玉田嘉紀 (Yoshinori Tamada) - マイポータル

基本情報

所属: 弘前大学健康未来イノベーションセンター（大学院医学研究科附属）医療データ解析学講座教授 (データ解析部門長)

学位: 情報学(2005年11月京都大学)

J-GLOBAL ID: 201801014931633936
researchmap会員ID: 7000022217

外部リンク: https://ytlab.jp

研究分野

経歴

2021年4月 - 現在

京都大学大学院医学研究科ビッグデータ医科学分野客員研究員
2020年11月 - 現在

弘前大学健康未来イノベーションセンター（大学院医学研究科附属）教授
2018年1月 - 2020年10月

京都大学大学院医学研究科人間健康科学系専攻特定准教授
2016年4月 - 2017年12月

東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター特任講師
2011年4月 - 2016年3月

東京大学大学院情報理工学系研究科コンピュータ科学専攻助教
2008年5月 - 2011年3月

東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター特任助教
2006年7月 - 2008年4月

GNI Systems Pharmacology Research Institute Senior Researcher
2005年12月 - 2006年6月

情報・システム研究機構統計数理研究所統計科学技術センター助手

論文

Novel cancer subtyping method based on patient-specific gene regulatory network.

Mai Adachi Nakazawa, Yoshinori Tamada, Yoshihisa Tanaka, Marie Ikeguchi, Kako Higashihara, Yasushi Okuno

Scientific reports 11(1) 23653-23653 2021年12月8日査読有り責任著者
Dynamic changes in gene-to-gene regulatory networks in response to SARS-CoV-2 infection

Yoshihisa Tanaka, Kako Higashihara, Mai Adachi Nakazawa, Fumiyoshi Yamashita, Yoshinori Tamada, Yasushi Okuno

Scientific Reports 11(1) 11241-11241 2021年5月査読有り責任著者
胎児性肺癌における遺伝子ネットワーク解析

笠島理加, 鈴木理樹, 清水英悟, 玉田嘉紀, 新井田厚司, 山口類, 井元清哉, 古川洋一, 宮野悟, 横瀬智之, 宮城洋平

日本癌学会総会記事 79回 PJ14-1 2020年10月
Classification of glomerular pathological findings using deep learning and nephrologist–AI collective intelligence approach

Eiichiro Uchino, Kanata Suzuki, Noriaki Sato, Ryosuke Kojima, Yoshinori Tamada, Shusuke Hiragi, Hideki Yokoi, Nobuhiro Yugami, Sachiko Minamiguchi, Hironori Haga, Motoko Yanagita, Yasushi Okuno

International Journal of Medical Informatics 141 104231-104231 2020年9月査読有り
【AI、ICT】臨床データを用いた医療ビッグデータの解析と創薬への応用

内野詠一郎, 佐藤憲明, 小島諒介, 玉田嘉紀, 柳田素子, 奥野恭史

日本腎臓学会誌 62(2) 64-68 2020年3月
Variant analysis of prostate cancer in Japanese patients and a new attempt to predict related biological pathways.

Rika Kasajima, Rui Yamaguchi, Eigo Shimizu, Yoshinori Tamada, Atsushi Niida, George Tremmel, Takeshi Kishida, Ichiro Aoki, Seiya Imoto, Satoru Miyano, Hiroji Uemura, Yohei Miyagi

Oncology reports 43(3) 943-952 2020年3月査読有り
System-based differential gene network analysis for characterizing a sample-specific subnetwork

Yoshihisa Tanaka, Yoshinori Tamada, Marie Ikeguchi, Fumiyoshi Yamashita, Yasushi Okuno

Biomolecules 10(2) 2020年2月査読有り
Memory efficient parallel algorithm for optimal DAG structure search using direct communication

Yoshinori Tamada

Journal of Parallel and Distributed Computing 119 27-35 2018年査読有り筆頭著者
Oncogenic roles of TOPK and MELK, and effective growth suppression by small molecular inhibitors in kidney cancer cells

Taigo Kato, Hiroyuki Inoue, Seiya Imoto, Yoshinori Tamada, Takashi Miyamoto, Yo Matsuo, Yusuke Nakamura, Jae-Hyun Park

Oncotarget 2016年4月3日査読有り
The hnRNP-Htt axis regulates necrotic cell death induced by transcriptional repression through impaired RNA splicing

Y. Mao, T. Tamura, Y. Yuki, D. Abe, Y. Tamada, S. Imoto, H. Tanaka, H. Homma, K. Tagawa, S. Miyano, H. Okazawa

CELL DEATH & DISEASE 7 e2207 2016年4月査読有り
Efficient parallel algorithm for optimal DAG structure search on parallel computer with torus network

Honda, H., Tamada, Y., Suda, R.

Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) 10048 LNCS 2016年査読有り
Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs

Asuka Nakata, Ryo Yoshida, Rui Yamaguchi, Mai Yamauchi, Yoshinori Tamada, Andre Fujita, Teppei Shimamura, Seiya Imoto, Tomoyuki Higuchi, Masaharu Nomura, Tatsuo Kimura, Hiroshi Nokihara, Masahiko Higashiyama, Kazuya Kondoh, Hiroshi Nishihara, Arinobu Tojo, Seiji Yano, Satoru Miyano, Noriko Gotoh

Scientific Reports 5(1) 2015年8月査読有り
Lung adenocarcinoma subtypes definable by lung development-related miRNA expression profiles in association with clinicopathologic features

Chinatsu Arima, Taisuke Kajino, Yoshinori Tamada, Seiya Imoto, Yukako Shimada, Masahiro Nakatochi, Motoshi Suzuki, Hisanori Isomura, Yasushi Yatabe, Tomoya Yamaguchi, Kiyoshi Yanagisawa, Satoru Miyano, Takashi Takahashi

Carcinogenesis 35(10) 2224-2231 2014年6月5日査読有り
Vasohibin-1 is identified as a master-regulator of endothelial cell apoptosis using gene network analysis

Muna Affara, Debbie Sanders, Hiromitsu Araki, Yoshinori Tamada, Benjamin J Dunmore, Sally Humphreys, Seiya Imoto, Christopher Savoie, Satoru Miyano, Satoru Kuhara, David Jeffries, Cristin Print, D Stephen Charnock-Jones

BMC Genomics 14(1) 23-23 2013年査読有り
Cell Cycle Gene Networks Are Associated with Melanoma Prognosis

Li Wang, Daniel G. Hurley, Wendy Watkins, Hiromitsu Araki, Yoshinori Tamada, Anita Muthukaruppan, Louis Ranjard, Eliane Derkac, Seiya Imoto, Satoru Miyano, Edmund J. Crampin, Cristin G. Print, Ying Xu

PLoS ONE 7(4) 2012年4月査読有り
Computational gene network analysis reveals TNF-induced angiogenesis

Kentaro Ogami, Rui Yamaguchi, Seiya Imoto, Yoshinori Tamada, Hiromitsu Araki, Cristin Print, Satoru Miyano

BMC Systems Biology 6(Suppl 2) 2012年査読有り
Gene network inference and visualization tools for biologists: application to new human transcriptome datasets

Daniel Hurley, Hiromitsu Araki, Yoshinori Tamada, Ben Dunmore, Deborah Sanders, Sally Humphreys, Muna Affara, Seiya Imoto, Kaori Yasuda, Yuki Tomiyasu, Kosuke Tashiro, Christopher Savoie, Vicky Cho, Stephen Smith, Satoru Kuhara, Satoru Miyano, D. Stephen Charnock-Jones, Edmund J. Crampin, Cristin G. Print

Nucleic Acids Research 40(6) 2377-2398 2011年11月査読有り
Estimating Genome-Wide Gene Networks Using Nonparametric Bayesian Network Models on Massively Parallel Computers

Y Tamada, S Imoto, H Araki, M Nagasaki, C Print, D S Charnock-Jones, S Miyano

IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 8(3) 683-697 2011年5月査読有り
SiGN: Large-scale gene network estimation environment for high performance computing

Tamada Y, Shimamura T, Yamaguchi R, Imoto S, Nagasaki M, Miyano S

Genome Informatics 25(1) 40-52 2011年査読有り筆頭著者
SiGN-SSM: Open source parallel software for estimating gene networks with state space models

Tamada, Y., Yamaguchi, R., Imoto, S., Hirose, O., Yoshida, R., Nagasaki, M., Miyano, S.

Bioinformatics 27(8) 2011年査読有り

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MISC

電子カルテデータを用いた機械学習によるAKI発症予測モデルの構築と検証

内野詠一郎, 内野詠一郎, 佐藤憲明, 佐藤憲明, 櫻木実, 櫻木実, 玉田嘉紀, 山田博之, 山田博之, 柳田素子, 奥野恭史

日本集中治療医学会学術集会(Web) 48th 2021年
Dynamic change of gene-to-gene regulatory networks in response to SARS-CoV-2 infection

Yoshihisa Tanaka, Kako Higashihara, Mai Adachi Nakazawa, Fumiyoshi Yamashita, Yoshinori Tamada, Yasushi Okuno

arXiv 2020年8月21日責任著者
【AI、ICT】臨床データを用いた医療ビッグデータの解析と創薬への応用

内野詠一郎, 佐藤憲明, 小島諒介, 玉田嘉紀, 柳田素子, 奥野恭史

日本腎臓学会誌 62(2) 64-68 2020年3月
AIと医療データ主導型個別化医療と予測医療

奥野恭史, 小清水宏, 鎌田真由美, 玉田嘉紀, 小島諒介, 内野詠一郎

あいみっく 41(1) 2-5 2020年2月
機械学習を利用した医療現場の退院時サマリ作成業務軽減に向けた試み

早川龍雄, 内野詠一郎, 玉田嘉紀, 奥野恭史

言語処理学会年次大会発表論文集(Web) 26th 2020年
電子カルテデータを用いた腎疾患AI

内野詠一郎, 玉田嘉紀, 奥野恭史

第93回日本薬理学会年会要旨集 93 2-CS 2020年
【AIとがん研究その妥当性、有効性ゲノム・エピゲノムから細胞・医用画像まで】分子レベルにおけるAIの創薬応用

