小林芳彦 (Yoshihiko Kobayashi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立大学法人東京科学大学総合研究院難治疾患研究所准教授

学位: 博士（農学）(岡山大学)

J-GLOBAL ID: 201801003278786819
researchmap会員ID: B000326413

2016年12月よりDuke University・Purushothama Rao Tata Lab (North Carolina, USA) において、博士研究員として呼吸器（肺および気管）の組織幹細胞、傷害後の組織再生、線維化に関する研究を遂行して参りました。現在は東京科学大学難治疾患研究所において、メカノバイオロジー、革新的組織培養技術、空間オミクス技術などの側面を加え、組織再生・リモデリングにおける細胞間・臓器間連携メカニズムを掘り下げています。共同研究のお誘い等お問い合わせはこちらのメールアドレスにお願い致します: kobayashi.y.6c08 [at] m.isct.ac.jp

主要な経歴

2024年10月 - 現在

東京科学大学総合研究院難治疾患研究所 (大学統合), 准教授
2024年3月 - 2024年9月

東京医科歯科大学難治疾患研究所, 准教授
2022年8月 - 2024年2月

京都大学医生物学研究所, 助教
2022年8月 - 2024年2月

京都大学大学院生命科学研究科, 助教
2021年6月 - 2022年7月

京都大学ウイルス・再生医科学研究所（2022年4月,医生物学研究所に改称）, 特定助教
2019年4月 - 2021年6月

日本学術振興会, 海外特別研究員
2016年12月 - 2021年6月

Duke University School of Medicine, Department of Cell Biology, Tata Lab, 博士研究員
2016年10月 - 2016年11月

日本学術振興会, 特別研究員 (PD, DC1 より切替)
2014年4月 - 2016年9月

日本学術振興会, 特別研究員 (DC1)

主要な受賞

2026年3月

難治疾患研究所研究発表会特別賞・オリジナリティ賞

小林芳彦
2023年6月

花王科学奨励賞, 公益財団法人花王芸術・科学財団

小林芳彦
2016年9月

岡山大学大学院環境生命科学研究科長賞, 岡山大学大学院環境生命科学研究科

小林芳彦
2016年9月

優秀発表賞, 基底膜下 stem-like cells による卵管上皮組織リモデリング, 日本繁殖生物学会

小林芳彦
2014年3月

岡山大学大学院環境生命科学研究科長賞, 岡山大学大学院環境生命科学研究科

小林芳彦
2013年6月

学生奨励賞, おかやまバイオアクティブ研究会

小林芳彦
2012年8月

2012 Animal Reproduction in Agriculture Research Fellowships, (Abstract award) Effect of elevated temperatures on prostaglandin synthesis in bovine oviductal epithelial cells, Society for the Study of Reproduction

小林芳彦

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主要な論文

TP53/TAU axis regulates microtubule bundling to control alveolar stem cell mediated regeneration

Konishi S, Enkhbayar K, Liu S, Miyashita N, Kobayashi Y, Hutchison V, Sai A, Agarwal P, Witonsky J, Jackson ND, Seibold MA, Chen J, Tata A, Tata PR

Journal of Clinical Investigation 2026年2月5日
Distinct dermal fibroblasts direct mechano-chemical signaling to the epidermis during pregnancy

Kobayashi Y., Sunadome K., Maki K., Fukunaga H., Matsubara H., Ohkubo S., Maki R., Yoshikawa M., Tata A., Tata PR …

bioRxiv 2025年9月筆頭著者
Transitional cell states sculpt tissue topology during lung regeneration

Konkimalla A*, Konishi S*, Macadlo L*, Kobayashi Y, Farino ZJ, Miyashita N, Haddad LEI, Morowitz J, Barkauskas CE, Agarwal P …

Cell Stem Cell 30(11) 1486-1502.e9 2023年11月査読有り
Human distal lung maps and lineage hierarchies reveal a bipotent progenitor

Murthy PKL*, Sontake V*, Tata A, Kobayashi Y, Macadlo L, Okuda K, Conchola AS, Nakano S, Gregory S, Miller LA, Spence JR, Engelhardt JF, Boucher RC, Rock JR, Randell SH, Tata PR, *Contributed equally.

Nature 604(7904) 111-119 2022年4月7日査読有り
Ferroptotic stress promotes the accumulation of pro-inflammatory proximal tubular cells in maladaptive renal repair.

Ide S*, Kobayashi Y*, Ide K, Strausser SA, Abe K, Herbek S, O’Brien LL, Crowley SD, Barisoni L, Tata A, Tata PR, Souma T. *Contributed equally.

eLife 10 2021年7月19日査読有り筆頭著者
Single-cell meta-analysis of SARS-CoV-2 entry genes across tissues and demographics.

