八木祐介 (Yusuke Yagi) - マイポータル

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所属: エディットフォース株式会社基盤研究開発部取締役CTO

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-7045-8015
J-GLOBAL ID: 202401013657480347
researchmap会員ID: R000064722

研究キーワード

論文

Pentatricopeptide repeat protein targeting CUG repeat RNA ameliorates RNA toxicity in a myotonic dystrophy type 1 mouse model

Masayuki Nakamori, Yusuke Yagi, masaru ohta, Osamu Nakanishi, Takyoshi Imai, Takayuki Tamai, Hideki Mochizuki, Maiko Miyai, Joe Nemoto

Science Translational Medicine 2025年4月16日
Fine-tuning of the PPR protein directs the RNA editing activity toward C-to-U or U-to-C conversion

Mizuho Ichinose, Takamasa Teramoto, Izumi Nakamura, Yasuka Shimajiri, Yusuke Yagi, Bernard Gutmann

Scientific Reports 15(1) 2025年2月21日
Translational enhancement of target endogenous mRNA in mammalian cells using programmable RNA-binding pentatricopeptide repeat proteins.

Ning Ping, Sayuri Hara-Kuge, Yusuke Yagi, Tomohiko Kazama, Takahiro Nakamura

Scientific reports 14(1) 251-251 2024年1月2日
Construction of a Versatile, Programmable RNA-Binding Protein Using Designer PPR Proteins and Its Application for Splicing Control in Mammalian Cells.

Yusuke Yagi, Takamasa Teramoto, Shuji Kaieda, Takayoshi Imai, Tadamasa Sasaki, Maiko Yagi, Nana Maekawa, Takahiro Nakamura

Cells 11(22) 2022年11月8日
U-to-C RNA editing by synthetic PPR-DYW proteins in bacteria and human culture cells.

Mizuho Ichinose, Masuyo Kawabata, Yumi Akaiwa, Yasuka Shimajiri, Izumi Nakamura, Takayuki Tamai, Takahiro Nakamura, Yusuke Yagi, Bernard Gutmann

Communications biology 5(1) 968-968 2022年9月15日
Identification of new pentatricopeptide repeat proteins, MREF1 and 2, involved in mitochondrial RNA editing, using computational target RNA prediction.

Takehito Kobayashi, Yusuke Yagi, Taizo Tamura, Takahiro Nakamura

Plant biotechnology (Tokyo, Japan) 37(1) 111-116 2020年3月25日
Comprehensive Prediction of Target RNA Editing Sites for PLS-Class PPR Proteins in Arabidopsis thaliana.

Takehito Kobayashi, Yusuke Yagi, Takahiro Nakamura

Plant & cell physiology 60(4) 862-874 2019年4月1日
Development of Genome Engineering Tools from Plant-Specific PPR Proteins Using Animal Cultured Cells.

Takehito Kobayashi, Yusuke Yagi, Takahiro Nakamura

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1469 147-55 2016年
The potential for manipulating RNA with pentatricopeptide repeat proteins.

Yusuke Yagi, Takahiro Nakamura, Ian Small

The Plant journal : for cell and molecular biology 78(5) 772-82 2014年6月
Recent advances in the study of chloroplast gene expression and its evolution.

Yusuke Yagi, Takashi Shiina

Frontiers in plant science 5 61-61 2014年
Two DYW subclass PPR proteins are involved in RNA editing of ccmFc and atp9 transcripts in the moss Physcomitrella patens: first complete set of PPR editing factors in plant mitochondria.

Mizuho Ichinose, Chieko Sugita, Yusuke Yagi, Takahiro Nakamura, Mamoru Sugita

Plant & cell physiology 54(11) 1907-16 2013年11月
Chloroplast envelope localization of EDS5, an essential factor for salicylic acid biosynthesis in Arabidopsis thaliana.

Kanako Yamasaki, Yukiya Motomura, Yusuke Yagi, Hironari Nomura, Shingo Kikuchi, Masato Nakai, Takashi Shiina

Plant signaling & behavior 8(4) e23603 2013年4月
Elucidation of the RNA recognition code for pentatricopeptide repeat proteins involved in organelle RNA editing in plants.

Yusuke Yagi, Shimpei Hayashi, Keiko Kobayashi, Takashi Hirayama, Takahiro Nakamura

PloS one 8(3) e57286 2013年
Pentatricopeptide repeat proteins involved in plant organellar RNA editing.

Yusuke Yagi, Makoto Tachikawa, Hisayo Noguchi, Soichirou Satoh, Junichi Obokata, Takahiro Nakamura

RNA biology 10(9) 1419-25 2013年
Isolation of Arabidopsis ahg11, a weak ABA hypersensitive mutant defective in nad4 RNA editing.

Maki Murayama, Shimpei Hayashi, Noriyuki Nishimura, Mayumi Ishide, Keiko Kobayashi, Yusuke Yagi, Tadao Asami, Takahiro Nakamura, Kazuo Shinozaki, Takashi Hirayama

Journal of experimental botany 63(14) 5301-10 2012年9月
Mechanistic insight into pentatricopeptide repeat proteins as sequence-specific RNA-binding proteins for organellar RNAs in plants.

Takahiro Nakamura, Yusuke Yagi, Keiko Kobayashi

Plant & cell physiology 53(7) 1171-9 2012年7月
Eukaryotic-type plastid nucleoid protein pTAC3 is essential for transcription by the bacterial-type plastid RNA polymerase.

Yusuke Yagi, Yoko Ishizaki, Yoichi Nakahira, Yuzuru Tozawa, Takashi Shiina

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109(19) 7541-6 2012年5月8日
Evolutionary aspects of plastid proteins involved in transcription: the transcription of a tiny genome is mediated by a complicated machinery.

Yusuke Yagi, Takashi Shiina

Transcription 3(6) 290-4 2012年
Light induction of Arabidopsis SIG1 and SIG5 transcripts in mature leaves: differential roles of cryptochrome 1 and cryptochrome 2 and dual function of SIG5 in the recognition of plastid promoters.

Yayoi Onda, Yusuke Yagi, Yukiko Saito, Nobuhiro Takenaka, Yoshinori Toyoshima

The Plant journal : for cell and molecular biology 55(6) 968-78 2008年9月

共同研究・競争的資金等の研究課題

細胞内mRNA翻訳プログラミングツールの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2016年4月 - 2019年3月

八木祐介, 中村崇裕
植物ミトコンドリアノックダウンシステムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

八木祐介
内在配列を標的としたRNAイメージング手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2014年4月 - 2016年3月

八木祐介
ＰＰＲ蛋白質を利用した標的ＲＮＡ特異的改変システムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2013年4月 - 2016年3月

八木祐介
色素体核様体タンパク質が担う新奇レトログレードシグナルに関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2009年 - 2010年

八木祐介

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