山本泰智 (Yasunori Yamamoto) - マイポータル

基本情報

所属: 情報・システム研究機構データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター (特任准教授)

学位: 博士（情報理工学）(2006年10月東京大学)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-6943-6887
J-GLOBAL ID: 202101014410918182
researchmap会員ID: R000029710

https://figshare.com/authors/Yasunori_Yamamoto/2745400

https://www.slideshare.net/yayamamo

開発や維持・運営に関わるサービス

研究キーワード

研究分野

情報通信 / 生命、健康、医療情報学 / セマンティックウェブ, 知識グラフ, テキストマイニング

論文

動画キャプション生成とMetaVDを用いた動作認識データセットの拡張

後藤颯志, チャクラボルティシュデシナ, 森田武史, 吉川友也, 山本泰智, 江上周作, 鵜飼孝典, 福田賢一郎

人工知能学会第二種研究会資料 2025(SWO-065) 03 2025年3月7日
Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features

Shuya Ikeda, Kiyoko F. Aoki-Kinoshita, Hirokazu Chiba, Susumu Goto, Masae Hosoda, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Tazro Ohta, Hiromasa Ono …

Journal of Biomedical Semantics 16(1) 2025年1月8日
常識知識グラフを用いたメタ動作認識データセットの自動構築

三辻史哉, チャクラボルティシュデシナ, 森田武史, 吉川友也, 山本泰智, 江上周作, 鵜飼孝典, 福田賢一郎

人工知能学会全国大会論文集 JSAI2025 2Q5GS303-2Q5GS303 2025年
動画キャプション生成を用いた動作認識データセットの拡張

後藤颯志, チャクラボルティシュデシナ, 森田武史, 吉川友也, 山本泰智, 江上周作, 鵜飼孝典, 福田賢一郎

人工知能学会全国大会論文集 JSAI2025 4I1GS1105-4I1GS1105 2025年
Examining HPO by organ and system to facilitate practical use by clinicians

Eisuke Dohi, Terue Takatsuki, Yuka Tateisi, Toyofumi Fujiwara, Yasunori Yamamoto

Genomics & Informatics 22(1) 2024年11月12日
Functional implications of glycans and their curation: insights from the workshop held at the 16th Annual International Biocuration Conference in Padua, Italy.

Karina Martinez, Jon Agirre, Yukie Akune, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Cecilia Arighi, Kristian B Axelsen, Evan Bolton, Emily Bordeleau, Nathan J Edwards, Elisa Fadda …

Database : the journal of biological databases and curation 2024 2024年8月13日
Extracting shapes from large RDF data collections

Daniel Fernández Álvarez, Yasunori Yamamoto, Jose Emilio Labra Gayo, Andra Waagmeester

Proceedings of Semantic Web Applications and Tools for Health Care and Life Sciences, SWAT4HCLS 2024年3月査読有り責任著者
The Human Phenotype Ontology in 2024: phenotypes around the world.

Michael A Gargano, Nicolas Matentzoglu, Ben Coleman, Eunice B Addo-Lartey, Anna V Anagnostopoulos, Joel Anderton, Paul Avillach, Anita M Bagley, Eduard Bakštein, James P Balhoff …

Nucleic acids research 2023年11月11日
Development of an integrated and inferenceable RDF database of glycan, pathogen and disease resources.

Koichi Arakawa, Tamiko Ono, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Yasunori Yamamoto

Scientific data 10(1) 582-582 2023年9月6日
CIRO: COVID-19 Infection Risk Ontology

Shusaku Egami, Yasunori Yamamoto, Ikki Ohmukai, Takashi Okumura

PLOS ONE 18(3) 1-18 2023年3月査読有り
Online tools for efficient paper writing

Yasunori Yamamoto, Toyofumi Fujiwara

Human Genome Variation 9(1) 2022年12月
統合データベース探索フレームワークTogoDXの開発とその応用

高月照江, 池田秀也, 井手隆広, 大田達郎, 小野浩雅, 片山俊明, 川島秀一, 申在紋, 建石由佳, 千葉啓和 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
TogoID: an exploratory ID converter to bridge biological datasets

