尾形善之 (Yoshiyuki Ogata) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪公立大学大学院農学研究科

J-GLOBAL ID: 201801004524729583
researchmap会員ID: B000327685

外部リンク: http://www.biosci.osakafu-u.ac.jp/ogata/

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

公立大学法人大阪大阪公立大学, 大学院農学研究科, 准教授 (農学博士)

受賞

2010年9月

奨励賞, 日本植物細胞分子生物学会

尾形善之

論文

Genetic Mapping of the HLA1 Locus Causing Hybrid Lethality in Nicotiana Interspecific Hybrids

Takahiro Tezuka, Naoto Kitamura, Sae Imagawa, Akira Hasegawa, Kumpei Shiragaki, Hai He, Masanori Yanase, Yoshiyuki Ogata, Toshinobu Morikawa, Shuji Yokoi

Plants 10(10) 2062-2062 2021年9月30日
Chemical genetic approach using β-rubromycin reveals that a RIO kinase-like protein is involved in morphological development in Phytophthora infestans.

Shuji Tani, Naotaka Nishio, Kenji Kai, Daisuke Hagiwara, Yoshiyuki Ogata, Motoaki Tojo, Jun-Ichi Sumitani, Howard S Judelson, Takashi Kawaguchi

Scientific reports 10(1) 22326-22326 2020年12月18日
An Artificial Conversion of Roots into Organs with Shoot Stem Characteristics by Inducing Two Transcription Factors.

Shigeru Hanano, Hajime Tomatsu, Ai Ohnishi, Koichi Kobayashi, Yuki Kondo, Shigeyuki Betsuyaku, Eiji Takita, Yoshiyuki Ogata, Keishi Ozawa, Kunihiro Suda …

iScience 23(7) 101332-101332 2020年7月24日
Gcorn Plant: A Database for Retrieving Functional and Evolutionary Traits of Plant Genes

Plant Physiol 180(2) 732-742 2019年6月査読有り
Correlation between toll-like receptor 4 and nucleotide-binding oligomerization domain 2 (NOD2) and pathological severity in dogs with chronic gastrointestinal diseases.

Kimiya Aono, Yasu-Taka Azuma, Tomoyo Nabetani, Shingo Hatoya, Masaru Furuya, Mariko Miki, Kana Hirota, Yasuyuki Fujimoto, Kazuhiro Nishiyama, Yoshiyuki Ogata …

Veterinary immunology and immunopathology 210 15-22 2019年4月査読有り
Gene cloning, expression, and X-ray crystallographic analysis of a β-mannanase from Eisenia fetida

Enzyme Microb Technol 117 15-22 2018年10月査読有り
ConfeitoGUI: A toolkit for size-sensitive community detection from a correlation network

PLoS One 13(10) e0206075 2018年10月査読有り
Pathway-specific metabolome analysis with 18O2-labeled Medicago truncatula via a mass spectrometry-based approach

Kota Kera, Dennis D. Fine, Daniel J. Wherritt, Yoshiki Nagashima, Norimoto Shimada, Takeshi Ara, Yoshiyuki Ogata, Lloyd W. Sumner, Hideyuki Suzuki

Metabolomics 14(5) 71 2018年5月1日査読有り
Quantitative Proteomic Analysis of the Response to Zinc, Magnesium, and Calcium Deficiency in Specific Cell Types of Arabidopsis Roots

Proteomes 4(1) pii: E1-1 2016年1月査読有り
Identification of putative target genes of bZIP19, a transcription factor essential for Arabidopsis adaptation to Zn deficiency in roots

Shoko Inaba, Rie Kurata, Mami Kobayashi, Yoko Yamagishi, Izumi Mori, Yoshiyuki Ogata, Yoichiro Fukao

PLANT JOURNAL 84(2) 323-334 2015年10月査読有り
Multiomics in Grape Berry Skin Revealed Specific Induction of the Stilbene Synthetic Pathway by Ultraviolet-C Irradiation

Mami Suzuki, Ryo Nakabayashi, Yoshiyuki Ogata, Nozomu Sakurai, Toshiaki Tokimatsu, Susumu Goto, Makoto Suzuki, Michal Jasinski, Enrico Martinoia, Shungo Otagaki …

PLANT PHYSIOLOGY 168(1) 47-59 2015年5月査読有り
A bioinformatics approach to distinguish plant parasite and host transcriptomes in interface tissue by classifying RNA-Seq reads

