姫岡優介 (Yusuke Himeoka) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院助教

研究者番号: 70903160
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-8545-1625
J-GLOBAL ID: 202101001093711122
researchmap会員ID: R000020155

外部リンク: http://www.yhimeoka.com

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 / システム生物学

経歴

2021年1月 - 現在

東京大学, 生物普遍性研究機構, 助教
2018年4月 - 2020年12月

コペンハーゲン大学ニールス・ボーア研究所, 博士研究員
2016年4月 - 2018年3月

日本学術振興会特別研究員（DC2）

受賞

2025年12月

ナイスステップな研究者2025, 文部科学省科学技術・学術政策研究所（NISTEP）

姫岡優介
2025年10月

第20回日本物理学会若手奨励賞（領域11）, 一般社団法人日本物理学会

姫岡優介
2025年9月

第21回日本生物物理学会若手奨励賞, 一般社団法人日本生物物理学会

姫岡優介
2024年6月

Nakatani Foundation Award, 公益財団法人中谷医工計測技術振興財団

姫岡優介
2018年3月

一高賞, 東京大学

姫岡優介
2015年3月

広域科学専攻奨励賞, 東京大学

姫岡優介

論文

Population dynamics of generalist and specialist strategies under feast-famine cycles

Rintaro Niimi, Chikara Furusawa, Yusuke Himeoka

PLOS Computational Biology 2026年4月30日
Elucidating the Bell-Shaped Dependence of Protein Translation Activity on EF-Tu Concentration in a Reconstituted Cell-Free System Using a Mechanistic Model

Shunnosuke Ban, Yusuke Himeoka, Ako Kagawa, Yoshihiro Shimizu, Tomoaki Matsuura, Chikara Furusawa

2026年4月20日
Analysis of metabolic stability under environmental perturbations using a kinetic model

Atsuki Hishida, Yusuke Himeoka, Chikara Furusawa

Biophysics and Physicobiology 2026年
Local stabilizability implies global controllability in catalytic reaction systems

Yusuke Himeoka, Shuhei A. Horiguchi, Naoto Shiraishi, Fangzhou Xiao, Tetsuya J. Kobayashi

2025年5月11日
Theoretical basis for cell deaths

Yusuke Himeoka, Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi

Physical Review Research 2024年11月27日
Roles of network topology in the relaxation dynamics of simple chemical reaction network models

Yusuke Himeoka, Julius B. Kirkegaard, Namiko Mitarai, Sandeep Krishna

Scientific Reports 14(1) 2024年9月27日
Evolution of hierarchy and irreversibility in theoretical cell differentiation model

Yoshiyuki T Nakamura, Yusuke Himeoka, Nen Saito, Chikara Furusawa

PNAS Nexus 2023年12月21日
Perturbation-response analysis of in silico metabolic dynamics in nonlinear regime: Hard-coded responsiveness in the cofactors and network sparsity

Yusuke Himeoka, Chikara Furusawa

eLife 2023年10月20日
Emergence of growth and dormancy from a kinetic model of the Escherichia coli central carbon metabolism

Yusuke Himeoka, Namiko Mitarai

Physical Review Research 2022年12月30日
Distinct survival, growth lag, and ribosomal RNA degradation kinetics during long-term starvation for carbon or phosphate

Yusuke Himeoka, Bertil Gummesson, Michael A. Sørensen, Sine Lo Svenningsen, Namiko Mitarai

mSphere 2020年9月6日
Dynamics of bacterial populations under the feast-famine cycles

Yusuke Himeoka, Namiko Mitarai

Physical Review Research 2020年3月27日
Epigenetic Ratchet: Spontaneous Adaptation via Stochastic Gene Expression

Himeoka, Yusuke, Kaneko, Kunihiko

Scientific reports 10(1) 1-7 2020年
When to wake up? The optimal waking-up strategies for starvation-induced persistence

Yusuke Himeoka, Namiko Mitarai

PLOS Computational Biology 17(2) 2019年12月30日
Modeling slow-processing of toxin messenger RNAs in type-I toxin–antitoxin systems: post-segregational killing and noise filtering

Yusuke Himeoka, Namiko Mitarai

Physical Biology 2019年3月1日
Theory for Transitions Between Exponential and Stationary Phases: Universal Laws for Lag Time

