村上洋太 (Yota Murakami) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院理学研究院理学研究院教授

学位: 理学博士(京都大学)

J-GLOBAL ID: 200901066651568187
researchmap会員ID: 0000025067

外部リンク: http://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~bo/

研究キーワード

研究分野

経歴

2009年4月 - 現在

北海道大学大学院理学研究院, 教授
1993年10月 - 現在

Associate Professor,
1993年10月 - 2009年3月

京都大学ウイルス研究所, 准教授（助教授）
1990年10月 - 1993年10月

米国スローン･ケタリング記念がんセンター
1990年10月 - 1993年10月

Memorial Sloan-Keetering Cancer Center(USA),
1987年10月 - 1990年10月

博士研究員京都大学ウィルス研究所
1987年10月 - 1990年10月

Institute for Virus Research,
博士研究員
京都大学, ウイルス研究所
Postdoctoral Fellow

学歴

論文

A zinc-finger protein Moc3 functions as a transcription activator to promote RNAi-dependent constitutive heterochromatin establishment in fission yeast.

Miyuki Mori, Michiaki Sato, Shinya Takahata, Takuya Kajitani, Yota Murakami

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 29(6) 471-485 2024年6月
Polymeric nature of tandemly repeated genes enhances assembly of constitutive heterochromatin in fission yeast

Tetsuya Yamamoto, Takahiro Asanuma, Yota Murakami

Communications Biology 6(1) 2023年8月4日
Opposing Roles of FACT for Euchromatin and Heterochromatin in Yeast.

Shinya Takahata, Yota Murakami

Biomolecules 13(2) 2023年2月16日
Cytoskeletal fractionation identifies LMO7 as a positive regulator of fibroblast polarization and directed migration

Taichi Bun, Yuta Sato, Hajime Futami, Yuki Tagawa, Yota Murakami, Masayuki Takahashi

Biochemical and Biophysical Research Communications 638 58-65 2023年1月査読有り
Tandemly repeated genes promote RNAi-mediated heterochromatin formation via an antisilencing factor, Epe1, in fission yeast

Takahiro Asanuma, Soichi Inagaki, Tetsuji Kakutani, Hiroyuki Aburatani, Yota Murakami

Genes & Development 2022年12月20日
The chromatin remodeler RSC prevents ectopic CENP-A propagation into pericentromeric heterochromatin at the chromatin boundary

Satoru Tsunemine, Hiromi Nakagawa, Yutaka Suzuki, Yota Murakami

Nucleic Acids Research 50(19) 10914-10928 2022年10月28日査読有り
Histone variant H2A.Z plays multiple roles in the maintenance of heterochromatin integrity.

Kazuki Tsukii, Shinya Takahata, Yota Murakami

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 27(2) 93-112 2022年2月
Two secured FACT recruitment mechanisms are essential for heterochromatin maintenance

Shinya Takahata, Saori Chida, Aoi Ohnuma, Motoyoshi Ando, Takahiro Asanuma, Yota Murakami

Cell Reports 36(7) 109540-109540 2021年8月最終著者
Construction and characterization of a zinc‐inducible gene expression vector in fission yeast

Shinya Takahata, Takahiro Asanuma, Miyuki Mori, Yota Murakami

Yeast 38(4) 251-261 2021年4月最終著者
Trimethylguanosine synthase 1 (Tgs1) is involved in Swi6/HP1‐independent siRNA production and establishment of heterochromatin in fission yeast

Hiroki Yu, Mai Tsuchida, Motoyoshi Ando, Tomoka Hashizaki, Atsushi Shimada, Shinya Takahata, Yota Murakami

Genes to Cells 26(4) 203-218 2021年4月査読有り最終著者責任著者
Unprogrammed epigenetic variation mediated by stochastic formation of ectopic heterochromatin

Masato Sorida, Yota Murakami

Current Genetics 66(2) 319-325 2020年4月査読有り責任著者
Epigenetic regulation affects gene amplification in Drosophila development.

Kohzaki H, Asano M, Murakami Y, Mazo A

Frontiers in bioscience (Landmark edition) 25 632-645 2020年1月査読有り
Heterochromatin suppresses gross chromosomal rearrangements at centromeres by repressing Tfs1/TFIIS-dependent transcription

Akiko K. Okita, Faria Zafar, Jie Su, Dayalini Weerasekara, Takuya Kajitani, Tatsuro S. Takahashi, Hiroshi Kimura, Yota Murakami, Hisao Masukata, Takuro Nakagawa

Communications Biology 2(1) 17 2019年12月査読有り
Complete Genome Sequence of Staphylococcus arlettae Strain P2, Isolated from a Laboratory Environment

Hiroki Yu, Makoto Taniguchi, Kazuma Uesaka, Apirak Wiseschart, Kusol Pootanakit, Yudai Nishitani, Yota Murakami, Koichiro Ishimori, Kentaro Miyazaki, Kei Kitahara

Microbiology Resource Announcements 8(45) 2019年11月7日査読有り
Nonmuscle myosin IIA and IIB differently suppress microtubule growth to stabilize cell morphology

Yuta Sato, Keiju Kamijo, Motosuke Tsutsumi, Yota Murakami, Masayuki Takahashi

The Journal of Biochemistry 2019年10月査読有り
Regulation of ectopic heterochromatin-mediated epigenetic diversification by the JmjC family protein Epe1.