Muus C*, Luecken MD*, Eraslan G*, Sikkema L*, Waghray A*, Heimberg G*, Kobayashi Y*, Vaishnav ED*, Subramanian A*, Smilie C* …

Nature Medicine 2021年3月査読有り筆頭著者
Secretory Cells Dominate Airway CFTR Expression and Function in Human Airway Superficial Epithelia

Okuda K, Dang H*, Kobayashi Y*, Carraro G*, Nakano S, Chen G, Kato T, Asakura T, Gilmore RC, Morton LC …

American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 203(10) 1275-1289 2020年12月15日査読有り
Human lung stem cell-based alveolospheres provide insights into SARS-CoV-2 mediated interferon responses and pneumocyte dysfunction

Katsura H*, Sontake V*, Tata A*, Kobayashi Y*, Edwards CE*, Heaton BE, Konkimalla A, Asakura T, Mikami Y, Fritch EJ …

Cell Stem Cell 27(6) 890-904.e8 2020年10月査読有り筆頭著者
Persistence of a regeneration-associated, transitional alveolar epithelial cell state in pulmonary fibrosis

Kobayashi Y, Tata A, Konkimalla A, Katsura H, Lee RF, Ou J, Banovich NE, Kropski JA, Tata PR

Nature Cell Biology 22(8) 934-946 2020年7月13日査読有り筆頭著者
Myoepithelial Cells of Submucosal Glands Can Function as Reserve Stem Cells to Regenerate Airways after Injury.

Tata A, Kobayashi Y, Chow RD, Tran J, Desai A, Massri AJ, McCord TJ, Gunn MD, Tata PR

Cell Stem Cell 22(5) 668-683.e6 2018年5月査読有り
Niche-mediated BMP/SMAD signaling regulates lung alveolar stem cell proliferation and differentiation

Chung M, Bujnis M, Barkauskas CE, Kobayashi Y, Hogan BLM

Development 145(9) dev163014-dev163014 2018年5月1日査読有り
Pulmonary Neuroendocrine Cells: Sensors and Sentinels of the Lung.

Kobayashi Y, Tata PR

Developmental Cell 45(4) 425-426 2018年5月査読有り筆頭著者
Remodeling of bovine oviductal epithelium by mitosis of secretory cells

Ito S, Kobayashi Y, Yamamoto Y, Kimura K, Okuda K

Cell and Tissue Research 366(2) 403-410 2016年11月査読有り
Regulation of bovine oviductal NO synthesis by follicular steroids and prostaglandins

Kobayashi Y, Yamamoto Y, Kageyama S, Hirayama H, Kimura K, Okuda K

Reproduction 151(6) 577-587 2016年6月査読有り筆頭著者
Roles of EDNs in regulating oviductal NO synthesis and smooth muscle motility in cows

Kobayashi Y, Yoshimoto Y, Yamamoto Y, Kimura K, Okuda K

Reproduction 151(6) 615-622 2016年6月査読有り筆頭著者
Summer heat stress affects prostaglandin synthesis in the bovine oviduct

Kobayashi Y, Wakamiya K, Kohka M, Yamamoto Y, Okuda K

Reproduction 146(2) 103-110 2013年8月査読有り筆頭著者

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主要な講演・口頭発表等

妊娠応答性真皮線維芽細胞がmechano-to-chemicalシグナルハブとして生理的皮膚組織リモデリングを統御する

小林芳彦, 砂留一範, 牧功一郎, 福永裕樹, 松原瞳, 安達泰治, 松本健一, 岩城光宏, 山本拓也, 豊島文子

第48回日本分子生物学会年会, シンポジウム「系譜と多機能性から解く線維芽細胞分子生物学」 2025年12月3日
シングルセル解像度で明らかとなりつつある呼吸器上皮細胞の時空間的heterogeneity

小林芳彦

第64回日本呼吸器学会学術講演会, シンポジウム「Single cell 解析とその次へ -網羅的時空間解析-」 2024年4月8日招待有り
肺胞組織修復過程に一過性に出現する上皮細胞状態と、肺胞線維化との関係性

小林芳彦

第22回日本再生医療学会総会, シンポジウム「呼吸器の幹細胞・オルガノイド研究の現状と再生医療の実現に向けて」 2023年3月23日招待有り
肺胞組織修復過程に出現する一過性の上皮細胞状態

小林芳彦

日本肺サーファクタント・界面医学会第58回学術研究会, シンポジウム「肺構成細胞からみた肺環境の恒常性と再生修復」 2022年9月24日招待有り
Reservoir of tissue-resident stem cells for regeneration of airway epithelium

Yoshihiko Kobayashi, Aleksandra Tata, Purushothama Rao Tata

第19回幹細胞シンポジウム 2022年5月28日
組織修復時に一過性に認められる上皮細胞種と、慢性呼吸器疾患におけるその蓄積

小林芳彦

第62回日本呼吸器学会学術講演会, シンポジウム「肺の微小環境と疾患病態」 2022年4月23日招待有り
Accumulation of regeneration-specific transitional cell state in pulmonary fibrosis

Kobayashi Y, Tata A, Tata PR

Online Trial Meeting 2020, the Japansese Society of Developmental Biologists 2020年9月25日
Dynamic uni- and multi-potent progenitors contribute to airway glandular tissue regeneration.

Kobayashi Y, Tata, PR

Cold Spring Harbor Laboratory Meeting – Stem Cell Biology 2019年9月18日
基底膜下 stem-like cells による卵管上皮組織リモデリング

小林芳彦, 伊藤さやか, 木村康二, 奥田潔

第109回日本繁殖生物学会大会 2016年9月
A system for remodeling the oviductal epithelium by stem-like cells

Kobayashi Y, Yamamoto Y, Kimura K, Okuda K

75th Annual Meeting of Society for Developmental Biology 2016年8月6日