Daisuke Ikeue, Christian Schudoma, Wenna Zhang, Yoshiyuki Ogata, Tomoaki Sakamoto, Tetsuya Kurata, Takeshi Furuhashi, Friedrich Kragler, Koh Aoki

PLANT METHODS 11 34 2015年5月査読有り
Quantitative proteomics of Arabidopsis shoot microsomal proteins reveals a cross-talk between excess zinc and iron deficiency

Sajad Majeed Zargar, Rie Kurata, Shoko Inaba, Akira Oikawa, Risa Fukui, Yoshiyuki Ogata, Ganesh Kumar Agrawal, Randeep Rakwal, Yoichiro Fukao

PROTEOMICS 15(7) 1196-1201 2015年4月査読有り
Potential Biomarkers of Fatigue Identified by Plasma Metabolome Analysis in Rats

Satoshi Kume, Masanori Yamato, Yasuhisa Tamura, Guanghua Jin, Masayuki Nakano, Yukiharu Miyashige, Asami Eguchi, Yoshiyuki Ogata, Nobuhito Goda, Kazuhiro Iwai …

PLOS ONE 10(3) e0120106 2015年3月査読有り
Correlation analysis of proteins responsive to Zn, Mn, or Fe deficiency in Arabidopsis roots based on iTRAQ analysis

Sajad Majeed Zargar, Masayuki Fujiwara, Shoko Inaba, Mami Kobayashi, Rie Kurata, Yoshiyuki Ogata, Yoichiro Fukao

PLANT CELL REPORTS 34(1) 157-166 2015年1月査読有り
Quantitative transcriptional changes associated with chlorosis severity in mosaic leaves of tobacco plants infected with Cucumber mosaic virus

Tomofumi Mochizuki, Yoshiyuki Ogata, Yuki Hirata, Satoshi T. Ohki

MOLECULAR PLANT PATHOLOGY 15(3) 242-254 2014年4月査読有り
Identification of laticifer-specific genes and their promoter regions from a natural rubber producing plant Hevea brasiliensis

Yuichi Aoki, Seiji Takahashi, Daisuke Takayama, Yoshiyuki Ogata, Nozomu Sakurai, Hideyuki Suzuki, Kasem Asawatreratanakul, Dhirayos Wititsuwannakul, Rapepun Wititsuwannakul, Daisuke Shibata …

Plant Science 225 1-8 2014年査読有り
Tools and databases of the KOMICS web portal for preprocessing, mining, and dissemination of metabolomics data

Nozomu Sakurai, Takeshi Ara, Mitsuo Enomoto, Takeshi Motegi, Yoshihiko Morishita, Atsushi Kurabayashi, Yoko Iijima, Yoshiyuki Ogata, Daisuke Nakajima, Hideyuki Suzuki …

BioMed Research International 2014 2014年査読有り
Cellulose digestion and metabolism induced biocatalytic transitions in anaerobic microbial ecosystems

Akira Yamazawa, Tomohiro Iikura, Yusuke Morioka, Amiu Shino, Yoshiyuki Ogata, Yasuhiro Date, Jun Kikuchi

Metabolites 4(1) 36-52 2013年12月31日査読有り
Defects in IRE1 enhance cell death and fail to degrade mRNAs encoding secretory pathway proteins in the Arabidopsis unfolded protein response

Kei-Ichiro Mishiba, Yukihiro Nagashima, Eiji Suzukia, Noriko Hayashi, Yoshiyuki Ogata, Yukihisa Shimada, Nozomu Koizumi

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 110(14) 5713-5718 2013年4月2日査読有り

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MISC

ShiftedIonsFinder: A standalone Java tool for finding peaks with specified mass differences by comparing mass spectra of isotope-labeled and unlabeled data sets

Kota Kera, Yoshiyuki Ogata, Takeshi Ara, Yoshiki Nagashima, Norimoto Shimada, Nozomu Sakurai, Daisuke Shibata, Hideyuki Suzuki

Plant Biotechnology 31(3) 269-274 2014年
Functional genomics of tomato in a post-genome-sequencing phase

Koh Aoki, Yoshiyuki Ogata, Kaori Igarashi, Kentaro Yano, Hideki Nagasaki, Eli Kaminuma, Atsushi Toyoda

