鹿島幸恵 (Yukie Kashima) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院新領域創成科学研究科准教授

J-GLOBAL ID: 202401001924317754
researchmap会員ID: R000080015

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

論文

Single-cell catalogue of immune cells from Japanese individuals.

Yukie Kashima, Kenichi Makishima, Genta Fujii, Masahide Seki, Yuuta Kuze, Patrick Reteng, Mamiko Sakata-Yanagimoto, Yutaka Suzuki

Communications biology 2026年6月23日
Neutrophil‐Macrophage Interactions Shape Inflammatory Macrophage Remodeling in Gastric Cancer During Chemo‐Immunotherapy

Keita H. Nagaoka, Hiroki Yamashita, Chiaki Mashima, Guoqiang Zhang, Hitoshi Saito, Tatsunori Minamide, Takuya Nakatsuru, Ryo Kamata, Shunsuke A. Sakai, Gaku Yamamoto …

Cancer Science 2026年5月21日
A cDC1-NK/T-Malignant Cell Circuit Drives Immunogenic Remodeling Under PD-1 Blockade in Gastric Cancer.

Takuya Nakatsuru, Hiroki Yamashita, Chiaki Mashima, Guoqiang Zhang, Hitoshi Saito, Tatsunori Minamide, Keita H Nagaoka, Ryo Kamata, Shunsuke A Sakai, Gaku Yamamoto …

Cancer science 2026年5月21日
Single-Cell Analysis Identified a Recurrent Malignant-Associated Transcriptional State in Colorectal Cancer

Sadahiro Iwabuchi, Kentaro Sawada, Motohiro Kojima, Miho Ozawa, Hiroya Taniguchi, Hideaki Bando, Kazumi Abe, Yuta Kuze, Kiyomi Imamura, Yukie Kashima …

CANCER SCIENCE 2026年3月2日
Spatial gene expression analysis reveals pathological niches in Japanese encephalitis virus neuroinvasion.

Yasuko Orba, Yukie Kashima, Koshiro Tabata, Yukari Itakura, Takuma Ariizumi, William W Hall, Hirofumi Sawa, Yutaka Suzuki, Michihito Sasaki

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122(43) e2515006122 2025年10月28日
Trajectory analysis reveals an uncommitted neuroblastic state in MYCN-driven neuroblastoma development.

Shoma Tsubota, Daniel R Carter, Janith A Seneviratne, Haruka Hirose, Teppei Shimamura, Yukie Kashima, Yutaka Suzuki, Koji Tsuda, Glenn M Marshall, Kenji Kadomatsu

Neuro-oncology 27(10) 2671-2683 2025年10月1日
Giant extrachromosomal element "Inocle" potentially expands the adaptive capacity of the human oral microbiome.

Yuya Kiguchi, Nagisa Hamamoto, Yukie Kashima, Lucky R Runtuwene, Aya Ishizaka, Yuta Kuze, Tomohiro Enokida, Nobukazu Tanaka, Makoto Tahara, Shun-Ichiro Kageyama …

Nature communications 16(1) 7397-7397 2025年8月11日
Amino acid substitutions in NSP6 and NSP13 of SARS-CoV-2 contribute to superior virus growth at low temperatures.

Yuri Furusawa, Maki Kiso, Ryuta Uraki, Yuko Sakai-Tagawa, Hiroyuki Nagai, Michiko Koga, Yukie Kashima, Masayuki Hojo, Noriko Iwamoto, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto …

Journal of virology 99(3) e0221724 2025年3月18日
Spatially resolved gene expression profiling of tumor microenvironment reveals key steps of lung adenocarcinoma development.

Yuma Takano, Jun Suzuki, Kotaro Nomura, Gento Fujii, Junko Zenkoh, Hitomi Kawai, Yuta Kuze, Yukie Kashima, Satoi Nagasawa, Yuka Nakamura …

Nature communications 15(1) 10637-10637 2024年12月6日
Integrative single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics analyses reveal diverse apoptosis-related gene expression profiles in EGFR-mutated lung cancer.

