篠原雄太 (Yuta Shinohara) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学遺伝子病制御研究所特任講師

学位: 博士(工学)(大阪大学)

J-GLOBAL ID: 201801007587610046
researchmap会員ID: B000307987

研究分野

経歴

2021年10月 - 現在

北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 特任講師
2018年4月 - 2021年9月

特定国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
2015年4月 - 2018年3月

理化学研究所, 生命システム研究センター, 特別研究員
2013年4月 - 2015年3月

日本学術振興会, 特別研究員(DC2)
2012年4月 - 2013年3月

理化学研究所, 大学院生リサーチアソシエイト

受賞

論文

Isoflurane activates the type 1 ryanodine receptor to induce anesthesia in mice.

Hiroyuki J Kanaya, Ken Kuwajima, Yuko Ito, Yuta Shinohara, Yohei Okubo, Shinnosuke Shiono, Fumiya Tatsuki, Rei-Ichiro Ohno, Hideki Ukai, Maki Ukai-Tadenuma …

PLoS biology 23(6) e3003172 2025年6月査読有り
Cortical parvalbumin neurons are responsible for homeostatic sleep rebound through CaMKII activation.

Kazuhiro Kon, Koji L Ode, Tomoyuki Mano, Hiroshi Fujishima, Riina R Takahashi, Daisuke Tone, Chika Shimizu, Shinnosuke Shiono, Saori Yada, Kyoko Matsuzawa …

Nature communications 15(1) 6054-6054 2024年7月18日査読有り
Phosphorylation of DNA-binding domains of CLOCK-BMAL1 complex for PER-dependent inhibition in circadian clock of mammalian cells.

Yuta Otobe, Eui Min Jeong, Shunsuke Ito, Yuta Shinohara, Nobuhiro Kurabayashi, Atsu Aiba, Yoshitaka Fukada, Jae Kyoung Kim, Hikari Yoshitane

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 121(23) e2316858121 2024年6月4日査読有り
GGT1 is a SNP eQTL gene involved in STAT3 activation and associated with the development of Post-ERCP pancreatitis.

Ryutaro Furukawa, Masaki Kuwatani, Jing-Jing Jiang, Yuki Tanaka, Rie Hasebe, Kaoru Murakami, Kumiko Tanaka, Noriyuki Hirata, Izuru Ohki, Ikuko Takahashi …

Scientific reports 14(1) 12224-12224 2024年5月28日査読有り
High-precision rapid testing of omicron SARS-CoV-2 variants in clinical samples using AI-nanopore.

Kaoru Murakami, Shimpei I Kubota, Kumiko Tanaka, Hiroki Tanaka, Keiichiroh Akabane, Rigel Suzuki, Yuta Shinohara, Hiroyasu Takei, Shigeru Hashimoto, Yuki Tanaka …

Lab on a chip 23(22) 4909-4918 2023年11月7日査読有り
Computer model of IL-6-dependent rheumatoid arthritis in F759 mice.

Reiji Yamamoto, Satoshi Yamada, Toru Atsumi, Kaoru Murakami, Ari Hashimoto, Seiichiro Naito, Yuki Tanaka, Izuru Ohki, Yuta Shinohara, Norimasa Iwasaki …

International immunology 35(9) 403-421 2023年9月5日査読有り
Zoobiquity experiments show the importance of the local MMP9-plasminogen axis in inflammatory bowel diseases in both dogs and patients.

Takeshi Yamasaki, Noriyuki Nagata, Toru Atsumi, Rie Hasebe, Yuki Tanaka, Izuru Ohki, Shimpei Kubota, Yuta Shinohara, Yong Bin Teoh, Nozomu Yokoyama …

International immunology 35(7) 313-326 2023年7月7日査読有り
GM-CSF Promotes the Survival of Peripheral-Derived Myeloid Cells in the Central Nervous System for Pain-Induced Relapse of Neuroinflammation.

Shiina Matsuyama, Reiji Yamamoto, Kaoru Murakami, Nobuhiko Takahashi, Rieko Nishi, Asuka Ishii, Junko Nio-Kobayashi, Nobuya Abe, Kumiko Tanaka, Jing-Jing Jiang …

Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) 211(1) 34-42 2023年7月1日査読有り
Temperature-Sensitive Substrate and Product Binding Underlie Temperature-Compensated Phosphorylation in the Clock

Yuta Shinohara, Yohei M. Koyama, Maki Ukai-Tadenuma, Takatsugu Hirokawa, Masaki Kikuchi, Rikuhiro G. Yamada, Hideki Ukai, Hiroshi Fujishima, Takashi Umehara, Kazuki Tainaka …

MOLECULAR CELL 67(5) 783-+ 2017年9月査読有り筆頭著者
Mass spectrometry-based absolute quantification reveals rhythmic variation of mouse circadian clock proteins

