宇賀優作 (Yusaku Uga) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構作物研究部門作物デザイン研究領域作物デザイン開発グループグループ長
: 東京農業大学大学院農学研究科国際農業開発学専攻客員教授
: 鳥取大学乾燥地研究センター客員教授

学位: 博士(農学)(筑波大学)

研究者番号: 00391566
J-GLOBAL ID: 201501027614814137
researchmap会員ID: B000244751

外部リンク: https://rootomics.dna.affrc.go.jp/

海外の稲作に貢献するための研究にこれまで19年間取り組んできました。「根深くして葉茂る。」というように、根は作物生産にとって重要な器官です。私は根の遺伝的改良を通して、干ばつなどの不良環境に強いイネの品種開発をめざしています。遺伝子単離や機能解析などの基礎研究からフィールドにおける実用化研究まで幅広く活動しています。ご興味を持たれた方はぜひご連絡ください。多くの方と共に研究できることを楽しみにしています。

2017年度から、CREST研究課題「ROOTomicsを利用した環境レジリエント作物の創出」の研究代表として環境ストレスに頑健な理想の作物根系を明らかにする研究を進めています。

2020年からはムーンショット研究課題「サイバーフィジカルシステムを利用した作物強靭化による食料リスクゼロの実現」のPIとして新しい作物デザイン技術の開発を開始しました。

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年4月 - 現在

農業・食品産業技術総合研究機構作物研究部門作物デザイン研究領域作物デザイン開発グループグループ長
2021年4月 - 現在

鳥取大学乾燥地研究センター客員教授
2017年4月 - 現在

東京農業大学大学院国際農業開発学専攻客員教授
2016年4月 - 2021年3月

農業・食品産業技術総合研究機構次世代作物開発研究センター上級研究員
2009年4月 - 2016年3月

農業生物資源研究所主任研究員
2014年9月 - 2015年8月

コーネル大学客員研究員
2004年4月 - 2009年3月

農業生物資源研究所任期付研究員
2003年4月 - 2004年3月

農業生物資源研究所非常勤職員

学歴

2000年4月 - 2003年3月

筑波大学博士課程農学研究科
2000年7月 - 2002年9月

国際イネ研究所
1998年4月 - 2000年3月

筑波大学修士課程バイオシステム研究科
1994年4月 - 1998年3月

東京農業大学国際農業開発学科
1990年4月 - 1993年3月

香川県立観音寺第一高等学校

委員歴

2020年3月 - 現在

日本育種学会代議員
2018年9月 - 現在

Molecular Breeding 編集委員
2018年3月 - 現在

Rice 編集委員
2018年1月 - 現在

Plant Root 編集委員
2017年3月 - 現在

The Crop Journal 編集委員
2012年1月 - 現在

根の研究編集委員
2020年7月 - 2022年6月

JSPS 特別研究員等審査会及び卓越研究員候補者選考委員

受賞

論文

MORE PANICLES 3 , a natural allele of OsTB1/FC1 , impacts rice yield in paddy fields at elevated <scp> CO ₂ </scp> levels

Toshiyuki Takai, Yojiro Taniguchi, Megumu Takahashi, Hideki Nagasaki, Eiji Yamamoto, Sakiko Hirose, Naho Hara, Hiroko Akashi, Jun Ito, Yumiko Arai‐Sanoh, Kiyosumi Hori, Shuichi Fukuoka, Hidemitsu Sakai, Takeshi Tokida, Yasuhiro Usui, Hirofumi Nakamura, Kensuke Kawamura, Hidetoshi Asai, Takuma Ishizaki, Kyonoshin Maruyama, Keiichi Mochida, Nobuya Kobayashi, Motohiko Kondo, Hiroyuki Tsuji, Yasuhiro Tsujimoto, Toshihiro Hasegawa, Yusaku Uga

The Plant Journal 2023年3月27日査読有り最終著者
Rice immediately adapts the dynamics of photosynthates translocation to roots in response to changes in soil water environment

Yuta Miyoshi, Fumiyuki Soma, Yong-Gen Yin, Nobuo Suzui, Yusaku Noda, Kazuyuki Enomoto, Yuto Nagao, Mitsutaka Yamaguchi, Naoki Kawachi, Eiji Yoshida, Hideaki Tashima, Taiga Yamaya, Noriyuki Kuya, Shota Teramoto, Yusaku Uga

Frontiers in Plant Science 13 2023年1月18日査読有り最終著者
Four-dimensional measurement of root system development using time-series three-dimensional volumetric data analysis by backward prediction

Shota Teramoto, Yusaku Uga

Plant Methods 18(1) 2022年12月9日査読有り責任著者
Agritech imaging of underground plant root growth using a distributed fiber optic sensor

