石濱泰 (Yasushi Ishihama) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院薬学研究科教授

学位: 博士（薬学）(1998年5月京都大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-7714-203X
J-GLOBAL ID: 200901055328608810

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 薬系分析、物理化学 /

経歴

2010年10月 - 現在

京都大学大学院薬学研究科教授
2006年4月 - 2010年9月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科特別研究助教授
2006年10月 - 2010年3月

(独)科学技術振興機構さきがけ研究員(兼任）
2004年4月 - 2006年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科特別研究助教授(非常勤・兼任）
2001年7月 - 2003年7月

南デンマーク大学生化学分子生物学科客員研究員

学歴

- 1992年

京都大学工学研究科工業化学専攻
- 1990年

京都大学工学部工業化学科

委員歴

2021年5月 - 現在

日本質量分析学会理事
2020年3月 - 現在

日本分析化学会電気泳動分析研究懇談会委員長
2019年9月 - 現在

Journal of Proteome Data and Methods Editor in chief
2019年4月 - 現在

日本分析化学会副会長
2017年1月 - 現在

Asia Oceania Human Proteome Organisation (AOHUPO) Executive Council
2013年7月 - 現在

Molecular and Cellular Proteomics Editorial Board
2012年1月 - 現在

日本クロマトグラフィー科学会理事
1999年 - 現在

日本分析化学会電気泳動分析研究懇談会役員
2018年1月 - 2020年12月

日本プロテオーム学会会長
2018年2月 - 2020年3月

京都生体質量分析研究会代表世話人
2017年1月 - 2019年12月

The Human Proteome Organization (HUPO) Council
2005年

CBI Journal Editorial Board
1999年

Journal of Chromatography A Editorial Board

受賞

論文

224

Acylated peptide enrichment utilizing lysine deacylases for lysine acylomics.

Kazuya Tsumagari, Yasushi Ishihama

Biochemical and biophysical research communications 563 60 - 65 2021年7月23日
Peak Identification and Quantification by Proteomic Mass Spectrogram Decomposition.

Pasrawin Taechawattananant, Kazuyoshi Yoshii, Yasushi Ishihama

Journal of proteome research 20(5) 2291 - 2298 2021年5月7日
Exploring the landscape of ectodomain shedding by quantitative protein terminomics.

Kazuya Tsumagari, Chih-Hsiang Chang, Yasushi Ishihama

iScience 24(4) 102259 - 102259 2021年4月23日
The Escherichia coli S2P intramembrane protease RseP regulates ferric citrate uptake by cleaving the sigma factor regulator FecR.

Tatsuhiko Yokoyama, Tomoya Niinae, Kazuya Tsumagari, Koshi Imami, Yasushi Ishihama, Yohei Hizukuri, Yoshinori Akiyama

The Journal of biological chemistry 100673 - 100673 2021年4月15日
Maintenance of neural stem-progenitor cells by the lysosomal biosynthesis regulators TFEB and TFE3 in the embryonic mouse telencephalon.

Naoya Yuizumi, Yujin Harada, Takaaki Kuniya, Takehiko Sunabori, Masato Koike, Masaki Wakabayashi, Yasushi Ishihama, Yutaka Suzuki, Daichi Kawaguchi, Yukiko Gotoh

Stem cells (Dayton, Ohio) 2021年2月20日
Asia-Oceania HUPO: Past, Present, and Future.

Yasushi Ishihama, Yu-Ju Chen, Je-Yoel Cho, Max Ching Ming Chung, Stuart J Cordwell, Teck Yew Low, Terence Chuen Wai Poon, Ho Jeong Kwon

Molecular & cellular proteomics : MCP 20 100048 - 100048 2021年1月16日
GlycoPOST realizes FAIR principles for glycomics mass spectrometry data.

Yu Watanabe, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Yasushi Ishihama, Shujiro Okuda

Nucleic acids research 49(D1) D1523-D1528 - D1528 2021年1月8日
Aberrant splicing isoforms detected by full-length transcriptome sequencing as transcripts of potential neoantigens in non-small cell lung cancer.

