白石勇太郎 (Yutaro Shiraishi) - マイポータル

基本情報

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-5502-1720
J-GLOBAL ID: 202001006343081655
researchmap会員ID: R000011935

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2025年11月 - 現在

大阪大学, 大学院薬学研究科, 講師
2024年10月 - 2025年11月

大阪大学, 大学院薬学研究科, 特任講師（常勤）
2020年10月 - 2024年9月

特定国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
2019年4月 - 2020年9月

一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム, 特別研究職員
2018年5月 - 2019年3月

東京大学, 特別研究職員
2017年4月 - 2018年4月

一般社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム, 特別研究職員
2016年4月 - 2017年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員（PD)
2015年4月 - 2016年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員（DC2)

受賞

論文

Integrative Real-Time NMR and X-ray Crystallography Reveal Prostaglandin D ₂ Metabolism

Soichiro Ohta, Shigeru Shimamoto, Haruka Oda, Tadayasu Ohkubo, Hiroya Oki, Yutaro Shiraishi, Kazuki Kawahara, Takuya Yoshida, Takumi Ueda

Analytical Chemistry 2025年12月8日査読有り
Structural basis of the residence time of adenosine A_2A receptor ligands revealed by NMR

Takumi Ueda, Tomoki Tsuchida, Masatoshi Kurita, Takuya Mizumura, Shunsuke Imai, Yutaro Shiraishi, Yutaka Kofuku, Shuhei Miyakawa, Kaori Fukuzawa, Koh Takeuchi …

Chemical Science 2025年8月査読有り
NMR Characterization of the Papain-like Protease from SARS-CoV-2 Identifies the Conformational Heterogeneity in Its Inhibitor-Binding Site

Yutaro Shiraishi, Ichio Shimada

Journal of the American Chemical Society 2023年8月2日査読有り筆頭著者責任著者
Biphasic activation of β-arrestin 1 upon interaction with a GPCR revealed by methyl-TROSY NMR

Yutaro Shiraishi, Yutaka Kofuku, Takumi Ueda, Shubhi Pandey, Hemlata Dwivedi-Agnihotri, Arun K. Shukla, Ichio Shimada

Nature Communications 12(1) 7158-7158 2021年12月査読有り筆頭著者
Function-Related Dynamics in Multi-Spanning Helical Membrane Proteins Revealed by Solution NMR

Koh Takeuchi, Yutaka Kofuku, Shunsuke Imai, Takumi Ueda, Yuji Tokunaga, Yuki Toyama, Yutaro Shiraishi, Ichio Shimada

Membranes 11(8) 604-604 2021年8月9日査読有り
Activation of adenosine A<inf>2A</inf> receptor by lipids from docosahexaenoic acid revealed by NMR

Mizumura, T., Kondo, K., Kurita, M., Kofuku, Y., Natsume, M., Imai, S., Shiraishi, Y., Ueda, T., Shimada, I.

Science Advances 6(12) eaay8544-eaay8544 2020年査読有り
Structural equilibrium underlying ligand-dependent activation of β<inf>2</inf>-adrenoreceptor

Imai, S., Yokomizo, T., Kofuku, Y., Shiraishi, Y., Ueda, T., Shimada, I.

Nature Chemical Biology 16(4) 430-439 2020年査読有り
Function-related conformational dynamics of G protein–coupled receptors revealed by NMR

Ueda, T., Kofuku, Y., Okude, J., Imai, S., Shiraishi, Y., Shimada, I.

Biophysical Reviews 11(3) 409-418 2019年査読有り
Deuteration and selective labeling of alanine methyl groups of β<inf>2</inf>-adrenergic receptor expressed in a baculovirus-insect cell expression system

Kofuku, Y., Yokomizo, T., Imai, S., Shiraishi, Y., Natsume, M., Itoh, H., Inoue, M., Nakata, K., Igarashi, S., Yamaguchi, H. …

Journal of Biomolecular NMR 71(3) 185-192 2018年査読有り
Phosphorylation-induced conformation of β<inf>2</inf>-adrenoceptor related to arrestin recruitment revealed by NMR

Shiraishi, Y., Natsume, M., Kofuku, Y., Imai, S., Nakata, K., Mizukoshi, T., Ueda, T., Iwaï, H., Shimada, I.

