松本悠希 (Yuki Matsumoto) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻准教授

J-GLOBAL ID: 201801008061606245
researchmap会員ID: B000289889

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 / 非結核性抗酸菌次世代シーケンシングゲノミクス進化生物学

経歴

2026年4月 - 現在

大阪大学, 大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻, 准教授
2022年 - 2026年3月

大阪大学, 微生物病研究所附属遺伝情報実験センター, 特任助教（常勤）
2017年 - 2022年

大阪大学, 微生物病研究所附属遺伝情報実験センター, 特任研究員（常勤）
2014年 - 2016年

特定国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 特別研究員
2014年 - 2014年

筑波大学, 生命環境科学研究科, 研究員

論文

Mycobacterium brisbanense Pulmonary Disease Treated with a Macrolide-Based Multidrug Regimen: A Case Report.

Yuki Nakaya, Kazuki Hashimoto, Kiyoharu Fukushima, Mutiara Fatimah, Yuki Matsumoto, Atsushi Funauchi, Akihiro Tsukaguchi, Keijiro Yamauchi, Akito Miyazaki, Yuki Iwahashi …

Internal medicine (Tokyo, Japan) 2026年6月11日
Comparison of culture and culture-free methods for comprehensive identification of mycobacteria: a single-center prospective study.

Kazuki Hashimoto, Kiyoharu Fukushima, Yuki Matsumoto, Haruko Saito, Atsushi Funauchi, Nanako Hamada, June Yamauchi, Tadayoshi Nitta, Daisuke Motooka, Takuro Nii …

Journal of clinical microbiology 64(4) e0112825 2026年4月8日査読有り
Gastric Aspirate Isolate Demonstrates Strain-Level Concordance With Sputum Isolate in Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease

Atsushi Funauchi, Kazuki Hashimoto, Kiyoharu Fukushima, Yuki Matsumoto, Nanako Hamada, Reina Hara, Takayuki Niitsu, Takuro Nii, Takanori Matsuki, Kazuyuki Tsujino …

OPEN FORUM INFECTIOUS DISEASES 13(4) 2026年4月査読有り
Fomite transmission of Mycobacterium abscessus between severely disabled patients.

Shiomi Yoshida, Yuki Matsumoto, Aya Kajihara, Masahisa Funato, Kazunari Tsuyuguchi, Satoshi Mitarai, Kiyoshi Takemoto, Shota Nakamura

Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases 2026年3月10日査読有り筆頭著者
Non-tuberculous Mycobacterial pulmonary disease due to novel mycobacterium: Mycobacterium habikinoensis: a case report.

Kyohei Maeda, Yoshitaka Tamura, Yuta Nagai, Yuki Kariya, Hiroki Katsuta, Naoko Ajiro, Hiroko Yoshida, Yuki Han, Shoji Hashimoto, Kinuyo Chikamatsu …

BMC infectious diseases 26(1) 2026年3月7日査読有り
Complete genome sequence of a new Mycobacterium sp. nov. from a compromised Japanese individual.

Nobuhiro Asai, Yuriko Igarashi, Narimi Miyazaki, Asami Osugi, Yuki Matsumoto, Shota Nakamura, Satoshi Mitarai, Hiroshige Mikamo

Microbiology resource announcements 15(2) e0042125 2026年2月12日査読有り
First reported recovery and genomic characterization of a previously uncharacterized Mycobacterium species from human blood cultures in an immunocompromised patient: A case report

Nobuhiro Asai, Yuriko Igarashi, Narimi Miyazaki, Arufumi Shiota, Yuka Yamagishi, Akiko Nakamura, Asami Osugi, Yuki Matsumoto, Shota Nakamura, Satsuki Murakami …

IDCases 2026年
IR Biotyperを用いた菌株分類の試み

安達史恵, 原直寛, 菅原庸, 松本悠希, 左近直美, 元岡大祐, 菅井基行, 河原隆二

日本臨床微生物学会雑誌 36(Suppl.1) 342-342 2025年12月
Evaluation of mlstverse system for accurate subspecies identification and drug resistance prediction in Mycobacterium abscessus species.

Wakako Arakaki, Takeshi Kinjo, Wakaki Kami, Hiroe Hashioka, Daijiro Nabeya, Hiroaki Nagano, Shiomi Yoshida, Kazunari Tsuyuguchi, Yuki Matsumoto, Shota Nakamura …

Microbiology spectrum 13(9) e0064325 2025年9月2日査読有り
Molecular epidemiological surveillance for non-tuberculous mycobacterial pulmonary disease: a single-center prospective cohort study.