Breeding Science 63(1) 14-20 2013年4月25日
EST ANALYSIS OF TRANS-RUBBER PRODUCING PLANT, EUCOMMIA ULMOIDES OLIVER AND IDENTIFICATION OF CANDIDATE GENES IN TRANS-1,4-POLYISOPRENE PRODUCTION

Nobuaki Suzuki, Shinya Takeno, Hirotaka Uefuji, Takashi Nishikawa, Takeshi Bamba, Ei-ichiro Fukusaki, Akio Kobayashi, Yoshiyuki Ogata, Daisuke Shibata, Yoshihisa Nakazawa

PHARMACEUTICAL BIOLOGY 50(5) 668-668 2012年5月
植物の化学防御に関わる複数の二次代謝経路を制御する新規転写調節因子の同定と機能解析

嵯峨寛久, 小川拓水, 鈴木秀幸, 尾形善之, 櫻井望, 柴田大輔, 太田大策

日本植物生理学会年会要旨集 53rd 2012年
Development of KaPPA-View4 for omics studies on Jatropha and a database system KaPPA-Loader for construction of local omics databases

Nozomu Sakurai, Yoshiyuki Ogata, Takeshi Ara, Ryosuke Sano, Nayumi Akimoto, Atsushi Hiruta, Hideyuki Suzuki, Masataka Kajikawa, Utut Widyastuti, Sony Suharsono …

Plant Biotechnology 29(2) 131-135 2012年
Plant expressed sequence tags databases: practical uses and the improvement of their searches using network module analysis

Yoshiyuki Ogata, Hideyuki Suzuki

PLANT BIOTECHNOLOGY 28(4) 351-360 2011年
2Ep24 トランスポリイソプレン生合成のトランスクリプトーム解析(植物細胞工学・組織培養・育種工学,一般講演)

上藤,洋敬, 櫻井,望, 藤井,文子, 尾形,善之, 藤本,真梨子, 原田,陽子, 井上,純大, 陳,任, 李,雪紅, 平田,收正 …

日本生物工学会大会講演要旨集平成21年度 66 2009年8月25日
シロイヌナズナ培養細胞を用いた発現制御ネットワーク予測への大規模アプローチ

尾形善之, 藤井文子, 森下宜彦, 松浦貴志, 森久美子, 浅見結貴, 丹下喜恵, 茂木岳, 蛭田敦, 佐野亮輔 …

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 2009 193-193 2009年
シロイヌナズナ細胞壁形成関連遺伝子と共発現相関のある転写因子に関する機能解析

大野隆史, 尾形善之, 櫻井望, 青木考, 岡崎孝映, 鈴木秀幸, 斉藤和季, 柴田大輔

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 2008 131-131 2008年
植物代謝物の液体クロマトグラフィー―フーリエ変換質量分析計（LC/FT-ICR-MS）によるアノテーション

飯島陽子, 中村由紀子, 櫻井望, 尾形善之, 鈴木秀幸, 岡崎孝映, 金谷重彦, 青木考, 柴田大輔

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 2007 204-204 2007年
Functional analyses of cell wall formation-related genes estimated from Arabidopsis thaliana gene coexpression profiles

Takashi Ohno, Yoshiyuki Ogata, Nozomu Sakurai, Koh Aoki, Koei Okazaki, Hideyuki Suzuki, Kazuki Saito, Daisuke Shibata

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48 S69-S69 2007年
Conprehensive transcript and metabolite profilings for elucidation of regulatory network for isoprenoid biosynthesis

Ryosuke Sano, Yoshiyuki Ogata, Nozomu Sakurai, Koh Aoki, Koei Okazaki, Hideyuki Suzuki, Kazuki Saito, Daisuke Shibata

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48 S69-S69 2007年
KaPPA-View2: A plant metabolic pathway database and tool for gene expression correlation analysis

Nozomu Sakurai, Kiyoshi Yamazaki, Yoshiyuki Ogata, Koh Aoki, Koei Okazaki, Takeshi Obayashi, Hideyuki Suzuki, Kazuki Saito, Daisuke Shibata

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48 S68-S68 2007年
A novel algorithm for coexpression network analysis and its application to Arabidopsis genes

Yoshiyuki Ogata, Nozomu Sakurai, Koh Aoki, Koei Okazaki, Kazuki Saito, Daisuke Shibata

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 48 S125-S125 2007年
トランスクリプトームへのネットワーク解析によるシロイヌナズナ遺伝子の効率的な共発現予測