Nature Communications 9(1) 194-194 2018年査読有り筆頭著者
Identification of a Conformational Equilibrium That Determines the Efficacy and Functional Selectivity of the μ-Opioid Receptor

Okude, J., Ueda, T., Kofuku, Y., Sato, M., Nobuyama, N., Kondo, K., Shiraishi, Y., Mizumura, T., Onishi, K., Natsume, M. …

Angewandte Chemie - International Edition 54(52) 15771-15776 2015年査読有り
Elucidation of the CCR1- and CCR5-binding modes of MIP-1α by application of an NMR spectra reconstruction method to the transferred cross-saturation experiments

Yoshiura, C., Ueda, T., Kofuku, Y., Matsumoto, M., Okude, J., Kondo, K., Shiraishi, Y., Shimada, I.

Journal of Biomolecular NMR 63(4) 333-340 2015年査読有り
Development of a method for reconstruction of crowded NMR spectra from undersampled time-domain data

Ueda, T., Yoshiura, C., Matsumoto, M., Kofuku, Y., Okude, J., Kondo, K., Shiraishi, Y., Takeuchi, K., Shimada, I.

Journal of Biomolecular NMR 62(1) 31-41 2015年査読有り
Functional dynamics of deuterated β<inf>2</inf>-adrenergic receptor in lipid bilayers revealed by NMR spectroscopy

Kofuku, Y., Ueda, T., Okude, J., Shiraishi, Y., Kondo, K., Mizumura, T., Suzuki, S., Shimada, I.

Angewandte Chemie - International Edition 53(49) 13376-13379 2014年査読有り
Efficacy of the β 2-adrenergic receptor is determined by conformational equilibrium in the transmembrane region

Kofuku, Y., Ueda, T., Okude, J., Shiraishi, Y., Kondo, K., Maeda, M., Tsujishita, H., Shimada, I.

Nature Communications 3(1) 1045-1045 2012年査読有り

MISC

核磁気共鳴法によるSARS-CoV-2パパイン様プロテアーゼの動的構造解析

白石勇太郎, 上田卓見, 嶋田一夫

細胞 57(4) 39-43 2025年4月招待有り筆頭著者責任著者
溶液NMR法によるGPCRの活性と直結する動的構造平衡の解明—Function-Related Conformational Dynamics of GPCRs Revealed by Solution NMR—ミニ特集生理学的環境での生体高分子の挙動の観察可能性の追求

上田卓見, 幸福裕, 竹内恒, 今井駿輔, 白石勇太郎, 嶋田一夫

日本結晶学会誌 = Journal of the Crystallographic Society of Japan 64(4) 279-284 2022年12月

講演・口頭発表等

NMR Characterization of the Papain-like Protease from SARS-CoV-2 Identifies the Conformational Heterogeneity in Its Inhibitor-Binding Site

Yutaro Shiraishi, Ichio Shimada

The 30th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems 2024年8月
GPCRとの相互作用によるβ-アレスチンの2段階活性化

第61会NMR討論会 2022年11月9日
Biphasic activation of β-arrestin 1 upon interaction with a GPCR revealed by methyl-TROSY NMR

29th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems 2022年8月23日
Gタンパク質共役型受容体のシグナル伝達制御機構の解明

白石勇太郎, 夏目芽依, 幸福裕, 今井駿輔, 中田國夫, 水越利巳, 上田卓見, 岩井秀夫, 嶋田一夫

第17回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム 2019年9月3日招待有り
Gタンパク質共役型受容体のシグナル伝達制御機構の解明

白石勇太郎, 夏目芽依, 幸福裕, 今井駿輔, 中田國夫, 水越利巳, 上田卓見, 岩井秀夫, 嶋田一夫

日本薬学会第139年会 2019年3月21日招待有り
Phosphorylation-induced conformation of β2-adrenoceptor related to arrestin recruitment revealed by NMR

Yutaro Shiraishi, Mei Natsume, Yutaka Kofuku, Shunsuke Imai, Kunio Nakata, Toshimi Mizukoshi, Takumi Ueda, Hideo Iwaï, Ichio Shimada

28th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems 2018年8月21日
Identification of a Conformational Equilibrium That Determines the Efficacy and Functional Selectivity of the μ-opioid Receptor

The 58th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference 2017年3月28日
β2アドレナリン受容体のリン酸化によるシグナル制御機構の解明

白石勇太郎, 幸福裕, 上田卓見, 嶋田一夫

第12回次世代を担う若手ファーマバイオフォーラム 2013年

共同研究・競争的資金等の研究課題

SARS-CoV-2の自然免疫回避を担うパパイン様プロテアーゼ基質選択性の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

白石勇太郎
核磁気共鳴法を用いたGタンパク質共役型受容体によるアレスチン活性化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2022年4月 - 2024年3月

白石勇太郎
Ｇタンパク質共役型受容体のＧＲＫ／アレスチンを介したシグナル伝達制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2015年4月 - 2017年3月

白石勇太郎

白石勇太郎

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論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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