Kazuki Hashimoto, Kiyoharu Fukushima, Yuki Matsumoto, Haruko Saito, Atsushi Funauchi, Nanako Hamada, Takayuki Niitsu, Yuko Abe, June Yamauchi, Tadayoshi Nitta …

Microbiology spectrum 13(10) e0043625 2025年8月21日査読有り
Microbiota-driven antitumour immunity mediated by dendritic cell migration.

Nina Yi-Tzu Lin, Shota Fukuoka, Shohei Koyama, Daisuke Motooka, Dieter M Tourlousse, Yuko Shigeno, Yuki Matsumoto, Hiroyuki Yamano, Kazutoshi Murotomi, Hideyuki Tamaki …

Nature 644(8078) 1058-1068 2025年8月1日査読有り
mlstverse-web: advancing real-time identification of mycobacteria from sputum using targeted sequencing NALC-Seq.

Yuki Matsumoto, Kiyoharu Fukushima, Shunran Zhang, Yuzy Fauzyah, Daisuke Motooka, Haruko Saito, June Yamauchi, Tadayoshi Nitta, Takuro Nii, Takanori Matsuki …

Functional & integrative genomics 25(1) 105-105 2025年5月21日査読有り筆頭著者
肺非結核性抗酸菌症患者の喀痰検体から分離された新種と思われるMycobacterium sp.の一例

前田恭兵, 永井裕太, 仮屋勇希, 韓由紀, 橋本章司, 田村嘉孝, 中村昇太, 永井崇之, 松本悠希

結核 100(3) 178-178 2025年5月
Identification of 2 Novel Species, Mycobacterium novusgordonae and M. shingordonae

Kazuki Hashimoto, Yuko Abe, Kiyoharu Fukushima, Yuki Matsumoto, Haruko Saito, Yuri Akamine, Takayuki Niitsu, June Yamauchi, Tadayoshi Nitta, Michio Tanaka …

Emerging Infectious Diseases 31(3) 2025年3月査読有り
Catheter-related bloodstream infection by a newly proposed "Mycobacterium toneyamachuris" in a boy with B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia.

Haruki Naruse, Noriyuki Watanabe, Atsuhiko Ohta, Yuuki Shimizu, Takashi Fukushima, Atsuko Watanabe, Tomohei Nakao, Yoshitada Taji, Yuki Matsumoto, Shota Nakamura …

Diagnostic microbiology and infectious disease 111(3) 116626-116626 2025年3月1日査読有り
Variability of macrolide-resistant profile in Mycobacterium avium complex pulmonary disease.

Kiyoharu Fukushima, Yuki Matsumoto, Yuko Abe, Kazuki Hashimoto, Daisuke Motooka, Seigo Kitada, Haruko Saito, Sho Komukai, Eriko Fukui, Takayuki Niitsu …

Antimicrobial agents and chemotherapy 68(11) e0121324 2024年11月6日査読有り筆頭著者
培養陰性の硬膜下膿瘍に対するSrRNA遺伝子の次世代シークエンス(NGS)解析

水嶋啓人, 漆畑伶, 平出拓也, 小坂カロリナアンドレア, 松本悠希, 元岡大祐, 中村昇太, 宮入烈

日本小児感染症学会総会・学術集会プログラム・抄録集 56回 187-187 2024年11月
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌のMobile Genetic Element解析を用いた院内伝播推定

宮入烈, 吉田カロリナアンドレア, 磯部裕介, 上野大蔵, 中村昇太, 松本悠希

日本小児感染症学会総会・学術集会プログラム・抄録集 56回 214-214 2024年11月
Non-tuberculosis Mycobacterial Pulmonary Disease Caused by Mycobacterium kiyosense, a New Species.

Kotaro Yamada, Takafumi Koyauchi, Koshi Yokomura, Taiga Fujita, Hiroki Sugiyama, Ryo Shimota, Nobuhiro Shimura, Yuki Matsumoto, Shota Nakamura, Kinuyo Chikamatsu …

Internal medicine (Tokyo, Japan) 63(13) 1913-1916 2024年7月1日査読有り
ART導入後にMycobacterium kyorinenseによる肺病変が出現し、免疫再構築症候群が疑われた後天性免疫不全症候群の一例

