熊谷雄太郎 (Yutaro Kumagai) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人産業技術総合研究所創薬基盤研究部門主任研究員

学位: 博士（医学）(大阪大学)
修士（工学）(東京工業大学)

研究者番号: 00528408
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-5039-3979
J-GLOBAL ID: 201601016393714457
researchmap会員ID: B000251321

外部リンク: http://ykumagai.strikingly.com/

研究キーワード

研究分野

経歴

2013年

大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任助教

論文

Bacterial extracellular vesicle ssRNA prevents colorectal cancer progression via Piezo1.

Takeshi Kondo, Yasunori Takayama, Yutaro Kumagai, Naoki Takemura, Shigetsugu Hatakeyama, Makoto Tominaga, Kenta Maruyama

Cell reports 45(1) 116737-116737 2025年12月17日
In Silico Analysis Revealed Marco (SR-A6) and Abca1/2 as Potential Regulators of Lipid Metabolism in M1 Macrophage Hysteresis.

Yubo Zhang, Wenbo Yang, Yutaro Kumagai, Martin Loza, Yitao Yang, Sung-Joon Park, Kenta Nakai

International journal of molecular sciences 26(1) 2024年12月26日
BootCellNet, a resampling-based procedure, promotes unsupervised identification of cell populations via robust inference of gene regulatory networks.

Yutaro Kumagai

PLoS computational biology 20(9) e1012480 2024年9月
An engineered ligand-responsive Csy4 endoribonuclease controls transgene expression from Sendai virus vectors.

Takumi Kishimoto, Ken Nishimura, Kana Morishita, Aya Fukuda, Yusaku Miyamae, Yutaro Kumagai, Kimio Sumaru, Mahito Nakanishi, Koji Hisatake, Masayuki Sano

Journal of biological engineering 18(1) 9-9 2024年1月16日
Extensive Computational Screening Identifies Marco (SR-A6) and Abca1/2 as Key Regulators of Intracellular Lipid Metabolism to Compensate Low Cholesterol Biosynthesis in M1 Macrophages Hysteresis

Yutaro Kumagai

Preprints 2024年
A multiomics atlas of brown adipose tissue development over time

Yutaro Kumagai, Yutaka Saito, Yasuyuki S Kida

Endocrinology 2023年4月21日
Multi-omics computational analysis unveils the involvement of AP-1 and CTCF in hysteresis of chromatin states during macrophage polarization.

Yubo Zhang, Wenbo Yang, Yutaro Kumagai, Martin Loza, Weihang Zhang, Sung-Joon Park, Kenta Nakai

Frontiers in immunology 14 1304778-1304778 2023年
Nociceptor-derived Reg3γ prevents endotoxic death by targeting kynurenine pathway in microglia

Erika Sugisawa, Takeshi Kondo, Yutaro Kumagai, Hiroki Kato, Yasunori Takayama, Kayako Isohashi, Eku Shimosegawa, Naoki Takemura, Yoshinori Hayashi, Takuya Sasaki …

Cell Reports 38(10) 110462-110462 2022年3月
Therapeutic Potential of Adipose Stem Cell-Derived Conditioned Medium on Scar Contraction Model

Imai, Y., Mori, N., Nihashi, Y., Kumagai, Y., Shibuya, Y., Oshima, J., Sasaki, M., Sasaki, K., Aihara, Y., Sekido, M. …

Biomedicines 10(10) 2022年
Adipose-derived mesenchymal stem cells differentiate into heterogeneous cancer-associated fibroblasts in a stroma-rich xenograft model

Yoshihiro Miyazaki, Tatsuya Oda, Yuki Inagaki, Hiroko Kushige, Yutaka Saito, Nobuhito Mori, Yuzo Takayama, Yutaro Kumagai, Toutai Mitsuyama, Yasuyuki S. Kida

Scientific Reports 11(1) 2021年12月査読有り
Requirement of the ltsa protein for formation of the mycolic acid-containing layer on the cell surface of Corynebacterium glutamicum

Kumagai, Y., Hirasawa, T., Wachi, M.

Microorganisms 9(2) 2021年
Zinc Finger Protein St18 Protects against Septic Death by Inhibiting VEGF-A from Macrophages

Kenta Maruyama, Hiroyasu Kidoya, Naoki Takemura, Erika Sugisawa, Osamu Takeuchi, Takeshi Kondo, Mohammed Mansour Abbas Eid, Hiroki Tanaka, Mikaël M. Martino, Nobuyuki Takakura …

Cell Reports 32(2) 107906-107906 2020年7月査読有り
RNA Sensing by Gut Piezo1 Is Essential for Systemic Serotonin Synthesis

Erika Sugisawa, Yasunori Takayama, Naoki Takemura, Takeshi Kondo, Shigetsugu Hatakeyama, Yutaro Kumagai, Masataka Sunagawa, Makoto Tominaga, Kenta Maruyama

Cell 2020年7月査読有り
Selective Induction of Human Autonomic Neurons Enables Precise Control of Cardiomyocyte Beating.

Yuzo Takayama, Hiroko Kushige, Yuka Akagi, Yutaka Suzuki, Yutaro Kumagai, Yasuyuki S Kida

Scientific reports 10(1) 9464-9464 2020年6月11日査読有り
Waves of chromatin modifications in mouse dendritic cells in response to LPS stimulation.

