佐々木裕次 (Yuji C. Sasaki) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院新領域創成科学研究科教授 (工学博士)

連絡先: ycsasakiedu.k.u-tokyo.ac.jp
通称等の別名: 佐々木裕次
J-GLOBAL ID: 201601019499802990
researchmap会員ID: B000253989

外部リンク: https://www.k.u-tokyo.ac.jp/materials/sasaki/index.html

研究キーワード

研究分野

経歴

2014年 - 2015年

東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 教授

論文

165

Real-time tilting and twisting motions of ligand-bound states of α7 nicotinic acetylcholine receptor

Yue Yang, Tatsuya Arai, Daisuke Sasaki, Masahiro Kuramochi, Hidetoshi Inagaki, Sumiko Ohashi, Hiroshi Sekiguchi, Kazuhiro Mio, Tai Kubo, Yuji C. Sasaki

European Biophysics Journal 53(1-2) 15-25 2024年1月17日
Ubiquitination of Major Histocompatibility Complex II Changes Its Immunological Recognition Structure

Yuko Kozono, Masahiro Kuramochi, Yuji C. Sasaki, Haruo Kozono

International Journal of Molecular Sciences 24(23) 17083-17083 2023年12月3日
Time-Resolved X-ray Observation of Intracellular Crystallized Protein in Living Animal.

Masahiro Kuramochi, Ibuki Sugawara, Yoichi Shinkai, Kazuhiro Mio, Yuji C Sasaki

International journal of molecular sciences 24(23) 2023年11月29日
The Blinking of Small-Angle X-ray Scattering Reveals the Degradation Process of Protein Crystals at Microsecond Timescale

Tatsuya Arai, Kazuhiro Mio, Hiroki Onoda, Leonard M. G. Chavas, Yasufumi Umena, Yuji C. Sasaki

International Journal of Molecular Sciences 24(23) 16640-16640 2023年11月23日
The ice-binding site of antifreeze protein irreversibly binds to cell surface for its hypothermic protective function

Yue Yang, Akari Yamauchi, Sakae Tsuda, Masahiro Kuramochi, Kazuhiro Mio, Yuji C. Sasaki, Tatsuya Arai

Biochemical and Biophysical Research Communications 2023年11月
Comparison of the Molecular Motility of Tubulin Dimeric Isoforms: Molecular Dynamics Simulations and Diffracted X-ray Tracking Study.

Tsutomu Yamane, Takahiro Nakayama, Toru Ekimoto, Masao Inoue, Keigo Ikezaki, Hiroshi Sekiguchi, Masahiro Kuramochi, Yasuo Terao, Ken Judai, Minoru Saito …

International journal of molecular sciences 24(20) 2023年10月21日
Comparison of the Molecular Motility of Tubulin Dimeric Isoforms: Molecular Dynamics Simulations and Diffracted X-ray Tracking Study

Tsutomu Yamane, Takahiro Nakayama, Toru Ekimoto, Masao Inoue, Keigo Ikezaki, Hiroshi Sekiguchi, Masahiro Kuramochi, Yasuo Terao, Ken Judai, Minoru Saito …

International Journal of Molecular Sciences 24(20) 15423-15423 2023年10月21日
Molecular Dynamics Mappings of the CCT/TRiC Complex-Mediated Protein Folding Cycle Using Diffracted X-ray Tracking.

Kazutaka Araki, Takahiro Watanabe-Nakayama, Daisuke Sasaki, Yuji C Sasaki, Kazuhiro Mio

International journal of molecular sciences 24(19) 2023年10月3日
Diffracted X-ray Tracking for Observing the Internal Motions of Individual Protein Molecules and Its Extended Methodologies.

Yuji C Sasaki

International journal of molecular sciences 24(19) 2023年10月2日
Comparison of the Molecular Motility of Tubulin Dimeric Isoforms: Molecular Dynamics Simulations and Diffracted X-ray Tracking Study

努山根, Takahiro Nakayama, Toru Ekimoto, Masao Inoue, Keigo Ikezaki, Hiroshi SEKIGUCHI, Masahiro Kuramochi, Yasuo Terao, Ken Judai, Minoru Saito …

International Journal of Molecular Sciences 2023年10月
Molecular Dynamics Mappings of the CCT/TRiC Complex-Mediated Protein Folding Cycle Using Diffracted X-ray Tracking