國吉健太, 新垣若子, 金城武士, 池宮城七重, 宮城一也, 松本悠希, 中村昇太, 田里大輔, 山本和子

結核 99(3) 122-122 2024年5月

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MISC

世界の結核研究の動向(48)結核に潜む非結核性抗酸菌症-世界的な動向と同定への取り組みについて

松本悠希, 中村昇太

複十字 (424) 2025年
非結核性抗酸菌の迅速その場同定-臨床現場での微生物ゲノム解析の現状と今後の展望-

中村昇太, 松本悠希, 福島清春, 飯田哲也

日本微生物資源学会誌 41(1) 2025年
肺Mycobacterium avium complex症におけるマクロライド耐性化の可塑性

船内敦司, 安部祐子, 福島清春, 松本悠希, 北田清悟, 元岡大佑, 橋本和樹, 新津敬之, 新居卓郎, 松木隆典 …

結核(Web) 100(3) 2025年
メチシリン耐性黄色ブドウ球菌のMobile Genetic Element解析を用いた院内伝播推定

宮入烈, 吉田カロリナアンドレア, 磯部裕介, 上野大蔵, 中村昇太, 松本悠希

日本小児感染症学会総会・学術集会プログラム・抄録集 56th 2024年
重症心身障害児施設におけるM.abscessus subsp.massilienseの院内感染事例

吉田志緒美, 露口一成, 青野昭男, 五十嵐ゆり子, 松本悠希, 中村昇太, 能田淳, 御手洗聡, 井上義一, 竹本潔 …

結核 98(4) 118-118 2023年6月

書籍等出版物

菌同定の最新研究ーベッドサイドで全ゲノムシーケンス

濱田奈々子, 福島清春, 松本悠希, 中村昇太

非結核性抗酸菌症診療 Up to Date,南江堂 2025年4月
世界の結核研究の動向(48)結核に潜む非結核性抗酸菌症-世界的な動向と同定への取り組みについて

松本悠希, 中村昇太

2025年
Rapid and Comprehensive Identification of Nontuberculous Mycobacteria.

Yuki Matsumoto, Shota Nakamura

2023年2月14日査読有り

講演・口頭発表等

ナノポアシーケンサーを用いたリアルタイムゲノム同定基盤の開発と臨床実装

松本悠希

第157回MPS・第85回BIO合同研究発表会 2026年7月3日
Mycobacterium abscessus subsp.massilienseによる院内感染伝播事例における菌ゲノム追跡調査

吉田志緒美, 露口一成, 青野昭男, 中村昇太, 御手洗聡, 松本悠希, 竹本潔, 鞍谷沙織, 船戸正久, 梶原綾, 能田淳

感染症学雑誌 2026年1月 (一社)日本感染症学会
IR Biotyperを用いた菌株分類の試み

安達史恵, 原直寛, 菅原庸, 松本悠希, 左近直美, 元岡大祐, 菅井基行, 河原隆二

日本臨床微生物学会雑誌 2025年12月 (一社)日本臨床微生物学会
喀痰検体からのNTM迅速診断：Culture-free法の開発

橋本和樹, 福島清春, 松本悠希, 船内敦司, 新居卓朗, 松木隆典, 辻野和之, 三木啓資, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

第100回日本結核・非結核性抗酸菌症学会学術講演会 2025年6月
NGSを用いた新しい分子疫学解析法: Digital VNTR

橋本和樹, 福島清春, 松本悠希, 船内敦司, 新居卓朗, 松木隆典, 辻野和之, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

第100回日本結核・非結核性抗酸菌症学会学術講演会 2025年6月
肺非結核性抗酸菌症患者の喀痰検体から分離された新種と思われるMycobacterium sp.の一例

前田恭兵, 永井裕太, 仮屋勇希, 韓由紀, 橋本章司, 田村嘉孝, 中村昇太, 永井崇之, 松本悠希

結核 2025年5月 (一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会
M.abscessus subsp.massilienseの院内感染事例におけるゲノム疫学調査による伝播の推定と感染防止介入の有効性評価

吉田志緒美, 露口一成, 松本悠希, 中村昇太, 倉原優, 小林岳彦, 田中悠也, 御手洗聡

結核 2025年5月 (一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会
肺Mycobacterium avium complex症におけるマクロライド耐性化の可塑性

船内敦司, 安部祐子, 福島清春, 松本悠希, 北田清悟, 元岡大佑, 橋本和樹, 新津敬之, 新居卓郎, 松木隆典, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

結核 2025年5月 (一社)日本結核・非結核性抗酸菌症学会
肺非結核性抗酸菌症の菌種およびクローンの経時的変化単施設前向きコホート研究

橋本和樹, 福島清春, 松本悠希, 船内敦司, 新津敬之, 安部祐子, 新居卓朗, 松木隆典, 辻野和之, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