Sorida M, Hirauchi T, Ishizaki H, Kaito W, Shimada A, Mori C, Chikashige Y, Hiraoka Y, Suzuki Y, Ohkawa Y …

PLoS genetics 15(6) e1008129-e1008129 2019年6月17日査読有り責任著者
Differential contributions of nonmuscle myosin IIA and IIB to cytokinesis in human immortalized fibroblasts

YAMAMOTO Kei, OTOMO Kohei, NEMOTO Tomomi, ISHIHARA Seiichiro, HAGA Hisashi, NAGASAKI Akira, MURAKAMI Yota, TAKAHASHI Masayuki

Exp. Cell Res. 376(1) 67-76 2019年3月査読有り
Sfh1, an essential component of the RSC chromatin remodeling complex, maintains genome integrity in fission yeast.

Naoe Kotomura, Satoru Tsunemine, Masahiro Kuragano, Takahiro Asanuma, Hiromi Nakagawa, Katsunori Tanaka, Yota Murakami

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 23(9) 738-752 2018年9月査読有り
RNAi-dependent heterochromatin assembly in fission yeast Schizosaccharomyces pombe requires heat-shock molecular chaperones Hsp90 and Mas5

Okazaki K, Kato H, Iida T, Shinmyozu K, Nakayama J, Murakami Y, Urano T

Epigenetics & Chromatin 11(1) 2018年6月査読有り
Different contributions of nonmuscle myosin IIA and IIB to the organization of stress fiber subtypes in fibroblasts.

Masahiro Kuragano, Taro Q P Uyeda, Keiju Kamijo, Yota Murakami, Masayuki Takahashi

Molecular biology of the cell 29(8) 911-922 2018年4月15日査読有り

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MISC

転写装置によるクロマチン構造制御

村上洋太

生化学 89(3) 441-444 2017年6月
Phosphorylation at Ser7 of RNA polymerase II CTD limits transcription speed and transcription elongation

Takuya Kajitani, Hiroaki Kato, Yuji Chikashige, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Damien Herand, Yota Murakami

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 348-348 2016年12月
Phosphorylation at Ser7 of RNAPII-CTD ensures on-chromatin retention of nascent ncRNAs, triggering RNAi-dependent heterochromatin formation

Takuya Kajitani, Hiroaki Kato, Yuji Chikashige, Yasushi Hiraoka, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Damien Hermand, Yota Murakami

GENES & GENETIC SYSTEMS 89(6) 331-331 2014年12月
A novel RNAi protein, Dsh1, assembles RNAi machinery on chromatin to amplify heterochromatic siRNA (vol 26, pg 1811, 2012)

Kei Kawakami, Aki Hayashi, Jun-ichi Nakayama, Yota Murakami

GENES & DEVELOPMENT 26(19) 2251-2251 2012年10月
A transcription factor Abf1 facilitates ORC binding onto the Saccharomyces cerevisiae replication origin via histone acetylase Gcn5.

Hidetsugu Kohzaki, Yota Murakami

GENES & GENETIC SYSTEMS 86(6) 383-383 2011年12月
Dynamics and functional regulation of non-coding RNA in RNAi-dependent heterochromatin

Yota Murakami

GENES & GENETIC SYSTEMS 85(6) 442-442 2010年12月
非筋細胞ミオシンIIの折りたたまれたコンフォメーションの役割(Role of folded conformation of nonmuscle myosin II)

木卜貴之, 加藤剛志, 中村彰男, 村上洋太, 高橋正行

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 83回・33回 1P-0457 2010年12月
非筋細胞ミオシンIIのフォールディドコンフォメーションの役割(Role of folded conformation of nonmuscle myosin II)

木卜貴之, 加藤剛, 中村彰男, 村上洋太, 高橋正行

日本細胞生物学会大会講演要旨集 62回 137-137 2010年5月
Tissue specific RNAi knockdown of DNA replication machinery in Drosophila showed requirement of replication factors in endoreplication, gene amplification and development.

