石野良純 (Yoshizumi Ishino) - マイポータル

基本情報

所属: 九州大学大学院農学研究院生命機能科学部門生物機能分子化学講座生物化学分野教授

学位: 薬学博士(北海道大学)

研究者番号: 30346837
J-GLOBAL ID: 200901065275485481
researchmap会員ID: 5000031151

外部リンク: http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/lab/seibutsukagaku/

研究キーワード

研究分野

経歴

2002年6月 - 現在

九州大学大学院農学研究院
1996年4月 - 2002年5月

生物分子工学研究所
1983年4月 - 1996年3月

宝酒造株式会社, バイオ研究所
1987年8月 - 1989年8月

Yale大学, Post Doctoral Fellow
Principal Research Scientist, Biomolecular Engineering Research Institute

学歴

1983年6月 - 1987年2月

大阪大学微生物病研究所, 研究生
1981年4月 - 1983年3月

大阪大学大学院, 薬学研究科, 薬品化学専攻
- 1983年

大阪大学
1977年4月 - 1981年3月

大阪大学, 薬学部

受賞

2022年9月

日本遺伝学会木原賞, 日本遺伝学会

石野良純
2019年6月

遺伝学奨励賞, 公益財団法人遠州頌徳会遺伝学振興会

石野良純
2018年3月

農芸化学会賞, 日本農芸化学会

石野良純
2017年12月

第１回日本医療研究開発大賞文部科学大臣賞

石野良純

論文

220

Substrate specificity and action mechanism of the HerA-NurA nuclease from the hyperthermophilic archaeon Thermococcus kodakarensis

Keishiro Uda, Takeshi Yamagami, Sonoko Ishino, Christoph Gerle, Chai C. Gopalasingam, Hideki Shigematsu, Tomoyuki Numata, Yoshizumi Ishino

mBio 2026年2月5日
Multiple antiviral mechanisms of Ephedrae Herba and Cinnamomi Cortex against influenza: inhibition of entry and replication.

Aya Fujikane, Ryosuke Fujikane, Yusuke Sechi, Akinori Nishi, Yoshizumi Ishino, Tetsuya Hiyoshi, Atsuhiko Sakamoto, Shigeki Nabeshima

Microbiology spectrum 13(6) e0037125 2025年6月3日
Comparing PCR-generated artifacts of different polymerases for improved accuracy of DNA metabarcoding,

Satoshi Nagai, Sirje Sildever, Noriko Nishi, Satoshi Tazawa, Leila Basti, Takanori Kobayashi, Yoshizumi Ishino

Metabarcoding and Metagenomics 6 27-39 2022年2月査読有り
Ephedrae Herba and Cinnamomi Cortex interactions with G glycoprotein inhibit respiratory syncytial virus infectivity.

Aya Fujikane, Atsuhiko Sakamoto, Ryosuke Fujikane, Akinori Nishi, Yoshizumi Ishino, Kenji Hiromatsu, Shigeki Nabeshima

Communications biology 5(1) 94-94 2022年1月25日
Genetic and biochemical characterizations of aLhr1 helicase in the thermophilic crenarchaeon sulfolobus acidocaldarius

Shoji Suzuki, Norio Kurosawa, Takeshi Yamagami, Shunsuke Matsumoto, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino

Catalysts 12(1) 2022年1月
Development of a time-series shotgun metagenomics database for monitoring microbial communities at the Pacific coast of Japan

Kazutoshi Yoshitake, Gaku Kimura, Tomoko Sakami, Tsuyoshi Watanabe, Yukiko Taniuchi, Shigeho Kakehi, Akira Kuwata, Haruyo Yamaguchi, Takafumi Kataoka, Masanobu Kawachi …

Scientific Reports 11(1) 2021年12月
Family D DNA polymerase interacts with GINS to promote CMG-helicase in the archaeal replisome.