Alexis Vandenbon, Yutaro Kumagai, Mengjie Lin, Yutaka Suzuki, Kenta Nakai

Genome biology 19(1) 138-138 2018年9月19日査読有り
Waves of chromatin modifications in mouse dendritic cells in response to LPS stimulation

Vandenbon, A., Kumagai, Y., Lin, M., Suzuki, Y., Nakai, K.

Genome Biology 19(1) 138 2018年9月査読有り
The ATP Transporter VNUT Mediates Induction of Dectin-1-Triggered Candida Nociception.

Kenta Maruyama, Yasunori Takayama, Erika Sugisawa, Yu Yamanoi, Takashi Yokawa, Takeshi Kondo, Ken-Ichi Ishibashi, Bikash Ranjan Sahoo, Naoki Takemura, Yuki Mori …

iScience 6 306-318 2018年8月31日査読有り
Estimation of diffusion constants from single molecular measurement without explicit tracking

Shunsuke Teraguchi, Yutaro Kumagai

BMC Systems Biology 12(Suppl 1) 15 2018年4月11日査読有り
Eosinophil depletion suppresses radiation-induced small intestinal fibrosis.

Naoki Takemura, Yosuke Kurashima, Yuki Mori, Kazuki Okada, Takayuki Ogino, Hideki Osawa, Hirosih Matsuno, Lamichhane Aayam, Satoshi Kaneto, Eun Jeong Park …

Science translational medicine 10(429) 2018年2月21日査読有り
Intracellular Protein-Labeling Probes for Multicolor Single-Molecule Imaging of Immune Receptor-Adaptor Molecular Dynamics

Ryota Sato, Jun Kozuka, Masahiro Ueda, Reiko Mishima, Yutaro Kumagai, Akimasa Yoshimura, Masafumi Minoshima, Shin Mizukami, Kazuya Kikuchi

JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 139(48) 17397-17404 2017年12月査読有り

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MISC

Intestinal Lin-c-Kit+NKp46-CD4-population highly produces IL-22 upon IL-1 beta stimulation

Youngae Lee, Yutaro Kumagai, Min Seong Jang, Jung-Hwan Kim, Bo-Gie Yang, Shizuo Akira, Myoung Ho Jang

JOURNAL OF IMMUNOLOGY 190 2013年5月
敗血症発症とPattern-recognition receptors (PRRs) (特集凝固炎症反応連関からみた敗血症の病態と治療)

熊谷雄太郎, 審良静男

Thrombosis medicine 1(2) 125-133 2011年11月
Type-I interferon modulates monocyte recruitment and maturation in chronic inflammation

Pui Y. Lee, Yi Li, Yutaro Kumagai, Jason Weinstein, Dina Nacionales, Edward Butfiloski, Erinn Kellner, Shizuo Akira, Eric Sobel, Minoru Satoh …

JOURNAL OF IMMUNOLOGY 182 2009年4月
自然免疫研究の最前線

熊谷雄太郎, 齊藤達哉, 審良静男

アレルギー 58(6) 638-647 2009年
Tlr-7-dependent and Fc gamma R-independent production of type I interferon in experimental murine lupus

Pui Y. Lee, Yutaro Kumagai, Yi Li, Jason Weinstein, Osamu Takeuchi, Dina Nacionales, Tole Barker, Taro Kawai, Minoru Satoh, Shizuo Akira …

ARTHRITIS AND RHEUMATISM 58(9) S903-S903 2008年9月
RNAウイルスの認識戦略

熊谷雄太郎, 審良静男

細胞工学 27(6) 607-612 2008年6月
自然免疫--システム生物学的アプローチの果たしうる役割 (第1土曜特集システム生物医学) -- (疾患のシステム生物医学)

熊谷雄太郎, 竹内理, 審良静男

医学のあゆみ 219(9) 707-713 2006年12月2日

共同研究・競争的資金等の研究課題

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成) 2022年4月 - 2028年3月

黒川顕, 川嶋実苗, 豊田敦, 鈴木穣, 林哲也, 中村保一, 森宙史, 野口英樹, 浅井潔, 岩崎渉, 森下真一, 笠原雅弘, 伊藤武彦, 瀬々潤, 中谷明弘, 島村徹平, 波江野洋, 熊谷雄太郎, 高橋弘喜, 平川英樹, 浜田道昭, 山田拓司
確率的描像による生体応答ダイナミクス記述の理論と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2025年3月

熊谷雄太郎
リバーストランスレーショナルアプローチによる動物の脳波による痛み評価法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

中江文, 熊谷雄太郎, 中井國博
オミクスデータを統合する数理的手法による免疫系モデル構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年7月 - 2021年3月

熊谷雄太郎
抗ウイルス免疫応答における新規細胞間接触依存シグナル伝達経路の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2017年4月 - 2019年3月

熊谷雄太郎
痛みの慢性化のきっかけとなる脳への細胞分子伝達メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2019年3月

中江文, 熊谷雄太郎, 中井國博, 吉岡芳親
喫煙によって引き起こされる慢性炎症の発症メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2013年4月 - 2017年3月

ディエスディエゴ, 熊谷雄太郎
核酸修飾酵素を用いた新規原理によるＲＮＡ結合タンパク質ターゲットの網羅的同定

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2015年3月

熊谷雄太郎
I型IFN産生細胞の生体内でのモニタリングと同定

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2009年 - 2010年

熊谷雄太郎