Journal of Gene Medicine 2010年
ヘテロクロマチンにおけるnon-coding RNAの解析

仲間美奈, 村上洋太

生化学 2007年
RNAによるクロマチン高次構造制御 (RNAと生命) -- (RNAサイレンシング)

村上洋太

蛋白質核酸酵素 51(16) 2456-2462 2006年12月
RNA干渉とヘテロクロマチン（特集：総研大発の染色体研究 / Part 3 Laboratory）

村上洋太, Yota MURAKAMI, ムラカミヨウタ

総研大ジャーナル = Sokendai journal (9) 25-25 2006年3月28日
RNAポリメラーゼIIとRNAi依存的ヘテロクロマチン

加藤太陽, 村上洋太

実験医学 23(16) 2469-2471 2005年
ヘテロクロマチンとセントロメア--ヘテロクロマチンとRNAiの出会い (特集染色体運動の制御起点--最新セントロメア研究)

加藤太陽, 村上洋太

蛋白質核酸酵素 49(12) 1990-1997 2004年9月
Regulation of chromosomal DNA replication by transcription factors.

Kohzaki, H, Murakami, Y

Cancer Research 2004年3月
Fission yeast CENP-B homologs nucleate centromeric heterochromatin by promoting heterochromatin-specific histone tail modifications

H Nakagawa, JK Lee, J Hurwitz, RC Allshire, J Nakayama, SIS Grewal, K Tanaka, Y Murakami

GENES & DEVELOPMENT 16(14) 1766-1778 2002年7月
Solution structure determination of the two DNA-binding domains in the Shizosaccharomyces pombe Abp1 protein by a combination of dipolar coupling and diffusion anisotropy restraints

J Kikuchi, J Iwahara, T Kigawa, Y Murakami, T Okazaki, S Yokoyama

JOURNAL OF BIOMOLECULAR NMR 22(4) 333-347 2002年4月
Characterization of a fission yeast SUMO-1 homologue, Pmt3p, required for multiple nuclear events, including the control of telomere length and chromosome segregation

K Tanaka, J Nishide, K Okazaki, H Kato, O Niwa, T Nakagawa, H Matsuda, M Kawamukai, Y Murakami

MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY 19(12) 8660-8672 1999年12月
Context-dependent modulation of replication activity of Saccharomyces cerevisiae autonomously replicating sequences by transcription factors

H Kohzaki, Y Ito, Y Murakami

MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY 19(11) 7428-7435 1999年11月
3PA135 染色体セントロメアタンパク質Abp1の溶液構造とそのDNA認識機構

菊地淳, 岩原淳二, 木川隆則, 村上洋太, 岡崎恒子, 横山茂之

生物物理 39 S182 1999年

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ヒストン修飾Eraserによる抑制的エピゲノムの維持・変動制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年6月 - 2024年3月

村上洋太
エピジェネティック変異の多様性増大を介した環境適応機構の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2023年3月

村上洋太
転写速度制御を介した統合的遺伝子発現制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2019年4月 - 2022年3月

村上洋太, 梶谷卓也
エピジェネティック突然変異を介した適応的突然変異誘発機構の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2020年3月

村上洋太
転写・クロマチン制御に関与するnon-coding RNAの網羅的探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

村上洋太, 高畑信也
RNAi依存性ヘテロクロマチンシステムと核膜による遺伝子発現調節機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2013年4月 - 2016年3月

村上洋太, 加藤太陽, 高畑信也
jmjCドメインタンパク質Epe1によるゲノムワイドなヘテロクロマチン制御機構

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

村上洋太
RNAポリメラーゼIIとRNA・クロマチンのクロストーク

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

村上洋太
クロマチン構造にゆらぎを生み出す分子基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

村上洋太, 高畑信也, 加藤太陽
非コードＲＮＡに制御されるヘテロクロマチン形成場の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

村上洋太
細胞周期進行にともなうヘテロクロマチン機能制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2010年 - 2011年

村上洋太
動的クロマチン高次構造であるヘテロクロマチンの構造・機能ネットワークの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2009年 - 2011年

村上洋太, 田中克典
ゲノムに存在するDNA:RNAハイブリッドの探索と機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2009年 - 2010年

村上洋太
RNAの運命決定制御とヘテロクロマチンにおける転写装置の役割

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

村上洋太, 山口雄輝
高次クロマチン構造による染色体機能ドメイン構築機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2005年 - 2009年

中山潤一, 村上洋太, 沖昌也
non-coding RNAとRNAiに依存するサイレントクロマチン構築機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2006年 - 2008年

村上洋太, 田中克典
RNAi依存的ヘテロクロマチン形成に重要なnon-coding RNA転写反応

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2006年 - 2007年

村上洋太
真核細胞の染色体複製制御機構の解析

1996年 - 2006年
RNAi依存的なサイレントクロマチン形成におけるRNAポリメラーゼIIの特異的機能

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2005年 - 2005年

村上洋太
サイレントクロマチン構築のダイナミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2004年 - 2005年

村上洋太, 田中克典

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