杉原優 (Yu Sugihara) - マイポータル

基本情報

所属: セインズベリー研究所チームリーダー

学位: 博士（農学）(2023年3月京都大学)
修士（農学）(2020年3月京都大学)

連絡先: yu.sugiharatsl.ac.uk
研究者番号: 61001376
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-6042-1091
J-GLOBAL ID: 202401011397049687
researchmap会員ID: R000066073

外部リンク: https://yusugihara.github.io

研究キーワード

研究分野

経歴

2025年1月 - 現在

セインズベリー研究所, チームリーダー
2024年4月 - 2024年11月

公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 契約研究員
2021年10月 - 2024年3月

セインズベリー研究所, 研究員

学歴

2020年4月 - 2023年3月

京都大学, 大学院農学研究科
2018年4月 - 2020年3月

京都大学, 大学院農学研究科
2014年4月 - 2018年3月

京都大学, 農学部, 資源生物科学科

論文

Helper NLR immune protein NRC3 evolved to evade inhibition by a cyst nematode virulence effector

Yu Sugihara, Jiorgos Kourelis, Mauricio P. Contreras, Hsuan Pai, Adeline Harant, Muniyandi Selvaraj, AmirAli Toghani, Claudia Martínez-Anaya, Sophien Kamoun

PLOS Genetics 2025年4月9日筆頭著者
A hierarchical immune receptor network in lettuce reveals contrasting patterns of evolution in sensor and helper NLRs

Hsuan Pai, Toshiyuki Sakai, Andres Posbeyikian, Raoul Frijters, Yu Sugihara, Mauricio P. Contreras, Jiorgos Kourelis, Hiroaki Adachi, Sophien Kamoun, AmirAli Toghani

2025年2月25日
Can AI modelling of protein structures distinguish between sensor and helper NLR immune receptors?

AmirAli Toghani, Raoul Frijters, Tolga O. Bozkurt, Ryohei Terauchi, Sophien Kamoun, Yu Sugihara

2024年11月26日最終著者責任著者
Activation of plant immunity through conversion of a helper NLR homodimer into a resistosome

Muniyandi Selvaraj, AmirAli Toghani, Hsuan Pai, Yu Sugihara, Jiorgos Kourelis, Enoch Lok Him Yuen, Tarhan Ibrahim, He Zhao, Rongrong Xie, Abbas Maqbool …

PLOS Biology 22(10) e3002868-e3002868 2024年10月18日
Subfunctionalization of NRC3 altered the genetic structure of the Nicotiana NRC network

Ching-Yi Huang, Yu-Seng Huang, Yu Sugihara, Hung-Yu Wang, Lo-Ting Huang, Juan Carlos Lopez-Agudelo, Yi-Feng Chen, Kuan-Yu Lin, Bing-Jen Chiang, AmirAli Toghani …

PLOS Genetics 20(9) e1011402-e1011402 2024年9月12日
Impact of rice GENERAL REGULATORY FACTOR14h (GF14h) on low-temperature seed germination and its application to breeding

Yusaku Sugimura, Kaori Oikawa, Yu Sugihara, Hiroe Utsushi, Eiko Kanzaki, Kazue Ito, Yumiko Ogasawara, Tomoaki Fujioka, Hiroki Takagi, Motoki Shimizu …

PLOS Genetics 20(8) e1011369-e1011369 2024年8月7日
Multiple Horizontal Mini-chromosome Transfers Drive Genome Evolution of Clonal Blast Fungus Lineages

Ana Cristina Barragan, Sergio M Latorre, Angus Malmgren, Adeline Harant, Joe Win, Yu Sugihara, Hernán A Burbano, Sophien Kamoun, Thorsten Langner

Molecular Biology and Evolution 41(8) 2024年8月2日
Disentangling the complex gene interaction networks between rice and the blast fungus identifies a new pathogen effector

Yu Sugihara, Yoshiko Abe, Hiroki Takagi, Akira Abe, Motoki Shimizu, Kazue Ito, Eiko Kanzaki, Kaori Oikawa, Jiorgos Kourelis, Thorsten Langner …