Mika Tei, Ettore Barbieri, Fumiyuki Soma, Yusaku Uga, Yosuke Kawahito

Optical Fibers and Sensors for Medical Diagnostics, Treatment and Environmental Applications XXII 11953 2022年3月2日査読有り
Identification of a unique allele in the quantitative trait locus for crown root number in <i>japonica</i> rice from Japan using genome-wide association studies

Shota Teramoto, Masanori Yamasaki, Yusaku Uga

Breeding Science 2022年査読有り責任著者
Quantification of Soil-surface Roots in Seedlings and Mature Rice Plants

Eiko Hanzawa, Yuka Kitomi, Yusaku Uga, Tadashi Sato

BIO-PROTOCOL 12(9) 2022年査読有り
Improving the efficiency of plant root system phenotyping through digitization and automation

Shota Teramoto, Yusaku Uga

Breeding Science 2022年査読有り責任著者
Plant root PET: visualization of photosynthate translocation to roots in rice plant

Y. Miyoshi, Y. Nagao, M. Yamaguchi, N. Suzui, Y.-G. Yin, N. Kawachi, E. Yoshida, S. Takyu, H. Tashima, T. Yamaya, N. Kuya, S. Teramoto, Y. Uga

Journal of Instrumentation 16(12) C12018-C12018 2021年12月1日査読有り
iPOTs: Internet of Things-based pot system controlling optional treatment of soil water condition for plant phenotyping under drought stress.

Yuko Numajiri, Kanami Yoshino, Shota Teramoto, Atsushi Hayashi, Ryo Nishijima, Tsuyoshi Tanaka, Takeshi Hayashi, Taiji Kawakatsu, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

The Plant journal : for cell and molecular biology 107(5) 1569-1580 2021年9月査読有り責任著者
RSAtrace3D: robust vectorization software for measuring monocot root system architecture

Shota Teramoto, Takanari Tanabata, Yusaku Uga

BMC PLANT BIOLOGY 21(1) 2021年8月査読有り責任著者
Synergy between a shallow root system with a DRO1 homologue and localized P application improves P uptake of lowland rice.

Aung Zaw Oo, Yasuhiro Tsujimoto, Mana Mukai, Tomohiro Nishigaki, Toshiyuki Takai, Yusaku Uga

Scientific reports 11(1) 9484-9484 2021年5月4日査読有り
The transcriptomic landscapes of rice cultivars with diverse root system architectures grown in upland field conditions.

Taiji Kawakatsu, Shota Teramoto, Satoko Takayasu, Natsuko Maruyama, Ryo Nishijima, Yuka Kitomi, Yusaku Uga

The Plant journal : for cell and molecular biology 106(4) 1177-1190 2021年5月査読有り責任著者
Dissection of root behavior to abiotic stimuli for breeding of climate-resilient crops.

Yusaku Uga, Mikio Nakazono

Breeding science 71(1) 1-1 2021年2月
Challenges to design-oriented breeding of root system architecture adapted to climate change.

Yusaku Uga

Breeding science 71(1) 3-12 2021年2月査読有り責任著者
A Deep Learning-Based Phenotypic Analysis of Rice Root Distribution from Field Images

S. Teramoto, Y. Uga

Plant Phenomics 2020 1-10 2020年10月16日査読有り責任著者
Root angle modifications by the DRO1 homolog improve rice yields in saline paddy fields.

Yuka Kitomi, Eiko Hanzawa, Noriyuki Kuya, Haruhiko Inoue, Naho Hara, Sawako Kawai, Noriko Kanno, Masaki Endo, Kazuhiko Sugimoto, Toshimasa Yamazaki, Shingo Sakamoto, Naoki Sentoku, Jianzhong Wu, Hitoshi Kanno, Nobutaka Mitsuda, Kinya Toriyama, Tadashi Sato, Yusaku Uga

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(35) 21242-21250 2020年9月1日査読有り責任著者
The intersection of nitrogen nutrition and water use in plants: new paths toward improved crop productivity

Darren C Plett, Kosala Ranathunge, Vanessa J Melino, Noriyuki Kuya, Yusaku Uga, Herbert J Kronzucker

Journal of Experimental Botany 71(15) 4452-4468 2020年7月25日
Rice functional genomics: theories and practical applications

Lizhong Xiong, Yusaku Uga, Yibo Li

MOLECULAR BREEDING 40(8) 2020年7月
De Novo Genome Assembly of the indica Rice Variety IR64 Using Linked-Read Sequencing and Nanopore Sequencing.

