飛松裕基 (Yuki Tobimatsu) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学生存圏研究所教授
: (兼任)　大学院農学研究科応用生命科学専攻教授（協力講座）

J-GLOBAL ID: 201401067408013947
Researcher ID: S-9248-2019
researchmap会員ID: 7000009499

外部リンク: http://www.rish.kyoto-u.ac.jp/lmsfpm/

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

京都大学, 生存圏研究所, 教授
2015年3月 - 2023年3月

京都大学, 生存圏研究所, 准教授
2014年1月 - 2015年2月

京都大学, 大学院農学研究科, 助教
2012年12月 - 2013年12月

米国エネルギー省グレートレイクバイオエネルギー研究センター, 植物科学部門, サイエンティスト
2012年4月 - 2013年12月

ウィスコンシン大学マジソン校, バイオケミストリー部門, アシスタントサイエンティスト
2010年4月 - 2012年3月

ウィスコンシン大学マジソン校, バイオケミストリー部門, 日本学術振興会海外特別研究員
2009年7月 - 2010年3月

ウィスコンシン大学マジソン校, バイオケミストリー部門, ポスドク研究員
2008年4月 - 2009年6月

京都大学, 大学院農学研究科, 日本学術振興会特別研究員DC2/PD

学歴

2004年4月 - 2009年3月

京都大学, 大学院農学研究科, 森林科学専攻
2000年4月 - 2004年3月

京都大学, 農学部, 生物機能科学科

委員歴

2023年4月 - 現在

日本木材学会, 代議員
2023年4月 - 現在

日本農芸化学会関西支部, 幹事校庶務幹事
2023年4月 - 現在

日本木材学会, 編集委員会
2021年11月 - 現在

Lignin, Editorial Board
2021年11月 - 現在

リグニン学会, 理事
2021年4月 - 現在

日本木材学会バイオマス変換研究会, 幹事
2020年6月 - 現在

Frontiers in Plant Science, Review Editor
2022年8月 - 2023年12月

Scientific Reports, Editorial Board

受賞

論文

120

A green degumming approach for lignocellulosic kenaf bast using ethanolamine deep eutectic solvent

Yan Song, Kai Nie, Pingping Ji, Changchun Sun, Puliao He, Shuai Zhang, Wei Jiang, Yuanming Zhang, Yuki Tobimatsu, Guangting Han …

International Journal of Biological Macromolecules 311 143717-143717 2025年6月査読有り
Taxus NPF transporter involved in the uptake of 10‐deacetylbaccatin III facilitates the biosynthesis of taxane compounds

Hiroaki Kusano, Homare Tabata, Hao Li, Kaori Kanazawa, Hiroshi Minami, Yoshihiro Kato, Yuki Tobimatsu, Kazufumi Yazaki

The Plant Journal 122(2) 2025年4月27日査読有り
Essential yet dispensable: the role of CINNAMATE 4-HYDROXYLASE in rice cell wall lignification

Supatmi Supatmi, Lydia Pui Ying Lam, Senri Yamamoto, Osama A Afifi, Pingping Ji, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, Toshiaki Umezawa, Yuki Tobimatsu

Plant Physiology 2025年4月24日査読有り
Glucosylation of Endogenous Haustorium-inducing factors Underpins Kin Avoidance in Parasitic Plants

Lei Xiang, Songkui Cui, Simon B. Saucet, Moe Takahashi, Shoko Inaba, Bing Xie, Mario Schilder, Shota Shimada, Mengqi Cui, Mutsumi Watanabe …

bioRxiv (preprint) 2025年4月22日
Stacked mutations disrupting syringyl and p-coumaroylated lignin biosynthesis in rice result in lignin dominated by guaiacyl units: insights into grass-specific lignin monomer biosynthesis and polymerization mechanisms

Pingping Ji, Osama A. Afifi, Senri Yamamoto, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, Toshiaki Umezawa, Yuki Tobimatsu

bioRxiv (preprint) 2025年3月25日
Altered development and lignin deposition in rice p‐COUMAROYL ESTER 3‐HYDROXYLASE loss‐of‐function mutants

