池田幸樹 (Yoshiki Ikeda) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学物質―細胞統合システム拠点特定拠点助教
: (兼任)大学院医学研究科「医学領域」産学連携推進機構

学位: 理学(2011年2月名古屋大学)

J-GLOBAL ID: 201801002171353204
researchmap会員ID: B000330757

研究分野

ライフサイエンス / 薬系化学、創薬科学 /

経歴

2024年12月 - 現在

京都大学, 大学院医学研究科「医学領域」産学連携推進機構

主要な受賞

2024年8月

第35回高遠桜雲賞, 第35回高遠シンポジウム

池田幸樹
2024年3月

第３５回加藤記念研究助成, 加藤記念バイオサイエンス振興財団

池田幸樹
2023年3月

教員評価優秀賞, 関西医科大学

池田幸樹
2022年3月

教員評価優秀賞, 関西医科大学

池田幸樹

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論文

Rational in silico design identifies two mutations that restore UT28K SARS-CoV-2 monoclonal antibody activity against Omicron BA.1

Tatsuhiko Ozawa, Yoshiki Ikeda, Liuan Chen, Rigel Suzuki, Atsushi Hoshino, Akira Noguchi, Shunsuke Kita, Yuki Anraku, Emiko Igarashi, Yumiko Saga …

Structure 2024年1月15日査読有り筆頭著者責任著者
Multimodal action of KRP203 on phosphoinositide kinases in vitro and in cells.

Yoshiki Ikeda, Mindy I Davis, Kazutaka Sumita, Yuxiang Zheng, Satoshi Kofuji, Mika Sasaki, Yoshihisa Hirota, Rajan Pragani, Min Shen, Matthew B Boxer …

Biochemical and biophysical research communications 679 116-121 2023年8月26日査読有り筆頭著者
Rap1 organizes lymphocyte front-back polarity via RhoA signaling and talin1.

Yoshihiro Ueda, Koichiro Higasa, Yuji Kamioka, Naoyuki Kondo, Shunsuke Horitani, Yoshiki Ikeda, Wolfgang Bergmeier, Yoshinori Fukui, Tatsuo Kinashi

iScience 26(8) 107292-107292 2023年8月18日
Characterization of cytoskeletal and structural effects of INF2 variants causing glomerulopathy and neuropathy.

Hiroko Ueda, Quynh Thuy Huong Tran, Linh Nguyen Truc Tran, Koichiro Higasa, Yoshiki Ikeda, Naoyuki Kondo, Masaki Hashiyada, Chika Sato, Yoshinori Sato, Akira Ashida …

Scientific reports 13(1) 12003-12003 2023年7月25日
Distinct bidirectional regulation of LFA1 and α4β7 by Rap1 and integrin adaptors in T cells under shear flow

Yuji Kamioka, Yoshihiro Ueda, Naoyuki Kondo, Keizo Tokuhiro, Yoshiki Ikeda, Wolfgang Bergmeier, Tatsuo Kinashi

Cell Reports 42(6) 112580-112580 2023年6月
Functional molecular evolution of a GTP sensing kinase: PI5P4Kβ.

Koh Takeuchi, Miki Senda, Yoshiki Ikeda, Koji Okuwaki, Kaori Fukuzawa, So Nakagawa, Mika Sasaki, Atsuo T Sasaki, Toshiya Senda

The FEBS journal 2023年3月1日
The critical role of Rap1-GAPs Rasa3 and Sipa1 in T cells for pulmonary transit and egress from the lymph nodes.

Shunsuke Horitani, Yoshihiro Ueda, Yuji Kamioka, Naoyuki Kondo, Yoshiki Ikeda, Makoto Naganuma, Tatsuo Kinashi

Frontiers in immunology 14 1234747-1234747 2023年
The GTP responsiveness of PI5P4Kβ evolved from a compromised trade-off between activity and specificity.