Keisuke Oki, Mariko Nagata, Takeshi Yamagami, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Takuji Oyama, Yoshizumi Ishino

Nucleic acids research 50(7) 3601-3615 2021年9月27日
New insights into the diversity and evolution of the archaeal mobilome from three complete genomes of Saccharolobus shibatae

Sofia Medvedeva, David Brandt, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Ying Liu, Konstantin Severinov, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino, David Prangishvili, Jörn Kalinowski, Mart Krupovic

Environmental Microbiology 23(8) 4612-4630 2021年8月1日
DNA polymerase D temporarily connects primase to the CMG-like helicase before interacting with proliferating cell nuclear antigen.

Keisuke Oki, Takeshi Yamagami, Mariko Nagata, Kouta Mayanagi, Tsuyoshi Shirai, Naruhiko Adachi, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino

Nucleic acids research 49(8) 4599-4612 2021年5月7日
Metagenomic analysis provides functional insights into seasonal change of a non-cyanobacterial prokaryotic community in temperate coastal waters.

Kaoru Matsumoto, Tomoko Sakami, Tsuyoshi Watanabe, Yukiko Taniuchi, Akira Kuwata, Shigeho Kakehi, Tan Engkong, Yoji Igarashi, Shigeharu Kinoshita, Shuichi Asakawa …

PloS one 16(10) e0257862 2021年査読有り
Two conformations of DNA polymerase D-PCNA-DNA, an archaeal replisome complex, revealed by cryo-electron microscopy

Kouta Mayanagi, Keisuke Oki, Naoyuki Miyazaki, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Kosuke Morikawa, Kenji Iwasaki, Daisuke Kohda, Tsuyoshi Shirai, Yoshizumi Ishino

BMC Biology 18(1) 152 2020年10月査読有り最終著者責任著者
Role of rada and dna polymerases in recombination-associated dna synthesis in hyperthermophilic archaea

Gaëlle Hogrel, Yang Lu, Nicolas Alexandre, Audrey Bossé, Rémi Dulermo, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino, Didier Flament

Biomolecules 10(7) 1-17 2020年7月1日
Studies on DNA-related enzymes to elucidate molecular mechanisms underlying genetic information processing and their application in genetic engineering

Yoshizumi Ishino

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 84(9) 1749-1766 2020年6月1日査読有り筆頭著者
The replication machinery of LUCA: common origin of DNA replication and transcription

Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino

BMC Biology 18(1) 61 2020年6月査読有り最終著者
Switch of the interactions between the ribosomal stalk and EF1A in the GTP- and GDP-bound conformations.

Maruyama K, Imai H, Kawamura M, Ishino S, Ishino Y, Ito K, Uchiumi T

Scientific reports 9(1) 14761 2019年10月査読有り
Pol B, a Family B DNA Polymerase, in Thermococcus kodakarensis is Important for DNA Repair, but not DNA Replication.

Kushida T, Narumi I, Ishino S, Ishino Y, Fujiwara S, Imanaka T, Higashibata H

Microbes and environments 34(3) 316-326 2019年9月査読有り
A Preliminary Metagenome Analysis Based on a Combination of Protein Domains.

Yoji Igarashi, Daisuke Mori, Susumu Mitsuyama, Kazutoshi Yoshitake, Hiroaki Ono, Tsuyoshi Watanabe, Yukiko Taniuchi, Tomoko Sakami, Akira Kuwata, Takanori Kobayashi …

Proteomes 7(2) 2019年4月29日査読有り
Replication protein A complex in Thermococcus kodakarensis interacts with DNA polymerases and helps their effective strand synthesis.

Nagata M, Ishino S, Yamagami T, Ishino Y

Bioscience, biotechnology, and biochemistry 83(4) 695-704 2019年4月査読有り
Elucidating functions of DP1 and DP2 subunits from the Thermococcus kodakarensis family D DNA polymerase.

Takashima N, Ishino S, Oki K, Takafuji M, Yamagami T, Matsuo R, Mayanagi K, Ishino Y

Extremophiles : life under extreme conditions 23(1) 161-172 2019年1月査読有り
Direct visualization of DNA baton pass between replication factors bound to PCNA.