Miho Oka, Liu Xu, Toshihiro Suzuki, Toshiaki Yoshikawa, Hiromi Sakamoto, Hayato Uemura, Akiyasu C Yoshizawa, Yutaka Suzuki, Tetsuya Nakatsura, Yasushi Ishihama, Ayako Suzuki, Masahide Seki

Genome biology 22(1) 9 - 9 2021年1月4日
Effect of Phosphorylation on the Collision Cross Sections of Peptide Ions in Ion Mobility Spectrometry

Ogata Kosuke, Chang Chih-Hsiang, Ishihama Yasushi

Mass Spectrometry (Web) 10(1) A0093 2021年
The jPOST Repository as a Public Data Repository for Shotgun Proteomics.

Yu Watanabe, Akiyasu C Yoshizawa, Yasushi Ishihama, Shujiro Okuda

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2259 309 - 322 2021年
Quantitative nascent proteome profiling by dual-pulse labelling with O-propargyl-puromycin and stable isotope-labelled amino acids

UCHIYAMA Junki, ISHIHAMA Yasushi, IMAMI Koshi, IMAMI Koshi

Journal of Biochemistry 169(2) 227 - 236 2021年
Isolation of Acetylated and Unmodified Protein N-Terminal Peptides by Strong Cation Exchange Chromatographic Separation of TrypN-Digested Peptides.

Chih-Hsiang Chang, Hsin-Yi Chang, Juri Rappsilber, Yasushi Ishihama

Molecular & cellular proteomics : MCP 20 100003 - 100003 2020年11月24日
Antipsychotic olanzapine-induced misfolding of proinsulin in the endoplasmic reticulum accounts for atypical development of diabetes.

Satoshi Ninagawa, Seiichiro Tada, Masaki Okumura, Kenta Inoguchi, Misaki Kinoshita, Shingo Kanemura, Koshi Imami, Hajime Umezawa, Tokiro Ishikawa, Robert B Mackin, Seiji Torii, Yasushi Ishihama, Kenji Inaba, Takayuki Anazawa, Takahiko Nagamine, Kazutoshi Mori

eLife 9 2020年11月17日
Toward Increased Reliability, Transparency, and Accessibility in Cross-linking Mass Spectrometry.

Alexander Leitner, Alexandre M J J Bonvin, Christoph H Borchers, Robert J Chalkley, Julia Chamot-Rooke, Colin W Combe, Jürgen Cox, Meng-Qiu Dong, Lutz Fischer, Michael Götze, Fabio C Gozzo, Albert J R Heck, Michael R Hoopmann, Lan Huang, Yasushi Ishihama, Andrew R Jones, Nir Kalisman, Oliver Kohlbacher, Karl Mechtler, Robert L Moritz, Eugen Netz, Petr Novak, Evgeniy Petrotchenko, Andrej Sali, Richard A Scheltema, Carla Schmidt, David Schriemer, Andrea Sinz, Frank Sobott, Florian Stengel, Konstantinos Thalassinos, Henning Urlaub, Rosa Viner, Juan A Vizcaíno, Marc R Wilkins, Juri Rappsilber

Structure (London, England : 1993) 28(11) 1259 - 1268 2020年11月3日
Phosphoproteomics and Bioinformatics Analyses Reveal Key Roles of GSK-3 and AKAP4 in Mouse Sperm Capacitation.

Nailis Syifa, Jhih-Tian Yang, Chang-Shiann Wu, Miao-Hsia Lin, Wan-Ling Wu, Cheng-Wei Lai, Sheng-Hsuan Ku, Suh-Yuen Liang, Yu-Chun Hung, Chia-Te Chou, Chien-Sheng Wang, Yasushi Ishihama, Jiahn-Haur Liao, Shih-Hsiung Wu, Tzu-Hua Wu

International journal of molecular sciences 21(19) 2020年10月2日
Extending the Separation Space with Trapped Ion Mobility Spectrometry Improves the Accuracy of Isobaric Tag-Based Quantitation in Proteomic LC/MS/MS.

Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama

Analytical chemistry 92(12) 8037 - 8040 2020年6月16日査読有り
EDEM2 stably disulfide-bonded to TXNDC11 catalyzes the first mannose trimming step in mammalian glycoprotein ERAD.

Ginto George, Satoshi Ninagawa, Hirokazu Yagi, Taiki Saito, Tokiro Ishikawa, Tetsushi Sakuma, Takashi Yamamoto, Koshi Imami, Yasushi Ishihama, Koichi Kato, Tetsuya Okada, Kazutoshi Mori

eLife 9 2020年2月17日査読有り
The ProteomeXchange consortium in 2020: enabling 'big data' approaches in proteomics.

