川嶋裕介 (Yusuke Kawashima) - マイポータル

基本情報

学位: 博士(薬科)(2021年3月大阪大学)

J-GLOBAL ID: 202001019803500362
researchmap会員ID: R000007417

経歴

2020年4月 - 2021年9月

星薬科大学, 薬品物理化学研究室, 特任助手

学歴

2017年4月 - 2021年3月

大阪大学, 大学院薬学研究科, 博士後期課程

論文

Prediction of Binding Pose and Affinity of Nelfinavir, a SARS-CoV-2 Main Protease Repositioned Drug, by Combining Docking, Molecular Dynamics, and Fragment Molecular Orbital Calculations

Yuma Handa, Koji Okuwaki, Yusuke Kawashima, Ryo Hatada, Yuji Mochizuki, Yuto Komeiji, Shigenori Tanaka, Takayuki Furuishi, Etsuo Yonemochi, Teruki Honma …

The Journal of Physical Chemistry B 128(10) 2249-2265 2024年3月4日査読有り
FMOe: Preprocessing and visualizing package of the fragment molecular orbital method for Molecular Operating Environment and its applications in covalent ligand and metalloprotein analyses

Hirotomo Moriwaki, Yusuke Kawashima, Chiduru Watanabe, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma

2024年2月8日
Protein–ligand binding affinity prediction of cyclin‐dependent kinase‐2 inhibitors by dynamically averaged fragment molecular orbital‐based interaction energy

Kenichiro Takaba, Chiduru Watanabe, Atsushi Tokuhisa, Yoshinobu Akinaga, Biao Ma, Ryo Kanada, Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, Yusuke Kawashima, Hirotomo Moriwaki …

Journal of Computational Chemistry 43(20) 1362-1371 2022年7月30日
eIF4A阻害剤のRNA配列特異性に対する動的FMO解析

半田佑磨, 川嶋裕介, 古石誉之, 米持悦生, 伊藤拓宏, 斉藤大寛, 岩崎信太朗, 加藤幸一郎, 渡邉千鶴, 本間光貴 …

日本薬学会年会要旨集 142年会 27C-am11S 2022年3月
Molecular action of larvicidal flavonoids on ecdysteroidogenic glutathione S-transferase Noppera-bo in Aedes aegypti

Kazue Inaba, Kana Ebihara, Miki Senda, Ryunosuke Yoshino, Chisako Sakuma, Kotaro Koiwai, Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Akira Watanabe, Yusuke Kawashima …

BMC Biology 20(1) 2022年2月17日
Special feature of COVID-19 in FMODB: Fragment molecular orbital calculations and interaction energy analysis of SARS-CoV-2 related proteins

Kaori Fukuzawa, Koichiro Kato, Chiduru Watanabe, Yusuke Kawashima, Yuma Handa, Ami Yamamoto, Kazuki Watanabe, Tatsuya Ohyama, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya …

2021年6月18日
Computational ab initio interaction analyses between neutralizing antibody and SARS-CoV-2 variant spike proteins using the fragment molecular orbital method

Kazuki Watanabe, Chiduru Watanabe, Teruki Honma, Yu-Shi Tian, Yusuke Kawashima, Norihito Kawashita, Kaori Fukuzawa, Tatsuya Takagi

Bulletin of the Chemical Society of Japan 2021年5月15日
Intermolecular Interaction Analyses on SARS-CoV-2 Receptor Binding Domain and Human Angiotensin-Converting Enzyme 2 Receptor-Blocking Antibody/peptide Using Fragment Molecular Orbital Calculation

Kazuki Watanabe, Chiduru Watanabe, Teruki Honma, Yu-Shi Tian, Yusuke Kawashima, Norihito Kawashita, Tatsuya Takagi, Kaori Fukuzawa

2021年3月2日
分子動力学計算とFMO計算を用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼと既存薬との結合性予測