日本呼吸器学会誌 2025年3月 (一社)日本呼吸器学会
呼吸器感染症の基礎的研究 NGSを用いた喀痰検体からのNTM迅速診断 NALC-Seq法

橋本和樹, 福島清春, 松本悠希, 船内敦司, 新津敬之, 安部祐子, 新居卓朗, 松木隆典, 辻野和之, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

日本呼吸器学会誌 2025年3月 (一社)日本呼吸器学会
肺非結核性抗酸菌症ゲノム解析で明らかになった新種Mycobacterium gordonaeの報告

新居卓朗, 福島清春, 松本悠希, 元岡大祐, 中村昇太, 木田博

日本呼吸器学会誌 2025年3月 (一社)日本呼吸器学会
Rapid Mycobacterial Identification with NALC-Seq and mlstverse-web

松本悠希

2025 International Conference on Emerging Infectious Diseases in the Pacific Rim 2025年3月
Genetic evolution and host switch of Vibrio parahaemolyticus from aquatic birds (Brown-headed gull) and aquatic reservoirs in Thailand

松本悠希

2025 International Conference on Emerging Infectious Diseases in the Pacific Rim 2025年3月
非結核性抗酸菌の迅速その場同定-臨床現場での微生物ゲノム解析の現状と今後の展望-

中村昇太, 松本悠希, 福島清春, 飯田哲也

日本微生物資源学会誌 2025年
M.abscessus subsp.massilienseの院内感染事例におけるゲノム疫学調査による伝播の推定と感染防止介入の有効性評価

吉田志緒美, 露口一成, 露口一成, 露口一成, 松本悠希, 中村昇太, 倉原優, 倉原優, 倉原優, 小林岳彦, 田中悠也, 御手洗聡

結核(Web) 2025年
肺Mycobacterium avium complex症におけるマクロライド耐性化の可塑性

船内敦司, 安部祐子, 福島清春, 松本悠希, 北田清悟, 元岡大佑, 橋本和樹, 新津敬之, 新居卓郎, 松木隆典, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

結核(Web) 2025年
ゲノム解析で明らかになった新種Mycobacterium gordonaeの報告

新居卓朗, 福島清春, 松本悠希, 元岡大祐, 中村昇太, 木田博

日本呼吸器学会誌(Web) 2025年
肺非結核性抗酸菌症の菌種およびクローンの経時的変化:単施設前向きコホート研究

橋本和樹, 福島清春, 福島清春, 松本悠希, 船内敦司, 新津敬之, 安部祐子, 新居卓朗, 松木隆典, 辻野和之, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

日本呼吸器学会誌(Web) 2025年
NGSを用いた喀痰検体からのNTM迅速診断:NALC-Seq法

橋本和樹, 福島清春, 福島清春, 松本悠希, 船内敦司, 新津敬之, 安部祐子, 新居卓朗, 松木隆典, 辻野和之, 熊ノ郷淳, 中村昇太, 木田博

日本呼吸器学会誌(Web) 2025年
遺伝子解析により新種と判明したMycobacterium gordonae

齋藤晴子, 山内寿音, 新田忠善, 松本悠希, 元岡大祐, 中村昇太, 福島清春, 木田博

日本臨床微生物学会雑誌 2024年12月 (一社)日本臨床微生物学会

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担当経験のある科目(授業)

2026年4月 - 現在

生物分子情報解析
2026年4月 - 現在

バイオ情報工学演習I
2026年4月 - 現在

バイオ情報工学セミナーI
2026年4月 - 現在

応用バイオ情報論
2026年4月 - 現在

バイオ情報工学研究IIa
2026年4月 - 現在

バイオ情報工学研究Ia
2026年4月 - 現在

バイオ情報工学入門
2026年 - 現在

生命医工学セミナー

共同研究・競争的資金等の研究課題

ゲノム解析による非結核性抗酸菌の高精度迅速同定および薬剤感受性判定システムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

金城武士, 鍋谷大二郎, 松本悠希
インドネシアに流行する抗酸菌のゲノム疫学研究

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2020年10月 - 2023年3月

中村昇太, 松本悠希, 金城武士
非結核性抗酸菌同定のためのメタゲノム解析法とゲノムデータベースの確立

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2019年4月 - 2022年3月

松本悠希

学術貢献活動

NGS EXPO 2022

その他

大阪大学免疫学フロンティア研究センター・大阪大学微生物病研究所 2022年10月

松本悠希

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研究分野

経歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

学術貢献活動

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