Shuya Ikeda, Hiromasa Ono, Tazro Ohta, Hirokazu Chiba, Yuki Naito, Yuki Moriya, Shuichi Kawashima, Yasunori Yamamoto, Shinobu Okamoto, Susumu Goto …

Bioinformatics 2022年7月8日
オントロジーを用いたCOVID-19感染リスク行動の推論

江上周作, 山本泰智, 大向一輝, 奥村貴史

人工知能学会第二種研究会資料 2022(SWO-056) 16 2022年3月11日
日本の難病に関する中心的基盤となる難病オントロジーNANDOと難病ポータルサイトNanbyoDataの正式リリース

仁宮洸太, 高月照江, 菊池敦生, 櫛田達矢, 山田涼太, 浅野由衣, 山本泰智, Orion Buske, 片山俊明, 桝屋啓志 …

トーゴーの日2021 1 2021年10月5日
Computation of Infection Risk via Confidential Locational Entries: A Precedent Approach for Contact Tracing With Privacy Protection.

Junko Ami, Kunihiro Ishii, Yoshihide Sekimoto, Hiroshi Masui, Ikki Ohmukai, Yasunori Yamamoto, Takashi Okumura

IEEE Access 9 87420-87433 2021年
Choosing preferable labels for the Japanese translation of the Human Phenotype Ontology.

Kota Ninomiya, Terue Takatsuki, Tatsuya Kushida, Yasunori Yamamoto, Soichi Ogishima

Genomics & informatics 18(2) e23 2020年6月
BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research.

Rutger A Vos, Toshiaki Katayama, Hiroyuki Mishima, Shin Kawano, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Toshiaki Tokimatsu, Atsuko Yamaguchi, Yasunori Yamamoto …

F1000Research 9 136-136 2020年
Tracing patients' PLOD with mobile phones: Mitigation of epidemic risks through patients' locational open data.

Ikki Ohmukai, Yasunori Yamamoto, Maori Ito, Takashi Okumura

CoRR abs/2003.06199 2020年
Tracing patient PLOD by mobile phones Mitigation of epidemic risks based on patient locational open data.

Ikki Ohmukai, Yasunori Yamamoto, Maori Ito, Takashi Okumura

29th IEEE International Conference on Enabling Technologies: Infrastructure for Collaborative Enterprises(WETICE) 283-286 2020年

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受賞

2022年11月

最優秀賞, Patient Locational Ontology-based Data (PLOD), Linked Open Data チャレンジ 2022 実行委員会

江上周作, 山本泰智, 大向一輝, 奥村貴史
2019年12月

基盤技術部門優秀賞, JSON2LD Mapper Reiwa Edition, LODチャレンジ2019実行委員会

山本泰智, 藤澤貴智, 伊藤宗太
2019年2月

プログレス賞, JSON2LD Mapper, LODチャレンジJapan実行委員会

山本泰智, 藤澤貴智, 小林巌生
2018年2月

アイディア部門優秀賞, JSON2LD Mapper, LODチャレンジ実行委員会

藤澤貴智、山本泰智
2016年2月

基盤技術部門最優秀賞, D2RQ Mapper, LODチャレンジ実行委員会

山本泰智, 片山俊明
2012年3月

アイディア部門優秀賞, LODチャレンジ実行委員会

山本泰智

MISC

A proposal for yet another search service for life science ontologies

Yasunori Yamamoto

Proceedings of 17th Annual International Biocuration Conference 2024年3月筆頭著者
Make RDF data more inter-connectable.

Yasunori Yamamoto, Takatomo Fujisawa

Proceedings ofSemantic Web Applications and Tools for Health Care and Life Sciences, SWAT4HCLS 2024年3月筆頭著者
難病・希少疾患の症例報告を用いたコーパス作成における課題と人工知能の応用

土肥栄祐, 建石由佳, 藤原豊史, 山本泰智

人工知能学会全国大会論文集(Web) 38th 2024年
難病関連データの利活用および国際共有に向けた取り組み

藤原豊史, 菊池敦生, 高月照江, 櫛田達矢, 申在紋, 山本泰智, 桝屋啓志, 佐藤万仁, 足立香織, 鎌田真由美 …

日本遺伝子診療学会大会プログラム・抄録集 31st 2024年
Towards Semantic Data Management of Visual Computing Datasets: Increasing Usability of MetaVD

