吉国靖雄 (Yasuo Yoshikuni) - マイポータル

基本情報

所属: ローレンスバークレー国立研究所米国エネルギー省ジョイントゲノム研究所 Scientist
: 北海道大学農学部客員準教授
: 東京農工大学工学部生命工学科客員准教授

学位: Ph.D.(University of California, Berkeley)

J-GLOBAL ID: 201801016237503580
researchmap会員ID: B000299365

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研究分野

経歴

2019年7月 - 現在

東京農工大学, 工学部生命工学科, 客員准教授
2019年7月 - 現在

北海道大学, 農学部, 客員準教授
2014年5月 - 現在

米国エネルギー省ジョイントゲノムインスティチュート, DNA合成科学プログラム, プログラム長
2008年8月 - 2013年7月

バイオアーキテクチャーラボ, 最高科学責任者
2000年3月 - 2002年7月

カリフォルニア大学バークレー校, 化学工学科, 技官

学歴

2002年8月 - 2007年3月

カリフォルニア大学バークレー校, 工学部, バイオエンジニアリング
1997年4月 - 2001年3月

東京理科大学, 基礎工学部, 生物工学科

論文

An efficient cre-based workflow for genomic integration and expression of large biosynthetic pathways in Eubacterium limosum.

Patrick A Sanford, Ian Blaby, Yasuo Yoshikuni, Benjamin M Woolston

Biotechnology and bioengineering 2024年7月2日
Multisubstrate specificity shaped the complex evolution of the aminotransferase family across the tree of life.

Kaan Koper, Sang-Woo Han, Ramani Kothadia, Hugh Salamon, Yasuo Yoshikuni, Hiroshi A Maeda

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 121(26) e2405524121 2024年6月25日
Synthetic genomes unveil the effects of synonymous recoding.

Akos Nyerges, Anush Chiappino-Pepe, Bogdan Budnik, Maximilien Baas-Thomas, Regan Flynn, Shirui Yan, Nili Ostrov, Min Liu, Meizhou Wang, Qingmei Zheng …

bioRxiv : the preprint server for biology 2024年6月16日
Self-Buffering system for Cost-Effective production of lactic acid from glucose and xylose using Acid-Tolerant Issatchenkia orientalis.

Ye-Gi Lee, Nam Kyu Kang, Chanwoo Kim, Vinh G Tran, Mingfeng Cao, Yasuo Yoshikuni, Huimin Zhao, Yong-Su Jin

Bioresource technology 399 130641-130641 2024年5月
Mitochondrial ATP generation is more proteome efficient than glycolysis.

Yihui Shen, Hoang V Dinh, Edward R Cruz, Zihong Chen, Caroline R Bartman, Tianxia Xiao, Catherine M Call, Rolf-Peter Ryseck, Jimmy Pratas, Daniel Weilandt …

Nature chemical biology 2024年3月6日
A transcriptomic atlas of acute stress response to low pH in multiple Issatchenkia orientalis strains.

Veronika Dubinkina, Shounak Bhogale, Ping-Hung Hsieh, Payam Dibaeinia, Ananthan Nambiar, Sergei Maslov, Yasuo Yoshikuni, Saurabh Sinha

Microbiology spectrum 12(1) e0253623 2024年1月11日
Statistical 3D morphology characterization of vaterite microspheres produced by engineered Escherichia coli.

Alex Y W Lin, Zong-Yen Wu, Alexander J Pattison, Isaak E Müller, Yasuo Yoshikuni, Wolfgang Theis, Peter Ercius

Biomaterials advances 156 213711-213711 2024年1月
Expression and characterization of spore coat CotH kinases from the cellulosomes of anaerobic fungi (Neocallimastigomycetes).

Stephen P Lillington, Matthew Hamilton, Jan-Fang Cheng, Yasuo Yoshikuni, Michelle A O'Malley

Protein expression and purification 210 106323-106323 2023年10月
Metabolic engineering of low-pH-tolerant non-model yeast, Issatchenkia orientalis, for production of citramalate.