Eric W Deutsch, Nuno Bandeira, Vagisha Sharma, Yasset Perez-Riverol, Jeremy J Carver, Deepti J Kundu, David García-Seisdedos, Andrew F Jarnuczak, Suresh Hewapathirana, Benjamin S Pullman, Julie Wertz, Zhi Sun, Shin Kawano, Shujiro Okuda, Yu Watanabe, Henning Hermjakob, Brendan MacLean, Michael J MacCoss, Yunping Zhu, Yasushi Ishihama, Juan A Vizcaíno

Nucleic acids research 48(D1) D1145-D1152 - D1152 2020年1月8日査読有り
Mass Spectrometry-Compatible Subcellular Fractionation for Proteomics

Takeshi Masuda, Naoyuki Sugiyama, Masaru Tomita, Sumio Ohtsuki, Yasushi Ishihama

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH 19(1) 75 - 84 2020年1月査読有り
Blood concentrations of small extracellular vesicles are determined by a balance between abundant secretion and rapid clearance.

Akihiro Matsumoto, Yuki Takahashi, Hsin-Yi Chang, Yi-Wen Wu, Aki Yamamoto, Yasushi Ishihama, Yoshinobu Takakura

Journal of extracellular vesicles 9(1) 1696517 - 1696517 2020年査読有り

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MISC

557

糖尿病マウスにおいて歯周病菌が肝臓代謝機能に及ぼす影響

柏木陽一郎, 生川由貴, 和泉自泰, 杉山直幸, 馬場健史, 石濱泰, 柏木厚典, 村上伸也

糖尿病 63(Suppl.1) S - 154 2020年8月
抗精神病薬オランザピンによって,プロインスリンは分子間ジスルフィド結合を介した構造異常が誘発され,小胞体関連分解によって処理される

蜷川暁, 多田誠一郎, 奥村正樹, 井ノ口健太, 木下岬, 金村進吾, 今見考志, 梅沢元, 石川時郎, 岡田徹也, Mackin Robert, 鳥居征司, 石濱泰, 稲葉謙次, 穴澤貴行, 長嶺敬彦, 森和俊

日本細胞生物学会大会講演要旨集 72回 2 - 47 2020年6月
jPOSTツール(I):ピークリスト処理のためのユーティリティ

Tabata Tsuyoshi, Yoshizawa Akiyasu C., Yasushi Ishihama

Journal of Proteome Data and Methods (Web) 2 2020年
配位子交換クロマトグラフィーを利用したチロシンリン酸化プロテオーム解析

中田花菜, 南部早紀, 杉山直幸, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 68th 2020年
温度制御逆相クロマトグラフィーによるプロテオーム解析

小形公亮, 富岡亮太, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 68th 2020年
リン酸化プロテオミクスを用いたヒトキノーム解析

杉山直幸, 今村春菜, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 68th 2020年
小胞体関連分解因子EDEM2は,TXNDC11とジスルフィド結合を介した複合体を形成し,マンノシダーゼ活性を発揮する

蜷川暁, GEORGE Ginto, 矢木宏和, 住友嘉樹, 石川時郎, 佐久間哲史, 山本卓, 今見考志, 石濱泰, 加藤晃一, 加藤晃一, 岡田徹也, 森和俊

日本生化学会大会(Web) 93rd [2Z01 - 027)] 2020年
ゲル支援LCMSにおける高速・多検体プロテオーム解析法EasyGelの開発

山下蓮太郎, 上村駿人, 今見考志, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 68th 2020年
プロテオーム計測技術の最前線

石濱泰

日本生態学会大会講演要旨(Web) 67th 2020年
トリプシン消化ペプチドの衝突誘起解離スペクトルの予測とショットガンプロテオミクスへの応用

橘本哲志, 吉沢明康, 吉井和佳, 石濱泰, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th (Web) 2020年
第二世代抗精神病薬オランザピンは,ジスルフィド結合の形成異常を起因としたプロインスリンの小胞体関連分解を誘発する

蜷川暁, 多田誠一郎, 井ノ口健太, 今見考志, 梅澤元, 石川時郎, 岡田徹也, MACKIN Robert, 鳥居征司, 石濱泰, 穴澤貴行, 長嶺敬彦, 森和俊