Yuri Takeda‐Kimura, Tetsuya Mori, Shiro Suzuki, Masahiro Sakamoto, Kazuki Saito, Ryo Nakabayashi, Yuki Tobimatsu, Toshiaki Umezawa

The Plant Journal 121(5) 2025年3月4日査読有り
Striga hermonthica induces lignin deposition at the root tip to facilitate prehaustorium formation and obligate parasitism

Songkui Cui, Yuri Takeda-Kimura, Takanori Wakatake, Jun Luo, Yuki Tobimatsu, Satoko Yoshida

Plant Communications 101294-101294 2025年3月査読有り
Electro-oxidation of synthetic lignin with linoleic acid and co-catalyst

Bing Xie, Yuki Tobimatsu, Toshiyuki Takano

Journal of Wood Science 71(1) 2025年2月19日査読有り
The distribution of monolignol glucosides coincides with lignification during the formation of compression wood in Pinus thunbergii

Naoki Maeda, Dan Aoki, Syunya Fujiyasu, Yasuyuki Matsushita, Masato Yoshida, Hideto Hiraide, Hayato Mitsuda, Yuki Tobimatsu, Kazuhiko Fukushima

The Plant Journal 2024年12月14日査読有り
Disruption of aldehyde dehydrogenase decreases cell wall‐bound p‐hydroxycinnamates and improves cell wall digestibility in rice

Senri Yamamoto, Osama Ahmed Afifi, Lydia Pui Ying Lam, Yuri Takeda‐Kimura, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, Laura E. Bartley, Toshiaki Umezawa, Yuki Tobimatsu

The Plant Journal 2024年11月21日査読有り
Essential Yet Dispensable: The Role of CINNAMATE 4-HYDROXYLASE in Rice Cell Wall Lignification

Supatmi, Lydia Pui Ying Lam, Senri Yamamoto, Osama A. Afifi, Pingping Ji, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, Toshiaki Umezawa, Yuki Tobimatsu

bioRxiv (preprint; published version: https://doi.org/10.1093/plphys/kiaf164) 2024年10月13日
Expression of laccase and ascorbate oxidase affects lignin composition in Arabidopsis thaliana stems

Konan Ishida, Senri Yamamoto, Takashi Makino, Yuki Tobimatsu

Journal of Plant Research 2024年10月7日査読有り
Altered Lignin Accumulation in Sorghum Mutated in Silicon Uptake Transporter SbLsi1

Reza Ramdan Rivai, Kiyoshi Yamazaki, Masaru Kobayashi, Yuki Tobimatsu, Tsuyoshi Tokunaga, Fujiwara Toru, Toshiaki Umezawa

Plant and Cell Physiology 2024年9月30日査読有り
Tannins from Acacia mangium bark as natural dyes for textiles: characteristics and applications

Maya Ismayati, Nissa Nurfajrin Solihat, Fifi Melinda Setiawati, Wasrin Syafii, Yuki Tobimatsu, Deni Zulfiana

Journal of Renewable Materials 12(9) 1625-1637 2024年8月査読有り
Acid-catalyzed solvolysis of softwood in caprylyl glycol to produce lignin derivatives

Tomohiro Yamada, Yuki Tobimatsu, Thi Thi Nge, Yusuke Matsumoto, Tatsuhiko Yamada

ACS Omega 9(25) 27610-27617 2024年6月10日査読有り
Antioxidant and UV-blocking activity of PVA/tannin-based bioplastics in food packaging application

Maya Ismayati, Netha Amelia Nur Fatah, Engela Evy Ernawati, Juliandri, Wida Banar Kusumaningrum, Muhammad Adly R. Lubis, Widya Fatriasari, Nissa Nurfajrin Solihat, Fahriya Puspita Sari, Abdul Halim …