Ryohei Narumi, Yoshihiro Shimizu, Maki Ukai-Tadenuma, Koji L. Ode, Genki N. Kanda, Yuta Shinohara, Aya Sato, Katsuhiko Matsumoto, Hiroki R. Ueda

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(24) E3461-E3467 2016年6月査読有り
Non-Enzymatic DNA Cleavage Reaction Induced by 5-Ethynyluracil in Methylamine Aqueous Solution and Application to DNA Concatenation

Shuji Ikeda, Kazuki Tainaka, Katsuhiko Matsumoto, Yuta Shinohara, Koji L. Ode, Etsuo A. Susaki, Hiroki R. Ueda

PLOS ONE 9(3) e92369 2014年3月査読有り
Establishment of TSH β real-time monitoring system in mammalian photoperiodism.

Tsujino K, Narumi R, Masumoto KH, Susaki EA, Shinohara Y, Abe T, Iigo M, Wada A, Nagano M, Shigeyoshi Y …

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 18(7) 575-588 2013年7月査読有り
Synthesis of environmentally sensitive 2’-deoxyguanosine containing solvatochromic pyrene fluorophore

Saito Y, Shinohara Y, Ishioroshi S, Suzuki A, Tanaka M, Saito I

Tetrahedron Letters 52(18) 2359-2361 2011年5月査読有り
Synthesis and photophysical properties of 8-arylbutadienyl 2’-deoxyguanosines

Saito Y, Koda M, Shinohara Y, Saito I

Tetrahedron Letters 52(4) 491-494 2011年1月査読有り
Design of environmentally sensitive fluorescent 2 '-deoxyguanosine containing arylethynyl moieties: Distinction of thymine base by base-discriminating fluorescent (BDF) probe

Yuta Shinohara, Katsuhiko Matsumoto, Kenji Kugenuma, Takashi Morii, Yoshio Saito, Isao Saito

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 20(9) 2817-2820 2010年5月査読有り筆頭著者
Pyrene-labeled deoxyguanosine as a fluorescence sensor to discriminate single and double stranded DNA structures: Design of ends free molecular beacons

Katsuhiko Matsumoto, Yuta Shinohara, Subhendu S. Bag, Yoshiki Takeuchi, Takashi Morii, Yoshio Saito, Isao Saito

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 19(22) 6392-6395 2009年11月査読有り
Ends free and self-quenched molecular beacon with pyrene labeled pyrrolocytidine in the middle of the stem

Yoshio Saito, Yuta Shinohara, Subhendu Sekhar Bag, Yoshiki Takeuchi, Katsuhiko Matsumoto, Isao Saito

TETRAHEDRON 65(4) 934-939 2009年1月査読有り
Design of extremely facile 3'- and 5'- ends free molecular beacons using C8 alkylamino substituted 2'-deoxyguanosine.

Matsumoto K, Shinohara Y, Numajiri K, Ishioroshi S, Morii T, Saito Y, Saito I

Nucleic acids symposium series (2004) 141-142 2009年査読有り
Design of an ultimate quencher free molecular beacon containing pyrrolocytidine-guanine base pair.

Saito Y, Shinohara Y, Bag SS, Takeuchi Y, Matsumoto K, Saito I

Nucleic acids symposium series (2004) 361-362 2008年査読有り

講演・口頭発表等

Timekeepers of the mammalian circadian clock regulate post-translational modifications.

Yuta Shinohara

第61回日本生物物理学会年会 2023年11月招待有り
Design principles of temperature-compensated phosphorylation in the circadian clock.

Yuta Shinohara

New Frontier in Protein Design & Engineering 2019年3月招待有り
Design principles of temperature-compensated phosphorylation in the mammalian circadian clock.

Yuta Shinohara

第18回日本蛋白質科学会年会 2018年6月招待有り

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

時間タンパク質学領域の総括

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

吉種光, 松尾拓哉, 原田慶恵, 篠原雄太, 土居雅夫, 岡部弘基, 池内与志穂, 吉村崇, 大出晃士, 秋山修志, 村中智明, 久本洋子, 寺内一姫, 遠藤求, 岩崎信太郎, 向山厚, 八木田和弘
時間タンパク質学：概日時計の24時間をカウントする翻訳後修飾コード

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

吉種光, 篠原雄太, 向山厚
概日時計クオーツとして機能するタンパク質振動子

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2021年7月 - 2025年3月

吉種光, 松尾拓哉, 篠原雄太
概日リズムの多重リン酸化を校正する酵素機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2020年4月 - 2024年3月

篠原雄太
哺乳類概日時計の自律的に発振するリン酸化反応の創生

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2020年3月

篠原雄太
合成生物学的アプローチによる哺乳類概日時計の温度補償性の理解

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2013年4月 - 2015年3月

篠原雄太

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講演・口頭発表等

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