PLOS Biology 21(1) 2023年1月19日筆頭著者
Phylogenomic analysis in Latilactobacillus sakei by using polymorphisms detected by next-generation sequencing

Chisato NISHIYAMA, Suguru SEKIGUCHI, Yu SUGIHARA, Minami NISHIKAWA, Natsu MAKITA, Tenta SEGAWA, Momoka TERASAKI, Hiroki TAKAGI, Takashi KOYANAGI

Bioscience of Microbiota, Food and Health 2023年
NGS-based genome wide association study helps to develop co-dominant marker for the physical map-based locus of PFRU controlling flowering in cultivated octoploid strawberry

Sorachi Saiga, Maiko Tada, Tenta Segawa, Yu Sugihara, Minami Nishikawa, Natsu Makita, Minami Sakamoto, Kanako Tanaka, Takuya Wada, Hiroki Takagi

Euphytica 219(1) 2023年1月
Genome Analysis Revives a Forgotten Hybrid Crop Edo-dokoro in the Genus Dioscorea

Satoshi Natsume, Yu Sugihara, Aoi Kudoh, Kaori Oikawa, Motoki Shimizu, Yuko Ishikawa, Masahiro Nishihara, Akira Abe, Hideki Innan, Ryohei Terauchi

Plant and Cell Physiology 2022年11月22日
Rice apoplastic CBM1-interacting protein counters blast pathogen invasion by binding conserved carbohydrate binding module 1 motif of fungal proteins

Takumi Takeda, Machiko Takahashi, Motoki Shimizu, Yu Sugihara, Tetsuro Yamashita, Hiromasa Saitoh, Koki Fujisaki, Kazuya Ishikawa, Hiroe Utsushi, Eiko Kanzaki …

PLOS Pathogens 2022年9月29日
A genetically linked pair of NLR immune receptors shows contrasting patterns of evolution

Motoki Shimizu, Akiko Hirabuchi, Yu Sugihara, Akira Abe, Takumi Takeda, Michie Kobayashi, Yukie Hiraka, Eiko Kanzaki, Kaori Oikawa, Hiromasa Saitoh …

Proceedings of the National Academy of Sciences 119(27) 2022年7月5日
Whole genome sequencing of a wild yam species Dioscorea tokoro reveals a genomic region associated with sex

Satoshi Natsume, Hiroki Yaegashi, Yu Sugihara, Akira Abe, Motoki Shimizu, Kaori Oikawa, Benjamen White, Aoi Kudoh, Ryohei Terauchi

2022年6月13日
High-performance pipeline for MutMap and QTL-seq

Yu Sugihara, Lester Young, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Daniel J. Shea, Hiroki Takagi, Helen Booker, Hideki Innan, Ryohei Terauchi, Akira Abe

PeerJ 10 e13170-e13170 2022年3月18日筆頭著者
Sat-BSA: an NGS-based method using local de novo assembly of long reads for rapid identification of genomic structural variations associated with agronomic traits

Tenta Segawa, Chisato Nishiyama, Muluneh Tamiru-Oli, Yu Sugihara, Akira Abe, Hinako Sone, Noriaki Itoh, Mayu Asukai, Aiko Uemura, Kaori Oikawa …

Breeding Science 71(3) 299-312 2021年
Genome analyses reveal the hybrid origin of the staple crop white Guinea yam ( Dioscorea rotundata )

Yu Sugihara, Kwabena Darkwa, Hiroki Yaegashi, Satoshi Natsume, Motoki Shimizu, Akira Abe, Akiko Hirabuchi, Kazue Ito, Kaori Oikawa, Muluneh Tamiru-Oli …

Proceedings of the National Academy of Sciences 117(50) 31987-31992 2020年12月15日筆頭著者

MISC

Population Genomics of Yams: Evolution and Domestication of Dioscorea Species

Yu Sugihara, Aoi Kudoh, Muluneh Tamiru Oli, Hiroki Takagi, Satoshi Natsume, Motoki Shimizu, Akira Abe, Robert Asiedu, Asrat Asfaw, Patrick Adebola …

Population Genomics 2021年筆頭著者

受賞

2024年8月

日本進化学会ポスドク口頭発表賞優秀賞