International Journal of Biological Macromolecules 128332-128332 2023年12月査読有り
Microstructural changes in carbonized wood-lignin, a potential space material, in response to atomic oxygen irradiation

Toshimitsu Hata, Sensho Honma, Takeshi Kajimoto, Kyoichi Oshida, Yuki Tobimatsu, Masahito Tagawa, Hirotsugu Kojima, Subyakto

Biomass Conversion and Biorefinery 2023年10月16日査読有り
Disruption of p-coumaroyl-CoA:monolignol transferases in rice drastically alters lignin composition

Lydia Pui Ying Lam, Yuki Tobimatsu, Shiro Suzuki, Takuto Tanaka, Senri Yamamoto, Yuri Takeda-Kimura, Yuriko Osakabe, Keishi Osakabe, John Ralph, Laura E Bartley …

Plant Physiology 194(2) 832-848 2023年10月13日査読有り
Simultaneous suppression of lignin, tricin and wall‐bound phenolic biosynthesis via the expression of monolignol 4‐O‐methyltransferases in rice

Nidhi Dwivedi, Senri Yamamoto, Yunjun Zhao, Guichuan Hou, Forrest Bowling, Yuki Tobimatsu, Chang‐Jun Liu

Plant Biotechnology Journal 22(2) 330-346 2023年10月5日査読有り
Regioselective stilbene O-methylations in Saccharinae grasses

Andy C. W. Lui, Kah Chee Pow, Nan Lin, Lydia Pui Ying Lam, Guoquan Liu, Ian D. Godwin, Zhuming Fan, Chen Jing Khoo, Yuki Tobimatsu, Lanxiang Wang …

Nature Communications 14(1) 3462 2023年6月12日査読有り

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MISC

314

Development of transgenic rice highly enriched in syringyl lignin by boosting its biosynthesis in a mutant deficient in grass-specific lignin decoration

第75回日本木材学会大会 2025年3月
細胞壁架橋構造を増強したヒドロキシケイ皮アルデヒドデヒドロゲナーゼ過剰発現イネの作出

山本千莉, Pingping Ji, ydia Pui Ying Lam, 窪井健斗, 梅澤俊明, 飛松裕基

2025年3月
電解メディエーターシステムを用いたリグニンの酸化分解: 単離リグニンおよびバイオマス試料への適用

謝冰, 飛松裕基, Pingping Ji, 寺本好邦, 高野俊幸

第75回日本木材学会大会 2025年3月
反応条件最適化によるグリコール改質リグニンの高収率製造プロセス開発

大橋康典, 松本悠佑, サボーラスロー, ティティネー, 山田竜彦, 木村肇, 米川盛生, 下川路朋紘, 飛松裕基

第75回日本木材学会大会 2025年3月
Aqueous/organic solvent fractionation of softwood-derived glycol lignin and properties of the obtained fractions

Thi Thi Nge, Yuki Tobimatsu, Yusuke Matsumoto, László Szabó, Yasunori Ohashi, Tatsuhiko Yamada

International Symposium on Wood Science and Technology 2025 2025年3月
Higher accumulation of lignin in low-Si sorghum mutants

Reza Ramdan Rivai, Masaru Kobayashi, Kiyoshi Yamazaki, Takuji Miyamoto, Yuki Tobimatsu, Tsuyoshi Tokunaga, Toru Fujiwara, Toshiaki Umezawa

International Symposium on Wood Science and Technology 2025 2025年3月
柑橘分泌腔への脂溶性二次代謝産物の隔離に関与する遺伝子の探索