Koh Takeuchi, Yoshiki Ikeda, Miki Senda, Ayaka Harada, Koji Okuwaki, Kaori Fukuzawa, So Nakagawa, Hong Yang Yu, Lisa Nagase, Misaki Imai …

Structure (London, England : 1993) 30(6) 886-899 2022年6月2日査読有り筆頭著者
SI-MOIRAI: A new method to identify and quantify the metabolic fate of nucleotides

Yoshiki Ikeda, Akiyoshi Hirayama, Satoshi Kofuji, Yoshihisa Hirota, Ryo Kamata, Natsuki Osaka, Yuki Fujii, Mika Sasaki, Satsuki Ikeda, Eric P Smith …

The Journal of Biochemistry 170(6) 699-711 2021年7月9日査読有り筆頭著者
Divergent Mechanisms Activating RAS and Small GTPases Through Post-translational Modification

Natsuki Osaka, Yoshihisa Hirota, Doshun Ito, Yoshiki Ikeda, Ryo Kamata, Yuki Fujii, Venkat R. Chirasani, Sharon L. Campbell, Koh Takeuchi, Toshiya Senda …

Frontiers in Molecular Biosciences 8 707439-707439 2021年7月8日査読有り
Effect of Learning Dataset for Identification of Active Molecules: A Case Study of Integrin αIIbβ3 Inhibitors.

Kentaro Kawai, Mami Tomonou, Yume Machida, Yukiko Karuo, Atsushi Tarui, Kazuyuki Sato, Yoshiki Ikeda, Tatsuo Kinashi, Masaaki Omote

Molecular informatics 2021年3月18日査読有り
Female dominance of both spatial cognitive dysfunction and neuropsychiatric symptoms in a mouse model of Alzheimer’s disease

Masanori A. Murayama, Nagisa Arimitsu, Jun Shimizu, Naruyoshi Fujiwara, Kenji Takai, Yoshiki Ikeda, Yoko Okada, Chieko Hirotsu, Erika Takada, Tomoko Suzuki …

Experimental Animals 70(3) 398-405 2021年査読有り
がんの接着による制御機構の解明と創薬

植田祥啓, 岩田亮一, 山崎文和, 赤間智也, 三木貴雄, 住吉麻実, 平野伸二, 福原貴太郎, 上岡裕治, 近藤直幸 …

関西医科大学雑誌 71 34-34 2020年12月
Activity-specificity trade-off gives PI5P4Kβ a nucleotide preference to function as a GTP-sensing kinase

Koh Takeuchi, Yoshiki Ikeda, Miki Senda, Ayaka Harada, Koji Okuwaki, Kaori Fukuzawa, So Nakagawa, Hongyang Yu, Lisa Nagase, Misaki Imai …

bioRxiv 2020年6月10日
IMP dehydrogenase-2 drives aberrant nucleolar activity and promotes tumorigenesis in glioblastoma.

Satoshi Kofuji, Akiyoshi Hirayama, Alexander Otto Eberhardt, Risa Kawaguchi, Yuki Sugiura, Oltea Sampetrean, Yoshiki Ikeda, Mikako Warren, Naoya Sakamoto, Shuji Kitahara …

Nature cell biology 21(8) 1003-1014 2019年8月査読有り
Identification of lysine methylation in the core GTPase domain by GoMADScan.

Yoshino H, Yin G, Kawaguchi R, Popov KI, Temple B, Sasaki M, Kofuji S, Wolfe K, Kofuji K, Okumura K …

PloS one 14(8) e0219436-e0219436 2019年査読有り
多角的解析からみえてくるGTPの新たな機能と人疾患への治療戦略時系列マルチオミクス解析によるGTP代謝とがん化をつなぐ制御メカニズムの解明

河口理紗, デホーン・ミヒル, 池田幸樹, 小藤智史, 平山明由, 森大, 曽我朋義, 竹内恒, 千田俊哉, 佐々木敦朗 …

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [4PW07-2] 2017年12月
An archaeal RNA binding protein, FAU-1, is a novel ribonuclease related to rRNA stability in Pyrococcus and Thermococcus

Yoshiki Ikeda, Yasuhiro Okada, Asako Sato, Tamotsu Kanai, Masaru Tomita, Haruyuki Atomi, Akio Kanai

SCIENTIFIC REPORTS 7(1) 12674 2017年10月査読有り
【がん代謝ワールブルグを超えて全容解明に挑むトリガーとなる分子、腸内細菌や免疫細胞の関与、標的治療の展望】(第2章)がん特異的な代謝 GTP代謝

小藤智史, 池田幸樹, Wolfe Kara, Randhawa Jaskirat, 河口理紗, 島田裕子, 小藤香織, 佐々木美加, 奥村晃市, 竹内恒 …

実験医学 35(10) 1633-1641 2017年6月
Structural reverse genetics study of the PI5P4Kβ-nucleotide complexes reveals the presence of the GTP bioenergetic system in mammalian cells.