Zong-Yen Wu, Wan Sun, Yihui Shen, Jimmy Pratas, Patrick F Suthers, Ping-Hung Hsieh, Sudharsan Dwaraknath, Joshua D Rabinowitz, Costas D Maranas, Zengyi Shao …

Metabolic engineering communications 16 e00220 2023年6月
Development of genetic tools for heterologous protein expression in a pentose-utilizing environmental isolate of Pseudomonas putida.

Rahul Gauttam, Thomas Eng, Zhiying Zhao, Qurrat Ul Ain Rana, Blake A Simmons, Yasuo Yoshikuni, Aindrila Mukhopadhyay, Steven W Singer

Microbial biotechnology 16(3) 645-661 2023年3月
Expanding the genomic encyclopedia of Actinobacteria with 824 isolate reference genomes.

Rekha Seshadri, Simon Roux, Katharina J Huber, Dongying Wu, Sora Yu, Dan Udwary, Lee Call, Stephen Nayfach, Richard L Hahnke, Rüdiger Pukall …

Cell genomics 2(12) 100213-100213 2022年12月14日
Discovering untapped biochemistry in microorganisms from hidden corners.

Zhiying Zhao, Yasuo Yoshikuni

Nature reviews. Microbiology 20(11) 639-639 2022年11月
Cas9-Based Metabolic Engineering of Issatchenkia orientalis for Enhanced Utilization of Cellulosic Hydrolysates.

Ye-Gi Lee, Chanwoo Kim, Nurzhan Kuanyshev, Nam Kyu Kang, Zia Fatma, Zong-Yen Wu, Ming-Hsun Cheng, Vijay Singh, Yasuo Yoshikuni, Huimin Zhao …

Journal of agricultural and food chemistry 70(38) 12085-12094 2022年9月28日
Structural characterization of a soil viral auxiliary metabolic gene product - a functional chitosanase.

Ruonan Wu, Clyde A Smith, Garry W Buchko, Ian K Blaby, David Paez-Espino, Nikos C Kyrpides, Yasuo Yoshikuni, Jason E McDermott, Kirsten S Hofmockel, John R Cort …

Nature communications 13(1) 5485-5485 2022年9月19日
Chromosomal integration of complex DNA constructs using CRAGE and CRAGE-Duet systems.

Zhiying Zhao, Jan-Fang Cheng, Yasuo Yoshikuni

STAR protocols 3(3) 101546-101546 2022年9月16日
Intersubunit Coupling Enables Fast CO2-Fixation by Reductive Carboxylases.

Hasan DeMirci, Yashas Rao, Gabriele M Stoffel, Bastian Vögeli, Kristina Schell, Aharon Gomez, Alexander Batyuk, Cornelius Gati, Raymond G Sierra, Mark S Hunter …

ACS central science 8(8) 1091-1101 2022年8月24日
Evolutionary origin and functional diversification of aminotransferases.

Kaan Koper, Sang-Woo Han, Delia Casas Pastor, Yasuo Yoshikuni, Hiroshi A Maeda

The Journal of biological chemistry 298(8) 102122-102122 2022年8月
Microbiome engineering for sustainable agriculture: using synthetic biology to enhance nitrogen metabolism in plant-associated microbes.

Sang-Woo Han, Yasuo Yoshikuni

Current opinion in microbiology 68 102172-102172 2022年8月
Metabolic engineering for valorization of macroalgae biomass.

Yusuke Sasaki, Yasuo Yoshikuni

Metabolic engineering 71 42-61 2022年5月
A Synthetic Gene Library Yields a Previously Unknown Glycoside Phosphorylase That Degrades and Assembles Poly-β-1,3-GlcNAc, Completing the Suite of β-Linked GlcNAc Polysaccharides.

Spencer S Macdonald, Jose H Pereira, Feng Liu, Gregor Tegl, Andy DeGiovanni, Jacob F Wardman, Samuel Deutsch, Yasuo Yoshikuni, Paul D Adams, Stephen G Withers

ACS central science 8(4) 430-440 2022年4月27日

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MISC

3S-Fa05 An engineered microbial platform for direct biofuel production from brown macroalgae :

Yoshikuni Yasuo

日本生物工学会大会講演要旨集 65 185-185 2013年
BIOT 19-Designed divergent evolution of enzyme function

Yasuo Yoshikuni, Jay D. Keasling

ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 232 2006年9月

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