小野幸輝 (yukiteru ono) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院新領域創成科学研究科特任研究員

J-GLOBAL ID: 202001016394886165
researchmap会員ID: R000011132

論文

Development of PCR primers enabling the design of flexible sticky ends for efficient concatenation of long DNA fragments.

Kohei Nomura, Kaoru Onda, Hirotaka Murase, Fumitaka Hashiya, Yukiteru Ono, Goro Terai, Natsuhisa Oka, Kiyoshi Asai, Daisuke Suzuki, Naho Takahashi …

RSC chemical biology 5(4) 360-371 2024年4月3日
Rtools: A Web Server for Various Secondary Structural Analyses on Single RNA Sequences.

Yukiteru Ono, Kiyoshi Asai

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2586 1-14 2023年
PBSIM3: a simulator for all types of PacBio and ONT long reads.

Yukiteru Ono, Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai

NAR genomics and bioinformatics 4(4) lqac092 2022年12月
MeCP2 Levels Regulate the 3D Structure of Heterochromatic Foci in Mouse Neurons.

Aya Ito-Ishida, Steven A Baker, Roy V Sillitoe, Yaling Sun, Jian Zhou, Yukiteru Ono, Junichi Iwakiri, Michisuke Yuzaki, Huda Y Zoghbi

The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience 40(45) 8746-8766 2020年11月4日
PBSIM2: a simulator for long read sequencers with a novel generative model of quality scores.

Yukiteru Ono, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada

Bioinformatics (Oxford, England) 37(5) 589-595 2020年9月25日
LncRRIsearch: A Web Server for lncRNA-RNA Interaction Prediction Integrated With Tissue-Specific Expression and Subcellular Localization Data.

Tsukasa Fukunaga, Junichi Iwakiri, Yukiteru Ono, Michiaki Hamada

Frontiers in genetics 10 462-462 2019年
AMAP: A pipeline for whole-genome mutation detection in Arabidopsis thaliana.

Kotaro Ishii, Yusuke Kazama, Tomonari Hirano, Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Mieko Yamada, Tomoko Abe

Genes & genetic systems 91(4) 229-233 2017年3月17日
Training alignment parameters for arbitrary sequencers with LAST-TRAIN.

Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Kiyoshi Asai, Martin C Frith

Bioinformatics (Oxford, England) 33(6) 926-928 2017年3月15日
Rtools: a web server for various secondary structural analyses on single RNA sequences.

Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Hisanori Kiryu, Kengo Sato, Yuki Kato, Tsukasa Fukunaga, Ryota Mori, Kiyoshi Asai

Nucleic acids research 44(W1) W302-7 2016年7月8日
Learning chromatin states with factorized information criteria.

Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Ryohei Fujimaki, Kiyoshi Asai

Bioinformatics (Oxford, England) 31(15) 2426-33 2015年8月1日
PBSIM: PacBio reads simulator--toward accurate genome assembly.

Yukiteru Ono, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada

Bioinformatics (Oxford, England) 29(1) 119-21 2013年1月1日
A regulatory circuit for piwi by the large Maf gene traffic jam in Drosophila.

Kuniaki Saito, Sachi Inagaki, Toutai Mituyama, Yoshinori Kawamura, Yukiteru Ono, Eri Sakota, Hazuki Kotani, Kiyoshi Asai, Haruhiko Siomi, Mikiko C Siomi

Nature 461(7268) 1296-9 2009年10月29日
Highly selective tuning of a silkworm olfactory receptor to a key mulberry leaf volatile.

Kana Tanaka, Yusuke Uda, Yukiteru Ono, Tatsuro Nakagawa, Makiko Suwa, Ryohei Yamaoka, Kazushige Touhara

Current biology : CB 19(11) 881-90 2009年6月9日
A bioinformatics strategy to produce a project structure of spiral development - Comprehensive functional analysis of the drug design target genes

Makiko Suwa, Yukiteru Ono

Synthesiology 2(4) 299-309 2009年
The Functional RNA Database 3.0: databases to support mining and annotation of functional RNAs.

Toutai Mituyama, Kouichirou Yamada, Emi Hattori, Hiroaki Okida, Yukiteru Ono, Goro Terai, Aya Yoshizawa, Takashi Komori, Kiyoshi Asai

Nucleic acids research 37(Database issue) D89-92 2009年1月
Computational overview of GPCR gene universe to support reverse chemical genomics study.

Makiko Suwa, Yukiteru Ono

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 577 41-54 2009年
The genome of a lepidopteran model insect, the silkworm Bombyx mori.

Insect biochemistry and molecular biology 38(12) 1036-45 2008年12月
Drosophila endogenous small RNAs bind to Argonaute 2 in somatic cells.

Yoshinori Kawamura, Kuniaki Saito, Taishin Kin, Yukiteru Ono, Kiyoshi Asai, Takafumi Sunohara, Tomoko N Okada, Mikiko C Siomi, Haruhiko Siomi

Nature 453(7196) 793-7 2008年6月5日
Idiographica: a general-purpose web application to build idiograms on-demand for human, mouse and rat.

Taishin Kin, Yukiteru Ono

Bioinformatics (Oxford, England) 23(21) 2945-6 2007年11月1日
fRNAdb: a platform for mining/annotating functional RNA candidates from non-coding RNA sequences.

Taishin Kin, Kouichirou Yamada, Goro Terai, Hiroaki Okida, Yasuhiko Yoshinari, Yukiteru Ono, Aya Kojima, Yuki Kimura, Takashi Komori, Kiyoshi Asai

Nucleic acids research 35(Database issue) D145-8 2007年1月

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MISC

Functional and structural overview of G-protein-coupled receptors comprehensively obtained from genome sequences

Makiko Suwa, Minoru Sugihara, Yukiteru Ono

Pharmaceuticals 4(4) 652-664 2011年
PiwiとpiRNAによる生殖幹細胞の非対称性制御

稲垣幸, 齋藤都暁, 光山統泰, 小野幸輝, 迫田絵里, 小谷葉月, 浅井清, 浅井清, 塩見春彦, 塩見美喜子

生化学 2009年
新規mRNA由来piRNAの同定と大Maf因子traffic jamによるショウジョウバエPiwiの機能制御

齋藤都暁, 稲垣幸, 光山統泰, 小野幸輝, 迫田絵里, 小谷葉月, 浅井潔, 浅井潔, 塩見春彦, 塩見美喜子 …

日本RNA学会年会要旨集 11th 2009年
ショウジョウバエAGO2に結合する内在性小分子RNAの解析

河村佳紀, 河村佳紀, 斎藤都暁, 光山統泰, 小野幸輝, 浅井潔, 浅井潔, 春原隆史, 岡田知子, 塩見美喜子 …

日本RNA学会年会要旨集 10th 2008年

小野幸輝

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