Yasunori Yamamoto, Shusaku Egami, Yuya Yoshikawa, Ken Fukuda

Proceedings of the ISWC 2023 Posters, Demos and Industry Tracks 2023年11月査読有り筆頭著者
RDF Data integration using Shape Expressions

Jose Emilio Labra-Gayo, Andra Waagmeester, Yasunori Yamamoto, Ángel Iglesias-Préstamo, Toshiaki Katayama, Thomas Liener, Deepak Unni, Jerven Bolleman, Kiyoko Flora Aoki-Kinoshita, Masashi Yokochi …

2023年7月3日
BioHackJP 2023 Report R4: integration of glyco data with chemo-, geno-, lipid-omics and pathway data

Kiyoko Flora Aoki-Kinoshita, Evan Bolton, Issaku Yamada, Akihiro Fujita, Masaaki Matsubara, Jerven Bolleman, Yasunori Yamamoto

2023年7月3日
バイオリソースの知識グラフの作成とその活用

櫛田達矢, 臼田大輝, 藤澤貴智, 山本泰智, 小林紀郎, 桝屋啓志

人工知能学会全国大会論文集(Web) 37th 2023年
TogoDX/Human:ヒトに関するデータを統合的に探索・俯瞰・抽出するためのアプリケーション

守屋勇樹, 池田秀也, 井手隆広, 大田達郎, 小野浩雅, 川島秀一, SHIN Jae-Moon, 高月照江, 建石由佳, 千葉啓和 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
より繋がるRDFデータの流通を目指して

山本泰智, 藤澤貴智

人工知能学会全国大会論文集 JSAI2022 2E6GS304-2E6GS304 2022年6月筆頭著者
診療録からの症状半自動抽出システム「POET」の開発

地引芳乃, 土肥栄祐, 仁宮洸太, 建石由佳, 山本泰智, 佐々木貴規, 藤原豊史

トーゴーの日2021 1 2021年10月5日
TogoID:データベース統合の基盤となるID変換サービス

池田秀也, 千葉啓和, 藤原豊史, 原薗陛正, 井手隆広, 片山俊明, 川島秀一, 箕輪真理, 三橋信孝, 守屋勇樹 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
行動と空間の状態に着目したCOVID-19感染リスクオントロジーの提案

江上周作, 大向一輝, 山本泰智, 神崎正英, 野本昌子, 伊藤真和吏, 坂根昌一, 網淳子, 奥村貴史, 奥村貴史

人工知能学会全国大会(Web) 35th 2021年
Logic Programming for the Biomedical Sciences

Chris Mungall, Hirokazu Chiba, Shuichi Kawashima, Pjotr Prins, Yasunori Yamamoto

2020年4月10日
LOD Surfer:クラス間関係に基づく連合検索を利用したLOD探索

山口敦子, 小林紀郎, 山本泰智, 桝屋啓志, 古崎晃司

人工知能学会全国大会(Web) 34th 2020年
知識グラフ,セマンティックウェブを構成するRDFと問い合わせ言語SPARQL

山本泰智

情報の科学と技術 70(8) 2020年
生命科学系日本語学術文書の係り受け解析

建石由佳, 薬師寺あかね, 飯田啓介, 山本泰智

言語処理学会年次大会発表論文集(Web) 25th 2019年
質の高い生命科学Linked Data利用基盤の構築に向けて

山本泰智, 山口敦子

人工知能学会全国大会(Web) 33rd 2019年
稀少・遺伝性疾患検索プラットフォームPubCaseFinder&PhenoTouchの開発

藤原豊史, 山本泰智, KIM Jin-Dong, 高木利久

日本人類遺伝学会大会プログラム・抄録集 64th 2019年
ヒトゲノムバリアント評価システムPubCaseFinderの開発

藤原豊史, 山本泰智, 金進東, 宮冬樹, 高木利久

日本遺伝子診療学会大会プログラム・抄録集 26th 2019年

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書籍等出版物

オミクスデータを探す!使いこなす!公共データベース厳選53 : 情報の海で手に入る宝物で、あなたの研究が発展する!