Yusuke Himeoka, Kunihiko Kaneko

Physical Review X 7(2) 2017年6月
Enzyme oscillation can enhance the thermodynamic efficiency of cellular metabolism: consequence of anti-phase coupling between reaction flux and affinity

Yusuke Himeoka, Kunihiko Kaneko

Physical Biology 13(2) 026002-026002 2016年4月5日
Entropy production of a steady-growth cell with catalytic reactions

Yusuke Himeoka, Kunihiko Kaneko

Physical Review E 90(4) 2014年10月

MISC

増殖している細胞のマクロ現象論とその破れ

姫岡優介

第68回物性若手夏の学校テキスト 2024年8月筆頭著者最終著者責任著者
代謝モデルの「不都合な真実」と「細胞を創る」こと

姫岡優介

生物工学会誌 102(6) 285-285 2024年7月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
大腸菌の代謝動力学モデルにおける成長状態と休眠状態の出現

姫岡優介

生物物理 64(3) 2024年6月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者

書籍等出版物

システム生物学入門

畠山, 哲央, 姫岡, 優介

講談社 2023年11月 (ISBN: 9784065334348)

講演・口頭発表等

136

生命と非生命の差異の解明に向けた理論研究

姫岡優介

日本物理学会 2026年春季大会領域11 若手奨励賞受賞記念講演 2026年3月24日招待有り
A theoretical basis for cell deaths

2026年3月18日招待有り
細胞死の理論

姫岡優介, 堀口修平, 白石直人, Fangzhou Xiao, 小林徹也

第13回計測自動制御学会制御部門マルチシンポジウムオーガナイズドセッション『数理科学が拓くシステム制御の新展開 ― JSTさきがけ研究からの挑戦 ―』 2026年3月3日
Theoretical basis for cell deaths and autonomy

2026年3月2日招待有り
細胞死の理論と自律性

姫岡優介

数理科学セミナー & HMMCセミナー 2026年2月16日招待有り
細胞死の数理的アプローチ

姫岡優介

お茶の水女子大学情報科学科「理学総論」 2026年1月14日招待有り
細胞死の理論と自律性

姫岡優介

iSeminar 2025年12月25日招待有り
Computational Analysis of Metabolic Stability and Dynamics

2025年11月3日招待有り
Towards a theory of transitions between life and non-life: cell death and the hardness of assembling complex chemical reaction systems

2025年10月2日招待有り
細胞死への数理的アプローチと生命-非生命の境界

姫岡優介

第63回日本生物物理学会年会第11回会員総会シンポジウム：生命とは何か？死とは何か？：生物物理学からの考察 2025年9月25日招待有り
A theory of cell death and the rarity of stably functioning biochemical systems.

姫岡優介

第63回日本生物物理学会年会シンポジウム『人工細胞そして生命ー非生命の境界』 2025年9月25日招待有り
Theoretical Basis for Cell Deaths

姫岡優介

第63回日本生物物理学会年会 2025年9月24日
Theoretical Basis for Cell Deaths

姫岡優介

第63回日本生物物理学会年会若手招待講演シンポジウム 2025年9月24日招待有り
変動環境下における栄養利用戦略の集団動態

新美倫太郎, 古澤力, 姫岡優介

日本物理学会第80回年会 2025年9月16日
細胞分化を引き起こす制御ネットワークの定量解析：力学系シミュレーションとグラフニューラルネットワークの統合的アプローチ

沖貴裕, 姫岡優介, 古澤力

日本物理学会第80回年会 2025年9月16日
発生における細胞分化不可逆性の力学系解析

笹森貫佑, 姫岡優介, 古澤力

日本物理学会第80回年会 2025年9月16日
細胞死の理論と代謝システムの万能可制御性定理

姫岡優介, 堀口修平, 白石直人, Fanzhou Xiao, 小林徹也

日本物理学会第80回年会 2025年9月16日
細胞死の理論と休止状態

姫岡優介

第二回多細胞休止を研究する会 2025年7月15日
A theoretical approach to dissecting life from non-life

2025年6月25日
Understanding the boundary of life and death

2025年5月25日招待有り

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所属学協会

2024年3月 - 現在

日本生物物理学会
2023年10月 - 現在

日本分子生物学会
2015年4月 - 2023年12月

日本物理学会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

『生命-非生命転移』学の創出

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

姫岡優介

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姫岡優介

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研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

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