小林裕樹 (Yuuki Kobayashi) - マイポータル

基本情報

所属: 東京農業大学総合研究所研究員

研究者番号: 60634714
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-1061-3639
J-GLOBAL ID: 202101008350082217
researchmap会員ID: R000031401

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研究分野

論文

Chromosome-resolved genome assemblies of Rhodotorula toruloides reveal abnormal chromosomal evolution under artificial culture conditions.

Yuuki Kobayashi, Moriya Ohkuma, Keita Aoki, Naoto Tanaka, Masako Takashima

Scientific reports 16(1) 1732 2025年12月11日査読有り筆頭著者責任著者
Nuclear division phenotypes in Sporidiobolales and Trichosporonales

Keita Aoki, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita, Yuuki Kobayashi, Naoto Tanaka, Masako Takashima

Microbiology Spectrum 2025年11月4日査読有り
Symbiont replacement and subsequent parallel genome erosion reshape a dual obligate symbiosis in the aphid Lachnus tropicalis

Tomonari Nozaki, Yuuki Kobayashi, Mika Ikeda, Shuji Shigenobu

2025年9月24日
Draft genome sequences of Buchnera aphidicola from three aphid species (Hemiptera: Aphididae: Eriosomatinae) associated with gall formation on elm trees.

Xin Tong, Yuuki Kobayashi, Mika Ikeda, Hsin-I Wen, Shin-Ichi Akimoto, Shuji Shigenobu

Microbiology resource announcements 14(7) e0033625 2025年7月10日査読有り
Whole-genome based phylogeny and comparative genomics of Sporidiobolales and related taxa of Basidiomycetes

Yuuki Kobayashi, Naoto Tanaka, Minenosuke Matsutani, Yuuna Kurokawa, Keita Aoki, Moriya Ohkuma, Ri-ichiroh Manabe, Masako Takashima

IMA Fungus 16 2025年5月13日査読有り筆頭著者責任著者
Vertical transmission of Wolbachia bypassing the germ line in an aphid

Tomonari Nozaki, Yuuki Kobayashi, Shuji Shigenobu

2025年4月19日
Analyses of hyphal diversity in Trichosporonales yeasts based on fluorescent microscopic observations.

Keita Aoki, Moriya Ohkuma, Takashi Sugita, Yuuki Kobayashi, Naoto Tanaka, Masako Takashima

Microbiology spectrum e0321024 2025年2月25日査読有り
Chromosome-level genome assemblies of Cutaneotrichosporon spp. (Trichosporonales, Basidiomycota) reveal imbalanced evolution between nucleotide sequences and chromosome synteny.

Yuuki Kobayashi, Ayane Kayamori, Keita Aoki, Yuh Shiwa, Minenosuke Matsutani, Nobuyuki Fujita, Takashi Sugita, Wataru Iwasaki, Naoto Tanaka, Masako Takashima

BMC genomics 24(1) 609 2023年10月11日査読有り筆頭著者責任著者
The draft genome sequence of the Japanese rhinoceros beetle Trypoxylus dichotomus septentrionalis towards an understanding of horn formation.

Morita S, Shibata TF, Nishiyama T, Kobayashi Y, Yamaguchi K, Toga K, Ohde T, Gotoh H, Kojima T, Weber JN …

Scientific reports 2023年5月30日査読有り
The genome of Lyophyllum shimeji provides insight into the initial evolution of ectomycorrhizal fungal genomes

Yuuki Kobayashi, Tomoko F Shibata, Hideki Hirakawa, Tomoaki Nishiyama, Akiyoshi Yamada, Mitsuyasu Hasebe, Shuji Shigenobu, Masayoshi Kawaguchi

DNA Research 30(1) 2023年1月5日査読有り筆頭著者責任著者
Hygrocybe griseonigricans（ハラタケ目ヌメリガサ科）の日本新産報告

小林裕樹, 重信秀治

日本菌学会会報 63(1) 17-21 2022年5月1日査読有り筆頭著者責任著者
First record of the cedar bark aphid, Cinara cedri cedri Mimeur, 1936 (Hemiptera: Aphidoidea) in Japan, and identification of infecting Wolbachia strains

Tomonari Nozaki, Yuuki Kobayashi, Shuji Shigenobu

BioInvasions Records 11(4) 900-911 2022年査読有り
Asymbiotic mass production of the arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus clarus

Sachiko Tanaka, Kayo Hashimoto, Yuuki Kobayashi, Koji Yano, Taro Maeda, Hiromu Kameoka, Tatsuhiro Ezawa, Katsuharu Saito, Kohki Akiyama, Masayoshi Kawaguchi

Communications Biology 5(1) 2022年1月査読有り
Taxonomic revision of Termitomyces species found in Ryukyu Archipelago, Japan, based on phylogenetic analyses with three loci