釜田陽光, 松下修平, 市川公康, 窪井健斗, 松川哲也, 三浦謙治, 飛松裕基, 矢﨑一史, 杉山暁史, 棟方涼介

第66回日本植物生理学会年会 2025年3月
ケイ素吸収の抑制はソルガム細胞壁のリグニン含量を増加させる

Reza Ramdan Rivai, 山崎清志, 宮本託志, 小林優, 飛松裕基, 德永毅, 藤原徹, 梅澤俊明

第66回日本植物生理学会年会 2025年3月
シロイヌナズナ種子ネオリグナンの立体化学制御に関与するディリジェントプロテインAtDIR12の機能解析

高江洲広司, 巽奏, 榊原圭子, 小埜栄一郎, 高野俊幸, 斉藤和季, 梅澤俊明, 飛松裕基

日本農芸化学会関西支部例会・第529回講演会 2025年2月
フェルラ酸架橋構造及びリグニン芳香核組成がイネ細胞壁の固体高次構造に及ぼす影響

山本千莉, Osama A. Afifi, 久住亮介, 小林加代子, 梅澤俊明, 飛松裕基

細胞壁研究者ネットワーク・第１８回定例研究会 2024年10月
イネの細胞壁形成に寄与するラッカーゼパラログの機能解析

窪井健斗, 寺野真季, 山本千莉, 巽奏, 三上文三, 刑部敬史, 刑部祐里子, 梅澤俊明, 飛松裕基

細胞壁研究者ネットワーク・第１８回定例研究会 2024年10月
Lignocellulose Molecular Assembly and Deconstruction Properties of Rice Transgenic and Mutant Lines with Altered Lignin and Ferulate Structure

Senri Yamamoto, Tomoya Imai, Osama A. Afifi, Ryosuke Kusumi, Kayoko Kobayashi, Laura E. Bartley, Toshiaki Umezawa, Yuki Tobimatsu

2nd ILS Pre-symposium on Lignin Analytics 2024年9月
Manipulation of lignin aromatic composition in grasses: elimination of syringyl lignin in rice mutant deficient in grass-specific lignin decoration

Ji Pingping, Osama A. Afifi, Senri Yamamoto, Keishi Osakabe, Yuriko Osakabe, Toshiaki Umezawa, Yuki Tobimatsu

2nd International Lignin Symposium 2024年9月
Electro-oxidation of lignin model compounds using electrolytic mediator system with various mediators

Bing Xie, Yuki Tobimatsu, Toshiyuki Takano

2nd International Lignin Symposium 2024年9月
Altered lignin accumulation in low silicon supply and mutants of sorghum

Reza Ramdan Rivai, Masaru Kobayashi, Kiyoshi Yamazaki, Takuji Miyamoto, Yuki Tobimatsu, Tsuyoshi Tokunaga, Toru Fujiwara, Toshiaki Umezawa

2nd International Lignin Symposium 2024年9月
Lignocellulose Molecular Assembly and Deconstruction Properties of Rice Transgenic and Mutant Lines with Altered Lignin and Ferulate Structure

Senri Yamamoto, Tomoya Imai, Osama A. Afifi, Ryosuke Kusumi, Kayoko Kobayashi, Laura E. Bartley, Toshiaki Umezawa, Yuki Tobimatsu

2nd International Lignin Symposium 2024年9月
Structural characterization of bast fibers before and after lignocellulose fractionations using deep eutectic solvents

Kai Nie, Pingping Ji, Wei Jiang, Guangting Han, Yuki Tobimatsu

2nd International Lignin Symposium 2024年9月
Correlation between ATR-FTIR spectral analysis and potentiometric titration for determining the functionalized carboxy group content in partially oxidized glycol lignin

Thi Thi Nge, Yuki Tobimatsu, Yasunori Ohashi, Yusuke Matsumoto, László Szabó, Tatsuhiko Yamada

2nd International Lignin Symposium 2024年9月
Acid-catalyzed caprylyl glycol solvolysis of softwood to produce functional lignin derivatives”（poster presentation）

Tomohiro Yamada, Yuki Tobimatsu, Thi Thi Nge, Yusuke Matsumoto, Tatsuhiko Yamada

2nd International Lignin Symposium 2024年9月
Fluctuation of ferulate content in sake rice grains under different climates and fertilization conditions

Takuji Miyamoto, Ikuhisa Nishida, Senri Yamamoto, Yuki Tobimatsu, Toshiaki Umezawa, Keigo Mikame, Norikuni Ohtake, Dai Hirata