Kazutaka Araki, Takahiro Watanabe-Nakayama, Daisuke Sasaki, Yuji C. SASAKI, Kazuhiro Mio

International Journal of Molecular Sciences 2023年10月
Diffracted X-ray Tracking for Observing the Internal Motions of Individual Protein Molecules and Its Extended Methodologies

Yuji C. SASAKI

International Journal of Molecular Sciences 2023年10月
Direct observation of 890 ns dynamics of carbon black and polybutadiene in rubber materials using diffracted x-ray blinking

Masahiro Kuramochi, Henry J. Kirkwood, Jayanath C. P. Koliyadu, Romain Letrun, Raphael de Wijn, Chan Kim, Tomomi Masui, Kazuhiro Mio, Tatsuya Arai, Hiroshi Sekiguchi …

Applied Physics Letters 123(10) 2023年9月4日
Real-Time Observation of Capsaicin-Induced Intracellular Domain Dynamics of TRPV1 Using the Diffracted X-ray Tracking Method.

Kazuhiro Mio, Tatsunari Ohkubo, Daisuke Sasaki, Tatsuya Arai, Mayui Sugiura, Shoko Fujimura, Shunsuke Nozawa, Hiroshi Sekiguchi, Masahiro Kuramochi, Yuji C Sasaki

Membranes 13(8) 2023年7月30日
Ligand-Dependent Intramolecular Motion of Native Nicotinic Acetylcholine Receptors Determined in Living Myotube Cells via Diffracted X-ray Tracking.

Koichiro Oishi, Mayu Nagamori, Yasuhiro Kashino, Hiroshi Sekiguchi, Yuji C Sasaki, Atsuo Miyazawa, Yuri Nishino

International journal of molecular sciences 24(15) 2023年7月28日
Ligand-Dependent Intramolecular Motion of Native Nicotinic Acetylcholine Receptors Determined in Living Myotube Cells via Diffracted X-ray Tracking

Koichiro Oishi, Mayu Nagamori, Yasuhiro Kashino, Hiroshi Sekiguchi, Yuji C. Sasaki, Atsuo Miyazawa, Yuri Nishino

International Journal of Molecular Sciences 2023年7月28日
Ligand-Dependent Intramolecular Motion of Native Nicotinic Acetylcholine Receptors Determined in Living Myotube Cells via Diffracted X-ray Tracking

Koichiro Oishi, Mayu Nagamori, Yasuhiro Kashino, Hiroshi SEKIGUCHI, Yuji C. SASAKI, Atsuo Miyazawa, Yuri Nishino

International Journal of Molecular Sciences 2023年7月
Real-Time Observation of Capsaicin-Induced Intracellular Domain Dynamics of TRPV1 Using the Diffracted X-ray Tracking Method

Kazuhiro Mio, Tatsunari Ohkubo, Daisuke Sasaki, Tatsuya Arai, Mayui Sugiura, Shoko Fujimura, Shunsuke Nozawa, Hiroshi SEKIGUCHI, Masahiro Kuramochi, Yuji C. SASAKI

Membranes 2023年7月
The effect of ice-binding proteins on the cryopreservation of Caenorhabditis elegans

Masahiro Kuramochi, Tatsuya Arai, Kazuhiro Mio, Sakae Tsuda, Yuji C Sasaki

microPublication Biology 2023年4月査読有り
Development of serial X-ray fluorescence holography for radiation-sensitive protein crystals.

Artoni Kevin R Ang, Yasufumi Umena, Ayana Sato-Tomita, Naoya Shibayama, Naohisa Happo, Riho Marumi, Yuta Yamamoto, Koji Kimura, Naomi Kawamura, Yu Takano …

Journal of synchrotron radiation 30(Pt 2) 368-378 2023年3月1日

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MISC

337

氷結合タンパク質は個体生物の凍結・非凍結低温環境における生存率を改善する

倉持昌弘, 新井達也, 三尾和弘, 津田栄, 佐々木裕次

アグリバイオ 6(14) 2023年
1分子生体高速ダイナミクス

佐々木裕次

CSJ Current Review (45) 2023年
回折X線明滅法を用いた加硫天然ゴム内部の粒子動態解析

新井達也, 新井達也, 坂口正紀, 三尾和弘, 佐々木裕次, 佐々木裕次

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
回折X線明滅法を用いたエボラウイルス増殖過程における感染細胞の形質膜動態計測

