共同研究・競争的資金等の研究課題

2021年4月 - 2024年3月

各種細胞株の放射線照射による生存率曲線と遺伝子発現量の測定

日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

課題番号
21K07617
体系的課題番号
JP21K07617
配分額
(総額)
4,160,000円
(直接経費)
3,200,000円
(間接経費)
960,000円

まず、当該研究室においては、RNA-seqのための細胞からRNAを抽出する作業ははじめてであるが、研究室における抽出プロトコルを確立し、安定して抽出できるようになった。RIN値については常に9以上であり、シーケンスは外注しているが、質のよいRNAを提供できるようになった。また、試しにHeLa細胞へのCo-60の照射前後のRNA-seqによる発現解析を行った。こちらも、当該研究室においては、バイオインフォマティクスによる解析ははじめてであるが、先行研究等を参考にし、解析手法を確立した。先行研究とほぼ同様な結果(発現遺伝子の一致等)が得られたので、本解析の妥当性が示された。本年度の前半の成果としては、主に実験プロトコルの確立がある。その後、放射線照射後、1、5、12時間後のRNA抽出実験を実施し、現在シーケンス中で、データが出来次第、主に遺伝子発現の時間発展について調べる予定である。

リンク情報
KAKEN
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21K07617
ID情報
  • 課題番号 : 21K07617
  • 体系的課題番号 : JP21K07617