Yuuki Kobayashi, Miyuki Katsuren, Masaru Hojo, Shohei Wada, Yoshie Terashima, Masayoshi Kawaguchi, Gaku Tokuda, Kazuhiko Kinjo, Shuji Shigenobu

Mycoscience 63(1) 33-38 2021年12月17日査読有り筆頭著者責任著者
Conservation and host-specific expression of non-tandemly repeated heterogenous ribosome RNA gene in arbuscular mycorrhizal fungi

Taro Maeda, Yuuki Kobayashi, Tomomi Nakagawa, Tatsuhiro Ezawa, Katsushi Yamaguchi, Takahiro Bino, Yuki Nishimoto, Shuji Shigenobu, Masayoshi Kawaguchi

2020年5月15日
Evidence of non-tandemly repeated rDNAs and their intragenomic heterogeneity in Rhizophagus irregularis

Taro Maeda, Yuuki Kobayashi, Hiromu Kameoka, Nao Okuma, Naoya Takeda, Katsushi Yamaguchi, Takahiro Bino, Shuji Shigenobu, Masayoshi Kawaguchi

Communications Biology 1(1) 2018年7月10日査読有り
The genome of Rhizophagus clarus HR1 reveals a common genetic basis for auxotrophy among arbuscular mycorrhizal fungi

Yuuki Kobayashi, Taro Maeda, Katsushi Yamaguchi, Hiromu Kameoka, Sachiko Tanaka, Tatsuhiro Ezawa, Shuji Shigenobu, Masayoshi Kawaguchi

BMC Genomics 19(1) 2018年6月査読有り筆頭著者
Expression and Genome-Wide Analysis of the Xylogen-Type Gene Family

Y. Kobayashi, H. Motose, K. Iwamoto, H. Fukuda

Plant and Cell Physiology 52(6) 1095-1106 2011年5月10日査読有り筆頭著者
A Phalaenopsis variety with floral organs showing C class homeotic transformation and its revertant may enable Phalaenopsis as a potential molecular genetic material

Ejima Chika, Kobayashi Yuuki, Honda Hiroaki, SHIMIZU Noriko, KIYOHARA Shunsuke, HAMASAKI Ryota, SAWA Shinichiro

Genes & genetic systems 86(2) 93-95 2011年査読有り

MISC

全ゲノムデータに基づくスポリディオボラス目酵母の系統解析

小林裕樹, 田中尚人, 松谷峰之介, 黒川祐菜, 青木敬太, 大熊盛也, 高島昌子

日本菌学会大会講演要旨集 68th 2024年
Analysis of xylem formation inducing factor xylogen in Arabidopsis

Y Kobayashi, K Iwamoto, H Motose, S Sawa, H Fukuda

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 47 S151-S151 2006年

書籍等出版物

グリーン・エージ No.598 2025年5月号

小林裕樹 (担当:分担執筆, 範囲:598: 24-27 [テーマ2：キノコの巧みな生態を探る―植物や昆虫と共生して生きるキノコの適応戦略])

一般財団法人日本緑化センター 2025年5月
国際菌学会（IMC12）および国際酵母学会（ICY16）で開催されたThe Yeasts, A Taxonomic Studyの更新版発行に関するミーティング

青木敬太, 小林裕樹, 高島昌子 (担当:共著, 範囲:40 (2): 1-4)

日本微生物資源学会誌 2024年
微生物資源の整備と利活用の戦略 (大熊盛也, 石田達也, 乙黒美彩, 飯田敏也編著)

⻘⽊敬太, ⼩林裕樹, ⾼島昌⼦ (担当:分担執筆, 範囲:第４章第２節真菌の命名と系統分類に関する課題)

エヌ・ティー・エス 2023年9月 (ISBN: 9784860438586)
生物の科学遺伝 2013年7月号特集：共生ゲノム学―生物共進化のプリンシプルに迫る

小林裕樹, 川口正代司 (担当:分担執筆, 範囲:67(4):472-477 (Part 3: ゲノム科学で理解する共生システムの多様性―ゲノムから見えてくる外生菌根菌の進化))

エヌ・ティー・エス 2013年7月 (ISBN: 9784864690522)

共同研究・競争的資金等の研究課題

アーバスキュラー菌根共生系から根粒共生系への進化基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年4月 - 2015年3月

川口正代司, 齋藤勝晴, 武田直也, 壽崎拓哉, 藤田浩徳, 半田佳宏, 小林裕樹, 佐々木武馬, 養老瑛美子, 高原正裕, 吉田千枝, 岡本暁, 宮澤日子太, 篠原秀文, 松林嘉克, 征矢野敬, 榊原均, 林誠, 菅沼教生, 山田明義, 江沢辰広

小林裕樹

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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