粕川, 雄也

羊土社 2025年12月 (ISBN: 9784758104319)
理論生物学事典

巌佐, 庸, 大槻, 久, 佐竹, 暁子, 望月, 敦史

朝倉書店 2025年11月 (ISBN: 9784254172034)
生命科学研究のためのデジタルツール入門第2版 - 結果に差がつく使いこなし術 -

(担当:分担執筆, 範囲:PubMedで最新の論文情報を取得する)

メディカル・サイエンス・インターナショナル 2024年6月28日 (ISBN: 4815731063)
実験医学増刊 Vol.40 No.17 バイオDBとウェブツールラボで使える最新70選〜知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤

(担当:分担執筆, 範囲:PubMed, inMeXes, Allie, Colil)

羊土社 2022年10月24日 (ISBN: 4758104069)
バリアントデータ検索&活用変異・多型情報を使いこなす達人レシピ (実験医学別冊)

坊農, 秀雅

羊土社 2020年9月28日 (ISBN: 4758122458)
バイオインフォマティクスデータスキル : オープンソースツールを使ったロバストで再現性のある研究

Buffalo, Vince, 酒匂, 寛, 山村, 吉信, 片山, 俊明, 川島, 秀一, 鈴木, 治夫, 山本, 泰智

オライリー・ジャパン,オーム社 (発売) 2020年9月 (ISBN: 9784873118635)
生命科学データ解析を支える情報技術

坊農, 秀雅, 粕川, 雄也, 山本, 泰智, 久保, 竜一, 大石, 直哉

技術評論社 2019年2月 (ISBN: 9784297103194)
AI導入によるバイオテクノロジーの発展

植田, 充美 (担当:分担執筆, 範囲:生命科学におけるLinked Open Data（LOD）を用いた知識共有)

シーエムシー出版 2018年2月 (ISBN: 9784781313153)
人工知能学大事典 = Encyclopedia of artificial intelligence

人工知能学会 (担当:分担執筆)

共立出版 2017年7月 (ISBN: 9784320124202)
オープンデータ時代の標準Web API SPARQL (NextPublishing)

加藤文彦, 川島秀一, 岡別府陽子, 山本泰智, 片山俊明 (担当:共著)

インプレスR&D 2015年11月13日 (ISBN: 4802090439)
今日から使える!データベース・ウェブツール : 達人になるための実践ガイド100

内藤, 雄樹

羊土社 2014年12月 (ISBN: 9784758103435)
セマンティックWeb プログラミング

大向一輝, 加藤文彦, 中尾光輝, 山本泰智, 玉川竜司 (原著:Toby Segaran, Colin Evans, Jamie Taylor)

オライリージャパン 2010年6月26日 (ISBN: 4873114527)

講演・口頭発表等

104

生命科学分野におけるLODの構築と利用

AIPシンポジウム活力ある安寧な社会共創に向け人が試される人工知能への期待 2016年11月14日招待有り

担当経験のある科目(授業)

2006年8月 - 2008年8月

生物情報科学学部教育プログラム Perl演習担当 (東京大学)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

オントロジー工学に基づくコンテキスト管理を利用した知識グラフ自動構築手法

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2028年3月

古崎晃司, 竹内和広, 山本泰智, 熊澤輝一
国際共有を前提とした症例情報統合化技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

藤原豊史, 土肥栄祐, 山口敦子, 山本泰智, 申在紋
日本語の症例報告への自動アノテーション技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

山本泰智
領域横断型知識統合と領域深造型意味処理を融合するオントロジー利用フレームワーク

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2021年3月

古崎晃司, 来村徳信, 熊澤輝一, 山本泰智
生命科学分散メタデータの高効率な統合と検索のための新規ディレクトリ機能の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

小林紀郎, 山本泰智
文献全文からの網羅的な生物メタ情報抽出技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2014年4月 - 2018年3月

山本泰智, 川島秀一, 片山俊明, 岡本忍
オントロジーの多次元的視点管理に基づく領域横断型セマンティックデータの知的探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2013年4月 - 2017年3月

古崎晃司, 来村徳信, 熊澤輝一, 山本泰智
時間経過を考慮した医学生物系文献情報からの知識抽出

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2004年 - 2004年

山本泰智

山本泰智

基本情報

研究キーワード

研究分野

論文

受賞

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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