Takeuchi K, Senda M, Lo YH, Kofuji S, Ikeda Y, Sasaki AT, Senda T

The FEBS journal 283(19) 3556-3562 2016年10月査読有り

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MISC

インテグリンとインテグリン結合性タンパク質間の相互作用の定量化

池田幸樹, 竹田浩之, 木梨達雄

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
生命の可能性を体現するGTPレジリエンスの分子進化機構の解析

竹内恒, 池田幸樹, 千田美紀, 原田彩佳, 奥脇弘次, 福澤薫, 中川草, 長瀬里沙, 今井美咲, 廣田佳久 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
インテグリン創薬から考える一回膜貫通型タンパク質における創薬ストラテジー

池田幸樹, 木梨達雄

SAR News 39 17-23 2020年10月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
がん特異的な代謝 7.GTP代謝

小藤智史, 小藤智史, 池田幸樹, WOLFE Kara, RANDHAWA Jaskirat, 河口理紗, 河口理紗, 島田裕子, 小藤香織, 佐々木美加 …

実験医学 35(10) 1633‐1641 2017年6月15日
GTP metabolic switch promotes malignant growth of brain tumors

S. Kofuji, M. Warren, K. Sumita, A. Ramkissoon, M. Sasaki, N. Majd, H. Yoshino, K. Kofuji, K. Okumura, Y. Ikeda …

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 26 2015年
ArchaeaにおけるRNA binding proteinであるFAU‐1はRibosomal RNAのprocessingに関わる新規RNaseである

池田幸樹, 岡田安弘, 佐藤朝子, 金井保, 冨田勝, 跡見晴幸, 金井昭夫

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th 1P-0285 (WEB ONLY) 2014年

書籍等出版物

実験医学増刊 Vol.35 No.10 がん代謝ワールブルグを超えて全容解明に挑む

(担当:共著, 範囲:第2章がん特異的な代謝 7. GTP代謝)

羊土社 2017年6月
大腸菌におけるRNase EとRNA結合タンパク質Hfq間の相互作用領域の解析

池田幸樹

名古屋大学 2011年2月

講演・口頭発表等

アカデミア創薬会議2024

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月27日
魔改造のタンパク質工学〜削る~

池田幸樹

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月27日招待有り
Molecular Glueを自由自在に創る

池田幸樹

第35回高遠シンポジウム 2024年8月26日
弱い相互作用を定量・可視化する”Hakoniwa(箱庭)”テクノロジー

池田幸樹

Seeds-Hub フォーラム 2024年7月9日招待有り
Feel Like Makin’ the Drug ~ Create Miniature Antibodies ~

Yoshiki Ikeda

2024 iCeMS retreat 2024年7月5日招待有り
In silico解析技術の提供によるLG研究の加速

Yoshiki Ikeda

第1回 L-グルコース研究会 2024年4月13日招待有り
In silico解析によるアカデミア創薬の加速

池田幸樹

角川ドワンゴ学園研究部研究発表会 2024年3月30日招待有り
「大学」って何してんの？

池田幸樹

須磨学園中学校・高等学校キャリアパスセミナー 2024年1月31日招待有り
アカデミア創薬会議2023

池田幸樹, 谷中冴子

第46回日本分子生物学会年会 2023年12月
Development of “Miniature antibody” technology

池田幸樹

第46回日本分子生物学会年会 2023年12月招待有り
Molecular Glueを自由自在に作る

池田幸樹

第14回スクリーニング学研究会 2023年11月
第３回アカデミア創薬会議

池田幸樹

第14回スクリーニング学研究会プレカンファレンス 2023年11月招待有り
インテグリン関連疾患とその治療に向けた戦略

池田幸樹

大鵬薬品工業株式会社講演会 2023年10月招待有り
In silico解析によるアカデミア創薬の加速

池田幸樹

愛媛大学理工学研究科応用化学コースシンポジウム 2023年7月21日招待有り
インテグリンミニチュア化設計による新規抗ウイルス薬の創出

池田幸樹

第45回日本分子生物学会年会 2022年12月1日
インテグリンミニチュア化設計による新規抗ウイルス薬の創出

池田幸樹, 竹田浩之, 木梨達雄

第45回日本分子生物学会年会 2022年12月1日
インテグリンミニチュア化設計による新規抗ウイルス薬の創出

池田幸樹, 竹田浩之, 木梨達雄

第13回スクリーニング学研究会 2022年11月25日
有用ペプチド開発ツール”PeptiCraft”の開発と実践

池田幸樹

第13回スクリーニング学研究会 2022年11月24日招待有り
第二回アカデミア創薬会議

池田幸樹

第13回スクリーニング学研究会 2022年11月24日招待有り
有用ペプチド開発のための新規ソフトウェア”PeptiCraft”の開発と実践

池田幸樹

高遠シンポジウム 2022年8月26日

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主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