Motohiro Izumi, Masanori Fujii, Ikei S Kobayashi, Vivian Ho, Yukie Kashima, Hibiki Udagawa, Daniel B Costa, Susumu S Kobayashi

Cell death & disease 15(8) 580-580 2024年8月9日
Detection of HPV DNA in Saliva of Patients with HPV-Associated Oropharyngeal Cancer Treated with Radiotherapy.

Atsushi Motegi, Shun-Ichiro Kageyama, Yukie Kashima, Hidenari Hirata, Hidehiro Hojo, Masaki Nakamura, Takeshi Fujisawa, Tomohiro Enokida, Makoto Tahara, Kazuto Matsuura …

Current oncology (Toronto, Ont.) 31(8) 4397-4405 2024年8月1日
Virological characteristics of a SARS-CoV-2-related bat coronavirus, BANAL-20-236.

Shigeru Fujita, Arnon Plianchaisuk, Sayaka Deguchi, Hayato Ito, Naganori Nao, Lei Wang, Hesham Nasser, Tomokazu Tamura, Izumi Kimura, Yukie Kashima …

EBioMedicine 104 105181-105181 2024年6月
Single-cell analytical technologies: uncovering the mechanisms behind variations in immune responses.

Yukie Kashima, Patrick Reteng, Yasuhiko Haga, Junya Yamagishi, Yutaka Suzuki

The FEBS journal 291(5) 819-831 2024年3月
Characterization of a SARS-CoV-2 EG.5.1 clinical isolate in vitro and in vivo.

Ryuta Uraki, Maki Kiso, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Seiya Yamayoshi, Mutsumi Ito, Shiho Chiba, Yuko Sakai-Tagawa, Masaki Imai, Yukie Kashima, Michiko Koga …

Cell reports 42(12) 113580-113580 2023年12月26日
CDC7 inhibition induces replication stress-mediated aneuploid cells with an inflammatory phenotype sensitizing tumors to immune checkpoint blockade.

Tomoko Yamamori Morita, Jie Yu, Yukie Kashima, Ryo Kamata, Gaku Yamamoto, Tatsunori Minamide, Chiaki Mashima, Miyuki Yoshiya, Yuta Sakae, Toyohiro Yamauchi …

Nature communications 14(1) 7490-7490 2023年11月18日
Evolution of the viral genomes of SARS-CoV-2 in association with the changes in local condition: a genomic epidemiological study of a suburban city of Japan.

Yukie Kashima, Taketoshi Mizutani, Yuki Okimoto, Minami Maeda, Kaoru Musashino, Ryo-Ichi Nishide, Akira Matsukura, Jison Nagase, Yutaka Suzuki

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 30(5) 2023年10月1日
Comparative pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron subvariants including BA.1, BA.2, and BA.5.

Tomokazu Tamura, Daichi Yamasoba, Yoshitaka Oda, Jumpei Ito, Tomoko Kamasaki, Naganori Nao, Rina Hashimoto, Yoichiro Fujioka, Rigel Suzuki, Lei Wang …

Communications biology 6(1) 772-772 2023年7月24日
Efficacy of antivirals and bivalent mRNA vaccines against SARS-CoV-2 isolate CH.1.1.

Ryuta Uraki, Mutsumi Ito, Maki Kiso, Seiya Yamayoshi, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Yuko Sakai-Tagawa, Yuri Furusawa, Masaki Imai, Michiko Koga, Shinya Yamamoto …

The Lancet. Infectious diseases 23(5) 525-526 2023年5月
Efficacy of antivirals and mRNA vaccination against an XBF clinical isolate.

Ryuta Uraki, Mutsumi Ito, Maki Kiso, Seiya Yamayoshi, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Yuko Sakai-Tagawa, Masaki Imai, Michiko Koga, Shinya Yamamoto, Eisuke Adachi …

The Lancet regional health. Western Pacific 34 100777-100777 2023年5月
CD70 is a therapeutic target upregulated in EMT-associated EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance.