2nd International Lignin Symposium 2024年9月

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講演・口頭発表等

Grass versus trees: from perspectives of lignin structure and biosynthesis

Yuki Tobimatsu

Stockholm University Japan-Sweden Lignin Meeting 2024年11月13日招待有り
「木」の誕生と進化をめぐる細胞壁の研究

飛松裕基

第534回生存圏シンポジウム・2024年京都大学森林科学公開講座・第18回⽣存圏フォーラム特別講演会「森と木の生物学」 2024年11月9日招待有り
リグニンの生合成と代謝工学

飛松裕基

生薬学会第70回年会シンポジウム1｜植物特化代謝物の生合成研究ー植物成分の成り立ちを改めて考えるー 2024年9月15日招待有り
Keynote Session: The Science and Engineering of Lignin (Session Introduction as Discussion Leader)

Mojgan Nejad, Yuki Tobimatsu

2024 Lignin Gordon Research Conference – Realizing Lignin's Potential in Biorefining by Bridging Biology, Chemistry, and Engineering – 2024年7月14日招待有り
Grass versus trees: from perspectives of lignin structure and biosynthesis

Yuki Tobimatsu

The 2nd International Mini-symposium on Wood Science – Towards a Brilliant Future with Wood Science – 2023年11月30日招待有り
木質バイオマスの形成機構とバイオテクノロジー ~主要芳香族成分リグニンを中心に〜

飛松裕基

静岡三大学連携講義「フロンティア科学特論Ⅰ」 2022年9月16日招待有り
NMR法を活用した木質バイオマスの構造・形成・利用研究

飛松裕基

第22回若手NMR研究会 2022年9月12日招待有り
Introduction by Discussion Leader for Session: Tools and Methods for the Analysis, Visualization and Structural Elucidation of Lignin

Yuki Tobimatsu

2022 Lignin Gordon Research Conference 2022年8月3日招待有り
How do grasses produce lignin differently from woods: case studies with rice

Yuki Tobimatsu

2022 Lignin Gordon Research Conference 2022年8月1日招待有り
How do grasses produce lignin differently from woods: case studies with rice

Yuki Tobimatsu

The 20th IUFRO Tree Biotech and the 2nd Forest Tree Molecular Biology and Biotechnology (FTMB) Conference 2022年7月8日招待有り
リグニンの多様性と可変性：組換え植物で探る木質の機能と利用へのインパクト

飛松裕基

第1回リグニン学会特別セミナー「リグニン科学の最前線」 2022年6月25日招待有り
Lignin complexity and flexibility: how and why do grasses produce lignins different from woods?

Yuki Tobimatsu

2022 World Wood Day Online Symposium and The Fourth IUFRO Forest Products Culture Colloquium 2022年3月21日招待有り
『リグニンの基礎－形成、構造、利用－』

飛松裕基, 秋山拓也, 松下泰幸

第64回―2021年紙パルプ技術協会年次大会/リグニン学会ミニシンポジウム 2021年11月4日招待有り
多様なリグニンモノマー〜リグニンの多様性・複雑性の源〜

飛松裕基

第65回リグニン討論会特別企画「リグニンの真の姿に迫る」 2020年11月17日招待有り
イネ科バイオマスを特徴付けるリグニンの構造多様性とその形成制御

飛松裕基

岡山大学資源植物科学研究所第3回作物イノベーション研究セミナー・植物機能性成分研究の最前線 2020年1月28日招待有り
植物細胞壁の形成と制御 –持続可能なバイオ燃料・有用化成品の生産に向けて–

飛松裕基

第 33 回京都大学宇治キャンパス産学交流会 2019年9月招待有り
Exploring lignin biosynthesis and bioengineering in grasses

飛松裕基

Bioengineering of lignocellulose for clean energy production: perspectivesand opportunities 2019年2月28日招待有り
代謝工学で探るセルロース系多糖とリグニンの微妙な関係：リグニン改変組換え植物におけるリグノセルロース特性の変化について