神経膠芽腫治療に向けた革新的な抗体医療技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

池田幸樹
不妊症治療を目指した細胞接着活性化剤の開発

公益財団法人加藤記念バイオサイエンス振興財団第35回研究助成 2024年4月 - 2026年3月

池田幸樹
サメVNAR作製プラットフォームを基盤とした次世代抗体医薬品の開発技術高度化

日本医療研究開発機構次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業 2021年7月 - 2026年3月

池田幸樹
インテグリン阻害による新規神経膠芽腫治療薬の探索

国立研究開発法人日本医療研究開発機構創薬支援推進事業・創薬総合支援事業(創薬ブースター) 2024年4月 - 2025年3月
インテグリン阻害による新規神経膠芽腫治療薬の探索

日本医療研究開発機構創薬総合支援(創薬ブースター)事業 2022年4月 - 2024年3月
Talin1によるインテグリン活性化を介した神経膠(芽)腫悪性化メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

池田幸樹
インテグリン阻害による新規神経膠芽腫治療薬の探索

日本医療研究開発機構創薬総合支援(創薬ブースター)事業 2020年4月 - 2022年3月

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産業財産権

特願2022-183639 着床促進薬とそのスクリーニング系

松浦徹, 池田幸樹, 吉田真子
特願2022-160708 窒素含有化合物、前記窒素含有化合物を含む組成物、及び腫瘍悪性度の予測マーカー

林美樹夫, 池田幸樹, 岩田亮一
特願2022-149604 抗SARS-CoV-2抗体

小澤龍彦, 谷英樹, 池田幸樹, 橋口隆生
特願P21008JP 重症筋無力症治療薬

服部文幸, 池田幸樹
特願2021-055869 窒素含有化合物、前記窒素含有化合物を含む組成物、及び腫瘍悪性度の予測マーカー

林美樹夫, 池田幸樹, 岩田亮一

メディア報道

富山大など、新型コロナの変異に対抗可能な中和抗体の改良手法を開発

Rakuten Infoseek https://news.infoseek.co.jp/article/mynavi_2714319/ 2024年1月18日インターネットメディア
富山大など、新型コロナの変異に対抗可能な中和抗体の改良手法を開発

BIGLOBEニュース https://news.biglobe.ne.jp/it/0118/mnn_240118_1662506812.html 2024年1月18日インターネットメディア
富山大など、新型コロナの変異に対抗可能な中和抗体の改良手法を開発

マイナビニュース https://news.mynavi.jp/techplus/article/20240118-2865009/ 2024年1月18日インターネットメディア
「スーパー中和抗体」オミクロン株にも効果富山大など改良

北日本新聞社 https://webun.jp/articles/-/536792 2024年1月17日新聞・雑誌
広範なコロナウイルス株に効果のある抗体医薬品を分子シミュレーションにてデザインすることに成功

日本の研究.com https://research-er.jp/articles/view/129817 2024年1月16日インターネットメディア
Research team unravels the trick of evolving the GTP sensor

VERVE TIMES 2022年5月インターネットメディア
US-Japan research team unravels the trick of evolving the GTP sensor

AAAS EurekAlert 2022年5月インターネットメディア
がん細胞の代謝物利用調べる方法確立創薬や治療戦略などへの応用期待

荘内日報社荘内日報 2021年11月12日新聞・雑誌
がん細胞の代謝経路追跡創薬、治療への応用期待

山形新聞社山形新聞 2021年11月10日新聞・雑誌
創薬AI開発のための学習データ作成に新視点、失敗例を1000倍学ばせると誤分類が100分の1以下に関西医大らの研究

Med IT Tech 2021年4月インターネットメディア

池田幸樹

基本情報

研究分野

経歴

主要な受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

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