Monique B Nilsson, Yan Yang, Simon Heeke, Sonia A Patel, Alissa Poteete, Hibiki Udagawa, Yasir Y Elamin, Cesar A Moran, Yukie Kashima, Thiruvengadam Arumugam …

Cancer cell 41(2) 340-355 2023年2月13日

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MISC

クローズアップ実験法(series 387) 最新空間プロテオーム解析のレビューと実際

鹿島幸恵, 鈴木穣

実験医学 43(18) 2971-2976 2025年11月
【ワクチン開発】サポート機関(東京大学医科学研究所) PEA(Proximisity Exension Assay)法によるプロテオーム解析

金井昭教, 鹿島幸恵, 鈴木穣

生体の科学 76(5) 534-535 2025年10月
Single-Cell Analysis Reveals Chimeric HIV-MKL1 Transcripts Associated With Clonal Persistence in People Living with HIV (PLWH) under cART

RAJIB Samiul Alam, KASHIMA Yukie, SUZUKI Yutaka, YOTSUYANAGI Hiroshi, YOTSUYANAGI Hiroshi, YAMAMOTO Hiroyuki, YAMAMOTO Hiroyuki, KOGA Michiko, KAWANA-TACHIKAWA Ai, KAWANA-TACHIKAWA Ai …

日本エイズ学会誌 27(4) 2025年
単一細胞分析はcART下でHIV(PLWH)に住んでいる人々におけるクローン持続性に関連するキメラHIV-MKL1転写物を明らかにする【JST機械翻訳】|||

RAJIB Samiul Alam, KASHIMA Yukie, SUZUKI Yutaka, YOTSUYANAGI Hiroshi, YOTSUYANAGI Hiroshi, YAMAMOTO Hiroyuki, YAMAMOTO Hiroyuki, KOGA Michiko, KOGA Michiko, KAWANA-TACHIKAWA Ai …

日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web) 72nd 2025年
HIV感染者T細胞のシングルセル遺伝子発現解析

立川愛[川名], 鹿島幸恵, 細谷香[中山], 鮎川洋子, 鈴木穣, 四柳宏, 山本浩之, 古賀道子

日本エイズ学会誌 26(4) 383-383 2024年11月
増大特集学術研究支援の最先端 Ⅳ.先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム(PAGS) ⅰ.大規模配列解析拠点ネットワーク支援 1細胞解像度での空間遺伝子発現解析(Xenium In SituとVisium HD)

金井昭教, 鹿島幸恵, 鈴木穣

生体の科学 75(5) 520-521 2024年10月15日
空間オミクス技術開発の最近の進歩—Overview of recent advance in spatial omics technology—特集空間オミクス解析の進歩

鹿島幸恵, 金井昭教, 鈴木穣

臨床免疫・アレルギー科 = Clinical immunology & allergology / 臨床免疫・アレルギー科編集委員会編 82(4) 366-371 2024年10月
染色体不安定性による自然免疫応答にはPI3K-AKT-mTOR pathwayが関与する(PI3K-AKT-mTOR signaling pathways regulate chromosomal instability-induced innate immune activation)

鎌田諒, 齊藤仁志, 箱崎優美, 鹿島幸恵, 山本岳, 山盛智子, Pinyi Lu, 大橋紹宏, 大橋紹宏

日本癌学会総会記事 83回 P-3307 2024年9月
ヒトオルガノイドおよびハムスターモデルを用いたSARS-CoV-2関連コウモリコロナウイルスであるBANAL-20-236のウイルス学的性状解析

藤田滋, Plianchaisuk Arnon, 出口清香, 伊藤駿, 直亨則, 王磊, Nasser Hesham, 田村友和, 木村出海, 鹿島幸恵 …

日本獣医学会学術集会講演要旨集 167回 212-212 2024年8月
若手呼吸器研究最前線シンポジウム肺オルガノイド空間的トランスクリプトーム解析による次世代創薬プラットフォーム開発ニッチオーム介入評価系の新ツールとしての可能性