半田佑磨, 川嶋裕介, 畑田崚, 奥脇弘次, 望月祐志, 古明地勇人, 田中成典, 本間光貴, 古石誉之, 福澤薫 …

日本薬学会年会要旨集 141年会 27V04-am12S 2021年3月
Combining self-organizing maps and hierarchical clustering for protein–ligand interaction analysis in post-fragment molecular orbital calculation

Yusuke Kawashima, Natsumi Mori, Norihito Kawashita, Yu-Shi Tian, Tatsuya Takagi

Chem-Bio Informatics Journal 21 1-10 2021年1月29日
A Comparison between the Cycloadditions of Allenyl- and Vinyl-Cyclopentanes Using Density Functional Theory and GRRM Program

Kazuki Watanabe, Yusuke Kawashima, Chisato Mukai, Tatsuya Takagi, Yukinori Suwa, Yu-Shi Tian, Norihito Kawashita

Chemical and Pharmaceutical Bulletin 68(8) 737-741 2020年8月1日査読有り
Absorption, Fluorescence, and Two-Photon Excitation Ability of 5-Phenylisolidolo[2,1-a]quinolines

Ramon Francisco Avena, Lin Qiao, Yuki Fujii, Kohei Otomo, Hirokazu Ishii, Takeyuki Suzuki, Hirofumi Tsujino, Tadayuki Uno, Yasuo Tsutsumi, Yusuke Kawashima …

ACS Omega 5(5) 2473-2479 2020年2月11日査読有り
Inhibiting guanine oxidation and enhancing excess-electron-transfer efficiency of a pyrene-modified oligonucleotide by introducing an electron-donating group on pyrene

Takumi Okuda, Yusuke Kawashima, Yuuya Kasahara, Tatsuya Takagi, Junpei Yamamoto, Shigenori Iwai, Satoshi Obika

Chemical Communication 2019(5) 14062-14065 2019年10月23日査読有り
Inhibiting guanine oxidation and enhancing the excess-electron-transfer efficiency of a pyrene-modified oligonucleotide by introducing an electron-donating group on pyrene

Takumi Okuda, Yusuke Kawashima, Yuuya Kasahara, Tatsuya Takagi, Junpei Yamamoto, Shigenori Iwai, Satoshi Obika

55(93) 14062-14065 2019年8月査読有り
Metal-Free Nitrogen-Containing Polyheterocyclic Near-Infrared (NIR) Absorption Dyes: Synthesis, Absorption Properties, and Theoretical Calculation of Substituted 5-Methylisoindolo[2,1-a]quinolines.

Yuki Fujii, Yukinori Suwa, Yuki Wada, Tsunayoshi Takehara, Takeyuki Suzuki, Yusuke Kawashima, Norihito Kawashita, Tatsuya Takagi, Hiromichi Fujioka, Mitsuhiro Arisawa

