in rice

Mao Suganami, Soichi Kojima, Fanmiao Wang, Hideki Yoshida, Kotaro Miura, Yoichi Morinaka, Masao Watanabe, Tsukasa Matsuda, Eiji Yamamoto, Makoto Matsuoka

Plant Physiology 2023年1月18日
Development of 12 sets of chromosome segment substitution lines that enhance allele mining in Asian cultivated rice

Kazufumi Nagata, Yasunori Nonoue, Kazuki Matsubara, Ritsuko Mizobuchi, Nozomi Ono, Taeko Shibaya, Kaworu Ebana, Eri Ogiso-Tanaka, Takanari Tanabata, Kazuhiko Sugimoto …

Breeding Science 2023年
Plant Genomic Selection: a Concept That Uses Genomics Data in Plant Breeding

Eiji Yamamoto

Plant Omics 190-204 2022年12月15日
Plant Omics Databases: an Online Resource Guide

Feng Li, Yingtian Deng, Eiji Yamamoto, Zhenya Liu

Plant Omics 253-269 2022年12月15日
Genome-wide association study identifies a gene responsible for temperature-dependent rice germination

Hideki Yoshida, Ko Hirano, Kenji Yano, Fanmiao Wang, Masaki Mori, Mayuko Kawamura, Eriko Koketsu, Masako Hattori, Reynante Lacsamana Ordonio, Peng Huang …

Nature Communications 13(1) 2022年9月29日
Mapping of Nematode Resistance in Hexaploid Sweetpotato Using an Next-Generation Sequencing-Based Association Study.

Nozomi Obata, Hiroaki Tabuchi, Miyu Kurihara, Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa, Yuki Monden

Frontiers in plant science 13 858747-858747 2022年
Transcriptome analysis of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis-infected tomatoes: a role of salicylic acid in the host response.

Naoki Yokotani, Yoshinori Hasegawa, Masaru Sato, Hideki Hirakawa, Yusuke Kouzai, Yoko Nishizawa, Eiji Yamamoto, Yoshiki Naito, Sachiko Isobe

BMC plant biology 21(1) 476-476 2021年10月19日
Exploring Efficient Linear Mixed Models to Detect Quantitative Trait Locus-by-Environment Interactions.

Eiji Yamamoto, Hiroshi Matsunaga

G3 (Bethesda, Md.) 2021年4月19日
Genetic loci mediating circadian clock output plasticity and crop productivity under barley domestication.

Manas R Prusty, Eyal Bdolach, Eiji Yamamoto, Lalit D Tiwari, Roi Silberman, Adi Doron-Faigenbaum, Jeffrey L Neyhart, David Bonfil, Khalil Kashkush, Klaus Pillen …

The New phytologist 2021年2月17日
Neighbor GWAS: incorporating neighbor genotypic identity into genome-wide association studies of field herbivory.

Yasuhiro Sato, Eiji Yamamoto, Kentaro K Shimizu, Atsushi J Nagano

Heredity 126(4) 597-614 2021年1月29日
Genomic Selection for F1 Hybrid Breeding in Strawberry (Fragaria × ananassa).

Eiji Yamamoto, Sono Kataoka, Kenta Shirasawa, Yuji Noguchi, Sachiko Isobe

Frontiers in plant science 12 645111-645111 2021年
Four genetic loci control compact plant size with yellow pear-shaped fruit in ornamental tomato (Solanum lycopersicum L.).

Meysam Safaei, Jamal-Ali Olfati, Yousef Hamidoghli, Babak Rabiei, Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa

The plant genome 13(2) e20017 2020年7月
Genome-wide study on the polysomic genetic factors conferring plasticity of flower sexuality in hexaploid persimmon.

Kanae Masuda, Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Atsushi Kono, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo, Ryutaro Tao, Isabelle M Henry, Takashi Akagi

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 27(3) 2020年6月1日
Genetic Mapping in Autohexaploid Sweet Potato with Low-Coverage NGS-based Genotyping Data.

Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa, Takumi Kimura, Yuki Monden, Masaru Tanaka, Sachiko Isobe

G3 (Bethesda, Md.) 10(8) 2661-2670 2020年6月1日査読有り
Genetic analyses of anthocyanin content using polyploid GWAS followed by QTL detection in the sweetpotato (<i>Ipomoea batatas</i> L.) storage root

Emdadul Haque, Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa, Hiroaki Tabuchi, Ung-Han Yoon, Sachiko Isobe, Masaru Tanaka

Plant Root 14 11-21 2020年

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講演・口頭発表等

A simple approach for genetic mapping in polyploids based on allelic dosage estimates from RAD-seq data.

Eiji Yamamoto

Plant & Animal Genome Asia 2019 2019年5月招待有り
Genome-wide association study, genomic selection and other technologies for tomato breeding in Japan.

Eiji Yamamoto

The 15th Solanaceae Conference 2018年10月招待有り
とりあえずGWASやってみる～最高のケースと最悪のケース～

山本英司

日本植物細胞分子生物学会 2018年8月
Genome-wide association study, genomic selection and other technologies for tomato breeding in Japan.

Eiji Yamamoto

Plant & Animal Genome Asia 2018 2018年5月招待有り
Application of whole-genome prediction in Japanese big-fruited tomato varieties.

Eiji Yamamoto

The East Asia Agricultural Genome Scientist Forum 2017 2017年12月招待有り
Design of rice panicle architecture for increasing grain number by using QTL pyramiding.

Eiji Yamamoto

Plant & Animal Genome Asia 2017 2017年5月招待有り
Genomic selection for yield and sugar content in Japanese tomato varieties.

Eiji Yamamoto

The 13th Japan Solanaceae Consortium JSOL2016 2016年11月招待有り
育種がゲノミックセレクションを変える〜トマトにおけるゲノミックセレクションの活用法〜

山本英司

日本育種学会グループ研究集会ゲノミックセレクションの社会実装について考える〜Breeding informatics XIV 2016年3月
ゲノミックセレクションによる高糖度・高収量トマト育成への挑戦〜シミュレーションによる試験設計から実践まで〜

山本英司

園芸学会小集会・次世代の園芸研究を見据えた先端ゲノム研究（第４回） 2016年3月招待有り
国内トマト品種群の遺伝解析に向けたAxiomジェノタイピングアレイの開発とゲノム育種への利用

山本英司

アフィメトリクスアグリゲノミクスセミナー 2015年11月招待有り
Genome-wide association study and whole-genome prediction in tomato F1 varieties in Japan by using custom 50K SNP genotyping array.

Eiji Yamamoto

Plant & Animal Genome Asia 2015 2015年6月招待有り
Genome composition of high-yield rice varieties in Japan.

Eiji Yamamoto

7th International Symposium of Rice Functional Genomics 2011年10月招待有り

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

個体別環境センシングが可能にするトマト難解析形質の分子遺伝学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

山本英司
遺伝子情報に基づく表現型予測モデルの構築とコンピューターシミュレーション育種への応用

科学技術振興機構さきがけ 2016年10月 - 2020年3月

山本英司
ゲノムワイドマーカー情報に基づく多収・高糖度トマト選抜のための次世代型マーカー育種技術開発とその試行

農林水産省次世代ゲノム基盤プロジェクト 2016年4月 - 2017年3月
イネ雑種崩壊の遺伝学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2008年 - 2009年

山本英司