田中良尚, 小島諒介, 玉田嘉紀, 鎌田真由美, 奥野恭史

実験医学 37(16) 2702-2707 2019年10月
【創薬とIT】標的分子探索、ドラッグリポジショニング、オミクスメカニズム解明

岩田浩明, 小島諒介, 玉田嘉紀

細胞 51(7) 318-321 2019年6月
【医療におけるAIの活用】医療×AI AIの基礎と医療への応用

玉田嘉紀, 佐藤憲明, 奥野恭史

整形・災害外科 62(3) 215-221 2019年3月
電子カルテ診療録に対する機械学習を用いた重要キーワード抽出機能の開発と今後の診療支援機能への展望

早川龍雄, 井上和仁, 玉田嘉紀, 内野詠一郎, 奥野恭史

医療情報学連合大会論文集 38回 788-791 2018年11月
電子カルテ診療録に対する機械学習を用いた重要キーワード抽出機能の開発と今後の診療支援機能への展望

早川龍雄, 井上和仁, 玉田嘉紀, 内野詠一郎, 奥野恭史

医療情報学連合大会論文集(CD-ROM) 38th 2018年
日本人における前立腺癌の遺伝子変異解析と癌化経路の予測

笠島理加, 山口類, 清水英悟, 玉田嘉紀, 新井田厚司, 岸田健, 青木一郎, 井元清哉, 宮野悟, 上村博司, 宮城洋平

日本癌学会総会記事 75回 P-2242 2016年10月
Significant growth suppressive effects of TOPK and MELK inhibitors in kidney cancer

Taigo Kato, Hiroyuki Inoue, Seiya Imoto, Yoshinori Tamada, Takashi Miyamoto, Yo Matsuo, Yusuke Nakamura, Jae-Hyun Park

CANCER RESEARCH 76 2016年7月
【ビッグデータ変革する生命科学・医療激増するオミクスデータ・医療データとどう向き合い、どう活用すべきか?】(第1章)ビッグデータと生命科学「京」を使った大規模データ解析によるがんのシステム異常の網羅的解析

宮野悟, 伊東聰, Park Heewon, 白石友一, 島村徹平, 玉田嘉紀, 井元清哉

実験医学 34(5) 733-738 2016年3月
肺腺癌におけるβカテニンの活性化はイレッサ(gefitinib)への耐性に寄与する

中田飛鳥, 吉田亮, 山口類, 玉田嘉紀, 藤田アンドレ, 島村徹平, 井元清哉, 樋口知之, 野村将春, 木村達郎, 軒原浩, 東山聖彦, 近藤和也, 西原広史, 東條有伸, 矢野聖二, 宮野悟, 後藤典子

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [3P1117]-[3P1117] 2015年12月
乳がん患者のタキサン系抗がん剤による術前化学療法の応答性予測

宮口健, 井元清哉, 牛嶋大, 松浦正明, 玉田嘉紀, 山口類, 宮野悟, 三木義男

日本癌学会総会記事 74回 J-1175 2015年10月
肺腺癌におけるβカテニンの活性化はイレッサ(gefitinib)への耐性に寄与する

中田飛鳥, 吉田亮, 山口類, 玉田嘉紀, 藤田アンドレ, 島村徹平, 井元清哉, 樋口知之, 野村将春, 木村達郎, 軒原浩, 東山聖彦, 近藤和也, 西原広史, 東條有伸, 矢野聖二, 宮野悟, 後藤典子

日本分子腫瘍マーカー研究会プログラム・講演抄録 35回 72-73 2015年9月
肺腺癌におけるβカテニンの活性化はイレッサ(gefitinib)への耐性に寄与する

中田飛鳥, 木村達郎, 軒原浩, 東山聖彦, 近藤和也, 西原広史, 東條有伸, 矢野聖二, 宮野悟, 後藤典子, 吉田亮, 山口類, 玉田嘉紀, 藤田アンドレ, 島村徹平, 井元清哉, 樋口知之, 野村将春

日本分子腫瘍マーカー研究会誌 31 46-47 2015年
乳がん患者のパクリタキセル応答性に関わる遺伝子ネットワーク解析(Gene network analysis of paclitaxel-response in breast cancer patients)

宮口健, 井元清哉, 牛嶋大, 松浦正明, 玉田嘉紀, 山口類, 宮野悟, 三木義男

日本癌学会総会記事 73回 P-3394 2014年9月
システムズバイオロジー手法を用いた肺癌の分子病態に関わる遺伝子制御ネットワークの描出(A systems biology approach towards better understanding of miRNA/mRNA regulatory networks in non-small cell lung cancer)

梶野泰祐, 有馬千夏, 玉田嘉紀, 井元清哉, 島田友香子, 宮野悟, 高橋隆

日本癌学会総会記事 71回 252-253 2012年8月

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