Tsuyoshi Tanaka, Ryo Nishijima, Shota Teramoto, Yuka Kitomi, Takeshi Hayashi, Yusaku Uga, Taiji Kawakatsu

G3 (Bethesda, Md.) 10(5) 1495-1501 2020年3月17日査読有り
根系形態の異なる水稲栽培土壌における水稲根層別分布割合と雑草発生との関係

天野一郎, 安達俊輔, 宇賀優作, 浅木直美

日本作物学会関東支部会報 35 20-21 2020年

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MISC

地中に隠れた作物根系のハイスループット・フェノタイピングを目指して—Towards high-throughput phenotyping of root system hidden underground—特集スマート育種の展開 : 現状と将来展望

寺本翔太, 宇賀優作

JATAFFジャーナル = JATAFF journal : 農林水産技術 10(12) 34-38 2022年12月
エックス線CTを用いたイネ根系計測のためのベクトル化ソフトウェアの開発

寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

根の研究 31(1) 2022年
植物に対する熱画像とRGB画像の3Dモデル構築及び3Dモデルレジストレーション手法の提案

林篤司, 高地伸夫, 高地伸夫, 七夕高也, 宇賀優作, 徳田献一

情報科学技術フォーラム講演論文集 21st 2022年
根の改良による環境ストレス耐性作物の開発-塩害水田向けのイネ根系形態-

宇賀優作

植調 55(11) 2022年
イネの根系形態を制御する遺伝子の農業への活用

宇賀優作

バイオサイエンスとインダストリー 79(3) 2021年
3Dクリノスタットによる微小重力処理後のイネ根端における重力刺激応答遺伝子の網羅的探索

久家徳之, 木富悠花, 西嶋遼, 川勝泰二, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
異なる根系を持つイネの品種間干ばつ応答発現プロファイルの比較

吉野花奈美, 沼尻侑子, 寺本翔太, 吉田沙樹, 西嶋遼, 宇賀優作, 川勝泰二

育種学研究 23 2021年
畑作条件で栽培した世界のイネ品種の根系フェノーム解析

寺本翔太, 高安聡子, 丸山奈津子, 木富悠花, 西嶋遼, 川勝泰二, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
野生イネOryza glumaepatulaが湛水処理で誘導的に形成する地表根の評価

宮下智貴, 宇賀優作, 塩野克宏

育種学研究 23 2021年
オミクスデータを利用した環境レジリエント作物創出のための研究基盤構築

宇賀優作, 七夕高也, 川勝泰二

育種学研究 23 2021年
RSAtrace3D:根系定量化のためのノイズに強い3次元ベクトル化ソフトウェア

寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
X線CTを用いた高温ストレスに対する土中のイネ根系の可塑性の解明

吉田沙樹, 沼尻侑子, 寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

育種学研究 23 2021年
干ばつ耐性向上をめざした稲の根系改良の試みと今後の展望

宇賀優作

熱帯農業研究 13(1) 2020年
地表根遺伝子(qSOR1)は塩害水田で生じる土壌の酸欠を回避し収量増に寄与する

佐藤雅志, 半澤栄子, 木富悠花, 菅野均志, 鳥山欽哉, 宇賀優作

育種学研究 22 2020年
水稲多植栽培におけるSEMIDWARF1およびDEEPER ROOTING 1の倒伏抵抗性に対する効果

大内蔵瑞穂, 宇賀優作, 木富悠花, 大川泰一郎

日本作物学会講演会要旨集 249th 2020年
深層学習を用いた画像解析によるフィールドでのイネ根系の多様性解析

寺本翔太, 宇賀優作

育種学研究 22 2020年
根系形態の違いが雑草発生と水稲による窒素吸収と収量に及ぼす影響

天野一郎, 川島正也, 安達俊輔, 宇賀優作, 浅木直美

日本作物学会講演会要旨集 249th 2020年
草型と根型のバランスが水稲品種IR64の耐倒伏性ならびに収量性に及ぼす影響

宇賀優作, 木富悠花, 大内蔵瑞穂, 大川泰一郎

育種学研究 22 2020年
地表根遺伝子qSOR1の同定と塩害水田向け品種育成への利用

木富悠花, 半澤栄子, 久家徳之, 井上晴彦, 原奈穂, 河合佐和子, 菅野徳子, 遠藤真咲, 杉本和彦, 山崎俊正, 坂本真吾, 千徳直樹, 呉健忠, 菅野均志, 光田展隆, 鳥山欽哉, 佐藤雅志, 宇賀優作

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2020 2020年
X線CTを用いたポット植え作物根の非破壊・迅速可視化技術

寺本翔太, 七夕高也, 宇賀優作

農研機構次世代作物開発研究センター成果情報(Web) 2020 2020年

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書籍等出版物

Rice Genomics, Genetics and Breeding

木富悠花, 伊藤純一, 宇賀優作 (担当:共著, 範囲:Genetic mechanisms involved in the formation of root system architecture)

Springer Nature 2018年
Genomics of Plant Genetic Resources

山本敏央, 宇賀優作, 矢野昌裕 (担当:共著, 範囲:Genomics-assisted allele mining and its integration into rice breeding)

Springer 2014年
Methodologies for root drought studies in rice

宇賀優作 (担当:共著, 範囲:Quantitative measurement of root growth angle by using the basket method)

IRRI 2012年