谷中慶三郎, 大久保達成, 大久保達成, 新井達也, 野澤俊介, 関口博史, 古山若呼, 南保明日香, 三尾和弘, 三尾和弘 …

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
回折X線明滅法を用いた劣化高分子の内部動態計測

坂口正紀, 新井達也, 引田理英, 佐々木裕次

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
フルオロアルキルアクリルポリマー表面の分子動態計測

稲益礼奈, 山口央基, 新井達也, 引田理英, 三尾和弘, 佐々木裕次, 佐々木裕次

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
機械学習を用いたX線動画解析による動態物性の抽出

倉持昌弘, 李卓起, 赤穂昭太郎, 佐々木裕次

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
回折X線明滅法による不凍タンパク質表面での氷結晶の動態計測

楊越, 新井達也, 新井達也, 引田理英, 佐々木裕次, 佐々木裕次

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
リン酸カルシウム血清タンパク質複合体のX線1粒子動態計測

李卓起, 大久保達成, 椎名孝明, 新井達也, 新井達也, 引田理英, 三尾和弘, 三浦裕, 黒須洋, 黒尾誠 …

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
回折X線明滅法を用いた光捕集反応中心複合体の分子動態解析

大久保達成, 大久保達成, 新井達也, 新井達也, 野澤俊介, 深谷亮, 一柳光平, 三尾和弘, 三尾和弘, 佐々木裕次 …

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2022 2023年
凍結低温環境下での生命活動維持を実現する氷晶結合タンパク質

倉持昌弘, 新井達也, 三尾和弘, 津田栄, 佐々木裕次

アグリバイオ 7(5) 2023年
回折X線明滅法による不凍タンパク質分子表面の凍結水の動態観察

新井達也, 新井達也, 楊越, 津田栄, 三尾和弘, 佐々木裕次, 佐々木裕次

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 23rd (CD-ROM) 2023年
回折X線明滅法を用いたエボラウイルス感染細胞の形質膜動態計測

谷中慶三郎, 新井達也, 野澤俊介, 古山若呼, 南保明日香, 三尾和弘, 佐々木裕次, 佐々木裕次

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 23rd (CD-ROM) 2023年
回折X線明滅法を用いた劣化ポリマーの内部動態計測

坂口正紀, 新井達也, 引田理英, 三尾和弘, 佐々木裕次

Photon Factory News 41(2) 2023年
氷晶結合タンパク質分子の構造特異機能に起因した凍結・低温耐性獲得メカニズム

倉持昌弘, 新井達也, 三尾和弘, 津田栄, 佐々木裕次

アグリバイオ 7(10) 2023年
氷結合タンパク質を発現した線虫の凍結保存効果

下谷祐平, 新井達也, 三尾和弘, 津田栄, 佐々木裕次, 倉持昌弘

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
HLA-DMによるペプチド交換反応の高速X線1分子計測法を用いた動的挙動解析

宮部俊宏, 小園裕子, 笠寺浩介, 松宮陽, 関口博史, 沖本憲明, 泰地真久人, 佐々木裕次, 小園晴生

SPring-8/SACLA利用研究成果集(Web) 9(1) 2021年
Dynamic Internal Motion of GPCR on Live Cells

Masaki Ishihara, Shoko Fujimura, Kohei Ichiyanagi, Shunsuke Nozawa, Shinichi Adachi, Ryo Fukaya, Masahiro Kuramochi, Hiroshi Sekiguchi, Kazuhiro Mio, Yuji C. Sasaki

BIOPHYSICAL JOURNAL 118(3) 56A-56A 2020年2月
7.X線1分子追跡法の技術開発とその広域利用

佐々木裕次

電気化学 88(3) 2020年
X-ray fluorescence holography for soft matter

Artoni Kevin R. Ang, Ayana Sato-Tomita, Naoya Shibayama, Yasufumi Umena, Naohisa Happo, Riho Marumi, Koji Kimura, Tomohiro Matsushita, Kazuto Akagi, Takahiko Sasaki …

Japanese Journal of Applied Physics 59(1) 2020年1月1日

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共同研究・競争的資金等の研究課題

X線を用いた高速１分子運動解析による膜タンパク質オペランド計測の実現

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

三尾和弘, 関口博史, 山下隼人, 佐々木裕次, 倉持昌弘
３つのレーザー励起によるX線１分子追跡法を用いたヘモグロビン動態の全貌決定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2020年4月 - 2023年3月