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th (Web) 26F - pm18 2020年
ヒトキノーム収斂型細胞内シグナルの解明

石濱泰

JSBMS Letters 45(Supplement) 80 - 80 2020年
LC/IMS/MSにおける前駆体イオン情報のみを用いるプロテオーム解析法の開発

中井郁那, 富岡亮太, 杉山直幸, 小形公亮, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 68th 2020年
質量分析と統計解析の融合による次世代プロテオミクス

石濱泰

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 100th 2020年
メタプロテオミクスを用いた細菌叢解析法の開発

MOON J.H., 伊藤麻里子, 杉山直幸, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 68th 2020年
大腸菌S2PファミリープロテアーゼRsePの基質探索:鉄取り込みに関与する転写制御因子の切断とその生理的意義

横山達彦, 新苗智也, 津曲和哉, 今見考志, 石濱泰, 檜作洋平, 秋山芳展

日本生化学会大会(Web) 93rd [1Z04 - 189)] 2020年
ゲル支援LCMSを用いる高速・多検体プロテオーム解析法EasyGelの開発

山下蓮太郎, 上村駿人, 今見考志, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th (Web) 27F - pm04S 2020年
配位子交換クロマトグラフィーによるリン酸化チロシン選択的ペプチド濃縮法の開発

中田花菜, 南部早紀, 杉山直幸, 杉山直幸, 石濱泰, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th (Web) 27J - am12S 2020年
緑藻クラミドモナスの脂質蓄積の制御(1)タンパク質リン酸化酵素TAR1の機能

新川はるか, 太田羽藍, 梶川昌孝, 梶川昌孝, 野村裕子, 小倉真優, 椹木裕里, 山野隆志, 中神弘史, 杉山直幸, 石濱泰, 兼崎友, 吉川博文, 福澤秀哉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020 2020年
プロダクトイオン情報を用いないLC/MSによるプロテオーム解析法の開発

中井郁那, 富岡亮太, 杉山直幸, 小形公亮, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th (Web) 27J - am11S 2020年

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書籍等出版物

臨床プロテオミクス－バイオマーカー探索から個別化医療へ

若林真樹, 石濱泰

金原出版 2012年5月15日
疾患克服をめざしたケミカルバイオロジー

石濱泰, 若林真樹

羊土社 2012年5月1日
「特集」プロテオミクスが解き明かす情報伝達ネットワーク : タンパク質リン酸化の全体像の解析から病態機構の理解分子標的薬評価の応用まで

服部成介, 石浜泰

羊土社 2009年 (ISBN: 9784758100526)

講演・口頭発表等

Peptide Chromatographic Approaches for Illuminating Human Proteome

石濱泰

18th KHUPO Annual International Proteomics Conference 2018年3月30日
ショットガンプロテオミクスにおける計測と情報の新展開

石濱泰

第15回北里疾患プロテオーム研究会 2018年3月20日
Proteomic Data Integration and Sharing by jPOST Repository/Database

石濱泰

International Life Science Integration Workshop 2018年3月6日
Kinome activity profiling based on large-scale kinase-substrate relationships

石濱泰

Asia-Oceania Mass Spectrometry Conference 2017 2017年12月13日
プロテオミクスを用いて暗黒キノーム世界を照らす

石濱泰

キャピラリー電気泳動シンポジウム講演要旨集 2017年11月28日
Chromatography-Driven Proteomics for Unveiling Human Proteome

石濱泰

The 46th International Symposium on High Performance Liquid Phase Separations and Related Techniques (HPLC 2017 Jeju) 2017年11月7日
プロテオームデータベースjPOSTの挑戦

石濱泰

トーゴ―の日シンポジウム2017 2017年10月4日
jPOST meets Chromosome X: hunting missing proteins

石濱泰

HUPO2017 HPP workshop 2017年9月17日
プロテオミクスデータ解析/演習

石濱泰, 小林大樹, 吉沢明康

BMSコンファレンス講演要旨集 2017年7月10日
Technology-Driven Proteomics?

石濱泰

第二回京都皮膚基礎研究会? 2017年3月31日
鞠小路プロテオミクスでつなぐゲノムと疾病?

