Yu Nakajima

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Research Areas

 
 

Academic & Professional Experience

 
Apr 2018
 - 
Mar 2019
Project Researcher, Atmosphere and Ocean research Institute, The University of Tokyo
 

Education

 
Apr 2012
 - 
Mar 2019
Department of Frontier Science, Atmosphere and Ocean Research Institute, The University of Tokyo
 
Apr 2008
 - 
Mar 2012
Department of Agriculture, Kyushu University
 

Awards & Honors

 
Aug 2017
Poster Award
 
Sep 2013
Most Outstanding Poster Award
 
13th SAME Symposium for Aquatic Microbial Ecology, Stresa, Italy.

Published Papers

 
Needham DM, Yoshizawa S, Hosaka T, Poirier C, Choi CJ, Hehenberger E, Irwin NAT, Wilken S, Yung CM, Bachy C, Kurihara R, Nakajima Y, Kojima K, Kimura-Someya T, Leonard G, Malmstrom RR, Mende DR, Olson DK, Sudo Y, Sudek S, Richards TA, DeLong EF, Keeling PJ, Santoro AE, Shirouzu M, Iwasaki W, Worden AZ
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America      Sep 2019   [Refereed]
Shibukawa A, Kojima K, Nakajima Y, Nishimura Y, Yoshizawa S, Sudo Y
Biochemistry      May 2019   [Refereed]
Wong SK, Yoshizawa S, Nakajima Y, Cuadra MJ, Nogi Y, Nakamura K, Takami H, Ogura Y, Hayashi T, Chiura HX, Hamasaki K
International journal of systematic and evolutionary microbiology   68(9) 2872-2877   Sep 2018   [Refereed]
Kumagai Y, Yoshizawa S, Nakajima Y, Watanabe M, Fukunaga T, Ogura Y, Hayashi T, Oshima K, Hattori M, Ikeuchi M, Kogure K, DeLong EF, Iwasaki W
The ISME journal   12(5) 1329-1343   May 2018   [Refereed]
Hasegawa M, Nakajima Y, Wong SK, Nakamura K, Ogura Y, Hayashi T, Kogure K, Yoshizawa S
Genome announcements   6(22)    May 2018   [Refereed]

Misc

 
中島 悠, 江崎 和音, 菊池 結貴子, 宮武 広直, 安藤 康伸, 生出 秀行, 横山 広美, 音野 瑛俊
科学技術コミュニケーション = Japanese journal of science communication   (21) 59-75   Jun 2017
大学院生出張授業プロジェクト(BAP)は,2008年に発足した学生団体であり,「高校生に研究の 魅力を伝える」「出張授業を全国の大学院生の文化にする」という2つの理念を掲げて活動を行ってきた.出張授業の実施先はメンバーである大学院生の出身高校を想定しており,これは大学院生・ 高校生の双方にメリットの存在する形態である.これまでの出張授業件数は129件,延べの受講者 は6,600人を超え,全国各地の高校で出張授業を実施してきた.東京大学大学院の全学から多様な 専門分野のメンバーが集まり,長年...
菊池 結貴子, 江崎 和音, 中島 悠, 石川 遼子, 伊與木 健太, 正田 亜八香, 音野 瑛俊
科学技術コミュニケーション   (20) 3-13   Jan 2017
近年,科学者と非科学者がテーブルを囲んで気軽に語り合う「サイエンスカフェ」が日本で広がりつつあり,開催回数・開催場所ともに急激に増加している.それに伴って,サイエンスカフェの形式も多様化してきており,現在では実に様々な形式のサイエンスカフェが開催・報告されている.本稿では,こうしたサイエンスカフェの多様性の一端として,著者らの運営するイベント「BAPcafe」を取り上げ,その運営方法と実施実績を詳述するとともに,実施記録や参加者へのアンケートをもとに,BAP cafeの特徴と効果および今後...
Yamada Takahito, Nakajima Yu, Ezaki Kazune, Shinogi Shingo, Shoda Ayaka, Yokoyama Hiromi, BAP collaboration
Meeting Abstracts of the Physical Society of Japan   69(0)    2014

Conference Activities & Talks

 
Yu Nakajima, Keiichi Kojima, Satoko Doi, Yuichiro Kashiyama, Ryosuke Nakai, Yuki Sudo, Kazuhiro Kogure, Susumu Yoshizawa
16th SAME Symposium of Aquatic Microbial Ecology   1 Sep 2019   
A haloarchaeal halorhodopsin-like Cl– pump in marine bacteria
Susumu Yoshizawa, Yu Nakajima, Kazuhiro Kogure
17th International Symposium on Microbial Ecology (ISME17)   12 Aug 2018   
Yu Nakajima, Satoko Doi, Keiichi Kojima, Yuki Sudo, Kazuhiro Kogure, Susumu Yoshizawa
32th JSME   11 Jul 2018   日本微生物生態学会
ロドプシンを保有するUltra-small actinobacteriaの光利用戦略
Yu Nakajima, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure
環境微生物系学会合同大会2017   29 Aug 2017   
複数のロドプシンを保有する細菌の比較トランスクリプトーム解析
中島悠, 吉澤晋, Edward, F. DeLong, 木暮一啓
水圏微生物研究フォーラム2016   9 Aug 2016   The University of Tokyo, AORI
プロテオロドプシン保有発光細菌における発光量の調節
Yu Nakajima, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure
BMB2015   1 Dec 2015   日本分子生物学会・異本生化学会
Physiological advantage of Rhodopsin-possessing bacteria: unseen residents of marine euphotic zone
Yu Nakajima, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure
Kyoto University International workshop Microbes beyond borders   5 Mar 2015   Kyoto University
Physiological advantage of bacteria possessing multiple rhodopsins
Yu Nakajima, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure
14th SAME Symposium for Aquatic Microbial Ecology   23 Aug 2015   
大学院生出張授業プロジェクト(BAP) 活動報告III
山田崇人, 中島悠, 江崎和音, 篠木新吾, 正田亜八香, 横山広美, 他BAP collaboration
日本物理学会第69回年次大会   27 Mar 2013   日本物理学会
Vibrio属細菌におけるプロテオロドプシンの活性評価および生理的役割の解明
Yu Nakajima, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure
29th JSME   22 Nov 2013   日本微生物生態学会
Quantification of the proton pump activity of proteorhodopsin in Vibrio campbellii
Yu Nakajima, Susumu Yoshizawa, Kazuhiro Kogure
13th SAME Symposium for Aquatic Microbial Ecology   8 Sep 2013   

Research Grants & Projects

 
JSPS: JSPS Young Research Fellowship
Project Year: Apr 2019 - Mar 2022    Investigator(s): Yu Nakajima
海洋細菌が持つ3つの異なるロドプシンにおけるpH依存型「使い分け」仮説の証明
日本科学協会: 笹川科学研究助成
Project Year: Apr 2017 - Mar 2018    Investigator(s): Yu Nakajima
ロドプシン保有細菌におけるハイブリッドソーラー自動車仮説の証明
JSPS: JSPS Young Research Fellowship
Project Year: Apr 2015 - Mar 2017    Investigator(s): Yu Nakajima