Mayanagi K, Ishino S, Shirai T, Oyama T, Kiyonari S, Kohda D, Morikawa K, Ishino Y

Scientific reports 8(1) 16209-16209 2018年11月査読有り

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MISC

231

Thermococcus kodakarensis由来DNA末端切断タンパク質複合体の機能構造解析

宇田敬史朗, 山上健, 石野園子, 松本俊介, 中島崇, 石野良純, 沼田倫征

日本結晶学会年会講演要旨集 2023 2023年
超好熱性アーキア由来ミスマッチ修復酵素Endonuclease MSとPCNAとの複合体の機能構造解析

井戸川倫子, 水島淑華, 中島崇, 石野園子, 山上健, 松本俊介, 石野良純, 沼田倫征

日本結晶学会年会講演要旨集 2023 2023年
X線小角散乱と計算科学を用いた統合的解析による天然変性タンパク質の動的構造と機能の理解

小田隆, 大井里香, 古寺哲幸, 安藤敏夫, 小沼剛, 菅瀬謙治, 苙口友隆, 井上倫太郎, 杉山正明, 石野園子 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2022 2022年
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのCMG様ヘリカーゼとファミリーDDNAポリメラーゼの相互作用によるレプリソームの形成と活性化

OKI Keisuke, NAGATA Mariko, YAMAGAMI Takeshi, NUMATA Tomoyuki, ISHINO Sonoko, OYAMA Takuji, ISHINO Yoshizumi

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
Thermococcus kadakarensisのDNA複製複合体レプリソームの機能的構造変換機構

沖啓輔, 永田麻梨子, 山上健, 真柳浩太, 白井剛, 大山拓次, 安達成彦, 沼田倫征, 松本俊介, 石野園子 …

極限環境生物学会誌(Web) 20 2021年
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisのレプリソームにおけるPolD上でのプライマーゼからPCNAへの置換による機能変換

沖啓輔, 山上健, 永田麻梨子, 真柳浩太, 白井剛, 安達成彦, 沼田倫征, 松本俊介, 石野園子, 石野良純

日本生化学会大会(Web) 94th 2021年
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensisにおけるレプリソームの機能変換機構

沖啓輔, 山上健, 永田麻梨子, 眞柳浩太, 沼田倫征, 石野園子, 石野良純

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020 2020年
アーキアの損傷塩基修復経路の生化学的,遺伝学的研究

原田明佳, 永田麻梨子, 沖啓輔, 松見理恵, 金井保, 跡見晴幸, 沼田倫征, 石野園子, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
PolD上での相互作用因子スウィッチングによるアーキア特有のレプリソーム機能変換機構の提唱

沖啓輔, 山上健, 永田麻梨子, 真柳浩太, 沼田倫征, 石野園子, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
好熱性アーキアにおけるDNA修復に働く新規ヘリカーゼ様タンパク質の機能解析

鈴木匠爾, 鈴木匠爾, 黒沢則夫, 山上健, 沼田倫征, 石野園子, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
アーキアのDNA複製進行時におけるMCMの活性制御

永田麻梨子, 石野園子, 山上健, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
Thermococcus kodakarensisの複製フォーク進行および修復を担う2つのCdc45/RecJ

永田麻梨子, 石野園子, 山上健, SIMONS Jan-Robert, 金井保, 跡見晴幸, 石野良純

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2018 2018年
Thermococcus kodakarensisのファミリーD DNAポリメラーゼはヘリカーゼおよびプライマーゼと結合して効率的な複製装置を形成する

沖啓輔, 永田麻梨子, 高島夏希, 山上健, 石野園子, 石野良純

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2018 2018年
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来ファミリーD DNAポリメラーゼの分子解剖による機能分布の解明

沖啓輔, 山上健, 永田麻梨子, 高島夏希, 真柳浩太, 白井剛, 石野園子, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.2P‐0079 (WEB ONLY) 2018年
クライオ電顕で「見る」古細菌複製フォーク複合体の機能構造

真柳浩太, 沖啓輔, 石野園子, 宮崎直幸, 岩崎憲治, 神田大輔, 白井剛, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.3AW‐10‐5 (WEB ONLY) 2018年
PolD‐PCNA‐DNA複合体の単粒子解析