尾形善之, 櫻井望, 青木考, 鈴木秀幸, 斉藤和季, 柴田大輔

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 47 S50-S50 2006年
イソプレノイド合成経路の制御系の解明にむけた発現相関のネットーワーク解析

佐野亮輔, 尾形善之, 櫻井望, 青木孝, 鈴木秀幸, 斉藤和季, 柴田大輔

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 47 S51-S51 2006年
シロイヌナズナ遺伝子発現相関を利用した細胞壁形成関連遺伝子のネットワーク解析

大野隆史, 尾形善之, 櫻井望, 青木考, 鈴木秀幸, 斉藤和季, 柴田大輔

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 47 S51-S51 2006年
アミノ酸代謝系遺伝子群の発現相関ネットワーク解析

杉山健二郎, 平井優美, 尾形善之, 櫻井望, 青木考, 澤田有司, 峠隆之, 鈴木秀幸, 斉藤和季, 柴田大輔

日本植物生理学会年会およびシンポジウム講演要旨集 47 S51-S51 2006年

講演・口頭発表等

Gcorn：遺伝子の機能と進化を解析するデータベース

尾形善之, 木村尚寛, 佐野亮輔

第41回日本分子生物学会年会 2018年12月
配列相同性に基づいて植物遺伝子を検索するデータベースの構築

尾形善之

第68回日本木材学会大会 2018年3月
植物遺伝子の配列相同性ネットワーク解析

尾形善之

第59回日本植物生理学会年会 2018年3月
次世代シーケンサーをより簡便に活用する

尾形善之

日本生物工学会バイオインフォマティクス相談部会第一回講演会 2017年12月招待有り
RNA-Seq解析に基づいた植物遺伝子発現データベースPLAGOの構築と利用

木村尚寛, 鈴木秀幸, 尾形善之

第35回日本植物細胞分子生物学会大会 2017年8月
マイクロアレイデータに基づく植物遺伝子発現データベース

尾形善之, 櫻井望, 鈴木秀幸

第58回日本植物生理学会年会 2017年3月
緑茶の官能検査と質量分析との統合解析

杉山貴文, 鈴木秀幸, 尾形善之

第39回日本分子生物学会年会 2016年12月
次世代シーケンスデータを用いた植物の遺伝子発現データベースの構築

木村尚寛, 鈴木秀幸, 尾形善之

第39回日本分子生物学会年会 2016年12月
Analysis of three types of networks on plant genes, related to their evolution and diversity.

尾形善之

Cytochrome P450 Biodiversity & Biotechnology 2016 2016年7月招待有り
植物の遺伝子構成に対する比較ゲノミクス

尾形善之, 森本舞香

第66回日本木材学会大会 2016年3月
植物ゲノムとゲノム中の遺伝子を用いた相関ネットワーク解析

森本舞香, 尾形善之

第38回日本分子生物学会年会 2015年12月
実用植物の遺伝子発現解析データベースの構築と活用

尾形善之

宗行俊、櫻井望、尾形善之 2015年12月
ブドウの次世代シーケンスデータの実験間でのネットワーク解析と特異的発現遺伝子の探索

新居秀平, 中元雄亮, 尾形善之

第38回日本分子生物学会年会 2015年12月
植物遺伝子の配列および機能に関する大規模ネットワーク解析

尾形善之

第52回植物化学シンポジウム 2015年11月招待有り

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

ConfeitoGUI

尾形善之

2015年9月 - 現在コンピュータソフト

共同研究・競争的資金等の研究課題

都市緑地の植生を環境DNAメタバーコーディング法で把握するための基礎的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2025年3月

中山祐一郎, 保田謙太郎, 尾形善之, 阿久井康平
アクチン脱重合因子による新規核内DNA倍加制御機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

稲田のりこ, 尾形善之
RNA-Seq解析を用いた植物物質生産制御因子の単離及び最低解析数の統計学的検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

鈴木秀幸, 萬年一斗, 松田一彦, 尾形善之, 水谷正治
遺伝子共発現ネットワーク解析を用いたイソフラボノイド生合成関連転写因子の機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2011年 - 2013年

鈴木秀幸, 尾形善之, 明石智義
代謝物多様性解明に向けたマスフラグメンテーション解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究課題提案型) 2008年 - 2010年

鈴木秀幸, 青木考, 嶋田典基, 尾形善之, 櫻井望, 飯島陽子

産業財産権

特許6318334 相関ネットワーク解析プログラム

尾形善之

尾形善之

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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