佐々木裕次, 関口博史, 柴山修哉
3D活性サイト科学の海外拠点・国際ネットワーク構築

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年11月 - 2019年3月

大門寛, 佐々木裕次, 野村琴広, 林好一, 木下豊彦, 若林裕助, 細川伸也, 松井文彦, 筒井一生, 福村知昭, 森川良忠, 小林伸彦, 郷原一寿, 山田容子, 松下智裕, 鷹野優
３Ｄ活性サイト科学のプラットフォーム構築による総括と研究支援

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

大門寛, 小林伸彦, 松下智裕, 高橋敏男, 林好一, 野村琴広, 山田容子, 細川伸也, 佐々木裕次, 鷹野優, 郷原一寿, 若林裕助, 室隆桂之, 筒井一生, 木下豊彦, 大山研司, 松井文彦, 田尻寛男, 森川良忠, 福村知昭
バイオロジーにおける3D活性サイト科学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

佐々木裕次, 関口博史, 柴山修哉, 宮澤淳夫, 久保泰, 一柳光平
実験室における天然変性タンパク質のＸ線１分子動態計測装置開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2015年4月 - 2018年3月

佐々木裕次
マイクロ回折粒子を用いた中性子1分子追跡法の実現

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

佐々木裕次, 大友季哉
コンパクトX線1分子計測装置の実現と複合計測法開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2010年 - 2012年

佐々木裕次, 一柳光平, 関口博史, 八木直人
高精度1分子内動画計測から見える生体分子構造認識プロセス

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2006年 - 2011年

佐々木裕次
X線1分子計測からのin-vivo蛋白質動的構造/機能解析

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2001年 - 2006年

佐々木裕次
X線1分子計測による細胞膜動的機能解析

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業さきがけ 1998年 - 2001年

佐々木裕次
配向制御されたミオシン単分子層による動的構造変化と発生力の同時計測

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1999年 - 1999年

須田斎, 佐々木裕次
配向制御されたミオシン単分子層での異方的弾性測定と構造変化相関

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1998年 - 1998年

須田斎, 佐々木裕次
全反射PIXEによる軽元素系物質の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 1997年 - 1998年

佐藤伊佐務, 佐々木裕次, 永田晋二
金薄膜に配向固定したミオシン単分子膜での異方的弾性測定と構造変化相関

日本学術振興会科学研究費助成事業重点領域研究 1997年 - 1997年

須田斎, 佐々木裕次

産業財産権

特開2023-075325 X線回折による高分子測定方法

稲益礼奈, 山口央基, 佐々木裕次, 三尾和弘
特開2022-174025 X線回折による高分子測定方法

稲益礼奈, 山口央基, 佐々木裕次, 三尾和弘
特開2022-019115 X線を用いた物質評価方法及び物質評価装置

三尾和弘, 佐々木裕次, 倉持昌弘
特許第6973766号運動計測装置

佐々木裕次, 池崎圭吾
特開2018-084447 運動計測装置

佐々木裕次, 池崎圭吾
特開平11-218691 液滴操作方法および装置

安田賢二, 佐々木裕次
特開平11-014567 時分割蛍光X線干渉計測方法および時分割蛍光X線干渉計測装置

佐々木裕次, 鈴木芳生
特開平10-332607 ラウエ斑点追跡法

佐々木裕次
特開平10-182693 分子の配向制御方法

原田義則, 安田賢二, 佐々木裕次
特開平9-304308 薄膜構造の解析方法及びその装置

鈴木芳生, 佐々木裕次, 冨岡安
特開平9-288052 分画装置

安田賢二, 佐々木裕次, 武田一男, 梅村晋一郎
特開平9-089780 光学測定装置

安田賢二, 佐々木裕次, 梅村晋一郎, 石渡信一, 木下一彦
特開平8-059394 集積用基板および集積方法

三矢宗久, 佐々木裕次, 岩田誠一
特開平7-049316 放射性同位元素の壊変によって発生する電磁波を用いた構造解析法

佐々木裕次, 鈴木芳生, 石橋整
特開平7-023796 細胞内試料サンプリング及び分析方法

佐々木裕次
特開平6-343478 マイクロインジェクション方法及び装置

内田憲孝, 佐々木裕次
特開平5-244997 DNAまたはRNAの塩基配列決定法

佐々木裕次, 原田義則

佐々木裕次

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論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

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