ACS omega 4(3) 5064-5075 2019年3月31日
ロジウム触媒による環化付加反応の計算化学的検討

諏訪志典, 渡邉一樹, 川嶋裕介, 田雨時, 川下理日人, 高木達也

日本薬学会年会要旨集 139年会(2) 258-258 2019年3月
分子軌道計算によるスペクトルの精度の検討

諏訪志典, 川嶋裕介, 川下理日人, 藤居由基, 田雨時, 藤岡弘道, 有澤光弘, 高木達也

ケモインフォマティクス討論会予稿集 2016 P9 2016年

MISC

散逸粒子動力学法を用いたRNA含有リポプレックス構造変化の可視化による検討

佐々木香純, 福田翔, 山崎雄斗, 川嶋裕介, 奥脇弘次, 古石誉之, 東顕二郎, 福澤薫, 米持悦生

日本DDS学会学術集会プログラム予稿集 37回 132-132 2021年6月
SARS-CoV-2メインプロテアーゼと既存薬のFMO動的相互作用解析

半田佑磨, 川嶋裕介, 畑田崚, 奥脇弘次, 望月祐志, 古石誉之, 米持悦生, 本間光貴, 古明地勇人, 田中成典 …

構造活性相関シンポジウム講演要旨集(CD-ROM) 49th 2021年
SARS-CoV-2RdRpとレムデシビルの動的相互解析

宮川柊兵, 奥脇弘次, 川嶋裕介, 古石誉之, 米持悦生, 加藤幸一郎, 福澤薫

日本薬学会関東支部大会講演要旨集(CD-ROM) 65th 2021年
分子シミュレーションを用いたsiRNAリポプレックスの可視化による構造解析

佐々木香純, 福田翔, 川嶋裕介, 奥脇弘次, 古石誉之, 東顕二郎, 福澤薫, 米持悦生

日本薬学会関東支部大会講演要旨集(CD-ROM) 65th 2021年
FMO計算によるSARS-CoV-2変異株RBD-中和抗体間の相互作用解析

渡邉一樹, 渡邉一樹, 渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 本間光貴, 田雨時, 川嶋裕介, 川下理日人, 星野忠次, 西田紀貴 …

日本薬学会関東支部大会講演要旨集(CD-ROM) 65th 2021年
自己組織化写像によるフラグメント間相互作用解析手法の開発

川嶋裕介, 田雨時, 半田佑磨, 奥脇弘次, 渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 川下理日人, 古石誉之, 米持悦生, 本間光貴 …

日本薬学会関東支部大会講演要旨集 65th 2021年
FMO計算を用いたSARS-CoV-2のRBD-中和抗体間の相互作用解析

渡邉一樹, 川嶋裕介, 福澤薫, 渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 本間光貴, 田雨時, 川下理日人, 高木達也

構造活性相関シンポジウム講演要旨集(CD-ROM) 48th 2020年
新型コロナウイルスによるパンデミックに対するFMODBの取り組み

渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 神坂紀久子, 大山達也, 高谷大輔, 加藤幸一郎, 川嶋裕介, 半田佑磨, 山本亜美, 渡邉一樹 …

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 48th (CD-ROM) 2020年
COVID-19関連タンパク質の量子化学計算のFMODBへの登録

山本亜美, 半田佑磨, 川嶋裕介, 渡邉一樹, 加藤幸一郎, 加藤幸一郎, 渡邉千鶴, 大山達也, 神坂紀久子, 高谷大輔 …

日本薬学会関東支部大会講演要旨集 64th 2020年
Unityによる分子描画ライブラリGalahadとそれを用いたVR化学教育コンテンツにおけるユーザーインターフェースの検討

川嶋裕介, 水谷祥佑, 田雨時, 見取英明, 高木達也

電子情報通信学会技術研究報告 119(75(MVE2019 1-2)) 2019年
Unityによる分子描画ライブラリGalahadとそれを用いたVR化学教育コンテンツにおけるユーザーインターフェースの検討 (第166回ヒューマンインタフェース学会研究会人工現実感,エンタテインメント,メディアエクスペリエンスおよび一般)

川嶋裕介, 水谷祥佑, 田雨時, 見取英明, 高木達也

ヒューマンインタフェース学会研究報告集 21 111-117 2019年
含窒素多環芳香族化合物に対する量子化学計算を用いた吸光波長予測に関する検討

諏訪志典, 川嶋裕介, 川下理日人, 藤居由基, 田雨時, 藤岡弘道, 有澤光弘, 高木達也

ケモインフォマティクス討論会予稿集(Web) 41st 2018年
プラズマ処理水中の過硝酸の分解に関する量子化学計算

川嶋裕介, 川下理日人, 川下理日人, 高木達也, 高木達也, 井川聡, 北野勝久

応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 64th 2017年
活性酸素種によるアミノ酸残基への酸化反応機構の量子化学計算

川嶋裕介, 川下理日人, 川下理日人, 高木達也, 高木達也, 井川聡, 北野勝久

応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 64th 2017年

川嶋裕介

基本情報

経歴

学歴

論文

MISC

メニュー

共著者の一覧