飛松裕基

セルロース学会北海道・東北支部セミナー：何が問題、セルロース 2019年1月21日招待有り
代謝工学で探る細胞壁超分子構造に及ぼすリグニンの寄与

飛松裕基

第3回動的木材化学懇談会 2019年1月12日招待有り
NMR approaches for studying lignin diversity and flexibility: principles and some case studies

Yuki Tobimatsu

Lignin Gordon Research Conference 2018年8月5日招待有り

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共同研究・競争的資金等の研究課題

リグニン改変植物で探る木質細胞壁の固体高次構造と機能発現

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

飛松裕基
多様なリグニン前駆物質の木化組織における輸送メカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2025年3月

津山濯, 高田直樹, 高野俊幸, 飛松裕基
統合ゲノム解析に基づく抗腫瘍性リグナン生合成機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

梅澤俊明, 飛松裕基, 山村正臣, 金谷重彦, 小野直亮
リグニンの分子構造が特異なクワの変異体を用いたゲノム編集樹木の有用性の実践的検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

梶田真也, 船田良, 古田裕三, 飛松裕基, 神代圭輔
細胞壁成分分布の網羅的解析から迫る樹木の姿勢制御機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

吉永新, 岸本崇生, 重冨顕吾, 上高原浩, 飛松裕基, 津山濯, 粟野達也
針葉樹二次代謝産物の腐朽菌による生物変換機構の網羅的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

堀千明, 飛松裕基
リグニンの多様性と可変性：組換え植物で探る木質の機能と利用へのインパクト

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

飛松裕基, 堀千明, 久住亮介, 梅澤俊明, 今井友也
きのこのゲノム編集技術を利用した木材腐朽現象の理解とバイオマス変換系の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

五十嵐圭日子, 飛松裕基, 高畠幸司
植物由来抗腫瘍性リグナン生合成系の微生物における新規構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年4月 - 2022年3月

梅澤俊明, 飛松裕基, 鈴木史朗
酵素分解反応を模倣するリグニンの電解システム反応の開発と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2021年3月

高野俊幸, 上高原浩, 飛松裕基, 榊原圭太
イネ科バイオマスの利用性向上を指向したフラボノイド修飾型リグニンの改変

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2017年11月 - 2020年3月

飛松裕基, LAM PUI YING
化学プローブを活用した木質形成の動的イメージング解析法の開発と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2016年4月 - 2020年3月

飛松裕基
細胞壁マトリックス成分の合成・梱包・輸送と堆積のダイナミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2015年4月 - 2020年3月

高部圭司, 上高原浩, 飛松裕基, 粟野達也, 津山濯, 高野俊幸, 吉永新
リグニンの新規主要構造であるリグニン-フラボノイド共重合体の形成・機能と応用展開

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2019年3月

飛松裕基, 鈴木史朗, 梅澤俊明, 吉永新, 高野俊幸
バイオマスの限定的分解-分離-再結合反応を基盤とした高付加価値医療材料の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2019年3月

上高原浩, 増田誠司, 飛松裕基, 高野俊幸, 吉永新, 田中義正, 蟹江治, 濱田剛, 早川和久
メタボリックラベル法を活用した細胞壁リグニンの新生体イメージング法の開発と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2014年8月 - 2016年3月

飛松裕基, 高野俊幸, 上高原浩
代謝工学と有機化学の連携による新規有用リグニンの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

梅澤俊明, 鈴木史朗, 飛松裕基, 柴田大輔, 鈴木秀幸, 河本晴雄, 菊地淳
超分子構造を惹起するバイオマスハイブリッド材料の開発と新規機能開拓

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

上高原浩, 高野俊幸, 吉永新, 田中義正, 飛松裕基, 早乙女周子
モノリグノール配糖体を用いた酵素的脱水素重合反応の解析と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2008年 - 2009年

飛松裕基

飛松裕基

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受賞

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