大河内康之 (Yasushi Okochi) - マイポータル

基本情報

所属: 名古屋大学大学院医学系研究科附属医学教育研究支援センター先端領域支援部門助教

学位: M.D.(2023年3月京都大学)

研究者番号: 21019185
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-3144-9375
J-GLOBAL ID: 202501021392613650
researchmap会員ID: R000088050

研究キーワード

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

名古屋大学大学院医学系研究科, 附属医学教育研究支援センター先端領域支援部門, 助教
2023年4月 - 2025年3月

京都大学医学部附属病院, 総合臨床教育・研修センター, 医員（研修医）

学歴

2017年4月 - 2023年3月

京都大学医学部医学科

受賞

2024年9月

日本消化器病学会研修医奨励賞
2022年3月

京都大学総長賞

論文

Single-cell transcriptome atlas of Drosophila gastrula 2.0

Shunta Sakaguchi, Sonoko Mizuno, Yasushi Okochi, Chiharu Tanegashima, Osamu Nishimura, Tadashi Uemura, Mitsutaka Kadota, Honda Naoki, Takefumi Kondo

Cell Reports 42(7) 112707-112707 2023年7月
Zero-shot reconstruction of mutant spatial transcriptomes

Yasushi Okochi, Takaaki Matsui, Shunta Sakaguchi, Takefumi Kondo, Honda Naoki

bioRxiv 2022年12月19日筆頭著者責任著者
<scp>ZBTB2</scp> links p53 deficiency to <scp>HIF</scp> ‐1‐mediated hypoxia signaling to promote cancer aggressiveness

Sho Koyasu, Shoichiro Horita, Keisuke Saito, Minoru Kobayashi, Hiroshi Ishikita, Christalle CT Chow, Gouki Kambe, Shigeto Nishikawa, Toshi Menju, Akiyo Morinibu …

EMBO reports 2022年11月7日
Model-based prediction of spatial gene expression via generative linear mapping

Yasushi Okochi, Shunta Sakaguchi, Ken Nakae, Takefumi Kondo, Honda Naoki

Nature Communications 2021年6月17日筆頭著者

MISC

1細胞RNA-seqデータから空間トランスクリプトームの再構成する機械学習

大河内康之, 坂口峻太, 本田直樹

細胞 56(4) 2024年4月筆頭著者
scRNA-seqデータから空間的遺伝子発現パターンを再構成する

大河内康之, 坂口峻太, 本田直樹

実験医学増刊 38(20) 2020年12月筆頭著者

講演・口頭発表等

全エクソーム解析にて胃高分化型腺癌が偽幽門腺化生から発生したことを示した一例

大河内康之, 二階堂光洋, 熊谷健, 清水孝洋, 平野智紀, 垣内伸之, 竹内康英, 内海貴裕, 平松由紀子, 竹田治彦, 中西祐貴, 高井淳, 宮本心一, 妹尾浩

日本消化器病学会近畿支部第121回例会 2024年9月28日
多発回腸漬瘍病変合併MDSに対してPTCyハプロ移植を施行し寛解に至った症例

大河内康之, 片岡阿沙美, 岡本吉央, 竹田淳恵, 諫田淳也, 山下浩平, 高折晃史

第120回近畿血液学地方会 2024年6月8日
シングルセルRNAseqデータからの細胞空間配置予測

大河内康之, 松井貴輝, 坂口峻太, 近藤武史, 本田直樹

定量生物学の会第十回年会 2022年12月
野生型リファレンスデータを利用した変異型空間トランスクリプトームの予測と実証

大河内康之, 松井貴輝, 坂口峻太, 近藤武史, 本田直樹

第45回日本分子生物学会年会 2022年12月
Studying the developmental process of lateral rectus muscle in human embryos with holoprosencephaly

大河内康之, 山口豊, 山田重人

第126回日本解剖学会総会・全国学術集会 2021年3月
Machine learning-assisted reconstruction of spatial gene expressions from scRNAseq data

大河内康之, 坂口峻太, 中江健, 近藤武史, 本田直樹

第43回日本分子生物学会年会 2020年12月
機械学習を利用したscRNAseqからの空間的遺伝子発現パターンの再構成

大河内康之, 坂口峻太, 中江健, 近藤武史, 本田直樹

シンポジウム：計測データと数理解析をつなげるとき (When we connect the data to mathematical analysis)『2020年度日本数理生物学会年会』 2020年9月招待有り
Prediction of spatial gene expressions from scRNAseq data by machine learning

大河内康之, 坂口峻太, 中江健, 近藤武史, 本田直樹

第58回日本生物物理学会年会 2020年9月
A Machine Learning Method to Reconstruct Spatial Gene Expression Profile in Tissues from Single-cell RNA-seq Data

Okochi Y., Sakaguchi S., Nakae K., Kondo T., Honda N.

2019 A3 Workshop on Mathematical Life Science, Beijing, China 2019年5月