真柳浩太, 沖啓輔, 石野園子, 宮崎直幸, 岩崎憲治, 神田大輔, 白井剛, 石野良純

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.2P‐0585 (WEB ONLY)-0585] 2017年12月
FUCA1 is induced by wild-type p53 and expressed at different levels in thyroid cancers depending on p53 status (vol 50, pg 2043, 2017)

Nobuo Tsuchida, Masa-Aki Ikeda, Yoshizumu Ishino, Michele Grieco, Giancarlo Vecchio

INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY 51(3) 996-996 2017年9月
高感度な核酸検出法とゲノム編集技術遺伝子工学技術はDNA関連酵素に支えられている~制限酵素,PCR,そしてゲノム編集へ~

石野良純

生物工学会誌 95(7) 377‐382 2017年7月25日
海洋微生物解析による沿岸漁業被害の予測・抑制技術の開発第2編微生物相に基づく漁業被害の発生予測・抑制技術の開発第1章微生物相のモニタリング解析と赤潮等発生予測手法の開発 4 網羅的DNA抽出法の開発及び微生物相メタゲノム配列データの収集

石野良純, 久原哲, 大嶋雄治, 島崎洋平, 田代康介, 山上健, 藤原篤志, 安池元重, 中村洋路, 長井敏 …

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (568) 72‐75 2017年3月31日
海洋微生物解析による沿岸漁業被害の予測・抑制技術の開発第1編メタゲノム解析による微生物相の把握及び環境評価技術の開発第2章漁場環境評価技術の開発 1 赤潮発生域における漁場環境評価技術の開発

石野良純, 久原哲, 大嶋雄治, 田代康介, 山上健, 島崎洋平, 藤原篤志, 中村洋路, 安池元重, 長井敏 …

農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果 (568) 30‐33 2017年3月31日

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書籍等出版物

アーキア生物学

石野, 良純, 跡見, 晴幸, 日本Archaea研究会

共立出版 2017年10月 (ISBN: 9784320057852)
ゲノム編集入門 : ZFN・TALEN・CRISPR-Cas9

山本, 卓(理学), 石野, 良純, 近藤, 昭彦, 西田, 敬二, 荒添, 貴之, 丹羽, 隆介, 坂本, 尚昭, 泰松, 清人, 川原, 敦雄, 鈴木, 賢一, 宮坂, 佳樹, 真下, 知士, 安本, 周平, 村中, 俊哉, 宮本, 達雄, 田中, 伸和

裳華房 2016年12月 (ISBN: 9784785358662)
DNA複製装置複合体(レプリソーム)の全体像を探る

石野良純

[九州大学] 2006年
化学と生物実験ライン48、タンパク質と核酸の分離精製

広川書店 2001年
改定PCR Tips.

秀潤社 1999年
PCR Tips.

秀潤社 1997年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

新規テクノロジー開発を見据えた新規Casタンパク質候補の機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2020年4月 - 2023年3月

石野良純
DNA複製起点の無い超好熱性アーキアの生命維持機構解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2022年3月

石野良純, 松見理恵
クライオ電子顕微鏡によるオカザキソームの機能構造連関の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

真柳浩太, 石野良純
クランプローダーＲＦＣによるクランプＰＣＮＡ装てん機構の構造生物学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

大山拓次, 石野良純, 白井剛, 真柳浩太
極限環境下におけるアーキアの遺伝情報維持機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2014年4月 - 2017年3月

石野良純, 内海利男, 金井昭夫, 跡見晴幸
生体分子構造データのグラフによる統一の試み

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

白井剛, 大山拓次, 真柳浩太, 石野良純
クランプによるレプリソームの制御機構の機能構造連関の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2012年4月 - 2016年3月

真柳浩太, 白井剛, 大山拓次, 石野良純
Digital DNA chipによる生物多様性評価と環境予測法の開発研究課題

科学技術振興機構 CREST 2011年 - 2016年

五條堀孝
電子顕微鏡による超分子複合体の構造解析用新規ラベル技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2014年3月