石濱泰

第2回臨床薬学懇話会? 2017年3月21日
分離分析の最新技術−high resolution LC-MS/MSをもちいたプロテオーム解析?

石濱泰

日本農芸化学会2017年度大会? 2017年3月18日
分離分析の最新技術―high resolution LC‐MS/MSをもちいたプロテオーム解析―

石濱泰

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2017年3月5日
プロテオミクスを用いたキノーム活性プロファイリング

石濱泰

日本生化学会大会(Web) 2017年
プロテオーム統合データベースjPOSTの構築

石濱泰

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2016年11月30日
ヒトプロテオーム解明に向けたプロテオーム解析法の開発

石濱泰

キャピラリー電気泳動シンポジウム講演要旨集 2016年11月19日
ヒトプロテオーム解明に向けたプロテオーム解析法の開発?

石濱泰

第36回キャピラリー電気泳動シンポジウム? 2016年11月11日
キナーゼ収斂型リン酸化プロテオミクスによるシグナルネットワーク解析?

石濱泰

第89回日本生化学会大会? 2016年9月27日
Kinase-centric pharmacoproteomics for molecular-targeting drug discovery?

石濱泰

HUPO2016 2016年9月21日
キナーゼ収斂型リン酸化プロテオミクスを用いたシグナルネットワーク解析と分子標的創薬?

石濱泰

第31回京都がん研究会? 2016年9月16日

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所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

大規模プロテオフォーム解析法の開発とその全体像の理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

石濱泰
MSサイレンシングによる時空間プロテオミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2020年7月 - 2022年3月

石濱泰, 小形公亮
再生治療が組織にもたらす代謝アダプテーションと３次元的超微細構造変化の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

野崎剛徳, 石濱泰, 豊田岐聡, 三浦治郎, 清水真人
オミクス解析を応用した歯周病菌感染による肝糖脂質代謝異常誘導の経門脈因子同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

柏木陽一郎, 石濱泰, 岩山智明
キノームの生理的基質同定に基づく細胞内シグナルパスウェイ大規模解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

石濱泰
花幹細胞におけるポリコム因子の導入、排除およびリン酸化シグナルによる活性調節

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2015年4月 - 2020年3月

伊藤寿朗, 石濱泰
タンパク質新生鎖の末端プロテオーム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

石濱泰
深層学習による質量ピーク探知法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

吉沢明康, 守屋勇樹, 田畑剛, 岩崎未央, 河野信, 五斗進, 石濱泰, 瀧川一学
急性生体侵襲下における単球系細胞の機能解析と組織傷害関連物質（DAMPs）の制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2019年3月

並木淳, 鈴木さゆり, 林田敬, 渋沢崇行, 多村知剛, 石濱泰
トリプシン超越型新世代ショットガンプロテオミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

石濱泰, 杉山直幸, 若林真樹
定量リン酸化プロテオミクスによる大規模リン酸化ストイキオメトリー解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2015年11月 - 2018年3月

石濱泰, TSAI CHIA-FENG
Nano Focusingを戦略とするESI-MSの超高感度化に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

江坂幸宏, 石濱泰, 村上博哉, 鳥村政基
ミトコンドリア病としてのパーキンソン病の共通発症機序の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2018年3月

今居譲, 井下強, 柴佳保里, 柴佳保里, 井下強, 服部信孝, 孟紅蕊, 荒野拓, 石濱泰
脂肪細胞分化過程における脂質修飾プロテオームの時空間解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2015年4月 - 2017年3月

石濱泰, CHANG HSIN-YI
アセチル化修飾と制御酵素の大規模相関解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

石濱泰
高深度プロテオミクスによるヒトプロテオーム完全解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

石濱泰, 杉山直幸, 若林真樹
プロテオミクスを用いたリン酸化シグナル定量系の構築と薬効予測モニタリングへの応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

朝長毅, 石濱泰, 松原久裕, 長山聡
樹状細胞の小胞輸送を標的とした抗炎症薬の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2016年3月

門脇則光, 石濱泰
分子標的創薬に向けたリン酸化ネットワーク基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2012年4月 - 2015年3月

石濱泰, 杉山直幸, 豊島文子, 若林真樹
マルチ翻訳後修飾プロテオミクスによる代謝・転写システムの大規模解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年4月 - 2014年3月

石濱泰