鈴木敏夫, 鈴木穣, Choi Harry, 中川智貴, 松原大祐, 関根郁夫, 永元哲治, 池尾聡, 鹿島幸恵, 鈴木絢子 …

日本呼吸器学会誌 13(増刊) 31-31 2024年3月
新規日本人コホート集団におけるクローン造血の探求

槇島健一, 鹿島幸恵, 久世裕太, 須摩桜子, 安部佳亮, 末原泰人, 服部圭一朗, 坂本竜弘, 鬼頭さくら, Nyuen Tran B. …

日本血液学会学術集会 85回 563-563 2023年10月
最新のシングルセル解析とその応用—The state-of-art single-cell technology and its application—特集ヒト細胞アトラスプロジェクトの現在地

鹿島幸恵, 鈴木穣

医学のあゆみ 286(3) 202-207 2023年7月15日
【バイオDBとウェブツールラボで使える最新70選知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤】(第8章)疾患に関するゲノムやバリアントを調べるマルチオミクス DBKERO 疾患ヒトゲノム変異の生物学的機能注釈をめざした多階層オミクス統合データベース

鹿島幸恵, 鈴木絢子, 中井謙太, 鈴木穣

実験医学 40(17) 2911-2914 2022年11月
CENP-E阻害剤による染色体不均等分配は小核形成を誘導することでcGAS-STING経路を活性化する(CENP-Einhibitors activate the cGAS-STING pathway by inducing micronucleus formation after chromosome missegregation)

鎌田諒, 箱崎優美, 鹿島幸恵, 山盛智子[森田], Lu Pinyi, 大橋紹宏

日本癌学会総会記事 81回 LBP-8 2022年9月
シングルセル解析技術・手法のアップデート—Update of single cell omics technologies—特集シングルセル解析の新たな可能性

鹿島幸恵, 鈴木絢子, 関真秀, 鈴木穣

Precision medicine = プレシジョンメディシン / 「Precision medicine」編集委員会編 4(8) 717-721 2021年7月
第1土曜特集 1細胞解析--技術と応用応用感染症の1細胞解析

鹿島幸恵, 鈴木穣, 立川(川名) 愛

医学のあゆみ 276(10) 972-976 2021年3月6日
トランスクリプトーム解析

鹿島幸恵, 鈴木絢子, 鈴木穣

遺伝子医学 = Gene & medicine 11(1) 2021年1月
RNA-seq

鈴木絢子, 鹿島幸恵, 関真秀, 鈴木穣

遺伝子医学 = Gene & medicine 10(4) 128-134 2020年10月
エピゲノム解析—Epigenome sequencing—特集ビッグデータ時代のゲノム医学 ; ゲノム医学の進歩

鈴木絢子, 鹿島幸恵, 関真秀, 鈴木穣

生体の科学 71(2) 102-107 2020年
【シングルセルゲノミクス組織の機能、病態が1細胞レベルで見えてきた!】(第1章)総論プロジェクト・技術の動向シングルセルゲノミクスのプラットフォーム

関真秀, 土屋一成, 鹿島幸恵, 鈴木絢子, 鈴木穣

実験医学 37(20) 3336-3344 2019年12月

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共同研究・競争的資金等の研究課題

空間オミクス解析に免疫反応多様性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2025年4月 - 2028年3月

鹿島幸恵
がん染色体不安定性（CIN）パラドックスの解明とCIN脆弱性を狙った新規治療法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

大橋紹宏, 中井一貴, 山下大生, 鎌田諒, 波江野洋, 鹿島幸恵
BRCA2非翻訳領域上に存在する新規生殖細胞突然変異のメカニズム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2020年10月 - 2024年3月

大橋紹宏, 向原徹, 桑田健, 堀居拓郎, 鹿島幸恵
新規CDC7キナーゼ阻害剤TAK-931の併用療法開発に向けた橋渡し研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

大橋紹宏, 影山俊一郎, 小林進, 鹿島幸恵
肺腺がんにおけるEGFR-TKI耐性機構の一細胞解析による解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2019年4月 - 2022年3月

鹿島幸恵

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