真柳浩太, 石野良純
超好熱生物の遺伝情報はどのように守られ、伝達されるのか？

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

石野良純, 跡見晴幸
天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月

佐藤衛, 柴田武彦, 太田元規, 明石知子, 石野良純, 肥後順一, 西村善文, 藤井義明, 石川冬木, 中村春木, 森川耿右
核内ネットワークを制御する天然変性タンパク質の機能発現

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月

石野良純, 清水光弘, 奥脇暢
レプリソームの構築・再編成及び機能制御機構の構造生物学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2009年 - 2011年

真柳浩太, 石野良純
アーキア研究による染色体DNA複製装置の機能原理の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2008年 - 2010年

石野良純, 跡見晴幸
複製フォーク複合体の構築、維持、変換の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2005年 - 2009年

釣本敏樹, 石野良純
DNA複製における不連続合成装置複合体形成と再編

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2006年 - 2007年

石野良純, 西田洋一
深海熱水環境からの超好熱古細菌ゲノム資源の大規模収集とその産業技術への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2004年 - 2007年

左子芳彦, 石野良純, 高井研, 野村紀通
DNA複製装置レプリソーム超複合体の再編による機能変換

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究特定領域研究 2005年 - 2005年

石野良純, 真柳浩太
DNA複製装置複合体(レプリソーム)の全体像を探る

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2003年 - 2005年

石野良純, 山上健, 神田大輔
Structural and functional analyses of the initiation mechanism of archaeal DNA replication

Human Frontier Science Program (HFSP) Research Grants 2002年 - 2005年

石野良純

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産業財産権

特許第6846763号標的核酸の検出方法

牧野洋一, 石野良純, 石野園子
特開2021-141868 耐熱性ミスマッチエンドヌクレアーゼによる核酸の切断方法

西田洋一, 石野良純, 石野園子, 横井崇秀, 相澤康則
特開2018-153168 微生物収集装置

石野良純, 石野園子, 金田敏枝, 田代康介, 久原哲
特許第6249400号新規DNAポリメラーゼ

石野良純, 山上健, 松川博昭
WO2017-090684 DNAポリメラーゼ変異体

石野良純, 石野園子, 山上健, 上森隆司, 高津成彰
特許第7067737号 DNAポリメラーゼ変異体

石野良純, 石野園子, 山上健, 上森隆司, 高津成彰
特許第6660675号水中微生物採集器、および水中微生物採集方法

奈須永典, 辻本敦美, 吉武和敏, 石野良純, 小林敬典, 坂見知子
WO2016-039377 耐熱性のミスマッチエンドヌクレアーゼの利用方法

上森隆司, 石野良純, 相良武宏, 石野園子, 山上健, 白井剛
特許第5852650号新規DNAポリメラーゼ

石野良純, 山上健, 松川博昭, 上森隆司, 相良武宏
WO2014-181875 新規DNA切断酵素

石野良純, 石野園子, 白石都
特許第5308027号変異型PCNA

時田忠昭, 檜原理史, 工藤孝, 河村啓, 土居洋文, 石野良純
特許第5177996号 DNA複製活性を有するタンパク質

時田忠昭, 土居洋文, 石野良純
WO2013-008877 新規DNAポリメラーゼ

石野良純, 山上健, 松川博昭, 上森隆司, 相良武宏
WO2013-008898 新規DNAポリメラーゼ

石野良純, 山上健, 松川博昭
特許第5030265号フラップエンドヌクレーゼ活性増強因子

堀江祐範, 謝敏▲玉, 福井孝一, 景山義隆, 松本和子, 石野良純
特許第4808361号新規DNA合成酵素

石野良純, カーンアイザック, ボッキエアルノー, 劉利東
特許第4514482号目的塩基配列の検出方法

奈須永典, 小野浩明, 麦田秋人, 中山一郎, 小林敬典, 正岡哲治, 久原哲, 石野良純
特開2010-088446 新規DNA分解酵素

石野良純, 當利和夫
特許第4486009号 DNAリガーゼ変異体

西田洋一, 石野良純, 森川耿右
特許第4452834号新規DNA分解酵素

石野良純, 當利和夫

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論文

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書籍等出版物

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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